Avtofagiya bilan bog'liq bo'lgan protein 101 - Autophagy-related protein 101 - Wikipedia
Avtofagiya bilan bog'liq bo'lgan protein 101 shuningdek, nomi bilan tanilgan ATG101 a oqsil odamlarda kodlanganligi C12orf44 gen (xromosoma 12 ochiq o'qish doirasi 44).[5]
Avtofagiya shakllanish jarayoni vakuol lizosomalarda parchalanishi kerak bo'lgan oqsillar va nuklein kislotalar atrofida. Yozilgan mRNA C12orf44 ketma-ketligi 1287 tayanch juftligini tashkil etadi va keyingi tarjima 218 ga teng aminokislotalar uzunligi bo'yicha. ATG101 oqsili mahalliylashtirilgan sitoplazma, lekin ehtimol a deb nomlanuvchi tuzilishga bog'langan holda topish mumkin fagofora, autofagiya bilan shug'ullanadi. Gen sutemizuvchilar orasida yuqori darajada saqlanib qolgan, shuningdek, ko'pchilik eukaryotlar orasida saqlanib qolgan. Bu to'g'ridan-to'g'ri o'zaro ta'sir qiladi deb o'ylashadi ATG13 ichida ULK1 fagoforlarni faollashtirish uchun muhim bo'lishi mumkin bo'lgan murakkab.
Funktsiya
ATG101 - bu autofagiya uchun mas'ul bo'lgan boshqa ko'plab oqsillar qatorida yangi topilgan muhim autophagy bilan bog'liq oqsil bo'lib, bu jarayon ko'p eukaryotik organizmlar orasida yaxshi saqlanib qolgan. Shu bilan birga, ATG101 boshqa ATG oqsillarining hech biri uchun gomologik emas. ATG101 muhim autofagiya oqsili bilan o'zaro ta'sir qiladi ATG13 sutemizuvchilarda, bu a ULK1 o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil.[6] ULK1 (51 ga o'xshamaydigan kinaz 1) sutemizuvchilarda makroautofagiyani faollashishi uchun muhim deb hisoblanadi. ATG101, proteazomal degradatsiyadan ATG13ni himoya qilish uchun tavsiya etiladi, shuning uchun hujayralardagi ATG13 darajasini stabillashtiradi va makroautofagiya darajasini tartibga soladi.[7] Nashr qilingan hujjatlarga ko'ra, ATG101 fagofora deb ham ataladigan izolyatsiya membranasida lokalizatsiya qilinadi. Fagoforga birikish, ehtimol uchinchi AAda topilgan palmitoylatsiya joyini tushuntirishi mumkin, ya'ni sistein. Fagoforlar tanazzulga uchrashi kerak bo'lgan materiallarni tanib olish va ularni o'rab olish uchun javobgardir lizosoma, parchalanadigan materiallarni to'liq o'rab turgan membranani hosil qilish orqali.
Protein xususiyatlari
| DUF1649 noma'lum funktsiyasi oqsili | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | DUF1649 | ||||||||
| Pfam | PF07855 | ||||||||
| InterPro | IPR012445 | ||||||||
| |||||||||
ATG101 oqsilida DUF1649 domeni (noma'lum funktsiya maydoni 1649) mavjud.
ATG101 aksariyat umurtqali hayvonlar, jumladan, odamlar bilan umumiy ajdodi 65 dan 85 million yil oldin ajralib chiqqan deb hisoblangan sichqon kabi hayvonlar orasida yuqori darajada saqlanib qolgan. Bu ATG101 funktsiyani saqlab qolish uchun tizimli ravishda saqlanib qolishi kerakligi bilan ahamiyatli ekanligiga dalil bo'lishi mumkin. Faqat 2 ta missense SNPlar ATG101 uchun DNK ketma-ketligida ma'lum bo'lib, bu oqsilning boshqa versiyalari mavjud emasligini ko'rsatib, uning tuzilish ahamiyatini ham ko'rsatib beradi.
Ushbu kontseptual tarjimada uchinchi aminokislotadagi palmitoylatsiya joyini va qavslar bilan o'ralgan bo'lishi mumkin bo'lgan fosforillanish joyini ko'rish mumkin. Aminokislotalar mRNKning kodlash sohasi bo'ylab hizalanadi, u yon tomonlarda ham raqamlangan. ATG101 da bu oqsil valinga boy.
Gen ifodasi
Hech qanday ma'lum bir sohada ATG101-ni o'rnatadigan aniq ma'lumotlar mavjud emas. Odamlarda ham, sichqonlarda ham bir nechta ekspression to'plamlarini ko'rib chiqib, u hamma joyda to'qimalarda ifoda etilgan deb taxmin qilingan.
Gen mahallasi
- GRASP GRP1 (fosfoinositidlar uchun umumiy retseptorlari 1) - biriktirilgan iskala oqsili[8] -
Nisbatan noma'lum bo'lgan, quyida ko'rib chiqilganidek, C12orf44 bilan bir qatorda joylashgan umumiy retseptorlari oqsilining kodlari 8924 bp.
- NR4A1 (yadro retseptorlari subfamilasi 4, A guruhi, a'zo 1) -
Ushbu gen steroid-tiroid gormoni-retinoid retseptorlari superfamilasining a'zosi bo'lgan IB o'sish omilini kodlaydi. Ekspression inson limfotsitlaridagi fitogemagglutinin va hibsga olingan fibroblastlarning sarum stimulyatsiyasi bilan yuzaga keladi. Kodlangan oqsil yadro transkripsiyasi omili vazifasini bajaradi. Proteinning yadrodan mitoxondriyaga ko'chishi apoptozni keltirib chiqaradi. Joylashuv C12orf44 bilan bir qatorda, 8097 bp.
- OR7E47P (hidlash retseptorlari, 7-oila, E oilasi, 47-psevdogen) -
Xushbo'y retseptorlari burundagi hidlovchi molekulalar bilan o'zaro aloqada bo'lib, hidni idrok etishni qo'zg'atadigan neyron reaktsiyasini boshlaydi. Xushbo'y retseptorlari oqsillari bitta kodlash-ekson genlaridan kelib chiqadigan G-protein bilan bog'langan katta retseptorlari (GPCR) oilasining a'zolaridir. Xushbo'y retseptorlari 7-transmembrana domen tuzilishini ko'plab nörotransmitter va gormonlar retseptorlari bilan bo'lishadi va hidlarni qabul qilish signallarini tanib olish va G oqsil vositasida o'tkazilishi uchun javobgardir. Xromosomada C12orf44 dan keyin joylashgan bo'lib, u xuddi shu ipda yotadi va uzunligi 946 bp.
- KRT80 (keratin 80) -
Ushbu gen tilda zaif ifoda etilgan epiteliya keratinini kodlaydi. U C12orf44 ga qarama-qarshi chiziqda joylashgan va uzunligi 23005 bp.
Adabiyotlar
- ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000123395 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000037204 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "Entrez Gen: 12-xromosoma ochiq o'qish doirasi 44".
- ^ Mercer CA, Kaliappan A, Dennis PB (iyul 2009). "Atg13" insonga bog'lovchi yangi protein Atg101 ULK1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va makroavtofagiya uchun juda muhimdir ". Avtofagiya. 5 (5): 649–62. doi:10.4161 / auto.5.5.8249. PMID 19287211.
- ^ Xosokava N, Sasaki T, Iemura S, Natsume T, Xara T, Mizusima N (oktyabr 2009). "Atg101, Atg13 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi yangi sutemizuvchilarning otofagiyasi oqsili". Avtofagiya. 5 (7): 973–9. doi:10.4161 / auto.5.7.9296. PMID 19597335.
- ^ NM_001098673.1. NCBI qo'llanmasi [Internet]. Bethesda (MD): Milliy tibbiyot kutubxonasi (AQSh), Milliy biotexnologiya axborot markazi; 2002 yil oktyabr https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Kitoblar
Tashqi havolalar
- Inson ATG101 genom joylashuvi va ATG101 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.