Fitobakter - Phytobacter - Wikipedia

Fitobakter
Ilmiy tasnif
Qirollik:	Bakteriyalar
Filum:	Proteobakteriyalar
Sinf:	Gammaproteobakteriyalar
Buyurtma:	Enterobakteriyalar
Oila:	Enterobakteriyalar
Tur:	Fitobakter; Chjan va boshq. 2008
Tur turlari
	Fitobakteriya diazotrofikasi;
Turlar
	P. diazotrophicus ; P. ursingii; P. palmae ; P. massiliensis

Koloniyalari P. diazotrophicus MacConkey agarda.

Fitobakter - bu Gram-manfiy bakteriyalar ilgari oilaning turli nasllariga ajratilgan izolatlar guruhidan kelib chiqadi Enterobakteriyalar. Ushbu nasl birinchi marta Xitoyda yovvoyi guruchdan azot biriktiruvchi izolatlar asosida tashkil etilgan,^[1] shuningdek, 2013 yilda Braziliyada ko'p davlatli sepsis epidemiyasi paytida olingan bir qator izolatlarni ham o'z ichiga oladi ^[2]^[3] va retrospektiv ravishda, 1970-yillarda AQShda ajratilgan, dastlab Brennerning XII biotipiga birlashtirilgan madaniyat kollektsiyalarida mavjud bo'lgan bir nechta klinik shtammlar.^[4]^[5] Standart biokimyoviy baholash panellari etishmayapti Fitobakter spp. ma'lumotlar bazasidan, shuning uchun ko'pincha boshqalar bilan noto'g'ri identifikatsiyaga olib keladi Enterobakteriyalar turlari, ayniqsa Pantoea aglomeralari.^[2] Turlarning klinik izolatlari kengaytirilgan spektrning muhim manbai sifatida aniqlandi b-laktamaza va karbapenem - odatda genetik mobil elementlar vositachiligidagi qarshilik genlari. Birgalikda yuqadigan sezgir bakteriyalarni kuchli himoya qilish haqida ham xabar berilgan.^[6] Ushbu turga mansub bakteriyalar pigmentli emas, ximorganizm va azotni tuzatishga qodir. Ular laktoza fermentatsiya, sitoxrom-oksidaza salbiy va katalaz ijobiy. Glyukoza gaz ishlab chiqarish bilan fermentlanadi. MacConkey agar (MAC) da o'sadigan koloniyalar dumaloq, qavariq va silliq bo'lib, butun chekkalari va odatda balandligi baland. Hozirgi vaqtda uchta tur ushbu turga kiritilgan Fitobakter,^[2]^[7] hali ham tarkibiga kiritilgan Kosakoniya Enterobacteriaceae yaqinda ko'rib chiqilgan oilasida.^[8] To'rtinchi turga qo'shilish, Fitobakteriya massiliensis, yaqinda avlodlarni birlashtirish orqali taklif qilingan Metakosakoniya va Fitobakter.^[9]

Turlar

Fitobakteriya diazotrofikasi eng keng tarqalgan Fitobakter atrof-muhit va odamlardan tiklangan turlari va opportunistik patogen ifloslangan bilan bog'liq kateterlar yoki foydalanish umumiy parenteral ovqatlanish.^[2]^[4]
Fitobakter ursingii biokimyoviy jihatdan farqlanishi mumkin Fitobakteriya diazotrofikasi metabolizm qobiliyatiga asoslanib d-serin va l-sorboza. Borligiga qaramay azot fiksatsiyasi genlar ekologik kelib chiqishini bildiradi, shu paytgacha faqat turlarning klinik izolatlari haqida xabar berilgan.^[2]
Fitobakter palma birinchi bo'lib Singapurda yog 'palmasining barg to'qimalarida aniqlangan azotni biriktirish qobiliyatiga ega tur (Elaeis guineensis ).^[7]
Fitobakteriya massiliensis, uning turi JC163^T sog'lom Senegallik bemorning najas florasidan ajratilgan.^[9]^[10]

Adabiyotlar

^ Chjan, Guo Xia; Peng, Guy Syan; Vang, En Tao; Yan, Xui; Yuan, Tsin Xua; Chjan, Vu; Lou, Syu; Vu, Xui; Tan, Chji Yuan (2008 yil may). "Oryza rufipogon yovvoyi guruchidan ajratilgan turli xil endofitik azotni fiksatsiya qiluvchi bakteriyalar va Phytobacter diazotrophicus gen. Nov. Sp. Nov". Mikrobiologiya arxivi. 189 (5): 431–439. doi:10.1007 / s00203-007-0333-7. PMID 18060384. S2CID 27236264.
^ ^a ^b ^v ^d ^e Pillonetto, Marselo; Arend, Laviniya N.; Faoro, Helisson; D'Espindula, Helena R.S.; Blom, Xoxen; Smits, Teo XM.; Mira, Marselo T.; Rezzoniko, Fabio (2017-11-10). "Fitobakterlar turini, uning fitobakteriya diazotrofikus turini (Zhang 2008) va Phytobacter ursingii sp. Novning tavsifi". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. [Epub nashrdan oldin] (1): 176-184. doi:10.1099 / ijsem.0.002477. PMID 29125457.
^ Pillonetto, Marselo; Arend, Laviniya; Gomesh, Suzi M. T.; Oliveira, Marluce A. A.; Timm, Loeci N .; Martins, Andreza F.; Bart, Afonso L.; Mazzetti, Alana; Xersemann, Lena; Smits, Theo H. M.; Mira, Marselo T. (2018-08-13). "Braziliyada ifloslangan umumiy parenteral oziqlanish bilan bog'liq bo'lgan ko'p qavatli polimikrobiyal epidemiyadan izolyatsiyani molekulyar tekshirish". BMC yuqumli kasalliklar. 18 (1): 397. doi:10.1186 / s12879-018-3287-2. ISSN 1471-2334. PMC 6090600. PMID 30103698.
^ ^a ^b Rezzoniko, Fabio; Smits, Theo HM; Montesinos, Emilio; Frey, Yurg E .; Daffi, Brion (2009-01-01). "Pantoea aglomerans o'simliklari va klinik shtammlarini genotipik taqqoslash". BMC mikrobiologiyasi. 9: 204. doi:10.1186/1471-2180-9-204. ISSN 1471-2180. PMC 2764716. PMID 19772624.
^ Brenner, Don J.; Fanning, G. Richard; Leete Knutson, Jan K.; Shtaygervalt, Arnold G.; Krichevskiy, Mixa I. (1984). "Herbicola Group-Enterobacter aglomerans shtammlarini dezoksiribonuklein kislotasini duragaylash va fenotipik testlar bo'yicha tasniflashga urinishlar". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 34 (1): 45–55. doi:10.1099/00207713-34-1-45. ISSN 1466-5026.
^ Chjan, Chjao; Li, Daixi; Shi, Xing; Zhai, Yao; Guo, Yatao; Zheng, Yali; Chjao, Lili; U, Yukun; Chen, Yusheng; Vang, Chjanvey; Su, Tszyanrong (2020-04-15). "Yangi paydo bo'layotgan Enterobacteriaceae turlarining genomik xarakteristikasi: inson kasalligida odatdagi patogen bilan birgalikda infektsiyaning birinchi holati". BMC Genomics. 21 (1): 297. doi:10.1186 / s12864-020-6720-z. ISSN 1471-2164. PMC 7156906. PMID 32293254.
^ ^a ^b Madayyan, Munusami; Saravanan, Venkatakrishnan Sivaraj; Blom, Xoxen; Smits, Theo H. M.; Rezzoniko, Fabio; Kim, So-Jin; Von, Hang-Yeon; Kvon, tez orada Vo; Uitman, Uilyam B.; Tsz, Liangxu (2020-02-01). "Phytobacter palmae sp. Nov., Yangi endofitik, N2 fiksaji, o'simliklarning o'sishini rivojlantiradi, yog 'palmasidan ajratilgan Gammaproteobacterium (Elaeis guineensis Jacq.)". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 70 (2): 841–848. doi:10.1099 / ijsem.0.003834. ISSN 1466-5026. PMID 31829916.
^ Alnajar, Seema; Gupta, Radhey S. (2017-10-01). "Filogenomika va qiyosiy genomik tadqiqotlar Enterobacteriaceae oilasidagi oltita asosiy guruhni ajratib turadi va oilaning bir nechta polifiletik a'zolarini qayta tasniflashni qo'llab-quvvatlaydi". Infektsiya, genetika va evolyutsiya. 54: 108–127. doi:10.1016 / j.meegid.2017.06.024. ISSN 1567-1348. PMID 28658607.
^ ^a ^b Ma, Yuanyuan; Yao, Rong; Li, Yuanyuan; Vu, Syuqin; Li, Shuying; An, Qianli (2020-04-30). "Metakosakoniya va fitobakteriyalar turini yagona fitobakterga birlashtirish va Metakosakonia massiliensisni fitobakter massiliensis taroqi sifatida qayta tasniflash. Nov." Hozirgi mikrobiologiya. doi:10.1007 / s00284-020-02004-4. ISSN 1432-0991. PMID 32350604. S2CID 216650629.
^ Lagier, Jan-Kristof; El Karkuri, Xolid; Mishra, Ajay Kumar; Robert, Ketrin; Raul, Dide; Fournier, Per-Eduard (2013-02-22). "Bir-biriga yaqin bo'lmagan tugallangan genomlar ketma-ketligi va Enterobacter massiliensis sp. Nov tavsifi". Genomik fanlarning standartlari. 7 (3): 399–412. doi:10.4056 / sigs.3396830. ISSN 1944-3277. PMC 3764934. PMID 24019988.

Bu Gammaproteobakteriyalar bilan bog'liq maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[:0-1] Chjan, Guo Xia; Peng, Guy Syan; Vang, En Tao; Yan, Xui; Yuan, Tsin Xua; Chjan, Vu; Lou, Syu; Vu, Xui; Tan, Chji Yuan (2008 yil may). "Oryza rufipogon yovvoyi guruchidan ajratilgan turli xil endofitik azotni fiksatsiya qiluvchi bakteriyalar va Phytobacter diazotrophicus gen. Nov. Sp. Nov". Mikrobiologiya arxivi. 189 (5): 431–439. doi:10.1007 / s00203-007-0333-7. PMID 18060384. S2CID 27236264.

[:1-2] v ^d ^e Pillonetto, Marselo; Arend, Laviniya N.; Faoro, Helisson; D'Espindula, Helena R.S.; Blom, Xoxen; Smits, Teo XM.; Mira, Marselo T.; Rezzoniko, Fabio (2017-11-10). "Fitobakterlar turini, uning fitobakteriya diazotrofikus turini (Zhang 2008) va Phytobacter ursingii sp. Novning tavsifi". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. [Epub nashrdan oldin] (1): 176-184. doi:10.1099 / ijsem.0.002477. PMID 29125457.

[3] Pillonetto, Marselo; Arend, Laviniya; Gomesh, Suzi M. T.; Oliveira, Marluce A. A.; Timm, Loeci N .; Martins, Andreza F.; Bart, Afonso L.; Mazzetti, Alana; Xersemann, Lena; Smits, Theo H. M.; Mira, Marselo T. (2018-08-13). "Braziliyada ifloslangan umumiy parenteral oziqlanish bilan bog'liq bo'lgan ko'p qavatli polimikrobiyal epidemiyadan izolyatsiyani molekulyar tekshirish". BMC yuqumli kasalliklar. 18 (1): 397. doi:10.1186 / s12879-018-3287-2. ISSN 1471-2334. PMC 6090600. PMID 30103698.

[:2-4] Rezzoniko, Fabio; Smits, Theo HM; Montesinos, Emilio; Frey, Yurg E .; Daffi, Brion (2009-01-01). "Pantoea aglomerans o'simliklari va klinik shtammlarini genotipik taqqoslash". BMC mikrobiologiyasi. 9: 204. doi:10.1186/1471-2180-9-204. ISSN 1471-2180. PMC 2764716. PMID 19772624.

[5] Brenner, Don J.; Fanning, G. Richard; Leete Knutson, Jan K.; Shtaygervalt, Arnold G.; Krichevskiy, Mixa I. (1984). "Herbicola Group-Enterobacter aglomerans shtammlarini dezoksiribonuklein kislotasini duragaylash va fenotipik testlar bo'yicha tasniflashga urinishlar". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 34 (1): 45–55. doi:10.1099/00207713-34-1-45. ISSN 1466-5026.

[6] Chjan, Chjao; Li, Daixi; Shi, Xing; Zhai, Yao; Guo, Yatao; Zheng, Yali; Chjao, Lili; U, Yukun; Chen, Yusheng; Vang, Chjanvey; Su, Tszyanrong (2020-04-15). "Yangi paydo bo'layotgan Enterobacteriaceae turlarining genomik xarakteristikasi: inson kasalligida odatdagi patogen bilan birgalikda infektsiyaning birinchi holati". BMC Genomics. 21 (1): 297. doi:10.1186 / s12864-020-6720-z. ISSN 1471-2164. PMC 7156906. PMID 32293254.

[:3-7] Madayyan, Munusami; Saravanan, Venkatakrishnan Sivaraj; Blom, Xoxen; Smits, Theo H. M.; Rezzoniko, Fabio; Kim, So-Jin; Von, Hang-Yeon; Kvon, tez orada Vo; Uitman, Uilyam B.; Tsz, Liangxu (2020-02-01). "Phytobacter palmae sp. Nov., Yangi endofitik, N2 fiksaji, o'simliklarning o'sishini rivojlantiradi, yog 'palmasidan ajratilgan Gammaproteobacterium (Elaeis guineensis Jacq.)". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 70 (2): 841–848. doi:10.1099 / ijsem.0.003834. ISSN 1466-5026. PMID 31829916.

[8] Alnajar, Seema; Gupta, Radhey S. (2017-10-01). "Filogenomika va qiyosiy genomik tadqiqotlar Enterobacteriaceae oilasidagi oltita asosiy guruhni ajratib turadi va oilaning bir nechta polifiletik a'zolarini qayta tasniflashni qo'llab-quvvatlaydi". Infektsiya, genetika va evolyutsiya. 54: 108–127. doi:10.1016 / j.meegid.2017.06.024. ISSN 1567-1348. PMID 28658607.

[:4-9] Ma, Yuanyuan; Yao, Rong; Li, Yuanyuan; Vu, Syuqin; Li, Shuying; An, Qianli (2020-04-30). "Metakosakoniya va fitobakteriyalar turini yagona fitobakterga birlashtirish va Metakosakonia massiliensisni fitobakter massiliensis taroqi sifatida qayta tasniflash. Nov." Hozirgi mikrobiologiya. doi:10.1007 / s00284-020-02004-4. ISSN 1432-0991. PMID 32350604. S2CID 216650629.

[10] Lagier, Jan-Kristof; El Karkuri, Xolid; Mishra, Ajay Kumar; Robert, Ketrin; Raul, Dide; Fournier, Per-Eduard (2013-02-22). "Bir-biriga yaqin bo'lmagan tugallangan genomlar ketma-ketligi va Enterobacter massiliensis sp. Nov tavsifi". Genomik fanlarning standartlari. 7 (3): 399–412. doi:10.4056 / sigs.3396830. ISSN 1944-3277. PMC 3764934. PMID 24019988.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]