Asosiy oligosakkarid - Core oligosaccharide

Lipopolisakkarid. Yadro ichki va tashqi yadroni o'z ichiga oladi.

Asosiy oligosakkarid (yoki Core-OS) tarkibidagi shakar qoldiqlarining qisqa zanjiri Gram-manfiy lipopolisakkarid (LPS). Core-OS bakterial turlar orasida juda xilma-xildir va hattoki turlarning turlarida ham [1]

Tuzilishi

Asosiy tizim tuzilishi va metabolik yo'llar: dan oligosakkarid Escherichia coli R1.[1] Ichki yadro yashil rangda, tashqi yadro esa ko'k rangda aks etadi.

Asosiy domen har doim to'g'ridan-to'g'ri biriktirilgan oligosakkarid komponentini o'z ichiga oladi lipid A va odatda o'z ichiga oladi shakar kabi geptoza va 3-oksidlovchi-D.-mannooktuloson kislotasi (KDO yoki keto-deoksiyoktulosonat deb ham ataladi).[2] Ko'pgina bakteriyalarning LPS tomirlari tarkibida uglevod bo'lmagan tarkibiy qismlar ham mavjud fosfat, aminokislotalar va etanolamin o'rinbosarlar.

Adabiyotda ko'plab asosiy tuzilmalar tasvirlangan, bu tavsif an'anaviy umumiy tuzilish (topilganidek ichak bakteriyalari va Pseudomonas ). Topilgan tuzilishga umumiy ma'lumot uchun yuqoridagi rasmga qarang E. coli R1.

Ichki yadro

Ichki yadroning "asosi" 1-3 KDO qoldiqlaridan iborat. Oxirgi KDO ko'pincha a bilan o'zgartiriladi fosfat yoki etanolamin guruh. KDOlardan 2-3 ta biriktirilgan geptozlar (ya'ni L-glitsero-D-mannoodatda fosforillanadi). Ushbu KDO va geptozalar "ichki yadro" ni o'z ichiga oladi ketosid bog'lanish KDO va lipid A o'rtasida (a2 → 6) kislota parchalanishiga ayniqsa sezgir. LPS tadqiqotchilari LPS ning lipid va polisakkarid qismlarini ajratish uchun kuchsiz kislota davolash usulidan foydalanadilar.

Faqat lipid A va ichki yadroni o'z ichiga olgan (yoki undan kam) LPS molekulasi. Misolga qarang ) "chuqur qo'pol LPS" deb nomlanadi.

Tashqi yadro

Tashqi yadro yaratilgan geksoza ichki yadrodagi oxirgi geptoza qoldig'iga biriktirilgan qoldiqlar. Ko'pincha tashqi yadroda joylashgan geksozalarga quyidagilar kiradi: D.-glyukoza, D.-mannoz, D.-galaktoza, va boshqalar.. Odatda β1 → 3 ga bog'langan kamida uchta geksoz mavjud, ular bilan Ey antigen uchinchi geksoza bilan bog'langan. Boshqa geksoza ko'pincha asosiy oligomerdan tarvaqaylab, tashqi yadroga bog'langan holda topiladi.

Lipit A va to'liq yadroli oligosakkaridni (ichki va tashqi) o'z ichiga olgan LPS "qo'pol LPS" deb nomlanadi.

Biosintez

Asosiy oligosakkarid sintezida ishtirok etadigan fermentlar orasida saqlanib qolgan Escherichia coli va Salmonella. Pseudomonas aeruginosa ba'zi noyob fermentlarga ega.[3]:273

Funktsiya

Lipopolisakkaridning asosiy oligosakkaridining membrana xatti-harakatiga ta'sir qilish mexanizmi yaxshi tushunilmagan.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Heinrichs DE, Yethon JA, Whitfield C (oktyabr 1998). "Escherichia coli va Salmonella enterica lipopolisaxaridlarining yadro mintaqalarida tarkibiy xilma-xillikning molekulyar asoslari". Molekulyar mikrobiologiya. 30 (2): 221–32. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.01063.x. PMID  9791168.
  2. ^ Hershberger C, Binkley SB (aprel, 1968). "3-deoksi-D-mannooktuloson kislotasining kimyosi va metabolizmi. I. Stereokimyoviy aniqlash". Biologik kimyo jurnali. 243 (7): 1578–84. PMID  4296687.
  3. ^ King JD, Kocíncová D, Westman EL, Lam JS (oktyabr 2009). "Obzor: Pseudomonas aeruginosa tarkibidagi lipopolisakkarid biosintezi". Tug'ma immunitet. 15 (5): 261–312. doi:10.1177/1753425909106436. PMID  19710102.