Sitoxrom b - Cytochrome b
 | Bu maqola mavzu bilan tanish bo'lmaganlar uchun etarli bo'lmagan kontekstni taqdim etadi. (2009 yil oktyabr) (Ushbu shablon xabarini qanday va qachon olib tashlashni bilib oling) |
 Mitoxondrial sitoxrom bc1 kompleksi | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Belgilar | Cytochrom_B_N | ||||||||
| Pfam | PF00033 | ||||||||
| InterPro | IPR005797 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00171 | ||||||||
| SCOP2 | 3 milliard / QOIDA / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.D.3 | ||||||||
| OPM superfamily | 3 | ||||||||
| OPM oqsili | 3h1j | ||||||||
| CDD | cd00284 | ||||||||
| |||||||||
Sitoxrom b tarkibidagi oqsil mitoxondriya ning ökaryotik hujayralar. Bu qismi sifatida ishlaydi elektron transport zanjiri va transmembrananing asosiy bo'linmasi hisoblanadi sitoxrom bc1 va b6f komplekslar.[1][2]
Funktsiya
Eukaryotlarning mitoxondriyasida va aerobik prokaryotlarda sitoxrom b nafas olish zanjiri murakkab III (EC 1.10.2.2 ) - bc1 kompleksi yoki ubiquinol-sitoxrom c reduktaza deb ham ataladi. O'simliklar xloroplastlari va siyanobakteriyalarida shunga o'xshash oqsil, sitokrom b6, plastokinon-plastosiyanin reduktaza tarkibiy qismi (EC 1.10.99.1 ), shuningdek, b6f kompleksi sifatida ham tanilgan. Ushbu komplekslar elektronlarni tashish, protonlarni harakatga keltiruvchi kuch hosil qilish uchun nasoslarni chiqarishda ishtirok etadi (PMF ). Ushbu proton gradienti avlod hosil qilish uchun ishlatiladi ATP. Ushbu komplekslar hujayralarda muhim rol o'ynaydi.[3]
Tuzilishi
Sitoxrom b / b6[4][5] taxminan 400 ta aminokislota qoldig'idan iborat ajralmas membrana oqsilidir, ehtimol u 8 ta transmembran segmentiga ega. O'simliklar va siyanobakteriyalarda sitoxrom b6 petB va petD genlari tomonidan kodlangan ikkita subbirlikdan iborat. Sitoxrom b / b6 kovalent ravishda ikkitasini bog'laydi heme b562 va b566 deb nomlanuvchi guruhlar. Gistidinning to'rtta saqlanib qolgan qoldiqlari quyidagicha joylashtirilgan ligandlar bu ikki gem guruhining temir atomlaridan iborat.
Filogenetikada foydalaning
Sitoxrom b odatda mintaqa sifatida ishlatiladi mitoxondrial DNK aniqlash uchun filogenetik uning ketma-ketligi o'zgaruvchanligi tufayli organizmlar o'rtasidagi munosabatlar. Bu ichidagi munosabatlarni aniqlashda eng foydali deb hisoblanadi oilalar va avlodlar. Sitoxrom b bilan taqqoslangan tadqiqotlar natijasida yangi tasniflash sxemalari paydo bo'ldi va yangi tavsiflangan turlarni bir turga ajratish hamda evolyutsion aloqalarni chuqurroq anglash uchun foydalanildi.[6]
Klinik ahamiyati
Sitoxrom bdagi mutatsiyalar birinchi navbatda natijaga olib keladi murosasizlik mashqlari odam kasallarida; kamdan-kam hollarda bo'lsa-da, og'ir ko'p tizimli patologiyalar haqida xabar berilgan.[7]
Sitoxrom b ning bitta nuqtali mutatsiyalari Plazmodium falciparum va P. Berghei bezgakka qarshi preparatga qarshilik bilan bog'liq atovaquone.[8]
Inson genlari
Sitoxrom b oqsillarini kodlovchi inson genlariga quyidagilar kiradi.
- CYB5A - A tipidagi sitoxrom b5 (mikrosomal)
- CYB5B - B tipidagi sitoxrom b5 (tashqi mitoxondriyal membrana)
- CYBASC3 - sitoxrom b, askorbatga bog'liq 3
- MT-CYB - mitoxondriyali kodlangan sitoxrom b
Adabiyotlar
- ^ Xauell N (1989 yil avgust). "Proteonli sitokrom b-da oqsil mintaqalarining evolyutsion saqlanishi va ularning oksidlanish-qaytarilish katalizidagi mumkin bo'lgan rollari". J. Mol. Evol. 29 (2): 157–69. Bibcode:1989 yilJMolE..29..157H. doi:10.1007 / BF02100114. PMID 2509716. S2CID 7298013.
- ^ Esposti MD, De Vries S, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A (iyul 1993). "Mitokondriyal sitoxrom b: evolyutsiyasi va oqsilning tuzilishi" (PDF). Biokimyo. Biofiz. Acta. 1143 (3): 243–71. doi:10.1016 / 0005-2728 (93) 90197-N. PMID 8329437.
- ^ Blankenship, Robert (2009). Fotosintezning molekulyar mexanizmlari. Blackwell Publishing. 124-132 betlar.
- ^ Xauell N (1989). "Protonmotiv sitoxrom b-da oqsil mintaqalarining evolyutsion saqlanishi va ularning oksidlanish-qaytarilish katalizidagi mumkin bo'lgan rollari". J. Mol. Evol. 29 (2): 157–169. Bibcode:1989 yilJMolE..29..157H. doi:10.1007 / BF02100114. PMID 2509716. S2CID 7298013.
- ^ Esposti MD, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A, De Vries S (1993). "Mitokondriyal sitoxrom b: evolyutsiyasi va oqsilning tuzilishi" (PDF). Biokimyo. Biofiz. Acta. 1143 (3): 243–271. doi:10.1016 / 0005-2728 (93) 90197-N. PMID 8329437.
- ^ Castresana, J. (2001). "Sitoxrom b Filogeniya va buyuk maymunlar va sutemizuvchilar taksonomiyasi ". Molekulyar biologiya va evolyutsiya. 18 (4): 465–471. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a003825. PMID 11264397.
- ^ Bleykli EL, Mitchell AL, Fisher N, Meunier B, Nijtmans LG, Schaefer AM, Jackson MJ, Turnbull DM, Taylor RW (iyul 2005). "Odamlarda va xamirturushda nafas olish zanjiri fermenti etishmovchiligini keltirib chiqaradigan mitoxondriyal sitoxrom b mutatsiyasi". FEBS J. 272 (14): 3583–92. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.04779.x. PMID 16008558.
- ^ Siregar JE, Syafruddin D, Matsuoka H, Kita K, Marzuki S (iyun 2008). "Mutatsiyaga asoslangan qarshilik Plazmodium bergey sitoxrom b genining xinon bog'lash sohasidagi 2 (Qo (2)) da atovakuonga ". Parazitologiya xalqaro. 57 (2): 229–32. doi:10.1016 / j.parint.2007.12.002. PMID 18248769.
Tashqi havolalar
- Sitoxromlar + b AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasida Tibbiy mavzu sarlavhalari (MeSH)