Lenfotsit antigeni 96 - Lymphocyte antigen 96

96-yil
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2E56, 2E59, 2Z65, 3FXI, 3ULA, 4G8A
Identifikatorlar
Taxalluslar	96-yil, ESOP-1, MD-2, MD2, ly-96, limfotsitlar antigeni 96
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 605243 MGI: 1341909 HomoloGene: 9109 Generkartalar: 96-yil
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	74,029,079 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 1 (sichqoncha)
Oxiri	16,709,611 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• koreceptor faoliyati; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • lipopolisakkarid retseptorlari faoliyati; • lipopolisakkaridni bog'lash; • Tollga o'xshash retseptor 4 bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• plazma membranasining ichki komponenti; • hujayra membranasi; • hujayradan tashqari mintaqa; • lipopolisakkarid retseptorlari kompleksi; • endosoma membranasi; • hujayradan tashqari;
Biologik jarayon	• pulli o'xshash retseptorlari 4 signalizatsiya yo'li; • immunitet tizimi jarayoni; • MyD88 ga bog'liq bo'lgan pullik kabi retseptorlari signalizatsiya yo'li; • lipopolisakkarid vositachiligidagi signalizatsiya yo'lining ijobiy regulyatsiyasi; • TRIFga bog'liq bo'lgan pullik kabi retseptorlari signalizatsiya yo'li; • uyali himoya javob; • hujayra yuzasi retseptorlari signalizatsiya yo'li; • lipopolisakkaridga javob; • o'sma nekrozi omilini ishlab chiqarishni ijobiy tartibga solish; • yallig'lanish reaktsiyasi; • lipopolisakkaridga uyali javob; • lipopolisakkaridni aniqlash; • I-kappaB kinaz / NF-kappaB signalizatsiyasi; • MyD88-dan mustaqil ravishda pullik kabi retseptorlari signalizatsiya yo'li; • lipopolisakkarid vositachiligidagi signalizatsiya yo'li; • MyD88-ga bog'liq bo'lmagan pullik kabi retseptorlari signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • tug'ma immunitet tizimi; • GO: 0060554, GO: 0060555 nekroptoz; • apoptotik signalizatsiya yo'li; • pulli retseptorlari signalizatsiya yo'li;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	23643
	17087
	ENSG00000154589
	ENSMUSG00000025779
	Q9Y6Y9
	Q9JHF9
	NM_001195797; NM_015364
	NM_001159711; NM_016923
	NP_001182726; NP_056179
	NP_001153183; NP_058619
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Lenfotsit antigeni 96, shuningdek, nomi bilan tanilgan "Miyeloid farqlash omili 2 (MD-2), "a oqsil odamlarda kodlanganligi 96-yil gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

The oqsil ushbu gen tomonidan kodlangan, bog'lanishda ishtirok etadi lipopolisakkarid bilan Pullik kabi retseptorlari (TLR4).

Funktsiya

MD-2 oqsili hujayra yuzasida tollga o'xshash retseptorlari 4 bilan bog'langan ko'rinadi va lipopolisaxaridga (LPS) ta'sirchanlikni beradi, shu bilan retseptor va LPS signalizatsiyasi o'rtasida bog'lanishni ta'minlaydi.^[7] Ya'ni, TLR4 va MD-2 o'rtasidagi asosiy interfeys LPSni bog'lashdan oldin hosil bo'ladi va dimerizatsiya interfeysi LPSni bog'lash orqali induktsiyalanadi.^[8]

Tuzilishi

MD-2 ligandni bog'lash uchun katta gidrofob cho'ntakni tashkil etuvchi ikkita anti-parallel β choyshabdan tashkil topgan chashka katlamali tuzilishga ega.^[9]^[10]

O'zaro aloqalar

Lenfotsit antijeni 96 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan TLR 4.^[5]^[11]

LPS MD-2da gidrofob cho'ntagiga bog'langanda, u to'g'ridan-to'g'ri ikkita TLR4-MD-2 komplekslarining dimerlanishiga vositachilik qiladi. Shunday qilib, MD-2 tizimli ravishda turli xil LPS molekulalarida umumiy naqshni tan oladigan heterodimerni hosil qiladi. Ushbu o'zaro ta'sirlar TLR4-ga LPS-ni tanib olishga imkon beradi.^[8]

LPS bakterial membranadan ajratib olinadi va tug'ma immunitetga javob berish uchun ikkita qo'shimcha oqsil, LPS bilan bog'lovchi oqsil va CD14 tomonidan TLR4-MD-2 ga o'tkaziladi.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000154589 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000025779 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b Shimazu R, Akashi S, Ogata H, Nagai Y, Fukudome K, Miyake K, Kimoto M (iyun 1999). "MD-2, Tollga o'xshash retseptorlari 4 ga lipopolisakkarid ta'sirchanligini ta'minlovchi molekula". Eksperimental tibbiyot jurnali. 189 (11): 1777–82. doi:10.1084 / jem.189.11.1777. PMC 2193086. PMID 10359581.
^ Abreu MT, Vora P, Faure E, Tomas LS, Arnold ET, Arditi M (Avgust 2001). "Tollga o'xshash retseptorlar-4 va MD-2 ning pasaygan ekspressioni bakterial lipopolisaxaridga javoban regulyatsiya qilingan proinflamatuar gen ekspresiyasidan ichak epiteliya hujayralarini himoya qilish bilan o'zaro bog'liq". Immunologiya jurnali. 167 (3): 1609–16. doi:10.4049 / jimmunol.167.3.1609. PMID 11466383.
^ ^a ^b "Entrez Gen: LY96 limfotsit antigeni 96".
^ ^a ^b ^v ^d Park BS, Song DH, Kim HM, Choi BS, Li H, Li JO (2009 yil aprel). "TLR4-MD-2 kompleksi orqali lipopolisakkaridni tanib olishning tarkibiy asoslari". Tabiat. 458 (7242): 1191–5. doi:10.1038 / nature07830. PMID 19252480. S2CID 4396446.
^ Kim HM, Park BS, Kim JI, Kim SE, Li J, Oh SC va boshq. (2007 yil sentyabr). "Eritoran bog'langan endotoksin antagonisti bo'lgan TLR4-MD-2 kompleksining kristalli tuzilishi". Hujayra. 130 (5): 906–17. doi:10.1016 / j.cell.2007.08.002. PMID 17803912. S2CID 18948568.
^ Ohto U, Fukase K, Miyake K, Satow Y (iyun 2007). "Odamning MD-2 kristalli tuzilmalari va IVa antiendoksik lipid bilan kompleksi". Ilm-fan. 316 (5831): 1632–4. doi:10.1126 / science.1139111. PMID 17569869. S2CID 37539892.
^ Re F, Strominger JL (2002 yil iyun). "Monomerik rekombinant MD-2 tollga o'xshash retseptor 4 ni mahkam bog'laydi va lipopolisaxaridga javob beradi". Biologik kimyo jurnali. 277 (26): 23427–32. doi:10.1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.

Qo'shimcha o'qish

Kato K, Morrison AM, Nakano T, Tashiro K, Honjo T (iyul 2000). "ESOP-1, embrion va kattalar sichqonlarining gematopoetik, asabiy va reproduktiv tizimlarida ifloslangan oqsil". Qon. 96 (1): 362–4. doi:10.1182 / qon.V96.1.362. PMID 10891475.
Dziarski R, Vang Q, Miyake K, Kirschning CJ, Gupta D (fevral, 2001). "MD-2 lipopolisakkaridga Tollga o'xshash retseptorlari 2 (TLR2) ta'sirini ta'minlaydi va Gram-musbat va Gram-manfiy bakteriyalarga va ularning hujayra devorlarining tarkibiy qismlariga TLR2 vositachiligidagi ta'sirini kuchaytiradi". Immunologiya jurnali. 166 (3): 1938–44. doi:10.4049 / jimmunol.166.3.1938. PMID 11160242.
Schromm AB, Lien E, Henneke P, Chow JC, Yoshimura A, Heine H, Latz E, Monks BG, Schwartz DA, Miyake K, Golenbock DT (iyul, 2001). "Endotoksin javob bermaydigan mutant hujayra chizig'ining molekulyar genetik tahlili: MD-2 konservalangan mintaqasidagi nuqta mutatsiyasi endotoksin ta'siridagi signalni bekor qiladi". Eksperimental tibbiyot jurnali. 194 (1): 79–88. doi:10.1084 / jem.194.1.79. PMC 2193443. PMID 11435474.
Visintin A, Mazzoni A, Spitzer JA, Segal DM (oktyabr 2001). "Secreted MD-2 - bu katta polimer oqsil bo'lib, lipopolisaxarid ta'sirini Tollga o'xshash retseptorlari 4 ga samarali ta'sir qiladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 98 (21): 12156–61. doi:10.1073 / pnas.211445098. PMC 59784. PMID 11593030.
Akashi S, Nagai Y, Ogata H, Oikava M, Fukase K, Kusumoto S, Kavasaki K, Nishijima M, Hayashi S, Kimoto M, Miyake K (dekabr 2001). "MD-2 sichqonchasi sichqonchani chaqiradi Tollga o'xshash retseptorlari 4 turga xos lipopolisaxaridni aniqlash". Xalqaro immunologiya. 13 (12): 1595–9. doi:10.1093 / intimm / 13.12.1595. PMID 11717200.
Abreu MT, Arnold ET, Tomas LS, Gonskiy R, Chjou Y, Xu B, Arditi M (iyun 2002). "TLR4 va MD-2 ekspressioni odamning ichak epiteliya hujayralarida immunitet vositachiligi signallari bilan tartibga solinadi". Biologik kimyo jurnali. 277 (23): 20431–7. doi:10.1074 / jbc.M110333200. PMID 11923281.
Re F, Strominger JL (2002 yil iyun). "Monomerik rekombinant MD-2 tollga o'xshash retseptor 4 ni mahkam bog'laydi va lipopolisaxaridga javob beradi". Biologik kimyo jurnali. 277 (26): 23427–32. doi:10.1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.
Latz E, Visintin A, Lien E, Fitsjerald KA, Monks BG, Kurt-Jons EA, Golenbok DT, Espevik T (dekabr 2002). "Lipopolisakkarid Golji apparati orqali tezkor ravishda 4-MD-2-CD14 retseptorlari majmuasi bilan signal uzatishni boshlash jarayonidan farq qiladi". Biologik kimyo jurnali. 277 (49): 47834–43. doi:10.1074 / jbc.M207873200. PMID 12324469.
Schröder NW, Morath S, Alexander C, Hamann L, Hartung T, Zähringer U, Göbel UB, Weber JR, Schumann RR (may 2003). "Streptococcus pneumoniae va Staphylococcus aureus ning lipoteykoik kislota (LTA) immunitet hujayralarini Tollga o'xshash retseptorlari (TLR) -2, lipopolisakkarid bilan bog'lovchi oqsil (LBP) va CD14 orqali faollashtiradi, shu bilan birga TLR-4 va MD-2 ishtirok etmaydi" ". Biologik kimyo jurnali. 278 (18): 15587–94. doi:10.1074 / jbc.M212829200. PMID 12594207.
Mullen GE, Kennedi MN, Visintin A, Mazzoni A, Leifer CA, Devies DR, Segal DM (aprel 2003). "MD-2 ni yig'ishda va ishlashida disulfid bog'lanishlarining roli". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 100 (7): 3919–24. doi:10.1073 / pnas.0630495100. PMC 153023. PMID 12642668.
Ohnishi T, Muroi M, Tanamoto K (may 2003). "MD-2 tollga o'xshash retseptorlari 4 oqsilini hujayra yuzasiga ko'chishi uchun zarur bo'lgan glikozilatsiyadan o'tishi uchun zarurdir". Klinik va diagnostik laboratoriya immunologiyasi. 10 (3): 405–10. doi:10.1128 / cdli.10.3.405-410.2003. PMC 154975. PMID 12738639.
Tompson PA, Tobias PS, Viriyakosol S, Kirkland TN, Kitchens RL (avgust 2003). "Lipopolisakkarid (LPS) bilan bog'langan oqsil hujayralar bilan bog'langan LPSga bo'lgan ta'sirni inhibe qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (31): 28367–71. doi:10.1074 / jbc.M302921200. PMID 12754215.
Visintin A, Latz E, Monks BG, Espevik T, Golenbok DT (2003 yil noyabr). "Lizinlar 128 va 132 lipopolisakkaridni MD-2 bilan bog'lashga imkon beradi, bu esa Tollga o'xshash retseptor-4 agregatsiyasiga va signal o'tkazilishiga olib keladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (48): 48313–20. doi:10.1074 / jbc.M306802200. PMID 12960171.
Re F, Strominger JL (2003 yil noyabr). "MD-2 odamning alohida funktsional sohalari vositachilik qiladi. Tollga o'xshash retseptorlari 4-biriktiruvchi va lipopolisaxaridlarning ta'sirchanligi". Immunologiya jurnali. 171 (10): 5272–6. doi:10.4049 / jimmunol.171.10.5272. PMID 14607928.
Hamann L, Kumpf O, Myuller M, Visintin A, Ekkert J, Schlag PM, Schumann RR (iyun 2004). "Odamning MD-2 genining birinchi eksonidagi kodlash mutatsiyasi lipopolisakkarid ta'sirida signalizatsiyaning pasayishiga olib keladi". Genlar va immunitet. 5 (4): 283–8. doi:10.1038 / sj.gene.6364068. PMID 15057266.
Gruber A, Mancek M, Vagner H, Kirshchning CJ, Jerala R (2004 yil iyul). "MD-2 ning strukturaviy modeli va uning uyali lipopolisaxaridni aniqlashda ishtirok etadigan asosiy aminokislotalar klasterlarining funktsional roli". Biologik kimyo jurnali. 279 (27): 28475–82. doi:10.1074 / jbc.M400993200. PMID 15111623.
Cario E, Golenbock DT, Visintin A, Rünzi M, Gerken G, Podolsky DK (2006 yil aprel). "Lipopolisakkarid bardoshlik mexanizmi sifatida MD-2 ichak epiteliysining tripsinga sezgir modulyatsiyasi". Immunologiya jurnali. 176 (7): 4258–66. doi:10.4049 / jimmunol.176.7.4258. PMID 16547263.
Jia HP, Kline JN, Penisten A, Apicella MA, Gioannini TL, Weiss J, McCray PB (Avgust 2004). "Inson nafas yo'llari epiteliyasining endotoksin ta'sirchanligi MD-2 ning past ifodalanishi bilan cheklanadi". Amerika fiziologiya jurnali. O'pka hujayralari va molekulyar fiziologiyasi. 287 (2): L428-37. doi:10.1152 / ajplung.00377.2003. PMID 15121639. S2CID 13203884.

Pulli retseptorlarning signalizatsiya yo'li. Kesilgan kulrang chiziqlar noma'lum birlashmalarni anglatadi

Tashqi havolalar

limfotsit + antigen + 96, + odam AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasida Tibbiy mavzu sarlavhalari (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000154589 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000025779 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10359581-5] Shimazu R, Akashi S, Ogata H, Nagai Y, Fukudome K, Miyake K, Kimoto M (iyun 1999). "MD-2, Tollga o'xshash retseptorlari 4 ga lipopolisakkarid ta'sirchanligini ta'minlovchi molekula". Eksperimental tibbiyot jurnali. 189 (11): 1777–82. doi:10.1084 / jem.189.11.1777. PMC 2193086. PMID 10359581.

[pmid11466383-6] Abreu MT, Vora P, Faure E, Tomas LS, Arnold ET, Arditi M (Avgust 2001). "Tollga o'xshash retseptorlar-4 va MD-2 ning pasaygan ekspressioni bakterial lipopolisaxaridga javoban regulyatsiya qilingan proinflamatuar gen ekspresiyasidan ichak epiteliya hujayralarini himoya qilish bilan o'zaro bog'liq". Immunologiya jurnali. 167 (3): 1609–16. doi:10.4049 / jimmunol.167.3.1609. PMID 11466383.

[entrez-7] "Entrez Gen: LY96 limfotsit antigeni 96".

[:0-8] v ^d Park BS, Song DH, Kim HM, Choi BS, Li H, Li JO (2009 yil aprel). "TLR4-MD-2 kompleksi orqali lipopolisakkaridni tanib olishning tarkibiy asoslari". Tabiat. 458 (7242): 1191–5. doi:10.1038 / nature07830. PMID 19252480. S2CID 4396446.

[9] Kim HM, Park BS, Kim JI, Kim SE, Li J, Oh SC va boshq. (2007 yil sentyabr). "Eritoran bog'langan endotoksin antagonisti bo'lgan TLR4-MD-2 kompleksining kristalli tuzilishi". Hujayra. 130 (5): 906–17. doi:10.1016 / j.cell.2007.08.002. PMID 17803912. S2CID 18948568.

[10] Ohto U, Fukase K, Miyake K, Satow Y (iyun 2007). "Odamning MD-2 kristalli tuzilmalari va IVa antiendoksik lipid bilan kompleksi". Ilm-fan. 316 (5831): 1632–4. doi:10.1126 / science.1139111. PMID 17569869. S2CID 37539892.

[pmid11976338-11] Re F, Strominger JL (2002 yil iyun). "Monomerik rekombinant MD-2 tollga o'xshash retseptor 4 ni mahkam bog'laydi va lipopolisaxaridga javob beradi". Biologik kimyo jurnali. 277 (26): 23427–32. doi:10.1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]