Chilodonella uncinata - Chilodonella uncinata

Chilodonella uncinata
Chilodonella uncinata.jpg
Ilmiy tasnif
Domen:
Eukaryota
(ochilmagan):
Alveolata
Filum:
Ciliophora
Sinf:
Filofaringeya
Buyurtma:
Cirtophorida
Oila:
Chilodonellidae
Tur:
Chilodonella
Turlar:
C. uncinata
Binomial ism
Chilodonella uncinata
(Erenberg, 1838)[1]
Sinonimlar
  • Chilodonella
  • Chilodonella algivora
  • Chilodonella rigida

Chilodonella uncinata a bir hujayrali ning organizmi kirpik sinf alveolalar. Kabi kirpik, C. uncinata bor siliya uning tanasini va ikki yadroli tuzilishini qamrab olgan mikronukleus va makronukleus.[2][3][4][5] Ba'zi boshqa siliyatlardan farqli o'laroq, C. uncinata millionlab o'z ichiga oladi minichromosomalar (somatik xromosomalar ) uning makronukleusida, mikronuklyusi esa 3 ga teng deb taxmin qilinadi xromosomalar. Childonella uncinata ning qo'zg'atuvchisi hisoblanadi Chilodonelloza, chuchuk suv baliqlarining gilzalari va terisiga ta'sir qiladigan kasallik va chivin lichinkasining fakulyativ paraziti bo'lib xizmat qilishi mumkin.

Habitat

Chilodonella uncinata kosmopolit taqsimotiga ega. Sifatida harakat qilishda gumon qilinmoqda fakultativ endoparazit ning lichinkalari Culex, Aedes va Anofellar chivin lichinkasi. U chuchuk suv havzalarida, ko'llarda, daryolar va daryolarda yashaydi, u erda bakteriyalar va boshqa mikroblar bilan oziqlanadi.

Sitologik namunalarning mikroskopik tekshiruvi shuni ko'rsatdiki, tarkibida teri osti chivinlari lichinkasi kistlangan C. uncinata chivin lichinkasida 25-100% o'limga ega edi, ammo hayotiylik tekshiruvlari o'tkazilmadi.[6]

Biologiya va morfologiya

Chilodonella uncinata keng thigmotatic zone bu tana kengligining uchdan ikki qismiga teng va chap tomonga yo'naltirilgan aniq tumshug'i bor.[7] Uni laboratoriya sharoitida emlangan donli bug'doy o'tlari muhitida saqlash mumkin Klebsiella sp. Optimal o'sish 25 dan 30 ° C gacha bo'ladi. C. uncinata qodir sporulyatsiya va ma'lum vaqt davomida cheklangan resurslarga ega bo'lgan muhitga qarshilik ko'rsatishi mumkin.

Genom tuzilishi

Hammasi kirpiklar ikkitasi bor yadrolar, ammo ular somatik yadro tuzilishida farq qiladi. Hammasi kirpiklar bundan mustasno Karyorelictea bo'linadigan makronukleusga ega bo'ling.[8] C. uncinata shuningdek, bo'linadigan makronukleusga ega, ammo u bir yoki ikkitasini o'z ichiga olgan makronukleer xromosomalarini ishlab chiqarish orqali o'zining makronadroviy genomini ona mikronadroviy genomidan o'zgartiradi. ochiq o'qish doirasi (ORF). Ushbu makronuklear xromosomalarning o'rtacha hajmi 4 kbit / s ni tashkil qiladi.[4] Makronukleer xromosomalari, shuningdek, kuchaytirilib, xromosomalar o'rtasida yuqori o'zgaruvchan nusxa sonini hosil qiladi. Masalan, A xromosoma 500 nusxaga ega bo'lishi mumkin, B xromosoma esa makronukleusda atigi 5 nusxaga ega. Bu makronukleer genomini millionlab individual xromosomalarni o'z ichiga oladi telomer tugaydi, faqat bitta ORF va transkripsiyani boshlash uchun majburiy transkripsiya faktori uchun kichik maydon.

Ichki ravishda olib tashlangan ketma-ketliklar

Ichki ravishda olib tashlangan ketma-ketliklar (IES) - kodlanmaydigan mintaqalar mikrob liniyasi ichida topilgan genom Siliatlar. Ular Diploid mikronadroviy genomidan olib tashlangan DNK qismlari sifatida aniqlanadi, ular davomida IES ketma-ketligi o'chirilmasligi mumkin bo'lgan xatolar yuz bergan bo'lsa ham, mikronadroviy genomning nusxasi makronukleer genomiga aylanadi.[2] Ciliate turlari orasida motiflarning ozgina saqlanishi mavjud; ammo, C. uncinata, boshqa siliat turlari singari, tur ichida saqlanib qolgan IES ketma-ketligini ko'rsatadi.[9] IES sekanslari genomda emas, balki siliatda funktsiyaga ega ekanligi noma'lum Parametsium, IES ketma-ketligi shaxsning juftlashish turini aniqlash uchun ishlatiladi. Rivojlanayotgan somatik yadrodan IESning ma'lum bir ketma-ketligi o'chirilmasa, u O tipidagi juftlashuv tipidir. Ammo, agar IES rivojlanayotgan makronukleusdan o'chirilsa, bu E tipidagi juftlashish turi. Parametsium faqat qarama-qarshi juftlik turi bilan juftlashishi mumkin.

Aksincha Tetrahimena yoki Parametsium, bu kuzatilgan C. uncinata oqsillarni kodlovchi bitta gen ichida IES sekanslari boshqa siliatlarga qaraganda ko'proq. Shuningdek, aholisi mavjud C. uncinata boshqa populyatsiyalar ko'tarmaydigan IES ketma-ketligini o'z ichiga olgan.

Ko'paytirish va bo'linish

Chilodonella uncinata uchun jinsiy konjugatsiya mavjud rekombinatsiya, va hujayraning ko'payishi jinssiz bo'linish orqali sodir bo'ladi [4]

Jinsiy konjugatsiya

Kirpiklarda jinsiy va ko'payish alohida.[10] C. uncinata boshqalar bilan juftlashishga qodir C. uncinata bir xil bo'lgan hujayralar juftlashish turi. Keyin juftlashish turi bir-birini to'ldiruvchi, germ-chiziqli yadro meyozga uchraydi va zigotik yadrolarni hosil qiladi. Har bir konjugatsiyalangan hujayra bitta zigotik yadroni zigotik yadrolar birlashadigan boshqa hujayraga o'tkazadi. Diploid jinsiy chiziq yadrosi mitozga uchraydi, bu esa ko'paytirilgan jinsiy chiziq yadrosini hosil qiladi. Ayni paytda somatik yadro parchalanmoqda.

Keyin takrorlangan mikro-chiziqli yadro yangi somatik yadroga aylanadi. Somatik yadroning genomik tuzilishi bitta genli xromosomalar bilan xromosoma parchalanishi va ushbu somatik xromosomalarning kuchayishi bilan yaratilmoqda. Har bir xromosomaning nusxa ko'chirish raqamini nima belgilashi yoki somatik xromosomalarning nusxa ko'chirish raqami jinsiy konjugatsiyalar o'rtasida nasabga ega ekanligi noma'lum.

Jinssiz ko'payish

C. uncinata hujayraning bo'linishi va takrorlanishi uchun jinssiz ko'payish orqali o'tadi amitoz. Sifatida C. uncinata ikkita yadroga ega, u yadrolarning ikki xil bo'linish uslubidan o'tadi. Jinsiy chiziq yadrosi o'tadi mitoz somatik yadro o'tishi paytida jinssiz bo'linish paytida amitoz. Amitoz - bu stoxastik jarayon bo'lib, mitozdan farqli o'laroq, yadro bo'linishida xromosomalarni ajratish uchun shpindel hosil bo'lmaydi. Buning o'rniga somatik yadro ichidagi xromosomalar ko'paytiriladi va yadro ikkilik bo'linish orqali o'tadi. Aniq mexanizmi noma'lum, ammo bo'linadigan somatik yadroning bir tomonida joylashgan somatik xromosomalar bitta qiz hujayraga, yadroning boshqa tomonidagi somatik xromosomalar esa boshqa qiz hujayraga tarqaladi deb ishoniladi.

Ushbu amitotik jarayon ikkita qiz hujayralarni potentsial ravishda bir xil jinsiy hujayralar yadrosiga ega bo'lishiga olib keladi, ammo xromosomalarning nusxa ko'chirish raqamlari bo'yicha boshqa somatik yadroga ega. Somatik yadro transkripsiyada faol bo'lgan yadro bo'lganligi sababli, amitotik jarayon natijasida hosil bo'lgan ushbu somatik nusxa raqami mutatsiyasi alohida hujayralar uchun fitnes oqibatlarini keltirib chiqarishi mumkin.

Genomik tadqiqotlarda foydalaning

Childonella uncinata laboratoriyada osongina o'stiriladi, tez nasl berish vaqtiga ega va bu murakkab genomik tuzilishga imkon beradi C. uncinata bo'lish a model organizm uchun genomik arxitektura, genomik tarmoqlar va genom evolyutsiyasi tadqiqot.[11] Xususan, C. uncinata boshqa yaqin aloqalar bilan birga Siliatlar ning takrorlanish evolyutsiyasini aniqlash uchun ishlatilgan alfa-tubulin gen. Bu aniqlandi C. uncinata ning ikkita paralogini o'z ichiga oladi alfa-tubulin bu erda paraloglar genning uchta kichik sohalarida yuqori darajada konsentratsiyalangan.[12]

Adabiyotlar

  1. ^ Alan Uorren (2010). "Chilodonella uncinata (Erenberg, 1838) ". WoRMS. Dunyo dengiz turlari turlarining reestri. Olingan 20 yanvar, 2012.
  2. ^ a b Zufall, Rebekka A.; Katz, Laura A. (2007). "Ciliate Chilodonella uncinata tarkibidagi tubulin genlarining mikronadroviy va makronuklear shakllari Genomni qayta ishlash va oqsil evolyutsiyasi haqidagi tushunchalarni ochib beradi". Eukaryotik mikrobiologiya jurnali. 54 (3): 275–82. doi:10.1111 / j.1550-7408.2007.00267.x. PMID  17552983.
  3. ^ Makgrat, K. L .; Zufall, R. A .; Katz, L. A. (2006). "Ciliate genom evolyutsiyasi". Katsda Laura A.; Battacharya, Debashish (tahrir). Mikrobial ökaryotlarning genomikasi va evolyutsiyasi. Oksford universiteti matbuoti. 64-77 betlar. ISBN  978-0-19-922905-5.
  4. ^ a b v Preskott, DM (1994). "Kirpikli protozoa DNKsi". Mikrobiologik sharhlar. 58 (2): 233–67. doi:10.1128 / MMBR.58.2.233-267.1994. PMC  372963. PMID  8078435.
  5. ^ Yao, Men-Chao; Dyukarkur, Sandra; Chalker, Duglas L. (2002). "Siliyatlardagi DNKning genom bo'yicha qayta tuzilishi". Kreygda Nensi L. (tahrir). Mobil DNK II. 730-758 betlar. ISBN  978-1-55581-209-6.
  6. ^ Bina Pani Das (2003). "Chilodonella uncinata - chivin lichinkalari uchun patogen bo'lgan protozoa" (PDF). Hozirgi fan. 85 (4): 483–489. Olingan 17 fevral 2011.
  7. ^ Lin, Denis H. (2008). Kirpikli protozoa: adabiyotning tavsifi, tasnifi va qo'llanmasi. Berlin: Springer. p. 183. ISBN  978-1-4020-8238-2.
  8. ^ Katz, LA (2001). "Siliyadagi yadro dualizmi evolyutsiyasi: so'nggi molekulyar ma'lumotlar asosida reanaliz". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 51 (Pt 4): 1587-92. doi:10.1099/00207713-51-4-1587. PMID  11491362.
  9. ^ Chalker, Duglas L.; La-Terza, Antonietta; Uilson, Allison; Kroenke, Kristofer D.); Yao, Men-Chao (1999). "Tetrahymena R o'chirish elementining yonma-yon tartibga soluvchi ketma-ketliklari DNKni qayta tashkil etish chegaralarini belgilaydi". Molekulyar va uyali biologiya. 19 (8): 5631–41. doi:10.1128 / mcb.19.8.5631. PMC  84415. PMID  10409752.
  10. ^ T. Robinson va L. A. Kats (2007). "Kirpikdagi 2 ta sitoskeletal genlar paraloglarining mendeliya bo'lmagan merosi Chilodonella uncinata". Molekulyar biologiya va evolyutsiya. 24 (11): 2495–2503. doi:10.1093 / molbev / msm203. PMID  17890762.
  11. ^ Bahor, KS; Fam, S; Zufall, RA (2013). "Chilodonella uncinata siliyosidagi xromosoma nusxasi sonining o'zgarishi va boshqaruvi". PLOS ONE. 8 (2): e56413. Bibcode:2013PLoSO ... 856413S. doi:10.1371 / journal.pone.0056413. PMC  3577910. PMID  23437129.
  12. ^ Isroil, RL; Kosakovskiy suv havzasi, SL; Muse, SV; Katz, LA (2002). "Siliyalarda takrorlangan alfa-tubulin genlarining evolyutsiyasi". Evolyutsiya; Organik evolyutsiya xalqaro jurnali. 56 (6): 1110–22. doi:10.1554 / 0014-3820 (2002) 056 [1110: eodatg] 2.0.co; 2. PMID  12144013.

Tashqi havolalar