Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6 - Small Cajal body specific RNA 6

Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6
RF00478.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SCARNA6
Identifikatorlar
BelgilarSCARNA6
Alt. BelgilarU88
RfamRF00478
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; scrNA
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000275
PDB tuzilmalarPDBe

Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6 (shuningdek, nomi bilan tanilgan SCARNA6 yoki U88) a kichik nukleolyar RNK ichida topilgan Kajal jasadlari va psevdouridilatsiyaga aloqador deb ishoniladi (izomerizatsiya ning siydik ga pseudouridin ) ning U5 splitseozomal RNK.

scaRNAlar ma'lum bir sinfdir kichik nukleolyar RNKlar ga mahalliylashtiradigan Kajal jasadlari va modifikatsiyasini boshqaring RNK polimeraza II ko'chirildi splitseozomal RNKlar U1, U2, U4, U5 va U12[1]

U88 fibrillyarin va Gar1p bilan birikkan va Kajal tanalarida lasan bilan birgalikda lokalizatsiyalangan.[1]Bu g'ayrioddiy qo'llanma RNK, chunki u ikkalasidan iborat H / ACA qutisi va a C / D qutisi saqlangan domenlar. 2'- ni boshqarishi taxmin qilinmoqdaO-U5 snRNA ning U41 qoldiqlarini metilatsiyalash.[1]

U88, shuningdek, boshqa odam snoRNAs scaRNA U87 va sichqonchaning homologi MBI-46 bilan chambarchas bog'liq.[2]Inson genomida U88 va U87 skaRNKlari bir xil mezbon geniga ega.[1][3]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (iyun 2002). "Kajal tanasiga xos bo'lgan kichik yadroli RNKlar: 2'-O-metillanish va psevdouridilatsiya bo'yicha qo'llanma RNKlarning yangi klassi". EMBO jurnali. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (iyun 2001). "RNomics: sichqonchada yangi, kichik, messenjer bo'lmagan RNKlarga 201 nomzodni aniqlaydigan eksperimental yondashuv". EMBO jurnali. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

Tashqi havolalar