WHSC1L1 - WHSC1L1

NSD3
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2DAQ, 4GND, 4GNE, 4GNF, 4GNG, 4RXJ, 4YZ8, 2ND1, 2NCZ
Identifikatorlar
Taxalluslar	NSD3, pp14328, WHSC1L1, WHISTLE, Wolf-Hirschhorn sindromiga nomzod 1 ga o'xshash 1, yadro retseptorlari bilan bog'langan SET domen oqsili 3, KMT3G, KMT3F
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 607083 MGI: 2142581 HomoloGene: 56960 Generkartalar: NSD3
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	38,382,272 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 8 (sichqoncha)
Oxiri	25,719,667 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• metiltransferaza faolligi; • transferaza faoliyati; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • metall ionlari bilan bog'lanish; • giston-lizin N-metiltransferaza faolligi; • GO: 0001105 transkripsiya koaktivatori faoliyati; • giston metiltransferaza faolligi (o'ziga xos H3-K36);
Uyali komponent	• hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • xromosoma; • kromatin;
Biologik jarayon	• giston metilatsiyasi; • metilatsiya; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • transkripsiya, DNK-andozali; • giston lizin metilatsiyasi; • xromatin moddasi; • transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • histon H3-K36 trimetilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • histon H3-K36 metilatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	54904
	234135
	ENSG00000147548
	ENSMUSG00000054823
	Q9BZ95
	Q6P2L6
	NM_017778; NM_023034
	NM_001001735; NM_001081269; NM_001308481; NM_001308482
	NP_060248; NP_075447
	NP_001001735; NP_001074738; NP_001295410; NP_001295411
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Giston-lizin N-metiltransferaza NSD3 bu ferment odamlarda kodlanganligi WHSC1L1 gen.^[5]^[6]

Ushbu gen Wolf-Hirschhorn sindromi nomzod-1 geni va oqsilni PWWP (prolin-triptofan-triptofan-prolin) domenlari bilan kodlaydi. Proteinning funktsiyasi aniqlanmagan. Ikkita muqobil ravishda qo'shilgan variantlar tavsiflangan.^[6]

WHSC1L1 geni kuchaytirilgan bir nechta saraton kasalliklarida, shu jumladan o'pka saratoni va bosh va bo'yin saratoni, va rol o'ynashi mumkin kanserogenez.^[7]^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000147548 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000054823 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Stec I, Nagl SB, van Ommen GJ, den Dunnen JT (iyun 2000). "PWWP domeni: differentsiatsiyaga ta'sir qiluvchi yadro oqsillarida potentsial protein-oqsil ta'sir doirasi?". FEBS Lett. 473 (1): 1–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01449-6. PMID 10802047. S2CID 26290698.
^ ^a ^b "Entrez Gen: WHSC1L1 Wolf-Hirschhorn sindromiga nomzod 1-o'xshash 1".
^ Kang, D; Cho, HS; Toyokava, G; Kogure, M; Yamane, Y; Ivay, Y; Xayami, S; Tsunoda, T; Maydon, HI; Matsuda, K; Nil, DE; Ponder, BA; Maehara, Y; Nakamura, Y; Hamamoto, R (fevral, 2013). "Giston metiltransferaza Wolf-Hirschhorn sindromiga nomzod 1 ga o'xshash 1 (WHSC1L1) inson kanserogenezida ishtirok etadi". Genlar, xromosomalar va saraton. 52 (2): 126–39. doi:10.1002 / gcc.22012 yil. PMID 23011637. S2CID 41047322.
^ Chen, Y; McGee, J; Chen, X; Doman, TN; Gong, X; Chjan, Y; Xemm, N; Ma, X; Xiggs, RE; Bagvat, SV; Buchanan, S; Peng, SB; Stashke, KA; Yadav, V; Yue, Y; Kouros-Mehr, Xosein (2014). "TCGA ma'lumotlar to'plamlari bo'yicha kuchaytirilgan dori vositasida saraton kasalligi haydovchisi genlarini aniqlash". PLOS ONE. 9 (5): e98293. doi:10.1371 / journal.pone.0098293. PMC 4038530. PMID 24874471.

Qo'shimcha o'qish

Angrand PO, Apiou F, Styuart AF va boshq. (2001). "NSD3, yangi SET domenini o'z ichiga olgan gen, 8p12 ga mos keladi va insonning ko'krak bezi saraton hujayralari qatorida kuchayadi". Genomika. 74 (1): 79–88. doi:10.1006 / geno.2001.6524. PMID 11374904.
Stec I, van Ommen GJ, den Dunnen JT (2001). "WHSC1L1, odamning 8p11.2 xromosomasida, WHSC1 ga o'xshaydi va 4p16.3 bilan birgalikda takrorlangan mintaqaga xaritalarni soladi". Genomika. 76 (1–3): 5–8. doi:10.1006 / geno.2001.6581. PMID 11549311.
Rosati R, La Starza R, Veronese A va boshq. (2002). "NUP98 t (8; 11) (p11.2; p15) bilan bog'liq bo'lgan o'tkir miyeloid leykemiyada NSD3 geniga qo'shilgan". Qon. 99 (10): 3857–60. doi:10.1182 / qon.V99.10.3857. PMID 11986249.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Tonon G, Vong KK, Maulik G va boshq. (2005). "Odamning o'pka saratonining yuqori aniqlikdagi genomik profillari". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 102 (27): 9625–30. doi:10.1073 / pnas.0504126102. PMC 1160520. PMID 15983384.
Kim SM, Kee HJ, Eom GH va boshq. (2006). "H3K4 va H3K27 metiltransferaza faolligi bilan yangi WHSC1 bilan bog'liq bo'lgan SET domen oqsilining xarakteristikasi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 345 (1): 318–23. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.04.095. PMID 16682010.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 8 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000147548 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000054823 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10802047-5] Stec I, Nagl SB, van Ommen GJ, den Dunnen JT (iyun 2000). "PWWP domeni: differentsiatsiyaga ta'sir qiluvchi yadro oqsillarida potentsial protein-oqsil ta'sir doirasi?". FEBS Lett. 473 (1): 1–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01449-6. PMID 10802047. S2CID 26290698.

[entrez-6] "Entrez Gen: WHSC1L1 Wolf-Hirschhorn sindromiga nomzod 1-o'xshash 1".

[7] Kang, D; Cho, HS; Toyokava, G; Kogure, M; Yamane, Y; Ivay, Y; Xayami, S; Tsunoda, T; Maydon, HI; Matsuda, K; Nil, DE; Ponder, BA; Maehara, Y; Nakamura, Y; Hamamoto, R (fevral, 2013). "Giston metiltransferaza Wolf-Hirschhorn sindromiga nomzod 1 ga o'xshash 1 (WHSC1L1) inson kanserogenezida ishtirok etadi". Genlar, xromosomalar va saraton. 52 (2): 126–39. doi:10.1002 / gcc.22012 yil. PMID 23011637. S2CID 41047322.

[8] Chen, Y; McGee, J; Chen, X; Doman, TN; Gong, X; Chjan, Y; Xemm, N; Ma, X; Xiggs, RE; Bagvat, SV; Buchanan, S; Peng, SB; Stashke, KA; Yadav, V; Yue, Y; Kouros-Mehr, Xosein (2014). "TCGA ma'lumotlar to'plamlari bo'yicha kuchaytirilgan dori vositasida saraton kasalligi haydovchisi genlarini aniqlash". PLOS ONE. 9 (5): e98293. doi:10.1371 / journal.pone.0098293. PMC 4038530. PMID 24874471.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]