Sitoxrom b5 - Cytochrome b5

Sitoxrom b5
CytB5 1icc.png
Sitoxrom B5 (kalamush) unga bog'langan kofaktor. Haem qora rangda, temir to'q sariq va temir bilan bog'langan histidin tayoq sifatida ko'rsatilgan qoldiqlar. (PDB: 1ICC​)
Identifikatorlar
BelgilarCYB5A
Alt. belgilarCYB5
NCBI geni1528
HGNC2570
OMIM250790
PDB1JEX
RefSeqNM_001914
UniProtP00167
Boshqa ma'lumotlar
LokusChr. 18 q23
Sitoxrom b5
Identifikatorlar
BelgilarCyt_B5
PfamPF00173
InterProIPR001199
PROSITEPDOC00170
Membranom211

Sitoxromlar b5 hamma joyda mavjud elektron transport gemoproteinlar ichida topilgan hayvonlar, o'simliklar, qo'ziqorinlar va binafsha rangli fototrofik bakteriyalar. The mikrosomal va mitoxondrial variantlari membrana bilan bog'langan, bakterial esa eritrotsitlar va boshqalar hayvon to'qimalari suvda eriydi. Sitoxrom oilasi b5o'xshash oqsillarga (sitoxromdan tashqari) kiradi b5 o'zi) flavotsitoxrom sitoxromidagi boshqa oksidlanish-qaytarilish domenlari bilan kovalent ravishda bog'langan gemoprotein domenlari b2 (L-aktakt dehidrogenaza; EC 1.1.2.3 ), sulfit oksidaza (EC 1.8.3.1 ), o'simlik va qo'ziqorin nitrat reduktazalari (EC 1.7.1.1, EC 1.7.1.2, EC 1.7.1.3 ) va o'simlik va zamburug'li sitoxrom b5/ asil lipid desaturaza termoyadroviy oqsillari.

Tuzilishi

Bir qator sitoxromning 3-o'lchovli tuzilmalari b5 xamirturushli flavotsitoxrom b2 ma'lum. Qatlam a + b sinfiga tegishli bo'lib, b varag'ining har ikki tomonida ikkita hidrofob yadro mavjud. Kattaroq gidrofob yadro, har tomondan burilish bilan bog'langan juft spiral bilan yopilgan holda, gemni bog'laydigan cho'ntakni tashkil qiladi. Kichikroq hidrofob yadro faqat strukturaviy rolga ega bo'lishi mumkin va fazoviy ravishda yaqin N-terminal va C-terminal segmentlari tomonidan hosil bo'ladi. Ikki histidin qoldiqlar beshinchi va oltinchi gem ligandlarini ta'minlaydi va gem guruhining propionat qirrasi gem yorig'i ochilishida yotadi. Sitoxromning ikkita izomerlari b5, A (major) va B (minor) shakllari deb ataladigan, gemning a- va b-meso uglerodlari bilan belgilangan o'qi atrofida 180 ° burilishi bilan farq qiladi.

Sitoxrom b5 ba'zi biokimyoviy reaktsiyalarda

EC 1.6.2.2 sitoxrom-b5 reduktaza

NADH + H+ + 2 ferritxitrom b5 → NAD+ + 2 ferrotsitoxrom b5

EC 1.10.2.1 L-askorbat - sitoxrom-b5 reduktaza

L-askorbat + ferritsitrom b5 → monodehidroaskorbat + ferrotsitoxrom b5

EC 1.14.18.2 CMP-N-atsetilneuraminat monooksigenaza

CMP-N-atsetilneuraminat + 2 ferrotsitoxrom b5 + O2 + 2 H+ → CMP-N-glikoloilneuraminat + 2 ferritsitrom b5 + H2O

EC 1.14.19.1 stearoyl-CoA 9-desaturaza

stearoyl-CoA + 2 ferrotsitoxrom b5 + O2 + 2 H+ → oleoyl-CoA + 2 ferritsitrom b5 + H2O

EC 1.14.19.3 linoleoyl-CoA 9-desaturaza

linoleoyl-CoA + 2 ferrotsitoxrom b5 + O2 + 2 H+ → b-linolenoyl-CoA + 2 ferritsitrom b5 + H2O

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  • Lederer F (1994). "Sitokrom b5 marta: moslashuvchan modul". Biochimie. 76 (7): 674–92. doi:10.1016/0300-9084(94)90144-9. PMID  7893819.
  • Napier JA, Michaelson LV, Sayanova O (2003 yil fevral). "Ko'p to'yinmagan yog 'kislotalarini sintez qilishda sitoxrom b5 sintez desaturazalarining roli". Prostaglandinlar, leykotrienlar va ajralmas yog 'kislotalari. 68 (2): 135–43. doi:10.1016 / S0952-3278 (02) 00263-6. PMID  12538077.
  • Rivera M, Barillas-Mury S, Kristensen KA, Little JW, Uells MA, Walker FA (dekabr 1992). "Genlarning sintezi, bakterial ekspresiyasi va kalamush tashqi mitoxondriyal membranasi sitoxromi B5 ning 1H NMR spektroskopik tadqiqotlari". Biokimyo. 31 (48): 12233–40. doi:10.1021 / bi00163a037. PMID  1333795.
  • Schenkman JB, Jansson I (2003 yil fevral). "B5 sitoxromining ko'plab rollari". Farmakologiya va terapiya. 97 (2): 139–52. doi:10.1016 / S0163-7258 (02) 00327-3. PMID  12559387.

Tashqi havolalar

  • PDB: 1B5A- Sichqoncha sitoxromining eritma tuzilishi b5 (A shakli)
  • PDB: 1B5B- Sichqoncha sitoxromining eritma tuzilishi b5 (B shakli)
  • PDB: 1CXY- Sitoxromning rentgen tuzilishi b558 dan Ectothiorhodospira vacuolata
  • Insonda Onlayn Mendelian merosi (OMIM): 250790 - Sitoxrom etishmovchiligi sababli methemoglobinemiya b5