To'xtovsiz parchalanish - Non-stop decay - Wikipedia

To'xtovsiz parchalanish (NDS) jarayoni diagrammasi.

To'xtovsiz parchalanish (NSD) a uyali mexanizmi mRNA a etishmaydigan mRNK molekulalarini aniqlash uchun kuzatuv kodonni to'xtatish va ushbu mRNKlarning tarjima qilinishiga yo'l qo'ymaslik. To'xtovsiz parchalanish yo'li uzoqqa etgan ribosomalarni chiqaradi 3 'oxiri mRNK ni hosil qiladi va mRNK ni ekzosoma kompleksi, yoki to RNase R selektiv degradatsiya uchun bakteriyalarda.[1][2] Aksincha Bema'ni vositachilik bilan parchalanish (NMD), polipeptidlar ribosomadan chiqmaydi va shu sababli NSD NMD dan ajralib turadigan mRNA parchalanish omillarini o'z ichiga oladi.[3]

To'xtovsiz parchalanish (NSD)

To'xtovsiz parchalanish (NSD) - bu to'g'ri to'xtash kodonini o'z ichiga olmagan, mRNKning noto'g'riligini aniqlaydigan va buzadigan uyali yo'l. To'xtatish kodonlari - bu oqsillar sintezi tugashi uchun signal beruvchi xabarchi RNKdagi signallar. Aberrant transkriptlar tarjima paytida ribosoma mRNK ning 3 'uchidagi A poli quyrug'iga aylanganda aniqlanadi. To'xtovsiz transkriptsiya nuqta mutatsiyalari normal to'xtash kodoniga zarar etkazganda sodir bo'lishi mumkin. Bundan tashqari, ba'zi transkripsiyaviy hodisalar, ayniqsa, ma'lum bir shtatlarda genlarning ekspressionini past darajada saqlashga imkon beradi.

NSD yo'li mRNKning 3 'uchida to'xtab qolgan ribosomalarni chiqarib yuboradi va mRNKni eukaryotlarda yoki bakteriyalarda RNase R tarkibidagi ekzosoma kompleksiga yo'naltiradi. Tegishli saytlarga yo'naltirilgandan so'ng, transkriptlar buziladi. NSD mexanizmi RNK eksozomasining Ski2p helikaza va (xususan) Ski7p tarkibiga kiradigan ko'p oqsilli struktura bo'lgan tosh kompleksi bilan o'zaro ta'sirini talab qiladi. Ushbu oqsillarning birikmasi va undan keyingi kompleks shakllanish aberrant mRNKlarning degradatsiyasini faollashtiradi. Ski7p mRNK poli (A) dumining 3 ’uchida to'xtab qolgan ribosomani bog'laydi va aberrant mRNA ning parchalanishi uchun ekzosomani jalb qiladi deb o'ylashadi. Ammo sutemizuvchilar hujayralarida Ski7p topilmadi va hatto NSD mexanizmining o'zi ham noaniq bo'lib qoldi. HBS1L (HBS1LV3) ning qisqa qo'shilish izoformasi ekzosoma va SKI komplekslarini bir-biriga bog'lab turadigan Ski7p odamning uzoq izlagan homologi ekanligi aniqlandi. So'nggi paytlarda, NSD sutemizuvchilar hujayralarida ham, biroz boshqacha tizim orqali sodir bo'lganligi haqida xabar berilgan. Ski7 sutemizuvchilarida Ski7 yo'qligi sababli GTPase Hbs1, shuningdek uning bog'lovchi sherigi Dom34 parchalanishning potentsial regulyatorlari sifatida aniqlandi. Hbs1 / Dom34 birgalikda tarjima jarayonini qayta boshlash uchun noto'g'ri ishlaydigan yoki faol bo'lmagan ribosomalarning dissotsiatsiyasini osonlashtiradigan, noto'g'ri regulyatsiya qilingan mRNKning 3 'uchiga bog'lanish qobiliyatiga ega. Bundan tashqari, Hbs1 / Dom34 kompleksi ribosomani ajratib, qayta ishlagandan so'ng, ekzosoma / chang'i kompleksini jalb qilishi ham ko'rsatilgan.

Ribozomani ozod qilish

Bakteriyalarda trans-translyatsiya, yuqori darajada saqlanib qolgan mexanizm, to'xtovsiz RNK to'planishiga to'g'ridan-to'g'ri qarshi vosita bo'lib, parchalanishni keltirib chiqaradi va noto'g'ri tartibga solingan ribosomani bo'shatadi. Dastlab kashf etilgan Escherichia coli, trans-tarjima jarayoni tmRNKning to'xtab qolgan ribosomaga barqaror bog'lanishiga imkon beradigan transfer-xabarchi RNK (tmRNA) va kofaktor SmpB oqsilining o'zaro ta'siri natijasida amalga oshiriladi.[4] Hozirgi tmRNA modeli tRNKga taqlid qilish uchun tmRNA va SmpB o'zaro ta'sir o'tkazishini ta'kidlaydi. SmpB oqsili to'xtab qolish nuqtasini taniydi va tmRNA ni ribosoma A joyiga bog'lanishiga yo'naltiradi.[4] Bog'langanidan so'ng, SmpB zaryadlangan alaninni ehson qilish orqali noto'g'ri ishlaydigan polipeptid zanjiri bilan transpeptidatsiya reaktsiyasiga kirishadi.[4] Ushbu jarayon orqali to'xtab qolgan va nuqsonli mRNK ketma-ketligi SmpB RNK ketma-ketligi bilan almashtiriladi, bu esa mRNK ning C-terminaliga degradatsiyani kuchaytiradigan 11 ta aminokislota yorlig'ini qo'shishni kodlaydi.[4] RNKning o'zgartirilgan qismi aminokislotalar yorlig'i bilan birga tarjima qilinadi va to'liq bo'lmagan xususiyatlarini namoyish etadi, ogohlantiradi va hujayra ichidagi proteazalarga ushbu zararli protein parchalarini olib tashlashga imkon beradi, bu esa zararlangan mRNKdagi to'xtab qolgan ribosomalarning ishlashini davom ettiradi.[4]

mRNA degradatsiyasi

Ko'p fermentlar va oqsillar mRNKning parchalanishida rol o'ynaydi. Masalan, ichida Escherichia coli uchta ferment mavjud: RNase II, PNPase va RNase R.[3] RNase R - bu 3'-5 'ekzoribonukleaza, u nuqsonli mRNKning parchalanishi uchun yollanadi.[5] RNase R ikkita tizimli domenga ega, N-terminalli spiral-burilish-spiral (HTH) va C-terminal lizin (K-ga boy) domen.[6] Ushbu ikkita domen faqat RNase R ga xos bo'lib, ular oqsilning selektivligi va o'ziga xosligini belgilovchi omillar sifatida belgilanadi.[7] K-ga boy domen tinimsiz mRNKning degradatsiyasida ishtirok etishi haqida dalillar ko'rsatilgan.[6] Ushbu domenlar boshqa RNases-da mavjud emas. RNase II va RNase R ikkalasi ham RNR oilasining a'zolari bo'lib, ular birlamchi ketma-ketlik va domen arxitekturasida diqqatga sazovor o'xshashlikka ega.[2] Biroq, RNase R mRNA ni samarali ravishda parchalash qobiliyatiga ega, RNase II esa parchalanish jarayonida kam samaradorlikka ega. Shunga qaramay, mRNA ning RNase R orqali parchalanishining o'ziga xos mexanikasi sir bo'lib qoldi.[5]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Vasudevan; Peltz, SW; Uilush, KJ; va boshq. (2002). "To'xtovsiz parchalanish - yangi mRNA kuzatuv yo'li". BioEssays. 24 (9): 785–8. doi:10.1002 / bies.10153. PMID  12210514.
  2. ^ a b Venkataraman, K; Guja, KE; Garsiya-Dias, M; Karzay, AW (2014). "To'xtovsiz mRNK yemirilishi: translyatsiya vositachiligidagi ribosomalarni qutqarishning o'ziga xos xususiyati". Mikrobiologiya chegaralari. 5: 93. doi:10.3389 / fmicb.2014.00093. PMC  3949413. PMID  24653719.
  3. ^ a b Vu, X; Brewer, G (2012). "Sutemizuvchilar hujayralarida mRNK barqarorligini tartibga solish: 2.0". Gen. 500 (1): 10–21. doi:10.1016 / j.gene.2012.03.021. PMC  3340483. PMID  22452843.
  4. ^ a b v d e Karzay, A. Vali; Roche, Erik D.; Zauer, Robert T.; (2000). "SsrA-SmpB tizimi oqsillarni belgilash, degradatsiyalash va ribosomalarni qutqarish". Tabiat, strukturaviy biologiya. 7: 449-455.
  5. ^ a b Alberts, Bryus (2002). Hujayraning molekulyar biologiyasi 4-nashr. Nyu-York: Garland fani. ISBN  978-0-8153-3218-3.
  6. ^ a b Vasudevan, Shobha; Pelts, Styuart V.; Wilusz, Kerol J. (sentyabr 2002). "To'xtovsiz parchalanish - yangi mRNA kuzatuv yo'li". BioEssays. 24 (9): 785–788. doi:10.1002 / bies.10153. ISSN  0265-9247. PMID  12210514.
  7. ^ Ge, Jiyun; Mehta, Preeti; Richards, Jeymi; Vali Karzay, A. (27 sentyabr, 2010 yil). "To'xtovsiz mRNK yemirilishi ribosomada boshlanadi". Molekulyar mikrobiologiya. 78 (5): 1159–1170. doi:10.1111 / j.1365-2958.2010.07396.x. PMC  3056498. PMID  21091502.

Tashqi havolalar