Nik operon - Nik operon - Wikipedia

The nik operon bu operon hujayraga nikel ionlarini yutish uchun zarur. U ko'plab bakteriyalarda mavjud, ammo keng o'rganilgan Helicobacter pylori. Nikel ko'plab mikroorganizmlar uchun zarur bo'lgan ozuqa moddasi bo'lib, u turli xil uyali jarayonlarda ishtirok etadi. Shu bilan birga, hujayradagi ortiqcha nikel ionlari hujayraga o'limga olib kelishi mumkin. Hujayradagi nikel ionlari kontsentratsiyasi nik operon.

Tuzilishi nik operon

The nik operon oltita gendan iborat. Birinchi beshta gen nikABCDE tipik tarkibiy qismlarni kodlash ABC transport tizimi va oxirgi gen nikR transkripsiyasini bosuvchi DNK bilan bog'langan oqsilni kodlaydi nikABCDE etarli bo'lganida Ni2+ mavjud. The nikR gen oxiridan 5 bp pastda joylashgan nikE, xuddi shu yo'nalishda transkripsiyalangan nikABCDE. Quyidagi jadval. Ning tuzilishini umumlashtiradi nik operon:

GenProtein kodlanganFunktsional roli
nikAABC tashuvchisi Ni2+majburiy komponentNi ni bog'laydi2+ ichida periplazma va uni permease; da rol o'ynashi mumkin kemotaksis nikelning toksik kontsentratsiyasidan uzoqroq
nikB & nikCABC transporter permease komponentlarini tashish2++ ichki membrana bo'ylab
nikD & nikEABC transporter ATP-majburiy komponentlariATP ni gidrolizlaydi transport jarayoni uchun energiya bilan ta'minlash
nikRtranskripsiya regulyatori nikABCDE operonning ifodasini pasaytiradi nik ortiqcha Ni borligida operon2+ ionlari

Tartibga solish

nikR Tartibga solish

Ifodasini tartibga solish nikR genga ikkitasi erishadi targ'ibotchilar. Birinchisi FNR regulyatori. FNR tomonidan boshqariladigan tartibga solish nikABCDE – nikR yuqori qismida joylashgan FNR qutisida sodir bo'ladi nikA taxminiy NikR bog'lash joyida.[1] Tartibga soluvchi ikkinchi promouter element nikR ning oqimi 51 bp yuqoriga ko'tariladi nikR transkripsiyani boshlash joyi va past darajadagi konstitutsiyaviy ifodani keltirib chiqaradi. Bunga dalillar ham mavjud nikR ifoda qisman autoregulyatsiya qilingan.[2]

Ni ni tartibga solish2+ qabul qilish

Ni2+ prokaryotik hujayralarga yuqori yaqinlik transport tizimlarining ikki turidan biri tomonidan qabul qilinadi.[3] Birinchi usul ABC tipidagi transportyorlarni o'z ichiga oladi (ushbu maqolada muhokama qilingan), ikkinchi mexanizm esa o'tish metali permeazlaridan foydalanadi (masalan, HoxN ning Ralstonia evtrofasi ). ABC tipidagi tashuvchi tizim beshta oqsil - NikA-E ni tashkil etadi, ular Ni ning ATP ga bog'liq transportini amalga oshiradilar.2+.[1] NikA - eruvchan, periplazmatik, Ni bilan bog'laydigan oqsil; NikB va NikC Ni o'tish uchun transmembrana teshik hosil qiladi; va NikD va NikE ATP ni gidrolizlaydi va bu energiyani Ni ga qo'shadi2+- transport. Ni qachon2+ ortiqcha miqdorda mavjud, NikR oqsili transkripsiyasini bostiradi nikABCDE.[2]

Komponentlari bo'yicha nikel ionlarini qabul qilishni tartibga solish nik operon

NikR majburiyligi bilan repressiya

Ma'lumotlar bazasini izlashga asoslanib, NikR transkriptsiya omillari lentasi-spiral-spiral (RHH) oilasining a'zosi ekanligi ko'rsatildi.[4] NikR ning N-terminalli domeni DNK bilan bog'lanish uchun mas'ul ekanligi va u faqat Ni ishtirokida bog'langanligi isbotlangan.2+. NikR ni Ni bilan bog'lash uchun ikkita sayt mavjud2+ ionlari. Ni ni bog'lash2+ operatorni bog'lash uchun faqat yuqori yaqinlik joylarini to'liq to'ldirishga imkon beradigan konsentrasiyalarda operatorga yaqinlik 1000 barobar ko'payadi va ikkala nikel bilan bog'langan joylarni egallab olganda operator izlari kattaroq bo'ladi.[5] Ushbu natijalar hujayra ichidagi Ni taxminlari bilan birlashtirilgan2+ va NikR kontsentratsiyasi NikR ni sezishga qodir degan xulosaga keladi2+ va tartibga solish nik hujayra ichidagi Ni doirasidagi operon ekspressioni2+ har bir hujayra uchun birdan pastgacha 10000 gacha molekulalar kontsentratsiyasi.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Navarro, Klarisse; Vu, Long-Fey; Mandrand-Berthelot, Mari-Andri (1993 yil 1 sentyabr). " nik operoni Escherichia coli nikel uchun periplazmatik bog'lanish-oqsilga bog'liq transport tizimini kodlaydi ". Molekulyar mikrobiologiya. 9 (6): 1181–1191. doi:10.1111 / j.1365-2958.1993.tb01247.x.
  2. ^ a b De Pina, K; Desjardin, V; Mandrand-Berthelot, MA; Giordano, G; Vu, LF (1999 yil yanvar). "Escherichia coli-da nikelga sezgir regulyatorni kodlovchi nikR genini ajratish va tavsifi". Bakteriologiya jurnali. 181 (2): 670–4. PMC  93426. PMID  9882686.
  3. ^ Eitinger, T; Mandrand-Berthelot, MA (yanvar 2000). "Mikroorganizmlarda nikel tashish tizimlari". Mikrobiologiya arxivi. 173 (1): 1–9. doi:10.1007 / s002030050001. PMID  10648098.
  4. ^ Chivers, PT; Sauer, RT (30 iyun 2000). "Bakteriyalarda yuqori darajadagi nikelni iste'mol qilishni tartibga solish. Ni2+- NikR ning yovvoyi va mutant operator saytlari bilan o'zaro bog'liqligi ". Biologik kimyo jurnali. 275 (26): 19735–41. doi:10.1074 / jbc.m002232200. PMID  10787413.
  5. ^ Chivers, Piter T.; Zauer, Robert T. (2002 yil 1 oktyabr). "NikR Repressor". Kimyo va biologiya. 9 (10): 1141–1148. doi:10.1016 / s1074-5521 (02) 00241-7.