Kontaminatsiyalangan hujayralar qatorlari ro'yxati - List of contaminated cell lines - Wikipedia

Ko'pchilik hujayra chiziqlari uchun keng ishlatiladigan biomedikal tadqiqotlar boshqa, ko'proq tajovuzkor hujayralar tomonidan o'stirilgan. Masalan, taxmin qilingan tiroid chiziqlari aslida melanoma hujayralari, prostata to'qimalari aslida siydik pufagi saratoni va taxmin qilingan bachadon madaniyati aslida ko'krak bezi saratoni edi.^[1] Bu o'zaro ifloslangan va boshqa hujayralar tomonidan ko'payib ketgan hujayra chiziqlarining ro'yxati. Skrining asosida baholash leykemiya -limfoma hujayra chiziqlari shuni ko'rsatadiki, ushbu hujayra chiziqlarining taxminan 15% odatda taxmin qilingan narsalarning vakili emas.^[2] Hozirgi vaqtda noto'g'ri tarqatish natijasida yuzaga keladigan tadqiqotlarda xatolikka yo'l qo'ymaslik uchun ifloslangan hujayra liniyalarini sanash va qayta nomlash bo'yicha loyiha olib borilmoqda.^[3][4][a]

Kontaminatsiyalangan hujayra chiziqlari ularning asl xarakterini bilmasdan tadqiqotlarda keng qo'llanilgan. Masalan, aksariyat hollarda endoteliy ECV-304 yoki megakaryotsit Haqiqatan ham DAMI hujayra liniyalari o'tkazilgan siydik pufagi karsinoma va eritroleukemiya navbati bilan hujayralar. Shunday qilib, ushbu hujayra chiziqlaridan foydalangan holda endoteliy yoki megakaryotsitlarga xos funktsiyalar bo'yicha olib borilgan barcha tadqiqotlar noto'g'ri bo'lib chiqdi va ko'proq ogohlantiruvchi misol keltirdi.

Hujayra chizig'i ifloslanishining ikkita asosiy usuli mavjud: tadqiqot guruhlari o'rtasida hujayra madaniyati ko'pincha almashinadi; agar ishlov berish paytida namuna ifloslanib, keyin uzatilsa, hujayralarning keyingi almashinuvi ifloslangan populyatsiyaning paydo bo'lishiga olib keladi, garchi taxmin qilingan hujayra chizig'ining qismlari hali ham asl bo'lsa. Manbaning ifloslanishi jiddiyroq: asl hujayra chizig'ini o'rnatishda ba'zi ifloslantiruvchi hujayralar tasodifan madaniyatlarga kiritilib, ular o'z vaqtida kerakli hujayralardan oshib ketadi. Dastlabki sinovlar, bu holda, hali ham hujayra chizig'i haqiqiy va yangi ekanligini ta'kidladi, ammo aslida u o'rnatilgandan ko'p o'tmay yo'q bo'lib ketdi va barchasi bunday hujayra chiziqlarining namunalari aslida ifloslantiruvchi hujayralardir. Hujayra chiziqlari ifloslangan aniq nuqtani aniqlash uchun uzoq izlanishlar talab etiladi. Kontaminatsiya deb baholangan aralashma aslida ikkita hujayra chizig'ining oddiy chalkashligi bo'lishi mumkin, ammo odatda ifloslanish taxmin qilinadi.^{[iqtibos kerak ]}

Hujayra chizig'i ifloslanganligi aniqlangandan so'ng, ular taxmin qilingan hujayra chizig'ining o'ziga xos turini talab qiladigan tadqiqotlar uchun odatda bundan keyin hech qachon foydalanilmaydi. Ko'pgina ifloslangan hujayra chiziqlari tashlanadi, ammo ba'zida ifloslantiruvchi hujayralar yangi xususiyatlarga ega (masalan, tomonidan mutatsiya yoki virusli transfektsiya, masalan HeLa kelib chiqishi Det98) va shu bilan birga yangi avlodni tashkil qiladi, shuning uchun tashlanmaydi. Agar hujayra chizig'i ifloslangan deb hisoblansa, u odatda haqiqiyligi uchun sinovdan o'tkaziladi.^[b] Dastlab HeLa hujayralarining keng ifloslanishi tan olingan Uolter Nelson-Ris oddiy yordamida Giemsa dog ' karyotiplash ostida yorug'lik mikroskopi. Ushbu uslub HeLa-ni tanishda yaxshi ishlaydi, chunki bu hujayralar o'ziga xos xususiyatga ega xromosoma buzilishlar. Yangi hujayralar qatorlari ko'payadi va tarqatiladi va / yoki kabi saqlash muassasalarida saqlanadi ATCC o'rnatishdan keyin imkon qadar tezroq, ifloslanish natijasida chiziq buzilishi ehtimolini minimallashtirish uchun. Bu ko'rib chiqilmoqda yaxshi amaliyot laboratoriya sharoitida saqlanadigan (ya'ni uzoq muddatli saqlashga joylashtirilmagan) hujayra liniyalarini vaqti-vaqti bilan ularning sifati va yaxlitligini ta'minlash uchun HeLa yoki boshqa umumiy ifloslantiruvchi moddalar bilan ifloslanishini tekshirish.^{[iqtibos kerak ]}

Kontaminatsiyalangan hujayralar qatorlari ro'yxati

488 ta hujayra qatorini o'z ichiga olgan ushbu ro'yxat so'nggi marta 2016 yil 1-dekabrda yangilangan.^[c]

Sellozavr shuningdek, "muammoli" hujayralar qatorlari ro'yxatini olib boradi.^[6] Ro'yxat ma'lumotlar bazasidagi barcha katakchalar qatoridan dinamik ravishda "Muammoli katakcha chizig'i" so'zlarini o'z ichiga olgan izoh bilan tuziladi. 2017 yil 17-yanvar holatiga ko'ra^[yangilash], ro'yxatda 757 ta yozuv mavjud.

Agar quyidagi jadvallarning alohida yozuvlarida hech qanday tur berilmagan bo'lsa, jadval turlari taxmin qilingan va haqiqiy hujayra turlariga tegishli.

Hujayra chiziqlari belgilangan Virtual quyidagi jadvalda manbada ifloslanish holatlari ma'lum; bu hujayra chiziqlari yo'q bo'lib ketdi yoki hech qachon mavjud emas edi. Nopok bo'lmagan chiziqlar bo'lgan holatlar ma'lum yoki qattiq gumon qilingan mavjud bo'lish belgilanadi Mavjud.

Kontaminatsiyalangan inson hujayralari chiziqlari

Inson bo'lmagan hujayralar ifloslangan

Izohlar

Adabiyotlar

Bibliografiya

• Chen, TR (1988). "HeLa, HeLa S3 va HEp-2 karyotiplarini qayta baholash". Sitogenet Hujayra Geneti. 48 (1): 19–24. doi:10.1159/000132579. PMID  3180844.
• Dirks, Villi G.; MacLeod, Roderick A. F.; Dreksler, Xans G. (1999). "ECV304 (endotelial) haqiqatan ham T24 (qovuq karsinomasi): hujayra chizig'ining manbada o'zaro ifloslanishi". In Vitro Cellular & Development Biology. 35 (10): 558–559. doi:10.1007 / s11626-999-0091-8.
• Dreksler, Xans G.; Dirks, Villi G.; MacLeod, Roderick A. F. (1999). "Soxta odamning gemopoetik hujayralari chiziqlari: o'zaro ifloslanish va noto'g'ri talqin qilish". Leykemiya. 13 (10): 1601–1607. doi:10.1038 / sj.leu.2401510. PMID  10516762.
• Dreksler, Xans G.; MacLeod, Roderick A. F.; Dirks, Willy G. (2001). "O'zaro kontaminatsiya: HS-Sulton miyeloma emas, balki Burkitt limfoma hujayrasi chizig'i" (PDF). Qon. 98 (12): 3495–3496. doi:10.1182 / qon.v98.12.3495. PMID  11732505.
• Dreksler, Xans G.; Kventmayer, H .; Dirks, Villi G.; Uffof, Kordon C.; MacLeod, Roderick A. F. (2002a). "WSU-CLL hujayra chizig'ining DNK-profilingi va sitogenetik tahlili REH hujayrasi (o'zgacha B-ALL) bilan o'zaro kontaminatsiyani aniqlaydi". Leykemiya. 16 (9): 1868–1870. doi:10.1038 / sj.leu.2402610. PMID  12200708.
• Dreksler, Xans G.; Uffof, Kordon C.; Dirks, Villi G.; MacLeod, Roderick A. F. (2002b). "Miks-uplar va mikoplazma: ichidagi dushmanlar". Leykemiya tadqiqotlari. 26 (4): 329–333. doi:10.1016 / S0145-2126 (01) 00136-9. PMID  11839374.
• Dreksler, Xans G.; Dirks, Villi G.; Matsuo, Y .; MacLeod, Roderick A. F. (2003). "Soxta leykemiya - limfoma hujayralari liniyalari: 500 dan ortiq hujayralardagi yangilanish". Leykemiya. 17 (2): 416–426. doi:10.1038 / sj.leu.2402799. PMID  12592342.
• Lakroix, Mark (2008). "" Soxta "katakchalar qatoridan doimiy foydalanish". Xalqaro saraton jurnali. 122 (1): 1–4. doi:10.1002 / ijc.23233. PMID  17960586.
• Lissovich, Mordaxay; Ravid, Dana (2007 yil yanvar). "Saraton xujayrasi liniyalarini noto'g'ri aniqlash bo'yicha amaliy ish: MCF-7 / AdrR hujayralari (qayta belgilangan NCI / ADR-RES) OVCAR-8 odamning tuxumdon karsinomasi hujayralaridan olingan". Saraton xatlari. 245 (1–2): 350–352. doi:10.1016 / j.canlet.2006.01.013. PMID  16504380.
• MacLeod, Roderick A. F.; Dirks, Villi G.; Dreksler, Xans G. (1997a). "Damiy hujayra liniyasining HEL tomonidan erta ifloslanishi". Qon. 90 (7): 2850–2851. doi:10.1182 / blood.v90.7.2850.2850_2850_2850.
• MacLeod, Roderick A. F.; Dirks, Villi G.; Reid, Y. A .; Xey, R. J .; Dreksler, Xans G. (1997b). "Dami megakaryotsitlarining HEL eritroleykemiya hujayralari bilan biriktirilgan sitogenetikasi va DNK barmoq izlari bilan ko'rsatilgan". Leykemiya. 11 (12): 2032–2038. doi:10.1038 / sj.leu.2400868. PMID  9447816.
• MacLeod, Roderick A. F.; Dirks, Villi G.; Matsuo, Y .; Kaufmann, M .; Milch, H .; Dreksler, Xans G. (1999). "Odamning o'sma hujayralari manbalarining paydo bo'lishi yo'llarining keng tarqalgan intraspeches-kontaminatsiyasi". Xalqaro saraton jurnali. 83 (4): 555–563. doi:10.1002 / (sici) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <555 :: aid-ijc19> 3.0.co; 2-2. PMID  10508494.
• Magistrlar, Jon R (2002). "HeLa hujayralari 50 yildan keyin: yaxshi, yomon va chirkin". Tabiat sharhlari saraton kasalligi. 2 (4): 315–319. doi:10.1038 / nrc775. PMID  12001993.
• Nelson-Riz, V. A .; Flandermeyer, R. R. (1976). "HeLa madaniyati aniqlangan". Ilm-fan. 191 (4222): 96–98. Bibcode:1976Sci ... 191 ... 96N. doi:10.1126 / science.1246601. PMID  1246601.
• Nelson-Riz, V. A .; Daniels, D. V.; Flandermeyer, R. R. (1981). "Kulturadagi hujayralarning o'zaro kontaminatsiyasi". Ilm-fan. 212 (4493): 446–452. Bibcode:1981Sci ... 212..446N. doi:10.1126 / science.6451928. PMID  6451928.
• Unger, Ronald E.; Krump-Konvalinkova, V .; Piters, K .; Kirkpatrick, C. J. (2002). "Endotelial fenotipning vitro ifodasi: HPMEC-ST1.6R yangi hujayra liniyasini o'z ichiga olgan birlamchi izolyatsiya qilingan hujayralar va hujayra qatorlarini qiyosiy o'rganish". Mikrovaskulyar tadqiqotlar. 64 (3): 384–397. doi:10.1006 / mvre.2002.2434. PMID  12453433.

Tashqi havolalar

• Sellozavr muammoli (ifloslangan / noto'g'ri aniqlangan) hujayralar qatorlari ro'yxati