ParDE II toksin-antitoksin tizimi - ParDE type II toxin-antitoxin system
| II toksin-anittoksin tizimining ParE toksini | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 arxeoel rele-relb kompleksining kristalli tuzilishi pirokok horikoshii ot3 dan | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | ParE_toksin | ||||||||
| Pfam | PF05016 | ||||||||
| Pfam klan | CL0136 | ||||||||
| InterPro | IPR007712 | ||||||||
| |||||||||
| ParD | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | ParD | ||||||||
| Pfam | PF09386 | ||||||||
| Pfam klan | CL0057 | ||||||||
| InterPro | IPR018985 | ||||||||
| |||||||||
The parDE II toksin-antitoksin tizimi ning bir misoli bakterial toksin-antitoksin (TA) ikkitasini kodlaydigan tizimlar oqsillar, biri kuchli inhibitor hujayralar ko'payishi (toksin) va boshqasiga o'ziga xos antidot (antitoksin). Ushbu tizimlar imtiyozli ravishda o'sishni kafolatlaydi plazmid - yangi tug'ilgan chaqaloqni o'ldirish orqali bakterial populyatsiyada qiz hujayralarini olib borish bakteriyalar hujayralarni bo'linishida (ajratilganidan keyin o'ldirish) plazmid nusxasini meros qilib olmaganlar.[1]
ParD a plazmid lenta-spiral-spiral DNKini hosil qiluvchi toksinlarga qarshi majburiy tuzilishi.[2] Bu barqarorlashadi plazmidlar ParE ni inhibe qilish orqali toksiklik yilda hujayralar ParD va ParE ni ifodalaydi. ParD a hosil qiladi dimer va shuningdek tartibga soladi o'ziniki targ'ibotchi (parDE). CcdB bilan bo'lgani kabi, toksin maqsadidir DNK-giraza.[3] ParE toksinini induktsiya qilish hujayraning bo'linishini inhibe qiladi, lekin hujayra o'sishini emas.
ParD va ccD tizimlar tuzilishi va harakatlari jihatidan juda o'xshash ekanligi aniqlandi. Har bir tizimning antitoksin oqsili o'z tarkibidagi toksin bilan ta'sir o'tkazib, toksin faolligini zararsizlantiradi va bu jarayonda ikkalasining kompleksi samarali transkripsiyaga aylanadi. repressor.[4]
Tashqi havolalar
Adabiyotlar
- ^ Jensen RB, Gerdes K (1995). "Bakteriyalarda hujayraning dasturlashtirilgan o'lishi: proteik plazmid stabilizatsiyasi tizimlari". Mol mikrobiol. 17 (2): 205–10. doi:10.1111 / j.1365-2958.1995.mmi_17020205.x. PMID 7494469.
- ^ Oberer M, Zangger K, Prytulla S, Keller V (yanvar 2002). "RK2 plazmidining toksinlarga qarshi ParD tuzilishi jihatidan ikki qismdan iborat va DNK bilan bog'langan oqsillarning lenta-spiral-spiral oilasiga kiradi". Biokimyo. J. 361 (Pt 1): 41-7. doi:10.1042/0264-6021:3610041. PMC 1222296. PMID 11743881.
- ^ Fiebig A, Kastro Rojas CM, Siegal-Gaskins D, Krosson S (2010). "ParE / RelE-oilaviy toksin-antitoksin tizimlarining o'zaro ta'sirining o'ziga xosligi, toksikligi va paralogik to'plamining regulyatsiyasi". Mol mikrobiol. 77 (1): 236–51. doi:10.1111 / j.1365-2958.2010.07207.x. PMC 2907451. PMID 20487277.
- ^ Smit AB, Lopes-Villarejo J, Diago-Navarro E, Mitchenall LA, Barendregt A, Xek AJ va boshq. (2012). "ParD va ccd Bakterial Toksin-Antitoksin tizimlari uchun umumiy kelib chiqish, Toksin / Maqsad va Toksin / Antitoksin o'zaro ta'sirini tahlillari tomonidan tavsiya etilgan". PLOS ONE. 7 (9): e46499. doi:10.1371 / journal.pone.0046499. PMC 3460896. PMID 23029540.