PPIC - PPIC

Xuddi shu qisqartma bilan muassasa uchun qarang Kaliforniya davlat siyosati instituti.
PPIC
Protein PPIC PDB 2esl.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarPPIC, CYPC, peptidilprolyl izomeraza S
Tashqi identifikatorlarOMIM: 123842 MGI: 97751 HomoloGene: 727 Generkartalar: PPIC
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 5 (odam)
Chr.Xromosoma 5 (odam)[1]
Xromosoma 5 (odam)
PPIC uchun genomik joylashuv
PPIC uchun genomik joylashuv
Band5q23.2Boshlang123,023,250 bp[1]
Oxiri123,036,725 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE PPIC 204517 da fs.png

Ps.Bng da PBB GE PPIC 204518 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

5480

19038

Ansambl

ENSG00000168938

ENSMUSG00000024538

UniProt

P45877

P30412

RefSeq (mRNA)

NM_000943

NM_008908

RefSeq (oqsil)

NP_000934

NP_032934

Joylashuv (UCSC)Chr 5: 123.02 - 123.04 MbChr 18: 53.41 - 53.42 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Peptidil-prolil sis-trans izomeraza S (PPIC) - bu ferment odamlarda kodlanganligi PPIC gen xromosomada 5. Peptidil-prolil cis-trans izomerase (PPIase) oilasi a'zosi sifatida bu oqsil katalizator cis-trans izomerizatsiya prolin imidic peptid bog'lari bu oqsillarni katlamasini yoki ta'mirlanishini engillashtirishga imkon beradi.[5][6][7] Bundan tashqari, PPIC ko'plab biologik jarayonlarda, shu jumladan mitoxondriyada ishtirok etadi metabolizm, apoptoz, oksidlanish-qaytarilish va yallig'lanish, shuningdek, tegishli kasalliklar va sharoitlarda, masalan ishemik reperfuziya shikastlanishi, OITS va saraton.[8][9][10][11]

Tuzilishi

Boshqa siklofilinlar singari, PPIC ham hidrofob yadroga ega b-barrel tuzilishini hosil qiladi. Ushbu b-bochka sakkizta anti-parallel b-ipdan iborat bo'lib, yuqori va pastki qismida ikkita a-spiral bilan yopilgan. Bundan tashqari, iplarning burilishlari va halqalari bochkaning egiluvchanligiga yordam beradi.[10] PPIC, xususan, 212 qoldiqdan iborat bo'lib, N-terminalda hidrofobik, ER-maqsadli ketma-ketlikni o'z ichiga oladi. PPIase domeni PPIA uchun homologdir va CsA tomonidan bog'lanib, inhibe qilinishi mumkin.[6]

Funktsiya

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil peptidil-prolil cis-trans izomeraza a'zosi (PPIase ) oila. PPIazlar katalizatsiyalashadi sis-trans izomerizatsiyasi ning prolin imidik peptid aloqalari oligopeptidlar va tezlashtiring katlama oqsillar.[7] Odatda, PPIazalar barcha eubakteriyalarda va eukaryotlarda, shuningdek bir nechta arxebakteriyalarda uchraydi va shu bilan yuqori darajada saqlanib qoladi.[8][12] PPIase oilasi, shuningdek, tarkibiy jihatdan ajralib turadigan uchta oilaga bo'linadi: siklofilin (CyP), FK506-biriktiruvchi oqsil (FKBP ) va parvulin (Pvn).[8][10] Siklofilin sifatida PPI bog'lanadi siklosporin A (CsA) va hujayra ichida bo'lishi yoki hujayra tomonidan ajratilishi mumkin.[9] Eukaryotlarda siklofilinlar hamma joyda ko'p hujayra va to'qima turlariga joylashadi, ammo PPIC ayniqsa buyrakda yuqori darajada namoyon bo'ladi.[9][10][13] PPIaz va oqsil chaperone faolligidan tashqari, siklofilinlar mitoxondriyal metabolizmda, apoptozda, immunologik javobda, yallig'lanishda va hujayralar o'sishi va ko'payishida ham ishlaydi.[8][9][10] PPIB bilan bir qatorda, PPIC mahalliylashtiriladi endoplazmatik to'r (ER), bu erda oksidlanish-qaytarilish gomeostazini saqlaydi. Ushbu ikkita siklofilinning kamayishi ERning giperoksidlanishiga olib keladi.[11] Miyada PPIC komplekslari siklofilin S bilan bog'liq protein Kalsineurin / NFAT yo'li orqali mikrogliya va makrofag funktsiyasini faollashtirish uchun (CyCAP).[13]

Klinik ahamiyati

Tsiklofilin sifatida PPIC immunosupressiv preparatni CsA bilan bog'lab, CsA-siklofilin kompleksini hosil qiladi va keyinchalik uni maqsad qiladi kalsineurin T-hujayraning faollashuvi uchun signalizatsiya yo'lini inhibe qilish.[9]

Kardiyak miyogen hujayralarda siklofilinlarning issiqlik zarbasi va gipoksiya-oksidlanish bilan faollashishi hamda issiqlik zarbasi oqsillari bilan murakkablashishi kuzatilgan. Shunday qilib, siklofilinlar ishemiya-reperfuziya shikastlanishi paytida kardioprotektsiya jarayonida ishlashi mumkin.[9] Xuddi shunday, PPIC CyCAP bilan kompleksni hosil qilib, omon qolish mexanizmlarini faollashtirish va miyadagi ishemik zararni yumshatish orqali neyroprotektsiyani keltirib chiqarishi mumkin.[13]

Hozirgi vaqtda siklofilin ekspressioni saraton patogenezi bilan juda o'zaro bog'liq, ammo o'ziga xos mexanizmlarni aniqlash kerak.[9] Masalan, tadqiqotlar PPICni epitelial tuxumdon saratonida (EOC) aylanma o'simta hujayralarining ishonchli ko'rsatkichi sifatida aniqlaydi va shuning uchun saratonni aniqlash va davolash uchun biomarker bo'lib xizmat qilishi mumkin.[14]

O'zaro aloqalar

PPIC ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000168938 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024538 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Sugano S, Kim DW, Yu YS, Mizushima-Sugano J, Yoshitomo K, Vatanabe S, Suzuki F, Yamaguchi N (oktyabr 1992). "Yadro lokalizatsiya potentsialiga ega oqsillarni kodlovchi cDNA-larni ajratib olish uchun epitop bilan belgilangan cDNA kutubxonasidan foydalanish". Gen. 120 (2): 227–33. doi:10.1016/0378-1119(92)90097-9. PMID  1383094.
  6. ^ a b Schneider H, Charara N, Schmitz R, Wehrli S, Mikol V, Zurini MG, Kuesniaux VF, Movva NR (Iyul 1994). "Inson siklophilin C: birlamchi tuzilishi, to'qimalarning tarqalishi va siklosporinlar uchun bog'lanishning o'ziga xosligini aniqlash". Biokimyo. 33 (27): 8218–24. doi:10.1021 / bi00193a007. PMID  8031755.
  7. ^ a b "Entrez Gen: PPIC peptidilprolyl izomeraza C (siklofilin C)".
  8. ^ a b v d Kazui T, Inoue N, Yamada O, Komatsu S (Yanvar 1992). "Aorta kamarining anevrizmalari uchun operatsiya vaqtida tanlangan miya perfuziyasi: qayta baholash". Ko'krak qafasi jarrohligi yilnomasi. 53 (1): 109–14. doi:10.1016 / 0003-4975 (92) 90767-x. PMID  1530810.
  9. ^ a b v d e f g Yao Q, Li M, Yang X, Chay X, Fisher V, Chen S (2005 yil mart). "Siklofilinlarning saraton va boshqa organ tizimlaridagi rollari". Jahon jarrohlik jurnali. 29 (3): 276–80. doi:10.1007 / s00268-004-7812-7. PMID  15706440. S2CID  11678319.
  10. ^ a b v d e Vang T, Yun CH, Gu SY, Chang WR, Liang DC (avgust 2005). "1.88 hCyP33 C domenining kristalli tuzilishi: peptidil-prolil sis-trans izomerazasining yangi sohasi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 333 (3): 845–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.006. PMID  15963461.
  11. ^ a b Stocki P, Chapman DC, Beach LA, Williams DB (Avgust 2014). "B va C siklofilinlarining kamayishi endoplazmatik retikulum oksidlanish-qaytarilish gomeostazining regulyatsiyasiga olib keladi". Biologik kimyo jurnali. 289 (33): 23086–96. doi:10.1074 / jbc.M114.570911. PMC  4132807. PMID  24990953.
  12. ^ Hoffmann H, Schiene-Fischer C (Iyul 2014). "Hujayradan tashqari siklofilinlarning funktsional jihatlari". Biologik kimyo. 395 (7–8): 721–35. doi:10.1515 / hsz-2014-0125. PMID  24713575. S2CID  32395688.
  13. ^ a b v d e f g Yamaguchi R, Xosaka M, Torii S, Xou N, Saito N, Yoshimoto Y, Imai H, Takeuchi T (iyun 2011). "Makrofaglarda NFAT faollashuvi orqali fagotsitik funktsiyalarni siklofilin S bilan bog'liq oqsillarni regulyatsiyasi". Miya tadqiqotlari. 1397: 55–65. doi:10.1016 / j.brainres.2011.03.036. PMID  21435337. S2CID  28737748.
  14. ^ Obermayr E, Castillo-Tong DC, Pils D, Speiser P, Braicu I, Van Gorp T, Mahner S, Sehouli J, Vergote I, Zeillinger R (Yanvar 2013). "Yumurtalik saratoniga chalingan bemorlarda aylanma o'sma hujayralarining molekulyar tavsifi ularning prognostik ahamiyatini yaxshilaydi - OVCAD konsortsiumini o'rganish". Ginekologik onkologiya. 128 (1): 15–21. doi:10.1016 / j.ygyno.2012.09.021. PMID  23017820.
  15. ^ a b Trahey M, Vaysman IL (Mar 1999). "Siklofilin S bilan bog'liq protein: invivo jonli ravishda endotoksin va proinflamatuar reaktsiyalarni kamaytiradigan normal sekretsiya qilingan glikoprotein". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 96 (6): 3006–11. doi:10.1073 / pnas.96.6.3006. PMC  15885. PMID  10077627.

Qo'shimcha o'qish