PsaA RNK motifi - psaA RNA motif - Wikipedia
| psaA RNK | |
|---|---|
 Ikkinchi darajadagi tuzilishning konsensusi psaA RNKlar | |
| Identifikatorlar | |
| Belgilar | psaA RNK |
| Rfam | RF01752 |
| Boshqa ma'lumotlar | |
| RNK turi | Cis- tartibga soluvchi element |
| Domen (lar) | siyanobakteriyalar |
| PDB tuzilmalar | PDBe |
The psaA RNK motifi sinfini tavsiflaydi RNKlar umumiy bilan ikkilamchi tuzilish.[1] psaA RNKlar faqatgina mos keladigan joylarda joylashgan 5 'tarjima qilinmagan mintaqalar ning operonlar tashkil topgan psaA va psaB genlar. Shu sababli, bu taxmin qilingan edi psaA RNKlar quyidagicha ishlaydi cis-tartibga solish elementlari Ushbu genlarning The psaAB genlar kodlaydi oqsillar tarkibidagi subbirliklarni hosil qiluvchi fotosurat I uchun ishlatiladigan tuzilma fotosintez. psaA RNK faqat aniqlangan siyanobakteriyalar, bu ularning fotosintez bilan bog'liqligiga mos keladi.
psaAB genlar ishlatilmaydigan siyanobakteriyalar turlarida tartibga solinishi ma'lum psaA RNK va ushbu tartibga solish tizimi o'z ichiga oladi transkripsiya omili oqsillar.[2] Ushbu tizimda. Ning ifodasi psaAB Hujayralar cheklangan manbadan energiyasini maksimal darajaga ko'tarish uchun, ehtimol hujayralar cheklangan miqdordagi yorug'lik bilan o'sishda ko'payadi.[3] Boshqa tomondan, yorug'lik darajasi yuqori bo'lganida, genlarning ekspressioni kamayadi, ehtimol bu zararli ta'sirni kamaytiradi radikallar bu fotosintezning yon mahsuloti.[3] Mintaqasi psaA RNK motifi azotni boshqarishda ishtirok etgan NtcA oqsilining bog'lanish joyining kutilgan ketma-ketligiga mos keladi.[4]
Strukturaviy ravishda psaA RNK motifi bazaviy juftlik natijasida hosil bo'lgan va juda ko'p miqdordagi murakkab tartibga solishdan iborat poyalar barqaror UNCG tomonidan bekor qilinadi tetraloop. Motivdagi konservalangan nukleotidlarning aksariyati standart Watson-Crick bazaviy juftliklarida qatnashadi. Ammo, chunki aniq funktsiyasi psaA RNKlar noma'lum, shuningdek, bu xususiyatlar qanday biokimyoviy rol o'ynashi noma'lum.
Adabiyotlar
- ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
- ^ Muramatsu M, Xixara Y (aprel 2007). "Fotosistem I subbirliklarini kodlovchi genlarning yuqori nurli nurlanishiga muvofiqligi, PCC 6803 shtammining siyanobakteriyasida Synechocystis sp. AT-ga boy yuqori oqim sekanslari orqali erishiladi". J. Bakteriol. 189 (7): 2750–2758. doi:10.1128 / JB.01903-06. PMC 1855792. PMID 17277074.
- ^ a b Muramatsu M, Xixara Y (2006 yil iyul). "Synechocystis sp. PCC 6803 da psaAB genlarining yuqori yorug'likka sezgir bo'lgan promotorlarining xarakteristikasi". O'simlik hujayralari fizioli. 47 (7): 878–890. doi:10.1093 / pcp / pcj060. PMID 16705009.
- ^ Su Z, Mao F, Dam P va boshq. (2006). "Synechococcus sp. WH 8102 siyanobakteriyasida azotni assimilyatsiya qilishni tartibga soluvchi tarmog'ini hisoblash va eksperimental tekshirish". Nuklein kislotalari rez. 34 (3): 1050–1065. doi:10.1093 / nar / gkj496. PMC 1363776. PMID 16473855.