PTPN22 - PTPN22 - Wikipedia

PTPN22
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2P6X, 2QCJ, 2QCT, 3BRH, 3H2X, 3OLR, 3OMH, 4J51
Identifikatorlar
Taxalluslar	PTPN22, oqsil tirozin fosfataza, retseptorlari bo'lmagan 22 turi (limfoid), LYP, LYP1, LYP2, PEP, PTPN8, oqsil tirozin fosfataza, retseptorlari bo'lmagan 22 turi, PTPN22.6, PTPN22.5, oqsil tirozin fosfataza retseptorlari bo'lmagan 22
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 600716 MGI: 107170 HomoloGene: 7498 Generkartalar: PTPN22
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 1 (odam)
Oxiri	113,871,753 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 3 (sichqoncha)
Oxiri	103,912,247 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• fosfoprotein fosfataza faolligi; • SH3 domenini bog'lash; • fosfataza faolligi; • kinaz bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • gidrolaza faolligi; • ubikuitin protein ligaz bilan bog'lanish; • oqsil tirozin fosfataza faolligi;
Uyali komponent	• sitoplazma; • sitoplazmaning perinuklear mintaqasi; • plazma membranasining sitoplazmatik tomoni; • hujayra yadrosi; • sitozol;
Biologik jarayon	• oqsil K63 bilan bog'langan hamma joyda ijobiy tartibga solish; • NIK / NF-kappaB signalizatsiyasini tartibga solish; • tug'ma immun javobni tartibga solish; • tabiiy killer hujayralarining ko'payishini tartibga solish; • pullik kabi retseptorlari 3 signal yo'lining ijobiy regulyatsiyasi; • T xujayrasi retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • B hujayra retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • fosfoanandamid deposforillanish; • immunitet tizimi jarayoni; • 2 ta signal yo'lini o'z ichiga olgan nukleotidlarni bog'laydigan oligomerizatsiya maydonini salbiy regulyatsiyasi; • p38MAPK kaskadining salbiy regulyatsiyasi; • oqsilni deposforillanish; • gen ekspressionining salbiy regulyatsiyasi; • T hujayralari retseptorlari signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • muramil dipeptidga uyali javob; • avtofagiya; • lipopolisakkaridga javob; • T hujayralarining differentsiatsiyasi; • gen ekspressionining ijobiy regulyatsiyasi; • ERK1 va ERK2 kaskadining ijobiy regulyatsiyasi; • pullik kabi retseptorlari 4 signalizatsiya yo'lining ijobiy regulyatsiyasi; • o'sma nekrozi omillarini ishlab chiqarishni salbiy tartibga solish; • otofagiyaning salbiy regulyatsiyasi; • JUN kinaz faolligini salbiy tartibga solish; • T hujayralari faollashuvining salbiy regulyatsiyasi; • I turdagi interferon ishlab chiqarishni ijobiy tartibga solish; • lipopolisakkarid vositachiligidagi signalizatsiya yo'li; • deposforillanish; • peptidil-tirozin deposforillanish; • T xujayrasi retseptorlari signalizatsiyasi yo'li;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	26191
	19260
	ENSG00000134242
	ENSMUSG00000027843
	Q9Y2R2
	P29352
	NM_001193431; NM_001308297; NM_012411; NM_015967
	NM_008979
	NP_001180360; NP_001295226; NP_036543; NP_057051
	NP_033005
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Protein tirozin fosfataza, retseptorlari bo'lmagan 22 turi (limfoid), shuningdek, nomi bilan tanilgan PTPN22, a oqsil odamlarda kodlanganligi PTPN22 gen.^[5]^[6]^[7] Ushbu gen turli xil tarzda ifodalanishi mumkin shakllari. PTPN22 T va B hujayra retseptorlarining ta'sirchanligiga ta'sir qiladi va mutatsiyalar otoimmun kasalliklar xavfining oshishi yoki pasayishi bilan bog'liq.

Molekulyar biologiya

Gen Kromda (minus) sentromeraning (1p13.2) yonida joylashgan 1-xromosomaning qisqa qo'lida joylashgan. ip. U uzunligi 57,898 asos bo'lib, 807 aminokislotadan iborat oqsilni (molekulyar og'irligi 91,705 Da) kodlaydi. 24 bor exons genda va 10 ta alohida oqsilni kodlovchi 21 ta transkript variantlari ma'lum. Oqsillar sitoplazma.^{[iqtibos kerak ]}

Funktsiya

Ushbu gen a-ni kodlaydi oqsil tirozin fosfataza bu birinchi navbatda ifodalangan limfoid to'qimalar. Ushbu ferment immunitet reaktsiyasi bilan bog'liq bo'lgan bir nechta signalizatsiya yo'llarida ishtirok etadi. Murin fosfataza modellari asosida,^[8]^[9] tarkibiy identifikatsiya,^[10] va inson genetikasi^[11] fosfataza bilan komplekslarni hosil qiladi C-src tirozin kinaz (Csk), Src oila a'zolarini boshqarish bilan bog'liq. Arg620Trp mutatsiyasi Csk bilan bog'lanishni buzadi, T va B hujayra retseptorlarining ta'sirchanligini o'zgartiradi va otoimmun kasalliklar bilan bog'liq. Fosfataza tartibga soladigan boshqa takliflar mavjud CBL funktsiyasi T xujayrasi retseptorlari signalizatsiya yo'li.^[5] Boshqa o'zaro ta'sirlar ehtimol.

Kasallik assotsiatsiyasi

Umumiy 1858T (rs2476601) Arg620Trp noma'lum bitta nukleotid polimorfizmi joylashgan PTPN22 geni otoimmun buzilishlar bilan bog'liq, shu jumladan xavfning oshishi 1-toifa diabet, romatoid artrit, lupus, Vitiligo va Graves kasalligi, ammo xavfning pasayishi Crohn kasalligi.^[12]^[13]^[14]

Yaqinda o'tkazilgan bir tadqiqot shuni ko'rsatadiki, mutatsiya aholi soniga ko'ra umr ko'rishni kamaytirmaydi.^[15] Mutatsiya inson evolyutsiyasida saqlanib qolishi mumkin, chunki u yuqumli kasallikka giper-immunitet ta'sirini ko'rsatishi mumkin.^[16]

Mutatsiyalar PTPN22 haddan tashqari vakili ko'krak bezi saratoni.^[17]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000134242 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027843 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b EntrezGene 26191
^ Metyus RJ, Boun DB, Flores E, Tomas ML (1992 yil may). "Gematopoietik hujayra ichidagi oqsil tirozin fosfatazalarining xarakteristikasi: tarkibida SH2 domenini o'z ichiga olgan fosfataza va boshqa tarkibida prolin, glutamik kislota, serin va treoninlarga boy sekanslar". Mol. Hujayra. Biol. 12 (5): 2396–405. doi:10.1128 / mcb.12.5.2396. PMC 364412. PMID 1373816.
^ Cohen S, Dadi H, Shaul E, Sharfe N, Roifman CM (mart 1999). "Limfoidga xos, induktsiya qilinadigan odam oqsilli tirozin fosfataza, Lipni klonlash va tavsifi". Qon. 93 (6): 2013–24. doi:10.1182 / qon.V93.6.2013.406k25_2013_2024. PMID 10068674.
^ Cloutier JF, Veillette A (1996 yil sentyabr). "T hujayralari va boshqa gemopoetik hujayralardagi tirozin fosfataza oqsillari bilan inhibitiv tirozin oqsil kinaz p50csk assotsiatsiyasi". EMBO J. 15 (18): 4909–18. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00871.x. PMC 452228. PMID 8890164.
^ Gregorieff A, Cloutier JF, Veillette A (1998 yil may). "Protein-tirozin fosfataza PEP ning Src homologiyasi 3 inhibitor tirozin oqsil kinaz p50 (csk) domeni bilan assotsiatsiyasi ketma-ketligi talablari". J. Biol. Kimyoviy. 273 (21): 13217–22. doi:10.1074 / jbc.273.21.13217. PMID 9582365.
^ Ghose R, Shextman A, Goger MJ, Ji H, Cowburn D (noyabr 2001). "Csk SH3 domeni va uning tabiiy ligandini o'z ichiga olgan yangi, o'ziga xos o'zaro ta'sir". Nat. Tuzilishi. Biol. 8 (11): 998–1004. doi:10.1038 / nsb1101-998. PMID 11685249.
^ Vang T, Miletic AV, Bottini N, Mustelin T (sentyabr 2007). "Odamning immunitetidagi oqsilli tirozin fosfataza PTPN22". Otoimmunitet. 40 (6): 453–61. doi:10.1080/08916930701464897. PMID 17729039.
^ Qu H, Tessier MC, Hudson TJ, Polychronakos C (mart 2005). "Oila asosida o'tkazilgan tadqiqotda PTPN22 oqsil tirozin fosfatazasi bilan R620W polimorfizmining assotsiatsiyasini tasdiqlash". J. Med. Genet. 42 (3): 266–70. doi:10.1136 / jmg.2004.026971. PMC 1736025. PMID 15744042.
^ Vang T, Congia M, Macis MD, Musumeci L, Orrú V, Zavattari P, Nika K, Tautz L, Taskén K, Cucca F, Mustelin T, Bottini N (dekabr 2005). "Otoimmun bilan bog'liq lenfoid tirozin fosfataza - bu funktsiyani oshirish variantidir". Nat. Genet. 37 (12): 1317–9. doi:10.1038 / ng1673. PMID 16273109.
^ Ghorban KH, Ezzeddini R, Eslami M, Yousefi B, Sadighi Moghaddam B, Tahoori MT, Dadmanesh M, Salek Farrokhi A (dekabr 2019). "PTPN22 1858 C / T polimorfizmi romatoid artritda potentsial patogen mexanizm sifatida sitokin profilining o'zgarishi bilan bog'liq". Immunologiya xatlari. 216: 106–113. doi:10.1016 / j.imlet.2019.10.010. PMID 31669381.
^ Napolioni V, Natali A, Sakkuchchi P, Lucarini N (avgust 2011). "PTPN22 1858C> T (R620W) funktsional polimorfizm va insonning uzoq umr ko'rishi". Mol. Biol. Rep. 38 (6): 4231–5. doi:10.1007 / s11033-010-0546-8. PMID 21113673.
^ "PTPN22". NLM (AQSh Gov). Olingan 5 aprel 2013.
^ Koboldt DC (2012). "Insonning ko'krak o'smalarining kompleks molekulyar portretlari". Tabiat. Tabiatni nashr etish guruhi. 490 (7418): 61–70. doi:10.1038 / tabiat11412. PMC 3465532. PMID 23000897.

Qo'shimcha o'qish

Gregersen PK (2005). "Romatoid artritda genlarni aniqlash yo'llari: PTPN22 va undan tashqarida". Immunol. Vah. 204: 74–86. doi:10.1111 / j.0105-2896.2005.00243.x. PMID 15790351.
Tovar O, Gough S, Heward J (2005). "HLA, CTLA-4 va PTPN22: umumiy immunitetning genetik master-kaliti?". Mutaxassis Rev Mol Med. 7 (23): 1–15. doi:10.1017 / S1462399405009981. PMID 16229750.
Bottini N, Vang T, Cucca F, Mustelin T (2006). "Birinchi turdagi diabet va boshqa otoimmun kasalliklarda PTPN22 ning roli". Semin. Immunol. 18 (4): 207–13. doi:10.1016 / j.smim.2006.03.008. PMID 16697661.
Györloff-Vingren, A .; Saxena, M .; Xan, S .; Vang X.; Alonso, A .; Renedo, M .; Oh, P.; Uilyams, S .; Shnitser, J .; Mustelin, T. (2000). "T hujayralarida hujayra ichidagi oqsil tirozin fosfatazalarining subcellular lokalizatsiyasi". Evropa immunologiya jurnali. 30 (8): 2412–2421. doi:10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2412 :: AID-IMMU2412> 3.0.CO; 2-J. PMID 10940933.
Hill RJ, Zozulya S, Lu YL, Uord K, Gishizki M, Jallal B (2002). "Lypfoid oqsil tirozin fosfataza Lyp adapter molekulasi Grb2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va T-hujayraning faollashuvining salbiy regulyatori sifatida ishlaydi". Muddati Gematol. 30 (3): 237–44. doi:10.1016 / S0301-472X (01) 00794-9. PMID 11882361.
Chien V, Tidow N, Uilyamson EA, Shih LY, Krug U, Kettenbax A, Fermin AC, Roifman CM, Koeffler HP (2003). "Miyeloid tirozin fosfataza, Lipning xarakteristikasi va uning Bcr-Abl signalini o'tkazish yo'lidagi roli". J. Biol. Kimyoviy. 278 (30): 27413–20. doi:10.1074 / jbc.M304575200. PMID 12764153.
Bottini N, Musumeci L, Alonso A, Rahmouni S, Nika K, Rostamkhani M, MacMurray J, Meloni GF, Lucarelli P, Pellecchia M, Eisenbarth GS, Comings D, Mustelin T (2004). "Lenfoid tirozin fosfatazaning funktsional varianti I tip diabet bilan bog'liq". Nat. Genet. 36 (4): 337–8. doi:10.1038 / ng1323. PMID 15004560.
Begovich AB, Karlton VE, Honigberg LA, Shrodi SJ, Chokkalingam AP, Aleksandr XS, Ardi KG, Xuan Q, Smit AM, Spoerke JM, Conn MT, Chang M, Chang SY, Saiki RK, Kataniyalik JJ, Leong DU, Garsiya VE , McAllister LB, Jeffery DA, Lee AT, Batliwalla F, Remmers E, Criswell LA, Seldin MF, Kastner DL, Amos CI, Sninsky JJ, Gregersen PK (2004). "Tirozin fosfataza (PTPN22) oqsilini kodlovchi gendagi missens bitta nukleotidli polimorfizm romatoid artrit bilan bog'liq". Am. J. Xum. Genet. 75 (2): 330–7. doi:10.1086/422827. PMC 1216068. PMID 15208781.
Kyogoku C, Langefeld CD, Ortmann WA, Lee A, Selby S, Carlton VE, Chang M, Ramos P, Baechler EC, Batliwalla FM, Novitzke J, Williams AH, Gillett C, Rodine P, Graham RR, Ardlie KG, Gaffney PM , Moser KL, Petri M, Begovich AB, Gregersen PK, Behrens TW (2004). "Tirozin fosfataza PTPN22 oqsilining R620W polimorfizmining inson SLE bilan genetik assotsiatsiyasi". Am. J. Xum. Genet. 75 (3): 504–7. doi:10.1086/423790. PMC 1182029. PMID 15273934.
Smiths D, Cooper JD, Collins JE, Heward JM, Franklyn JA, Howson JM, Vella A, Nutland S, Rance HE, Maier L, Barratt BJ, Guja C, Ionescu-Tirgistist C, Savage DA, Dunger DB, Widmer B, Strachan DP, Ring SM, Walker N, Clayton DG, Twells RC, Gough SC, Todd JA (2004). "1-toifa diabet bilan limfoid tirozin fosfataza lokusi (LYP / PTPN22) o'rtasidagi aloqani replikatsiyasi va uning umumiy otoimmunitet lokusi sifatidagi roli". Qandli diabet. 53 (11): 3020–3. doi:10.2337 / diabet.53.11.3020. PMID 15504986.
Ladner MB, Bottini N, Valdes AM, Noble JA (2005). "Birinchi turdagi diabet bilan PTPN22 genining yagona nukleotid polimorfizmi C1858T assotsiatsiyasi". Hum. Immunol. 66 (1): 60–4. doi:10.1016 / j.humimm.2004.09.016. PMID 15620463.
Orozco G, Sanches E, Gonsales-Gay MA, Lopes-Nevot MA, Torres B, Kliz R, Ortego-Centeno N, Ximenes-Alonso J, Paskual-Salsedo D, Balsa A, de Pablo R, Nunes-Roldan A, Gonsales -Escribano MF, Martin J (2005 yil yanvar). "Revmatoid artrit va tizimli qizil yuguruk kasalligi bilan limfoid oqsil fosfataza kodlovchi PTPN22 funktsional bir nukleotidli polimorfizm assotsiatsiyasi". Artrit revmi. 52 (1): 219–24. doi:10.1002 / 20771-modda. PMID 15641066.
Steer S, Lad B, Grumley JA, Kingsley GH, Fisher SA (2005). "Britaniyalik populyatsiyada romatoid artrit xavfi yuqori bo'lgan protein tirozin fosfataza genidagi R602W assotsiatsiyasi: kasallikning erta boshlanishi / zo'ravonlik ta'sirining dalili". Artrit revmi. 52 (1): 358–60. doi:10.1002 / 20737-modda. PMID 15641088.
Zheng V, She JX (2005). "Lenfoid tirozin fosfataza (PTPN22) va 1-toifa diabet o'rtasidagi genetik bog'liqlik". Qandli diabet. 54 (3): 906–8. doi:10.2337 / diabet.54.3.906. PMID 15734872.
Zhernakova A, Eerligh P, Wijmenga C, Barrera P, Roep BO, Koeleman BP (2005). "Gollandiya populyatsiyasida PTPN22 kodlash variantining otoimmun kasalliklari bilan differentsial assotsiatsiyasi". Genlar immuniteti. 6 (6): 459–61. doi:10.1038 / sj.gene.6364220. PMID 15875058.

Tashqi havolalar

Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: Q9Y2R2 (Tirozin-oqsil fosfataza retseptorlari bo'lmagan 22 turi) da PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000134242 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027843 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] EntrezGene 26191

[pmid1373816-6] Metyus RJ, Boun DB, Flores E, Tomas ML (1992 yil may). "Gematopoietik hujayra ichidagi oqsil tirozin fosfatazalarining xarakteristikasi: tarkibida SH2 domenini o'z ichiga olgan fosfataza va boshqa tarkibida prolin, glutamik kislota, serin va treoninlarga boy sekanslar". Mol. Hujayra. Biol. 12 (5): 2396–405. doi:10.1128 / mcb.12.5.2396. PMC 364412. PMID 1373816.

[pmid10068674-7] Cohen S, Dadi H, Shaul E, Sharfe N, Roifman CM (mart 1999). "Limfoidga xos, induktsiya qilinadigan odam oqsilli tirozin fosfataza, Lipni klonlash va tavsifi". Qon. 93 (6): 2013–24. doi:10.1182 / qon.V93.6.2013.406k25_2013_2024. PMID 10068674.

[8] Cloutier JF, Veillette A (1996 yil sentyabr). "T hujayralari va boshqa gemopoetik hujayralardagi tirozin fosfataza oqsillari bilan inhibitiv tirozin oqsil kinaz p50csk assotsiatsiyasi". EMBO J. 15 (18): 4909–18. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00871.x. PMC 452228. PMID 8890164.

[9] Gregorieff A, Cloutier JF, Veillette A (1998 yil may). "Protein-tirozin fosfataza PEP ning Src homologiyasi 3 inhibitor tirozin oqsil kinaz p50 (csk) domeni bilan assotsiatsiyasi ketma-ketligi talablari". J. Biol. Kimyoviy. 273 (21): 13217–22. doi:10.1074 / jbc.273.21.13217. PMID 9582365.

[10] Ghose R, Shextman A, Goger MJ, Ji H, Cowburn D (noyabr 2001). "Csk SH3 domeni va uning tabiiy ligandini o'z ichiga olgan yangi, o'ziga xos o'zaro ta'sir". Nat. Tuzilishi. Biol. 8 (11): 998–1004. doi:10.1038 / nsb1101-998. PMID 11685249.

[11] Vang T, Miletic AV, Bottini N, Mustelin T (sentyabr 2007). "Odamning immunitetidagi oqsilli tirozin fosfataza PTPN22". Otoimmunitet. 40 (6): 453–61. doi:10.1080/08916930701464897. PMID 17729039.

[pmid15719322-12] Qu H, Tessier MC, Hudson TJ, Polychronakos C (mart 2005). "Oila asosida o'tkazilgan tadqiqotda PTPN22 oqsil tirozin fosfatazasi bilan R620W polimorfizmining assotsiatsiyasini tasdiqlash". J. Med. Genet. 42 (3): 266–70. doi:10.1136 / jmg.2004.026971. PMC 1736025. PMID 15744042.

[pmid16273109-13] Vang T, Congia M, Macis MD, Musumeci L, Orrú V, Zavattari P, Nika K, Tautz L, Taskén K, Cucca F, Mustelin T, Bottini N (dekabr 2005). "Otoimmun bilan bog'liq lenfoid tirozin fosfataza - bu funktsiyani oshirish variantidir". Nat. Genet. 37 (12): 1317–9. doi:10.1038 / ng1673. PMID 16273109.

[pmid131669381-14] Ghorban KH, Ezzeddini R, Eslami M, Yousefi B, Sadighi Moghaddam B, Tahoori MT, Dadmanesh M, Salek Farrokhi A (dekabr 2019). "PTPN22 1858 C / T polimorfizmi romatoid artritda potentsial patogen mexanizm sifatida sitokin profilining o'zgarishi bilan bog'liq". Immunologiya xatlari. 216: 106–113. doi:10.1016 / j.imlet.2019.10.010. PMID 31669381.

[15] Napolioni V, Natali A, Sakkuchchi P, Lucarini N (avgust 2011). "PTPN22 1858C> T (R620W) funktsional polimorfizm va insonning uzoq umr ko'rishi". Mol. Biol. Rep. 38 (6): 4231–5. doi:10.1007 / s11033-010-0546-8. PMID 21113673.

[Genetics_Home_Reference-16] "PTPN22". NLM (AQSh Gov). Olingan 5 aprel 2013.

[nature11412-17] Koboldt DC (2012). "Insonning ko'krak o'smalarining kompleks molekulyar portretlari". Tabiat. Tabiatni nashr etish guruhi. 490 (7418): 61–70. doi:10.1038 / tabiat11412. PMC 3465532. PMID 23000897.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]