WcaG RNK motifi - wcaG RNA motif - Wikipedia
| wcaG RNK motifi | |
|---|---|
 Ikkinchi darajadagi tuzilishning konsensusi wcaG RNKlar | |
| Identifikatorlar | |
| Belgilar | wcaG RNK |
| Rfam | RF01761 |
| Boshqa ma'lumotlar | |
| RNK turi | Cis- tartibga soluvchi element |
| Domen (lar) | Siyanobakteriyalar |
| PDB tuzilmalar | PDBe |
The wcaG RNK motifi bu RNK ba'zilarida saqlanadigan tuzilma bakteriyalar tomonidan aniqlangan bioinformatika.[1] wcaG RNKlar aniq topilgan fajlar yuqtiradigan siyanobakteriyalar. Eng taniqli wcaG RNKlari ketma-ketlikda topilgan DNK ishlov berilmagan joydan olingan dengiz bakteriyalari. wcaG RNKlar quyidagi kabi ishlashi mumkin cis-tartibga solish elementlari, ularning mumkin bo'lgan joylarini hisobga olgan holda 5 'tarjima qilinmagan mintaqalar ning genlar. Bu taklif qilingan wcaG RNKlar keyingi funktsiyalarni bajarishi mumkin riboswitches.
Genlar tomonidan tartibga solinishi haqida faraz qilingan wcaG Sintezida RNKlar ishlaydi ekzopolisakkaridlar, yoki ularning yuqori miqdori bilan indüklenir yorug'lik. Ushbu so'nggi genlar, ehtimol, siyanobakterial bilan bog'liq fotosintez. Aniqlangan wcaG Tozalangan faglardagi RNKlar ajratilgan genlar oqimida. Ushbu genlar faglarga xos deb hisoblanmasa ham, ilgari siyanobakteriyalarni yuqtirgan fajlar odatda bunday genlarni o'z ichiga olishi kuzatilgan.[2][3][4]
Adabiyotlar
- ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
- ^ Sallivan MB, Coleman ML, Weigele P, Rohwer F, Chisholm SW (may 2005). "Prochlorococcus siyanofagining uchta genomi: imzo xususiyatlari va ekologik talqinlari". PLoS Biol. 3 (5): e144. doi:10.1371 / journal.pbio.0030144. PMC 1079782. PMID 15828858.
- ^ Rohwer F, Thurber RV (2009 yil may). "Viruslar dengiz muhitini boshqaradi". Tabiat. 459 (7244): 207–212. doi:10.1038 / nature08060. PMID 19444207.
- ^ Lindell D, Jaffe JD, Coleman ML va boshq. (2007 yil sentyabr). "Dengiz virusi va xostining genom bo'yicha ekspression dinamikasi birgalikda evolyutsiyaning xususiyatlarini ochib beradi". Tabiat. 449 (7158): 83–86. doi:10.1038 / nature06130. PMID 17805294.