Darobaktin - Darobactin

Darobaktin
Identifikatorlar
3D model (JSmol )	Interaktiv rasm;
	InChI InChI = 1S / C47H55N11O12 / c48-13-5-9-25-23-11-12-30-27 (15-23) 28 (19-51-30) 40-39 (58-42 (63) 31) 17-36 (50) 61) 53-41 (62) 29 (49) 16-24-18-52-37-26 (24) 8-4-10-35 (37) 70-40) 46 (67) 56-34 (21-60) 44 (65) 57-38 (25) 45 (66) 55-33 (20-59) 43 (64) 54-32 (47 (68) 69) 14-22-6- 2-1-3-7-22 / h1-4,6-8,10-12,15,18-19,25,29,31-34,38-40,51-52,59-60H, 5, 9,13-14,16-17,20-21,48-49H2, (H2,50,61) (H, 53,62) (H, 54,64) (H, 55,66) (H, 56) , 67) (H, 57,65) (H, 58,63) (H, 68,69) / t25-, 29-, 31-, 32-, 33-, 34-, 38-, 39-, 40 + / m0 / s1 Kalit: IAOIRKWNLBCFFO-KUDSBEMESA-N;
	Jilmayganlar NCCC [C @@ H] 1 [C @ H] (bosimining ko'tarilishi (= O) [C @ H] (CO) bosimining ko'tarilishi (= O) [C @ H] 2NC (= O) [C @ H] (CC () N) = O) bosimining ko'tarilishi (= O) [C @@ H] (N) CC3 = CNC4 = C3C = CC = C4O [C @@ H] 2C2 = CNC3 = CC = C1C = C23) C (= O) N [C @@ H] (CO) C (= O) N [C @@ H] (CC1 = CC = CC = C1) C (O) = O;
Xususiyatlari
Kimyoviy formulalar	C47H55N11O12
Molyar massa	966.022 g · mol−1
	Boshqacha ko'rsatilmagan hollar bundan mustasno, ulardagi materiallar uchun ma'lumotlar berilgan standart holat (25 ° C [77 ° F], 100 kPa da).
	Infobox ma'lumotnomalari

Darobaktin eksperimental hisoblanadi antibiotik qarshi samarali bo'lishi mumkin bo'lgan birikma Gram-manfiy bakteriyalar. Agar u odamga mos keladigan shaklga aylantirilsa, u birinchi bo'lib hayvondan paydo bo'ladi mikrobiom.^[1]

Tarix

Murakkab ichida topilgan Fotorhabdus hazm qilish tizimida yashovchi 2019 yilda bakteriyalar entomopatogen nematodalar.^[2] Tadqiqotchilar nematodani mumkin bo'lgan xost sifatida aniqladilar, chunki ular ovqatlanadilar hasharotlar ularni maqsad qilib lichinkalar va keyinchalik odamlarda uchraydigan patogenlar bilan to'qnashadigan bakteriyalarni chiqarish.^[1]

Eksperimentlarda u sichqonchani yuqtirish bilan davolashdi Escherichia coli va Klebsiella pnevmoniyasi, ikkala a'zosi Enterobakteriyalar, toksik nojo'ya ta'sirlarsiz.^[1]

Gram-manfiy bakteriyalar

Gram-manfiy bakteriyalar hujayra konvertlari uchun xarakterli arxitekturaga ega, ichki membranasi bilan, an tashqi membrana, va ularning orasidagi periplazmik bo'shliq. Ushbu tartibda peptidoglikan qatlam nisbatan ingichka va tarkibida ishlatilgan kristal binafsha binoni saqlamaydi Gramlarni bo'yash usuli bakterial tasniflash. Antibiotiklarga qarshilik bakterial patogenlarda keng tarqaldi va Enterobacteriaceae kabi grammusbat bakteriyalarda bularning ko'pi sotib olingan genlarga to'g'ri keladi. Qarshilik genlari eksport qiluvchi yoki zararsizlantiradigan oqsillarni kodlaydi b-laktam antibiotiklari, aminoglikozidlar, tetratsiklin, levomitsetin, fosfomitsin, va boshqalar. Plazmidlar ushbu genlarni olib yurish shtammlar orasida yoki turlar orasida osonlikcha harakat qiladi. Binobarin, hozirda mavjud bo'lgan tasdiqlangan antibiotiklar paneliga qarshilik tobora xavotirga soladigan muammo hisoblanadi.^[1] Ushbu bakteriyalarga qarshi samarali bo'lgan so'nggi antibiotiklar klassi 1960 yillarda paydo bo'lgan.^[2]

Faoliyat tartibi

Darobaktin inhibe qiladi BamA va Gram-manfiy hujayra konvertining to'g'ri shakllanishini buzadi.^[2] BamA - BamABCDE kompleksining markaziy komponenti, tarkibiga oqsillarni qo'shadi periplazma tashqi membranaga. BamA tashqi membrana bilan bog'langan oqsillarning katlanishiga ham yordam beradi. Shunday qilib, darobaktin bakteriyalarning tashqi membranasini to'g'ri shakllanishiga to'sqinlik qiladi va hujayralar o'limiga olib keladi.^[1] Faqat Gram-manfiy bakteriyalarda BamA va tashqi membrana beta-barrel oqsillari bo'lganligi sababli, ular faqat darobaktinga sezgir.

Biosintez

Darobaktin - bu RiPP, ya'ni a ribosomal sintez qilingan va tarjimadan keyin o'zgartirilgan peptid. Uning ishlab chiqarilishi va eksporti odatda jim beshta gen tomonidan kodlanadi operon laboratoriya madaniyati sharoitida minimal ishlab chiqarishni ko'rsatdi. Yetuk darobaktin yettitadan iborat aminokislotalar Trp-1-dan Trp-3gacha va Trp-3-dan Lys-5gacha (yoki Arg-5, variant shakllarida) o'zaro bog'liqlik bilan uzoqroq kashshofdan olingan yadro peptidi. ^[2] Kalit ferment kashshofdan etuk shaklga etishish uchun radikal SAM / DarE SPAZM fermenti.

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ^d ^e Nild, Devid (2019 yil 24-noyabr). "Antibiotikni olib yuradigan kichkina qurt topildi, bu bizga supero'tkazuvchilar bilan kurashishda yordam beradi". ScienceAlert. Olingan 2019-11-26.
^ ^a ^b ^v ^d Imay, Yu; Meyer, Kirsten J .; Iinishi, Akira; Favr-Godal, Kventin; Yashil, Robert; Manuse, Sylvie; Kaboni, Mariyaelena; Mori, Miho; Nil, Samanta; Giglieri, Megan; Honrao, Chandrashekhar (2019-11-20). "Yangi antibiotik Gram-manfiy patogenlarni tanlab o'ldiradi". Tabiat: 1–1. doi:10.1038 / s41586-019-1791-1. ISSN 1476-4687. PMC 7188312.

[:0-1] v ^d ^e Nild, Devid (2019 yil 24-noyabr). "Antibiotikni olib yuradigan kichkina qurt topildi, bu bizga supero'tkazuvchilar bilan kurashishda yordam beradi". ScienceAlert. Olingan 2019-11-26.

[:1-2] v ^d Imay, Yu; Meyer, Kirsten J .; Iinishi, Akira; Favr-Godal, Kventin; Yashil, Robert; Manuse, Sylvie; Kaboni, Mariyaelena; Mori, Miho; Nil, Samanta; Giglieri, Megan; Honrao, Chandrashekhar (2019-11-20). "Yangi antibiotik Gram-manfiy patogenlarni tanlab o'ldiradi". Tabiat: 1–1. doi:10.1038 / s41586-019-1791-1. ISSN 1476-4687. PMC 7188312.

[1]

[2]

Identifikatorlar

3D model (JSmol )	Interaktiv rasm
InChI InChI = 1S / C47H55N11O12 / c48-13-5-9-25-23-11-12-30-27 (15-23) 28 (19-51-30) 40-39 (58-42 (63) 31) 17-36 (50) 61) 53-41 (62) 29 (49) 16-24-18-52-37-26 (24) 8-4-10-35 (37) 70-40) 46 (67) 56-34 (21-60) 44 (65) 57-38 (25) 45 (66) 55-33 (20-59) 43 (64) 54-32 (47 (68) 69) 14-22-6- 2-1-3-7-22 / h1-4,6-8,10-12,15,18-19,25,29,31-34,38-40,51-52,59-60H, 5, 9,13-14,16-17,20-21,48-49H2, (H2,50,61) (H, 53,62) (H, 54,64) (H, 55,66) (H, 56) , 67) (H, 57,65) (H, 58,63) (H, 68,69) / t25-, 29-, 31-, 32-, 33-, 34-, 38-, 39-, 40 + / m0 / s1 Kalit: IAOIRKWNLBCFFO-KUDSBEMESA-N
Jilmayganlar NCCC [C @@ H] 1 [C @ H] (bosimining ko'tarilishi (= O) [C @ H] (CO) bosimining ko'tarilishi (= O) [C @ H] 2NC (= O) [C @ H] (CC () N) = O) bosimining ko'tarilishi (= O) [C @@ H] (N) CC3 = CNC4 = C3C = CC = C4O [C @@ H] 2C2 = CNC3 = CC = C1C = C23) C (= O) N [C @@ H] (CO) C (= O) N [C @@ H] (CC1 = CC = CC = C1) C (O) = O
Xususiyatlari
Kimyoviy formulalar	C₄₇H₅₅N₁₁O₁₂
Molyar massa	966.022 g · mol⁻¹
Boshqacha ko'rsatilmagan hollar bundan mustasno, ulardagi materiallar uchun ma'lumotlar berilgan standart holat (25 ° C [77 ° F], 100 kPa da).
Infobox ma'lumotnomalari