CLE peptidi - CLE peptide - Wikipedia

CLE peptidlari (CLAVATA3 / Embrion atrofidagi mintaqa bilan bog'liq) guruhidir peptidlar bilan bog'liq bo'lgan o'simliklarda uchraydi hujayra signalizatsiyasi. Ishlab chiqarish CLE genlari tomonidan boshqariladi. CLE peptidi bilan bog'langanda retseptorlari boshqa hujayrada hodisalarning zanjirli reaktsiyasi yuzaga keladi, bu esa turli fiziologik va rivojlanish jarayonlariga olib kelishi mumkin. Ushbu signalizatsiya yo'li turli xil bo'lib saqlanadi quruqlikdagi o'simliklar.[1]

Fon

O'simliklar va hayvonlar ikkalasi ham hujayradan hujayraga signal berish uchun kichik polipeptidlardan foydalanadilar. CLAVATA3 / Embrion atrofidagi mintaqa, shuningdek o'simlik peptidi gormoni deb ham ataladi, signalizatsiya hujayradan hujayra signalizatsiyasi, shuningdek uzoq masofali aloqa uchun muhimdir. Ushbu ikkita harakat o'simlik hujayralari uchun juda muhimdir, chunki ular harakatsiz va hujayralar kengayishini amalga oshirishi kerak. Ko'p hujayrali organizmlarda hujayralararo hujayralararo aloqa organizm ichida sodir bo'ladigan ko'plab o'sish jarayonlari uchun juda muhim ekanligi aniqlandi. 12 yoki 13 aminokislota polipeptidlari saqlanib qolgan CLE domenlaridan olingan CLE oqsillarining etuk shakllari.[2][3][4] Ushbu sohada ko'proq tadqiqotlar olib borilishi bilan ko'proq va ko'proq CLE genlari aniqlanmoqda. CLE genlari nafaqat urug 'o'simliklarida, balki ularda ham topilgan likofitlar, bryofitlar va yashil suv o'tlari.[5][6]

Genlar

CLE peptid signalizatsiyasi bo'yicha olib borilgan tadqiqotlarning aksariyati o'tkazilgan Arabidopsis, chunki bu genomda CLE genlar oilasining 32 a'zosi mavjud. CLE genlar oilasiga mansub CLV3 bir yoki bir nechta to'qimalarda uchraydi Arabidopsis. CLE oilasining barcha 32 a'zolari ikkita xususiyatga ega: kichik oqsilni o'zlarining N-terminalarida taxminiy sekretsiya signallari bilan kodlash va ularning C-terminalinalarida yoki ularning yonida saqlangan CLE motifini o'z ichiga oladi.[7] CLE genlar oilasining 32 a'zosi asl gen mutatsiyalaridan kelib chiqqan.

Tuzilmalar

CLE peptidlari CLE genlari tomonidan kodlanadi. Ushbu peptidlar o'simlik tarkibida har xil ishni bajaradigan har bir peptid tuzilishi bilan tuzilishi jihatidan farq qiladi. Ishlaydigan CLE peptidlarining minimal uzunligi 12 ga teng aminokislotalar bir nechta tanqidiy qoldiqlar bilan[8] O'simlik ichida mavjud bo'lgan ikki xil peptidli tuzilmalar mavjud va ular A va B tiplarida. A tipidagi gormonlar chiqarilganda o'simlik ildiz o'sishi tezligini pasaytiradi, B tipidagi peptidlarning ajralishi esa qon tomir o'simlikning o'sishi.[9] A tipidagi peptidlarning ajralishi B tipidagi peptidlar vositasida bo'lgan o'simlikning qon tomir rivojlanishini tezlashtiradi. Bu shuni ko'rsatadiki, o'simlikning o'sishini tartibga solish uchun ushbu ikki turdagi peptidlar birgalikda ishlaydi. Maxsus peptidlar:[8]

A tipidagi peptidlar

  • CLE 1/3/4
  • CLE 2
  • CLE 5/6
  • CLE 7
  • CLE 8
  • CLE 9
  • CLE 10
  • CLE 11
  • CLE 12
  • CLE 13
  • CLE 14
  • CLE 16
  • CLE 17
  • CLE 18
  • CLE 19
  • CLE 20
  • CLE 21
  • CLE 22
  • CLE 25
  • CLE 26
  • CLE 27
  • CLE 40
  • CLE 45

B tipidagi peptidlar

  • CLE 41/44 / TDIF
  • CLE 42
  • CLE 43
  • CLE 46

Apikal meristemada o'q uzish

Crassula ovata apikal meristemalarini suratga oling (chapda). O'n to'rt kundan keyin barglar rivojlandi (o'ngda).
Apikal meristemaning Tunica-Corpus modeli (o'sib boruvchi uchi). Epidermal (L1) va subepidermal (L2) qatlamlar tunika deb ataladigan tashqi qatlamlarni hosil qiladi. Ichki L3 qatlami korpus deb ataladi. L1 va L2 qatlamlaridagi hujayralar yon tomonga bo'linadi, bu esa bu qatlamlarni farq qiladi, L3 qatlam esa tasodifiy tarzda bo'linadi.

Meristematik hujayralar o'simlikning turli organlarini tug'diradi va o'sishni davom ettiradi. Meristematik to'qimalarning ikki turi mavjud 1) Apikal Meristem 2) Lateral Meristem. Apikal Meristema ikki xil; kurtak apikal meristemasi (SAM) barglar va gullar kabi organlarni hosil qiladi, ildiz apikal meristemasi (RAM) kelajakda ildiz o'sishi uchun meristematik hujayralarni ta'minlaydi. SAM va RAM xujayralari tezda bo'linadi va noaniq deb hisoblanadi, chunki ular hech qanday aniq belgilangan so'nggi holatga ega emaslar. Shu ma'noda, meristematik hujayralar tez-tez o'xshash xulq-atvori va funktsiyasiga ega bo'lgan hayvonlarning asosiy hujayralari bilan taqqoslanadi. O'simliklar ichida SAM hujayralari umumiy o'sishda va rivojlanishda katta rol o'ynaydi, chunki bu o'simlikning asosiy qismlarini tashkil etuvchi barcha hujayralar o'simtaning apikal meristemasidan (SAM) kelib chiqadi. SAM ichida uch xil muhim maydon mavjud va ular markaziy zona, periferik zona) va qovurg'a meristemasini o'z ichiga oladi. Ushbu sohalarning har biri SAM tarkibida yangi ildiz hujayralarini ishlab chiqarishda muhim ahamiyatga ega. Barcha SAM-lar odatda gumbaz shaklida bo'lib, ular qatlamli bo'lib, tunika va korpus sifatida tavsiflanadi. CLV3 (SAM) Markaziy zona mintaqasida ildiz hujayralari ishlab chiqarilishini tartibga solishda muhim rol o'ynaydi, bu WUSCHEL (WUS) genini targ'ib qiluvchi hujayra uchun ham amal qiladi. Ushbu ikkita genning kombinatsiyasi CLUS3 genini boshqarish orqali ildiz hujayralari ishlab chiqarishini salbiy yoki ijobiy tartibga soluvchi WUS tomonidan hujayralar ishlab chiqarilishini tartibga soladi.;[10][11]

Boshqa o'simliklarning genlari

CLE genlari ko'plab topilgan monokotlar, dikotlar va hatto mox. Tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, guruch kabi ba'zi o'simliklarda ko'p CLE domeni mavjud.[5][7] Genomlarida CLE-ga o'xshash turli xil genlar ham topilgan o'simlik-parazit nematodalar masalan, lavlagi, soya va kartoshka kistasi nematodalari.[12][5][13]

Adabiyotlar

  1. ^ Betsuyaku S, Sawa S, Yamada M (2011). "CLE peptidlarining o'simliklarni rivojlanishidagi funktsiyasi va o'simlik-mikroblarning o'zaro ta'siri". Arabidopsis kitobi. 9: e0149. doi:10.1199 / tab.0149. PMC  3268505. PMID  22303273.
  2. ^ Kondo T, Sawa S, Kinoshita A, Mizuno S, Kakimoto T, Fukuda H, sakagami Y (2006). "Situ MALDI-TOF MS tahlilida aniqlangan CLV3 bilan kodlangan o'simlik peptidi". Ilm-fan. 313 (5788): 845–48. doi:10.1126 / science.1128439. JSTOR  3846935.
  3. ^ Ito Y, Nakanomyo I, Motose H, Ivamoto K, Sawa S, Dohmae N, Fukuda H (avgust 2006). "Dodeca-CLE peptidlari o'simliklarning ildiz hujayralari differentsiatsiyasini bostiruvchi vositalar sifatida". Ilm-fan. 313 (5788): 842–5. doi:10.1126 / science.1128436. PMID  16902140.
  4. ^ Ohyama K, Shinohara H, Ogawa-Ohnishi M, Matsubayashi Y (avgust 2009). "Arabidopsis talianasida ildiz hujayralari taqdirini tartibga soluvchi glikopeptid". Nat. Kimyoviy. Biol. 5 (8): 578–80. doi:10.1038 / nchembio.182. PMID  19525968.
  5. ^ a b v Oelkers K, Goffard N, Vayler GF, Gresshoff PM, Mathesius U, Frickey T (yanvar 2008). "CLE signal beruvchi peptidlar oilasining bioinformatik tahlili". BMC zavodi Biol. 8: 1. doi:10.1186/1471-2229-8-1. PMC  2254619. PMID  18171480.
  6. ^ Miwa H, Tamaki T, Fukuda H, Sawa S (iyun 2009). "CLE signalizatsiyasi evolyutsiyasi: CLV1 va SOL2 / CRN retseptorlari xilma-xilligining kelib chiqishi". O'simlik signallari Behav. 4 (6): 477–81. doi:10.4161 / psb.4.6.8391. PMC  2688290. PMID  19816140.
  7. ^ a b Cock JM, McCormick S (2001 yil iyul). "Gomologiyani CLAVATA3 bilan bo'lishadigan genlarning katta oilasi". O'simliklar fizioli. 126 (3): 939–42. doi:10.1104 / s.126.3.939-bet. PMC  1540125. PMID  11457943.
  8. ^ a b Yamaguchi YL, Ishida T, Sawa S (2016). "CLE peptidlari va ularning o'simlik rivojlanishidagi signalizatsiya yo'llari". J. Exp. Bot. 67 (16): 4813–26. doi:10.1093 / jxb / erw208. PMID  27229733.
  9. ^ Whitford R, Fernandez A, De Groodt R, Ortega E, Hilson P (Noyabr 2008). "Ikki xil funktsional sinfdagi CLE peptidlarini o'simlik sinergik ravishda qon tomir hujayralarining bo'linishini keltirib chiqaradi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 105 (47): 18625–30. doi:10.1073 / pnas.0809395105. PMC  2587568. PMID  19011104.
  10. ^ Brand U, Fletcher JC, Hobe M, Meyerowitz EM, Simon R (2000 yil iyul). "Arabidopsisdagi ildiz hujayralari taqdirining CLV3 faoliyati bilan tartibga solingan teskari aloqaga bog'liqligi". Ilm-fan. 289 (5479): 617–9. doi:10.1126 / science.289.5479.617. PMID  10915624.
  11. ^ Schoof H, Lenhard M, Haecker A, Mayer KF, Yurgens G, Laux T (2000 yil mart). "Arabidopsisning asosiy hujayralari populyatsiyasi CLAVATA va WUSCHEL genlari o'rtasida tartibga soluvchi tsikl bilan ta'minlangan meristemalarni uradi". Hujayra. 100 (6): 635–44. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80700-x. PMID  10761929.
  12. ^ Vang X, Mitchum MG, Gao B, Li C, Diab H, Baum TJ, Xussey RS, Devis EL (mart 2005). "Arabidopsis taliananing CLAVATA3 / ESR (CLE) funktsiyasiga o'xshash o'simlik-parazit nematodadan parazitizm geni". Mol. Pathol o'simlik. 6 (2): 187–91. doi:10.1111 / j.1364-3703.2005.00270.x. PMID  20565649.
  13. ^ Guo Y, Xan L, Xeyms M, Denver R, Klark SE (sentyabr 2010). "CLAVATA2 Arabidopsis ildiz hujayralarining spetsifikatsiyasini tartibga soluvchi alohida CLE-bog'lovchi retseptorlari kompleksini hosil qiladi". O'simlik J. 63 (6): 889–900. doi:10.1111 / j.1365-313X.2010.04295.x. PMC  2974754. PMID  20626648.

Qo'shimcha o'qish