Gefirin - Gephyrin - Wikipedia

GPHN
Protein GPHN PDB 1ihc.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarGPHN, GEPH, GPH, GPHRYN, HKPX1, MOCODC, gefirin
Tashqi identifikatorlarOMIM: 603930 MGI: 109602 HomoloGene: 10820 Generkartalar: GPHN
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 14 (odam)
Chr.Xromosoma 14 (odam)[1]
Xromosoma 14 (odam)
Genomic location for GPHN
Genomic location for GPHN
Band14q23.3-q24.1Boshlang66,507,407 bp[1]
Oxiri67,181,803 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE GPHN 220773 s at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

10243

268566

Ansambl

ENSG00000171723

ENSMUSG00000047454

UniProt

Q9NQX3

Q8BUV3

RefSeq (mRNA)

NM_145965
NM_172952

RefSeq (oqsil)

NP_666077
NP_766540

Joylashuv (UCSC)Chr 14: 66.51 - 67.18 MbChr 12: 78.23 - 78.68 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Gefirin a oqsil odamlarda kodlanganligi GPHN gen.[5][6][7][8][9]

Ushbu gen neyronlarning birikmasini kodlaydi oqsil bu langarlarni inhibe qiladi neyrotransmitter postsinaptik sitoskeletga retseptorlari retseptorlari subbirligi domeniga yuqori yaqinlik bilan bog'lanish orqali va tubulin dimerlar. Nöronal bo'lmagan to'qimalarda, shuningdek, kodlangan protein talab qilinadi molibden kofaktor biosintezi. Ushbu gendagi mutatsiyalar nevrologik holat bilan bog'liq bo'lishi mumkin giperekpleksiya va shuningdek, olib keladi molibden kofaktorining etishmasligi.

Gen

Turli xil izoformlarni kodlovchi ko'plab muqobil ravishda biriktirilgan transkript variantlari tavsiflangan; ammo, barcha transkript variantlarining to'liq metrajli xususiyati hozircha ma'lum emas.[8] Ishlab chiqarish muqobil ravishda qo'shilgan variantlar ta'sir qiladi kodlash gen doirasidagi mintaqalar. "Yin-yang" kodlamaydigan ketma-ketlik juftligi o'z ichiga oladi gefirin aniqlandi.[10] Ushbu ketma-ketliklar bir-biriga qarama-qarshi bo'lib, yuzlab xilma-xil nukleotid holatlaridan iborat. Ushbu ikkala naqsh ham noyob insoniyatdir va ularning ajdodlari DNK naqshidan ajralib chiqqandan so'ng tez rivojlangan. The gefirin yin va yang ketma-ketliklari bugungi kunda har qanday asosiy nasabni ifodalovchi populyatsiyalarda keng tarqalgan.

Funktsiya

Gefirin 93kDa ko'p funktsionaldir oqsil bu postsinaptik oqsillar tarmog'ining tarkibiy qismi inhibitiv sinapslar. U 3 dan iborat domenlar: N terminal G domeni, C terminal E domeni va ikkalasini bog'laydigan katta tuzilmaydigan bog'lovchi domeni. Trimerik G va dimerik E domenlari uchun tuzilmalar mavjud bo'lishiga qaramay, to'liq uzunlikdagi oqsil uchun hech qanday tuzilma mavjud emas, bu oqsilni kristallanishini qiyinlashtiradigan katta tuzilmagan mintaqaga bog'liq bo'lishi mumkin. Ammo yaqinda to'liq uzunlikdagi gefirinni o'rganish kichik burchakli rentgen nurlari asosan trimmerlar hosil qilishini va uzoq bog'lovchi mintaqasi tufayli u ixcham holatda yoki ikkita kengaytirilgan holatning birida mavjud bo'lishini ko'rsatadi.[11]

Ijobiy antikorlarni bo'yash chunki gefirin uchun sinaps ko'pincha mavjud bo'lishiga mos keladi glitsin va / yoki GABAA retseptorlari. Shunga qaramay, ba'zi bir istisnolar kabi bo'lishi mumkin neyronlar ning Dorsal ildiz ganglionlari mavjudligiga qaramay, gefirin yo'q GABAA retseptorlari.[9] Gefirin inhibitiv sinapslarda asosiy iskala oqsili hisoblanadi, vazifasiga o'xshash PSD-95 da glutamaterjik sinapslar.[12][13] Gefirin uning bilan o'zaro ta'sirida aniqlandi glitsin retseptorlari, orqa miya va miya sopi ichidagi inhibitor sinapslarning asosiy retseptorlari oqsillari. Glisin retseptorlari bilan o'zaro ta'siridan tashqari, yaqinda nashr etilgan nashrlar gefirinning GABA ning alfa va beta bo'linmalarining transmembran spirallari TM3 va TM4 orasidagi hujayra ichidagi halqa bilan ham o'zaro aloqada ekanligini ko'rsatdi.A retseptorlari.[14]

Gefirin GABA retseptorlarini GABARAP /P130 murakkab, keyin retseptorlarni sinapsga olib keladi.[15] Sinapsda bir marta oqsil bog'lanadi kollibistin[16] va neyroligin 2.[17] Hujayralarda gefirin hosil bo'ladi oligomerlar kamida uchta bo'linmaning. Bir nechta qo'shilish variantlari retseptorlari yaqinligiga ta'sir qilmasdan, bu oligomerizatsiyani oldini oluvchi tavsiflangan. Ular shunga qaramay, inhibitor sinapslarning tarkibiga ta'sir qiladi va hatto epilepsiya kabi kasalliklarda ham rol o'ynashi mumkin.[18]

Gefirin oqsilini kiritish uchun ham talab qilinadi molibden ichiga molibdopterin.[19]

Yuqorida aytib o'tilganidek, gefirin ham Moko biosintezining terminal ikki bosqichini katalizlaydi. Oldingi bosqichda N-terminalli G domeni molibdopterinning apo shaklini adenillatib, oraliq adenillangan molibdopterinni hosil qiladi. Terminal bosqichida C-terminal E domeni dedenilatsiyani va shuningdek, metall kiritish mexanizmini katalizlaydi.

Klinik ahamiyati

Odamlar bilan temporal epilepsiya vaqtinchalik loblarida anormal darajada past darajadagi gefirin borligi aniqlandi.[20] Hayvon modellarida umuman gefirin etishmovchiligi mushaklarning qattiqlashishiga va tug'ilishdan so'ng darhol o'limga olib keladi. Qattiq mushaklar ham simptomdir qo'rqinchli kasallik, bu gefirin genidagi mutatsiyadan kelib chiqishi mumkin. Agar odam gefiringa qarshi avtomatik antikorlarni ishlab chiqaradigan bo'lsa, bu hatto natijaga olib kelishi mumkin qattiq odam sindromi.[18]

Yin-yang ketma-ketliklari

Insonni o'z ichiga olgan Yin-yang DNK sekanslari gefirin gen. Yin-yang haplotiplari DNKning tarqalishi rivojlanib, ikkita divergent shaklni hosil qilishda paydo bo'ladi. Ushbu rasmda sakkizta global populyatsiyadagi 934 kishi uchun gefirin markazida joylashgan genomik mintaqadagi ~ 1000 marker holatlari ko'rsatilgan. Odamlar juft xromosomalarni olib yuradilar, shuning uchun har bir kishi ikkita nusxadan ega gefirin gen. Yin-yang mintaqasidagi quyuq ko'k va qizil gorizontal chiziqlar navbati bilan ikki yin va ikkita yang haplotiplarini olib yuruvchi shaxslarni, och ko'k esa yin va yang haplotiplarini olib yuruvchi shaxslarni anglatadi.

Insoniyat tarixining bir qismida DNKning ketma-ketligi mavjud edi gefirin Bu ikkiga bo'lingan va ikki xil evolyutsion yo'lni bosib o'tgan.[10] Ushbu turdagi bo'linishlar ikkita populyatsiya bir-biridan ajratilib qolganda yoki xromosoma mintaqasi bo'lmaganda yuz berishi mumkin. rekombinatsiya voqealar. Ajdodlar ketma-ketligidan ajralib chiqqan ikkita ketma-ketlik har biri keyinchalik keng tarqalgan yuzdan ortiq mutatsiyaga ega bo'ldi. Bu nisbatan qisqa vaqt ichida evolyutsion miqyosda sodir bo'ldi, chunki yuzlab mutatsiyalar odamlarning Osiyodagi ko'chishidan oldin alohida "yin" va "yang" ketma-ketliklarida o'rnatildi. Xabar qilinishicha, hozirgi vaqtda osiyoliklar deyarli teng miqdordagi yin va yang ketma-ketliklarini va har bir asosiy insoniyat nasabini ifodalovchi global populyatsiyani yin va yang qatorlariga ega.[10] Ushbu ulkan yin-yang naqshining mavjudligi shuni ko'rsatadiki, insoniyat tarixi davomida butunlay bir-biridan ajralib turadigan ikkita evolyutsion yo'l jadal rivojlanib, taxminlarga ko'ra tartibga solishni kuchaytirish bo'yicha umumiy maqsadga erishilgan. gefirin.

O'zaro aloqalar

GPHN ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan Rapamitsinning sutemizuvchilar maqsadi[6] va ARHGEF9.[16]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000171723 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000047454 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Oldin P, Shmitt B, Grenningloh G, Pribilla I, Multhaup G, Beyreuter K, Maulet Y, Verner P, Langosch D, Kirsch J (Iyul 1992). "Gefirinning taxminiy glitsin retseptorlari-tubulin bog'lovchi oqsili, asosiy tuzilishi va qo'shilishning muqobil variantlari". Neyron. 8 (6): 1161–70. doi:10.1016/0896-6273(92)90136-2. PMID  1319186.
  6. ^ a b Sabatini DM, Barrow RK, Blackshaw S, Burnett PE, Lay MM, Field ME, Bahr BA, Kirsch J, Betz H, Snayder SH (iyun 1999). "RAFT1ning rapamitsinga sezgir signalizatsiyasi uchun zarur bo'lgan gefirin bilan o'zaro ta'siri". Ilm-fan. 284 (5417): 1161–4. doi:10.1126 / science.284.5417.1161. PMID  10325225.
  7. ^ Fritschy JM, Harvey RJ, Shvarts G (may 2008). "Gefirin: qaerda turamiz, qayerga boramiz?". Neurosci tendentsiyalari. 31 (5): 257–64. doi:10.1016 / j.tins.2008.02.006. PMID  18403029.
  8. ^ a b "Entrez Gen: GPHN gefirin".
  9. ^ a b Lorenzo LE, Godin AG, Vang F, Sent-Luis M, Carbonetto S, Wiseman PW, Ribeiro-da-Silva A, De Koninck Y (iyun 2014). "Gefirin klasterlari GABA mavjudligiga qaramay kichik diametrli birlamchi afferent terminallarda mavjud emasA Retseptorlar ". J. Neurosci. 34 (24): 8300–17. doi:10.1523 / JNEUROSCI.0159-14.2014. PMC  6608243. PMID  24920633.
  10. ^ a b v Climer S, Templeton AR, Zhang V (2015). "Inson gefirini ulkan funktsional kodlashmaydigan yin-yang ketma-ketliklariga kiradi". Tabiat aloqalari. 6: 6534. doi:10.1038 / ncomms7534. PMC  4380243. PMID  25813846. Xulosa – ScienceDaily.
  11. ^ Sander B, Tria G, Shkumatov AV, Kim EY, Grossmann JG, Tessmer I, Svergun DI, Shindelin H (oktyabr 2013). "Gefirinning AFM va SAXS tomonidan strukturaviy tavsifi ixcham va kengaytirilgan holatlarning aralashmasini ochib beradi". Acta Crystallographica bo'limi D. 69 (Pt 10): 2050-60. doi:10.1107 / S0907444913018714. PMID  24100323.
  12. ^ Giesemann T, Schwarz G, Nawrotzki R, Berhörster K, Rothkegel M, Schlüter K, Schrader N, Schindelin H, Mendel RR, Kirsch J, Jockusch BM (sentyabr 2003). "Gefirin, profilin va Mena postsinaptik iskala oqsillari o'rtasida kompleks shakllanish: mikrofilament tizimiga bog'lanish". J. Neurosci. 23 (23): 8330–9. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-23-08330.2003. PMC  6740687. PMID  12967995.
  13. ^ Ehrensperger MV, Hanus C, Vannier C, Triller A, Dahan M (may 2007). "SPT tahlilida aniqlangan glitsin retseptorlari va gefirin o'rtasida ko'plab bog'liqlik holatlari". Biofiz. J. 92 (10): 3706–18. doi:10.1529 / biophysj.106.095596. PMC  1853151. PMID  17293395.
  14. ^ Maric HM, Mukherjee J, Tretter V, Moss SJ, Schindelin H (dekabr 2011). "Gefirin vositachiligida b-aminobutirik kislota A turi va glitsin retseptorlari klasteri umumiy bog'lanish joyiga tayanadi". J. Biol. Kimyoviy. 286 (49): 42105–14. doi:10.1074 / jbc.M111.303412. PMC  3234978. PMID  22006921.
  15. ^ Thiriet, Marc (2013). Qon aylanish va shamollatish tizimidagi hujayra ichidagi signalizatsiya vositachilari. Nyu-York, Nyu-York: Springer Nyu-York. p. 605. ISBN  978-1-4614-4370-4.
  16. ^ a b Kins S, Betz H, Kirsch J (2000 yil yanvar). "Kollibistin, yangi aniqlangan miyaga xos GEF, gefirinning submembran klasterini keltirib chiqaradi". Nat. Neurosci. 3 (1): 22–9. doi:10.1038/71096. PMID  10607391.
  17. ^ Poulopoulos A, Aramuni G, Meyer G, Soykan T, Xun M, Papadopulos T, Jang M, Paarmann I, Fuchs S, Xarvi K, Jedlicka P, Shvartsaxer SW, Betz H, Harvi RJ, Brose N, Chjan V, Varoka F (Sentyabr 2009). "Neyroligin 2 gefirin va kollibistin orqali perizomatik inhibitor sinapslarda postsinaptik birikmani boshqaradi". Neyron. 63 (5): 628–42. doi:10.1016 / j.neuron.2009.08.023. PMID  19755106.
  18. ^ a b Tretter V, Mukherjee J, Maric HM, Schindelin H, Sieghart V, Moss SJ (2012). "Gefyrin, GABAergik sinapslarning sirli tashkilotchisi". Old hujayra neyroschi. 6: 23. doi:10.3389 / fncel.2012.00023. PMC  3351755. PMID  22615685.
  19. ^ Reiss J, Jonson JL (iyun 2003). "Molibden kofaktor biosintetik MOCS1, MOCS2 va GEPH genlaridagi mutatsiyalar". Hum. Mutat. 21 (6): 569–76. doi:10.1002 / humu.10223. PMID  12754701.
  20. ^ Fang M, Shen L, Yin H, Pan YM, Van L, Chen D, Xi ZQ, Xiao Z, Vang XF, Chjou SN (oktyabr 2011). "Odamlarda vaqtinchalik lob epilepsiya neyronlarida gefirinni regulyatsiyasi va kalamush modeli". Sinaps. 65 (10): 1006–14. doi:10.1002 / syn.20928. PMID  21404332.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar