KIAA1958 - KIAA1958 - Wikipedia

KIAA1958
Identifikatorlar
TaxalluslarKIAA1958
Tashqi identifikatorlarOMIM: 617390 HomoloGene: 136743 Generkartalar: KIAA1958
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 9 (odam)
Chr.Xromosoma 9 (odam)[1]
Xromosoma 9 (odam)
KIAA1958 uchun genomik joylashuv
KIAA1958 uchun genomik joylashuv
Band9q32Boshlang112,486,847 bp[1]
Oxiri112,669,397 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001287036
NM_001287038
NM_133465

n / a

RefSeq (oqsil)

NP_001273965
NP_001273967
NP_597722

n / a

Joylashuv (UCSC)Chr 9: 112.49 - 112.67 Mbn / a
PubMed qidirmoq[2]n / a
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash

KIAA1958 oqsillari a oqsil odamlarda KIAA1958 tomonidan kodlangan gen.[3] Ortologlar KIAA1958 ning evolyutsiyasi juda orqada akkordatlar ammo, homologiyada unga yaqinroq primatlar boshqa har qanday ortologlardan ko'ra. KIAA1958 noma'lum paraloglar.

Gen

KIAA1958 ning uzun qo'lida joylashgan 9-xromosoma (9.q32) odamlarda 115249248 dan 115427597 gacha bo'lgan ortiqcha yo'nalishda.[4] Uning mRNKsi 2683 bp.[3] Gen 9-xromosomada ushbu qo'shnilarga ega:

KIAA1958 gen qo'shnilari

HSDL2: gidroksisteroid dehidrogenaza o'xshash oqsil 2 rol o'ynaydi nukleotid majburiy, oksidoreduktaza faoliyati va sterol majburiy.[5]

C9orf147: 9-xromosoma ochiq o'qish doirasi 147 noma'lum funktsiyaga ega.[6]

C9orf80: 9-chi xromosoma o'qish doirasi SOSS kompleksining tarkibiy qismi bo'lib, MRN kompleksining quyi qismida harakatlanadigan ko'p proteinli kompleks DNKni tiklash va G2 /M nazorat punkti. SOSS kompleksi DNK zararlanganda bitta zanjirli DNK bilan bog'lanib, hujayradagi turli xil so'nggi nuqtalarga ta'sir qiladi. DNKning shikastlanishi javob, shu jumladan hujayra siklini tekshirish punkti faollashtirish, rekombinatsion ta'mirlash va genomik barqarorlikni saqlash.[7]

SNX30: Nexin-30 ni saralash bilan bog'liq bo'lishi mumkin fosfatidilinozitol majburiy.[8]

Ifoda

KIAA1958 eng yuqori miqdorlarda ifodalangan gırtlak EST tomonidan taklif qilinganidek.[9] Ichida eng yuqori ifoda rivojlanish bosqichi bo'ladi blastokist va sog'liq holati uchun bu eng ko'p topilgan bachadon o'smalari.[9]NCBI GEO profilidagi ma'lumotlar[10] shuni ko'rsatadiki, KIAA1958 ekspressioni inson tanasidagi ko'plab to'qima turlarini o'z ichiga oladi. EMBL-EBI yordamida KIAA1958 haddan tashqari ta'sirlanganligi aniqlandi psevdopod Migratsiyasi paytida RNK metastatik saraton hujayralar.[11] KIAA1958 shuningdek Stat5 / ab va stat 3 da haddan tashqari ifoda etilgan, bu prostata saratoni hujayralarining o'sishi va hayotiyligi uchun juda muhim bo'lgan transkripsiya omillari.[11] va ikkalasi ham embrional ildiz hujayrasi va pluripotent ildiz hujayrasi.[11]

Oqsil

KIAA1958 fosforillangan joylarni bashorat qilgan

KIAA1958 716 dan iborat aminokislotalar va 6,375 izoelektrik nuqtasi bilan 79212 Da og'irlikda.[12] KIAA1958 oqsili haqida ko'p narsa ma'lum bo'lmasa-da, KIAA1958 ning tuzilishi va funktsiyasini bashorat qilish uchun superkompyuterlar yordamida ilmiy bashorat qilingan. KIAA1958 o'tkaziladi tarjimadan keyingi modifikatsiyalar. Eng qiziqarli modifikatsiya fosforillanish. Boshqa oqsillarga nisbatan KIAA1958 translyatsiyadan keyingi modifikatsiya qilish jarayonida fosforillangan serinlarning sezilarli darajada katta miqdoriga ega. 36 serin fosforillangan deb taxmin qilinmoqda.

Tuzilishi

SDLE Biology WorkBench-dagi PELE - bu KIAA1958 oqsilining ikkilamchi tuzilishini taxmin qilishga qodir bo'lgan superkompyuter.[13] Ushbu vositaga ko'ra, oqsilning ikkilamchi tuzilishi alfa spirallar va beta-varaqlarning birikmasidan iborat bo'lib, deyarli teng miqdorda va deyarli butun oqsil bo'ylab tarqaladi.

O'zaro aloqalar

Ayni paytda KIAA1958 ning boshqa biron bir oqsil bilan o'zaro aloqasi borligi haqida ma'lum bir dalil yo'q.[14]

Gomologiya

Tur va turlarUmumiy ismKirish raqamiSeq. UzunlikSeq. ShaxsiyatSeq. O'xshashlik
Pan trogloditlariShimpanzeXM_5283917945 bp99%99%
Muskul mushakSichqonchaBAC38268719 a97%98%
Kallitrix jakusi Oddiy marmosetXM_0027432042346 baravar97%82%
Pongo abeliiSumatran OrangutanXM_0028201121120bp96%4%
Sus skrofaYovvoyi cho'chqaXM_0031220702502 bp93%81%
Ailuropoda melanoleucaGigant pandaXM_0029259382151 bp85%91%
Nomascus leucogenysOq yonoqli gibbonXM_003263945950 bp93%5%
Oryctolagus cuniculusEvropa quyoniXM_0027079902223 bp93%43%
Loxodonta africana Afrikalik buta filiXM_0034075212388 bp93%80%
Cricetulus griseus Xitoy hamsteriXM_0035055082534 bp92%42%
Equus caballusOtXM_0019163022536 bp91%93%
Bos taurusSigirXM_876102.52480 bp91%81%
Rattus norvegicusKalamushXM_0027265321364 bp91%36%
Cavia porcellusGvineya cho'chqasiXM_0034637912217 bp91%43%
Monodelphis domesticaOpossumXM_0013759762217 bp78%41%
Branchiostoma floridaeLanceletXP_002611438719 a29%48%
Amfimedon queenslandicaShimgichXP_003390994388 a25%48%
Acyrthosiphon pisumNo'xat aphidXP_0019437201197 aa24%43%
Oikopleura dioicaChordateCBY34656629 a22%43%
Ciona intestinalisVazo tunikasiXP_0021259641004 aa23%43%
Ksenopus (silurana) tropicalisG'arbiy tirnoqli qurbaqaAAI61073679 a23%43%
Halotsintiya roretziDengiz ananasiBAB40645980 a23%45%

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000165185 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  3. ^ a b "Homo sapiens KIAA1958 (KIAA1958), mRNA". NCBI. Olingan 20 aprel 2012.
  4. ^ "Homo sapiens geni KIAA1958, kodlash KIAA1958". AceView. Olingan 19 aprel 2012.
  5. ^ "Q6YN16 (HSDL2_HUMAN) ko'rib chiqildi, UniProtKB / Swiss-Prot". UniProt. Olingan 1 may 2012.
  6. ^ "Homo sapiens geni C9orf147, kodlash 9 xromosoma 147 o'qish doirasi". AceView. Olingan 1 may 2012.
  7. ^ "Q9NRY2 (SOSSC_HUMAN) ko'rib chiqildi, UniProtKB / Swiss-Prot". Olingan 1 may 2012.
  8. ^ "Q5VWJ9 (SNX30_HUMAN) ko'rib chiqildi, UniProtKB / Swiss-Prot". Olingan 1 may 2012.
  9. ^ a b "Unigene EST profili". Unigene. Olingan 8 may 2012.
  10. ^ "Geo Profillar". NCBI. Olingan 28 aprel 2012.
  11. ^ a b v "Genlarni ifodalash bo'yicha profillar". Embl-Ebi. Olingan 8 may 2012.
  12. ^ "Biology WorkBench". SDSC. Olingan 3 may 2012.
  13. ^ "Biologiya dastgohi". SDSC Biology WorkBench. Olingan 28 aprel 2012.
  14. ^ "Proteinlarning o'zaro ta'siri". Ip. Olingan 7 may 2012.

Qo'shimcha o'qish