RUNX3 - RUNX3 - Wikipedia

RUNX3
Protein RUNX3 PDB 1cmo.png
Identifikatorlar
TaxalluslarRUNX3, AML2, CBFA3, PEBP2aC, runt bilan bog'liq transkriptsiya faktor 3, RUNX oilaviy transkripsiya omil 3
Tashqi identifikatorlarOMIM: 600210 MGI: 102672 HomoloGene: 37914 Generkartalar: RUNX3
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
RUNX3 uchun genomik joylashuv
RUNX3 uchun genomik joylashuv
Band1p36.11Boshlang24,899,511 bp[1]
Oxiri24,965,121 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE RUNX3 204197 s

Ps.Bng da PBB GE RUNX3 204198 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001031680
NM_004350
NM_001320672

NM_019732
NM_001369050

RefSeq (oqsil)

NP_001026850
NP_001307601
NP_004341

NP_062706
NP_001355979

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 24.9 - 24.97 MbChr 4: 135.12 - 135.18 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Runt bilan bog'liq transkripsiya omili 3 a oqsil odamlarda kodlanganligi RUNX3 gen.[5]

Funktsiya

Ushbu gen transkripsiya omillari tarkibidagi runt domeni tarkibidagi oilaning a'zosini kodlaydi. Ushbu oqsilning heterodimeri va beta subbirligi bir qator kuchaytiruvchi va targ'ibotchilardan topilgan 5'-YGYGGT-3 'DNKning asosiy ketma-ketligi bilan birikadigan kompleks hosil qiladi,[6] va transkripsiyani faollashtirishi yoki bostirishi mumkin. Shuningdek, u boshqa transkripsiya omillari bilan o'zaro ta'sir qiladi. U o'smani bostiruvchi vazifasini bajaradi va gen tez-tez o'chiriladi yoki saraton kasalligida transkripsiya bilan o'chiriladi. Ushbu gen uchun turli xil izoformlarni kodlovchi bir nechta transkript variantlari topildi.[7]

Melanotsitik hujayralarda RUNX3 gen ekspressioni tartibga solinishi mumkin MITF.[8]

Sichqoncha

Sichqonchaning oshqozon-ichak shilliq pardasi Runx3 stimulyatsiya qilingan proliferatsiya tufayli giperplaziyani namoyon qiladi va bosilib qoladi apoptoz epiteliya hujayralarida va hujayralar TGF-beta stimulyatsiyasiga chidamli.[9]

RUNX3 munozarasi

2011 yilda Runx3 ning o'smani bostiruvchi funktsiyasiga jiddiy shubha tug'ildi, Li va uning hamkasblari tomonidan ilgari nashr etilgan.[10]Li va uning hamkasblari (2002) tomonidan olib borilgan dastlabki tadqiqotlar asosida, Li va uning hamkasblariga (2002) asoslanib, keyingi adabiyotlarning aksariyati RUNX3 normal ichak epiteliyasida ifodalangan va shuning uchun u shunday harakat qilishi mumkin deb taxmin qilishgan. epiteliya saratonida o'smaning supressori tekshirildi. Ushbu adabiyotlarning aksariyati turli xil saraton kasalliklarida RUNX3 targ'ibotchining metilatlanish holatini o'z ifodasi uchun proksi sifatida ishlatgan. Shunga qaramay, o'smaning hujayra genomlarida juda ko'p genlar metillanganligi ma'lum va bu genlarning aksariyati ushbu saraton kelib chiqishining normal to'qimalarida ifodalanmagan. Boshqalari RUNX3 oqsilini aniqlash uchun yomon tavsiflangan (yoki to'liq bekor qilingan) antikorlardan foydalangan yoki RT-PCR yoki tasdiqlangan antikorlardan foydalangan va ichak epiteliyasida RUNX3 ni aniqlay olmagan, ammo Li va uning hamkasblari (2002) . Yaqinda Ülo Mayvalining kitobida ushbu faktlar muhokama qilindi.[11]

O'zaro aloqalar

RUNX3 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan TLE1.[12]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000020633 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000070691 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Levanon D, Negreanu V, Bernshteyn Y, Bar-Am I, Avivi L, Groner Y (sentyabr 1994). "AML1, AML2 va AML3, runt domeni gen-oilasining inson a'zolari: cDNA tuzilishi, ekspressioni va xromosoma lokalizatsiyasi". Genomika. 23 (2): 425–32. doi:10.1006 / geno.1994.1519. PMID  7835892.
  6. ^ Levanon D, Eyzenshteyn M, Groner Y (1998 yil aprel). "Saytga yo'naltirilgan mutagenez runt domenining uch o'lchovli modelini qo'llab-quvvatlaydi". Molekulyar biologiya jurnali. 277 (3): 509–12. doi:10.1006 / jmbi.1998.1633. PMID  9533875. S2CID  13139512.
  7. ^ "Entrez Gen: RUNX3 runt bilan bog'liq transkripsiya omil 3".
  8. ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (Dekabr 2008). "Ikki bosqichli DNK mikroarray strategiyasi yordamida aniqlangan yangi MITF maqsadlari". Pigment hujayralari va melanoma tadqiqotlari. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971.
  9. ^ Li QL, Ito K, Sakakura C, Fukamachi H, Inoue Ki, Chi XZ, Li KY, Nomura S, Li CW, Xan SB, Kim HM, Kim WJ, Yamamoto H, Yamashita N, Yano T, Ikeda T, Itoxara S , Inazawa J, Abe T, Hagiwara A, Yamagishi H, Ooe A, Kaneda A, Sugimura T, Ushijima T, Bae SC, Ito Y (aprel 2002). "RUNX3 ekspressionini yo'qotish va oshqozon saratoni o'rtasidagi sababiy bog'liqlik". Hujayra. 109 (1): 113–24. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00690-6. PMID  11955451. S2CID  11362226.
  10. ^ Levanon D, Bernshteyn Y, Negreanu V, Bone KR, Pozner A, Eilam R, Lotem J, Brenner O, Groner Y (oktyabr 2011). "Oddiy oshqozon-ichak epiteliyasida Runx3 ekspressioni yo'qligi uning o'simta supressori funktsiyasini shubha ostiga qo'yadi". EMBO Mol Med. 3 (10): 593–604. doi:10.1002 / emmm.201100168. PMC  3258485. PMID  21786422.
  11. ^ Maiväli, Ülo (2015). Biomedikal fanni talqin qilish. Akademik matbuot. 44-45 betlar. ISBN  9780124186897.
  12. ^ Levanon D, Goldstein RE, Bernstein Y, Tang H, Goldenberg D, Stifani S, Paroush Z, Groner Y (sentyabr 1998). "AML1 va LEF-1 tomonidan transkripsiyaviy repressiya TLE / Groucho korepressorlari vositachiligida". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 95 (20): 11590–5. Bibcode:1998 yil PNAS ... 9511590L. doi:10.1073 / pnas.95.20.11590. PMC  21685. PMID  9751710.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.