Tsiklik peptid - Cyclic peptide

a-Amanitin
Bacitratsin
Siklosporin

Tsiklik peptidlar bor polipeptid zanjirlari bog'lanishlarning dumaloq ketma-ketligini o'z ichiga oladi. Bu peptidning amino va karboksil uchlari orasidagi bog'lanish orqali bo'lishi mumkin, masalan siklosporin; amino uchi va yon zanjir o'rtasidagi bog'liqlik, masalan bacitratsin; masalan, karboksil uchi va yon zanjir kolistin; yoki ikkita yon zanjir yoki yanada murakkab tartib, masalan amanitin. Tabiatda ko'plab tsiklik peptidlar kashf etilgan va boshqalar laboratoriyada sintez qilingan. Ularning uzunligi atigi ikkita aminokislota qoldig'idan yuzlabgacha. Tabiatda ular tez-tez mikroblarga qarshi yoki toksikdir; tibbiyotda ular turli xil dasturlarga ega, masalan, antibiotiklar va immunosupressiv vositalar.[1]Yupqa qatlamli xromatografiya (TLC) biologik massadan xom ekstrakt tarkibidagi tsiklik peptidlarni aniqlash uchun qulay usuldir.[2]

Tasnifi

Tsiklik peptidlar halqani o'z ichiga olgan bog'lanish turlari bo'yicha tasniflanishi mumkin.

  • Gomodetik tsiklik peptidlar, masalan siklosporin A, halqa faqat oddiy peptid bog'lanishlaridan iborat bo'lganlardir (ya'ni bitta qoldiqning alfa karboksilining boshqasining alfa aminiga). Bunday turlarning eng kichigi 2,5-diketopiperazinlar,[3] dipeptidning tsikllanishidan kelib chiqadi.
  • Tsiklik izopeptidlar tarkibida kamida bitta alfa amid bo'lmagan bog'lanish mavjud, masalan, mikrosistin va bakitratsin singari bitta qoldiqning yon zanjiri bilan boshqa qoldiqning alfa karboksil guruhiga bog'lanishi.
  • Tsiklik depsipeptidlar, kabi aureobasidin A va HUN-7293, amidlardan biri o'rniga kamida bitta lakton (ester) bog'lanishiga ega. Ba'zi tsiklik depsipeptidlar C-terminal karboksil bilan zanjirdagi Thr yoki Ser qoldiqlarining yon zanjiri o'rtasida siklizlanadi, masalan, kahalalid F, theonellapeptolide va didemnin B.
  • Kabi velosipedlar amanitinlar va falloidinlar odatda ikkala yon zanjir orasidagi ko'prik guruhini o'z ichiga oladi. Amatoksinlarda bu a shaklida hosil bo'ladi sulfoksid Trp va Cys qoldiqlari orasidagi ko'prik. Boshqa bisiklik peptidlarga echinomitsin, triostin A va Selogentin S kiradi.
  • A orqali sikllangan qator bi va monosiklik peptidlar mavjud disulfid birikmasi ikkitasi o'rtasida sisteinlar, oksitotsin taniqli namuna bo'lish.

Biosintez

O'simliklardagi tsiklik peptidlar ikki bosqichli jarayon orqali sintezlanadi; The tarjima chiziqli peptid zanjiri va keyinchalik proteazga o'xshash ferment ta'sirida yoki boshqa usullar bilan tsiklik tuzilishga aylanishi.[4][5][6]

Xususiyatlari va ilovalari

Tsiklik peptidlar ovqat hazm qilish jarayoniga nihoyatda chidamli bo'lib, ularni yangi og'iz dori-darmonlari ustida ishlaydigan olimlar qiziqtiradi.[7]

Bunga misollar:

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Jensen, Knud (2009-09-01). Biyofarmasötik dasturlar uchun peptid va oqsil dizayni. John Wiley & Sons. ISBN  9780470749715.
  2. ^ Venyan, Syu; Jun, Tang; Changjiu, Dji; Venjun, u; Ninghua, Tan (2008). "O'simliklarda siklotidlarni aniqlashda TLC kimyoviy usulini qo'llash". Ilmiy nashr. 53 (11): 1671–1674. doi:10.1007 / s11434-008-0178-8.
  3. ^ Borthwick AD (may 2012). "2,5-Diketopiperazinlar: sintez, reaktsiyalar, dorivor kimyo va bioaktiv tabiiy mahsulotlar". Kimyoviy sharhlar. 112 (7): 3641–3716. doi:10.1021 / cr200398y. PMID  22575049.
  4. ^ Sartarosh, Karla J. S.; Pujara, Pareshkumar T.; Rid, Darvin V.; Chiwocha, Shiela; Chjan, Xaysia; Covello, Patrik S. (2013). "O'simliklar karyofillasi oilasi a'zosidagi chiziqli prekursorlardan tsiklik peptidlarning ikki bosqichli biosintezi serinli proteazga o'xshash ferment tomonidan siklizatsiyani o'z ichiga oladi". Biologik kimyo jurnali. 288 (18): 12500–12510. doi:10.1074 / jbc.M112.437947. PMC  3642298. PMID  23486480.
  5. ^ Venyan Syu; va boshq. (2011). "Ribosomal bo'lmagan peptid sintetazlardan mustaqil ravishda sintez qilingan prekursorlardan siklopeptid ishlab chiqarishning turli mexanizmlari". Acta Biochimica et Biofhysica Sinica. 43 (10): 757–762. doi:10.1093 / abbs / gmr062. PMC  3180235. PMID  21764803.
  6. ^ Venyan Syu; va boshq. "O'simliklar tsiklopeptidlari va mumkin bo'lgan biosintez mexanizmlari". Iqtibos jurnali talab qiladi | jurnal = (Yordam bering)
  7. ^ Devid J. Kreyk (2006 yil 17 mart). "Choksiz oqsillar bo'sh uchlarini bog'lashadi". Ilm-fan. 311 (5767): 1563–7. doi:10.1126 / science.1125248. PMID  16543448.

Tashqi havolalar