Runt domeni - Runt domain - Wikipedia

Runt domeni
Identifikatorlar
BelgilarRunt
PfamPF00853
InterProIPR013524
SCOP21 sm / QOIDA / SUPFAM

The Runt domeni saqlanib qolgan evolyutsiyadir protein domeni.[1]

The AML1 / RUNX1 geni o'tkir miyeloid leykemiyada t (8; 21) translokatsiya bilan qayta tashkil etilgan.[2] Gen juda o'xshash Drosophila melanogaster segmentatsiya geni oqimi va sichqoncha transkripsiyasi faktoriga PEBP2 alfa subunit geni.[2] Runt domeni deb nomlanuvchi umumiy o'xshashlik mintaqasi DNK bilan bog'lanish va oqsil-oqsillarning o'zaro ta'siri uchun javobgardir.

Yuqori darajada konservalangan Runt domeniga qo'shimcha ravishda AML-1 geni mahsuloti ATP bilan bog'lanish maydonini (GRSGRGKS) olib boradi va prolin va serin qoldiqlariga boy bo'lgan C-terminal mintaqasiga ega. Oqsil (o'tkir miyeloid leykemiya 1 oqsili, onkogen AML-1, yadro bilan bog'lovchi omil (CBF), alfa-B subbirligi va boshqalar) ma'lum bo'lgan bir qator yadro joyiga, 5'-pygpyggt-3 'ga bog'lanadi. kuchaytiruvchilar va targ'ibotchilar.

Protein alfa- va beta-subbirliklarning heterodimeridir. Alfa-subunit DNKni monomer sifatida bog'laydi va normal gemopoezning rivojlanishida muhim rol o'ynaydi. CBF - bu miya va yurakdan tashqari ko'plab to'qima turlarida ifodalangan yadro oqsilidir; eng yuqori darajalar timus, suyak iligi va periferik qonda uchraydi.

Ushbu domen ushbu yozuvdagi oqsillarning N-uchiga to'g'ri keladi.

Misollar

Ushbu domenni o'z ichiga olgan oqsillarni kodlovchi inson genlariga quyidagilar kiradi.

Adabiyotlar

  1. ^ Kagoshima H, Shigesada K, Satake M, Ito Y, Miyoshi H, Ohki M, Pepling M, Gergen P (oktyabr 1993). "Runt domeni geteromerik transkripsiya regulyatorlarining yangi oilasini aniqlaydi". Trends Genet. 9 (10): 338–41. doi:10.1016 / 0168-9525 (93) 90026-E. PMID  8273148.
  2. ^ a b Xirai H, Shimizu K, Miyoshi H, Ohira M, Mitani K, Imai T, Yokoyama K, Soeda E, Ohki M (1995). "O'tkir miyeloid leykemiya bilan shug'ullanadigan AML1 genining alternativ qo'shilishi va genomik tuzilishi". Nuklein kislotalari rez. 23 (14): 2762–2769. doi:10.1093 / nar / 23.14.2762. PMC  307102. PMID  7651838.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR013524