RefSeq - RefSeq
 | |
|---|---|
| Tarkib | |
| Tavsif | genomlarning ortiqcha bo'lmagan ketma-ket ma'lumotlar bazasi. |
| Aloqa | |
| Ilmiy-tadqiqot markazi | Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi |
| Birlamchi iqtibos | Pruitt KD va boshq. (2005)[1] |
| Kirish | |
| Veb-sayt | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq |
Yo'naltiruvchi ketma-ketlik (RefSeq) ma'lumotlar bazasi[1] bu ochiq kirish omma e'tiboriga havola qilingan va yozilgan to'plam nukleotid ketma-ketliklar (DNK, RNK) va ularning oqsil mahsulotlar. Ushbu ma'lumotlar bazasi tomonidan yaratilgan Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) va farqli o'laroq GenBank, har bir tabiiy biologik molekula (ya'ni DNK, RNK yoki oqsil) uchun viruslardan tortib bakteriyalargacha, ökaryotlargacha bo'lgan asosiy organizmlar uchun faqat bitta yozuvni taqdim etadi.
Har biriga model organizm, RefSeq genomik DNK, gen transkriptlari va ushbu transkriptlardan kelib chiqadigan oqsillar uchun alohida va bog'langan yozuvlarni taqdim etishga qaratilgan. RefSeq etarli ma'lumotlarga ega bo'lgan asosiy organizmlar bilan cheklangan (2011 yil sentyabr holatiga ko'ra 66000 dan ortiq "nomlangan" organizmlar),[2] esa GenBank har qanday yuborilgan organizm uchun ketma-ketlikni o'z ichiga oladi (taxminan 250,000 turli xil nomlangan organizmlar).
RefSeq toifalari
| Turkum | Tavsif |
|---|---|
| Bosimining ko'tarilishi | To'liq genomik molekulalar |
| NG | Tugallanmagan genomik mintaqa |
| NM | mRNA |
| NR | ncRNA |
| NP | Oqsil |
| XM | bashorat qilingan mRNA model |
| XR | bashorat qilingan ncRNA model |
| XP | bashorat qilingan Oqsil model (eukaryotik ketma-ketliklar) |
| WP | bashorat qilingan Oqsil model (prokaryotik ketma-ketliklar) |
Batafsil ma'lumot va boshqa toifalar uchun qarang 1-jadval yilda Kitobning 18-bobi Ma'lumotlar bazasi (RefSeq) ma'lumotlar bazasi.
Shuningdek qarang
- GenBank
- Tartibni tahlil qilish
- Tartibni profillash vositasi
- Ketma-ketlik motifi
- UniProt
- Tartibga qo'yilgan ökaryotik genomlar ro'yxati
- Arxeologik genomlar ketma-ketligi
Adabiyotlar
- ^ a b Pruitt KD, Tatusova T, Maglott DR (2005). "NCBI ma'lumotnoma ketma-ketligi (RefSeq): genomlar, transkriptlar va oqsillarning ortiqcha ortiqcha ketma-ketlik ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalari rez. 33 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D501-4. doi:10.1093 / nar / gki025. PMC 539979. PMID 15608248.
- ^ RefSeq Release 80 Statistikasi (Hisobot). Milliy tibbiyot kutubxonasi. 2017. Olingan 13 yanvar 2017.
Manbalar
Ushbu maqola o'z ichiga oladijamoat mulki materiallari dan Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi hujjat: "NCBI qo'llanmasi".
Ushbu maqola o'z ichiga oladi