Inson genomidagi tarkibiy o'zgaruvchanlik - Structural variation in the human genome - Wikipedia

Strukturaviy o'zgarish

Strukturaviy o'zgarish ichida inson genomi operativ ravishda genomik o'zgarishlar deb ta'riflanadi, bu shaxslar orasida o'zgarib turadi DNK segmentlari 1 kilo bazadan kattaroq (kb) va ikkalasi ham bo'lishi mumkin mikroskopik yoki submikroskopik.[1] Ushbu ta'rif ularni hajmi 1 kb dan kam bo'lgan kichik variantlardan ajratib turadi, masalan, qisqa o'chirish, qo'shimchalar va bitta nukleotid variantlar.

Odamlar vaqt o'tishi bilan shakllangan va o'zgartirilgan nihoyatda murakkab va murakkab genomga ega evolyutsiya. Inson genomidagi DNK-ketma-ketlikning taxminan 99,9% butun dunyodagi shaxslar orasida saqlanadi, ammo ba'zi bir xilma-xilliklar mavjud.[1] Yagona nukleotid polimorfizmlari (SNP) odamlarda genetik o'zgarishga eng katta hissa qo'shgan hisoblanadi, chunki ular juda ko'p va osonlikcha aniqlanadi.[2] Hisob-kitoblarga ko'ra, insoniyat populyatsiyasida kamida 10 million SNP mavjud, ammo boshqa ko'plab turdagi genetik variantlar mavjud va ular keskin farqli miqyosda uchraydi.[1] Inson populyatsiyasidagi genomlar o'rtasidagi farq bitta nukleotid polimorfizmidan tortib to dramatik o'zgarishlarga qadar inson kariotipi.[3]

Insonning genetik o'zgarishi inson populyatsiyasidagi shaxslar o'rtasidagi fenotipik farqlar uchun javobgardir. Turli xil turlari mavjud genetik o'zgarish va uning ahamiyatini yaxshiroq anglash uchun u keng o'rganiladi. Ushbu tadqiqotlar genetik variantlarni aniq birlashtiradigan kashfiyotlarga olib keladi fenotiplar shuningdek, ularning oqibatlari kasallik. Avvaliga, oldinroq DNKning ketma-ketligi texnologiyalar, o'zgaruvchanlik mikroskopik miqyosda o'rganilgan va kuzatilgan. Ushbu miqyosda faqatgina kuzatuvlar farqlar edi xromosoma raqam va xromosoma tuzilishi. Taxminan 3 Mb va undan kattaroq ushbu variantlar mikroskopik strukturaviy variantlar hisoblanadi.[1] Ushbu o'lchov mikroskop yordamida tasavvur qilish uchun etarlicha katta va o'z ichiga oladi aneuploidiyalar, heteromorfizmlar va xromosomalarning qayta tuzilishi.[1] DNK sekvensiyasi joriy qilinganida, u SNP va minisatellitlarni o'z ichiga olgan kichikroq va nihoyatda ko'proq ketma-ketliklarni topishga eshik ochdi. Bunga hajmi 1 kb dan kam bo'lgan kichik inversiyalar, dublyajlar, qo'shimchalar va o'chirishlar kiradi.[1]Inson genomining loyihasida inson genomi muvaffaqiyatli ravishda ketma-ketlashtirildi, bu genetik o'zgarishni taqqoslash uchun mos yozuvlar inson genomini taqdim etdi. Sekvensiya texnologiyalari va mos yozuvlar genomini takomillashtirish bilan 1 kb dan kattaroq, ammo mikroskopik variantlardan kichikroq bo'lgan bir nechta turli xil o'lchamlar mavjud edi. Taxminan 1 kb dan 3 Mb gacha bo'lgan ushbu variantlar submikroskopik strukturaviy variantlar hisoblanadi.[1] Yaqinda kashf etilgan ushbu tuzilish variantlari fenotipik xilma-xillikda va kasallikka moyillikda juda muhim rol o'ynaydi.

Strukturaviy variantlarning turlari

Strukturaviy o'zgarish fenotipik xilma-xillikka hissa qo'shadigan inson genetik o'zgarishining muhim turi.[2] Yo'q qilish, ko'paytirish va nusxa ko'chirish sonining ko'p sonli variantlarini, shuningdek qo'shimchalar, inversiyalar va translokatsiyalarni o'z ichiga olgan mikroskopik va submikroskopik strukturaviy variantlar mavjud.[1] Bular inson genomidagi strukturaviy variantlarning bir necha xil turlari va ular bir-biridan ancha farq qiladi. Translokatsiya - bu xromosomalarni qayta tashkil etish, xromosoma bo'limi pozitsiyani o'zgartiradigan, ammo butun DNK tarkibidagi o'zgarishsiz xromosomalararo yoki ichki darajasida.[1] DNKning 1 kb dan kattaroq va har xil nusxalari bir xil ketma-ketlikning 90% dan ko'prog'iga ega bo'lgan haploid genomiga ikki yoki undan ortiq nusxada uchraydigan bo'limi segmental takrorlash yoki kam nusxadagi takrorlash deb hisoblanadi.[1] Bular inson genomida mavjud bo'lgan ma'lum bo'lgan turli xil tuzilish variantlarining bir nechtasi. Strukturaviy variantlarning ushbu turli shakllarini va boshqalarni tasavvur qiladigan jadval 1-rasmda keltirilgan.

Inversiya - bu xromosoma bo'yicha DNKning yo'naltiruvchi genomga nisbatan yo'nalishi bo'yicha teskari bo'lgan bo'limi.[1] Inversiyani aniqlaydigan ko'plab tadqiqotlar o'tkazildi, chunki ular ko'plab kasalliklarda katta rol o'ynashi aniqlandi. Tadqiqot shuni ko'rsatdiki, qirq foiz gemofiliya A bemorlarda hajmi to'rt yuz kb bo'lgan ma'lum bir mintaqaning 8-omil geni inversiyasi mavjud edi.[4] Inversiyani to'xtatish nuqtasi boshqa ko'plab inversiya hodisalarida kuzatiladigan segmentar takrorlanish atrofida ekanligi aniqlandi.[4]

Har bir strukturaviy variant qanday yaratilganligini to'liq tushunish qiyin. Xromosomadagi takroriy ketma-ketliklar allelik bo'lmagan gomologik rekombinatsiya ehtimolini oshirishi ilgari ma'lum bo'lgan.[5] Ushbu takrorlangan ketma-ketliklar xromosomalarning yo'q qilinishiga, takrorlanishiga, inversiyalariga va teskari takrorlanishiga olib kelishi mumkin. Ushbu mexanizmning ketma-ket takrorlanishidan hosil bo'lgan mahsulotlar 2-rasmda tasvirlangan hidni qabul qiluvchi 8p normal qayta tashkil etilishi va takrorlangan teskari ketma-ketliklar o'rtasida bog'liqlik mavjudmi degan savolga javob beradigan gen klasterlari. Tadqiqotchilar xromosomalarning qayta tashkil etilishiga, aslida, 8p takrorlanishdagi gomologik rekombinatsiya sabab bo'lganligini kuzatdilar. Shuning uchun ular xromosomalararo darajada qayta tuzilish uchun ishlatiladigan substrat xushbo'y retseptorlari uchun genlar degan xulosaga kelishdi.[5] Ushbu kashfiyot teskari dublikatlarning strukturaviy variantlarning rivojlanishiga ta'sir ko'rsatadigan rolini ochib berdi. Ushbu turdagi genetik variantlarning rivojlanishini yaxshiroq tushunish uchun strukturaviy variantlarni ishlab chiqarish mexanizmlari va usullari muhimdir.

Strukturaviy o'zgarish mexanizmi

Nusxalash-raqam o'zgarishi

Nusxa nusxalari variantlari DNKning o'zgaruvchan nusxa raqamida, uni mos yozuvlar genomiga solishtirganda mavjud bo'lgan va hajmi 1 kb dan katta bo'lgan bo'limlari sifatida aniqlanadi.[1] Ushbu ta'rif keng va yo'q qilish, takrorlash va katta nusxadagi variantlarni o'z ichiga oladi. Agar nusxa ko'chirish raqamining varianti aholining 1% va undan ko'prog'ida bo'lsa, u nusxa polimorfizmi deb ham hisoblanadi.[1] Inson genomidagi nusxa sonining global o'zgarishi bo'yicha tadqiqotlar bo'lib, u inson genomidagi nusxa ko'chirish soni variantlarining xususiyatlarini shubha ostiga qo'ydi. Ma'lumki, inson genomidagi nusxalar sonining o'zgarishi muhim, ammo hozirgi vaqtda u hali to'liq tushunilmagan edi. Inson genomining o'zgarishi juda xilma-xildir, chunki ko'p sonli turlar mavjud, shu jumladan inversiya, takrorlanish, SNP va boshqa shakllar. Ular turli xil populyatsiyalardan bo'lgan 270 kishining genomlarini SNP massivlari kabi texnologiyalar bilan nusxa ko'chirish raqamlarining variantlarini o'rganishdi.[6] Ularning natijalari shuni ko'rsatdiki, nusxa ko'chirish raqamlarining ko'plab variantlarida bog'lanish muvozanati aniq tartibga solingan, bu esa har xil populyatsiyalarda nusxa sonining o'zgarishini aniqlagan.[6] Tadqiqot natijasiga ko'ra, genomning o'n ikki foizida CNVR mavjud. Ularning har bir genomdagi DNKning bitta nukleotid polimorfizmiga qaraganda ko'proq ishtirok etishi aniqlandi.[6] Bu ajoyib kashfiyot edi, chunki bitta genetik nukleotidli polimorfizmlar inson genomidagi son jihatidan eng katta ekanligi ma'lum bo'lgan. Ammo kattaligi jihatidan ushbu turdagi strukturaviy variantlar inson genomida ko'proq ishtirok etishi aniqlandi.

Nusxa nusxalarini o'rganish davom ettirildi, chunki bir nechta tadqiqotlar ularning mavjudligi chuqurligini va ularning ahamiyatini ochib berdi. Nusxa nusxalari tashkilotining rolini shubha ostiga olgan va ularning qaysi nusxalari turi bilan qiziqqan tadqiqot o'tkazildi. Ma'lumki, nusxa ko'chirish sonining o'zgarishi odamlarning ko'plab kasalliklarida katta rol o'ynaydi, ammo o'sha paytda ushbu takrorlanishlar bo'yicha keng ko'lamli tadqiqotlar o'tkazilmagan. Ular butun genom ketma-ketligini hamda keyingi avlodlar ketma-ketligini bajarish orqali 119 ta ma'lum bo'lgan CNVlarni o'z ichiga olgan 112 kishidan 130 ta to'xtash nuqtasini ketma-ket qilishga qaror qildilar.[7] Ular tandem dublikatlari CNVlarning 83 foizini tashkil qilgan bo'lsa, 8,4 foizi uch marta, 4,2 foizi qo'shni dublyajlari, 2,5 foizi inseritsial translokatsiyalar va 1,7 foizi boshqa murakkab tuzilmalar bo'lgan.[7] Nusxa nusxalari asosan tandem nusxalari bo'lib, bu populyatsiya bo'yicha o'tkazilgan tadqiqot natijalariga ko'ra inson genomidagi nusxa soni variantining eng keng tarqalgan turiga aylandi, strukturaviy variantlarni shakllantirishning mexanik tomonida esa ko'proq kerak edi. Juda qiziqarli va kamdan-kam uchraydigan mexanizmlarga bag'ishlangan tadqiqot mavjud edi patogen nusxa ko'chirish raqamlari. Tadqiqotchilar nusxa sonining o'zgarishi genomning tarkibiy o'zgarishi uchun muhim ahamiyatga ega ekanligini va insonning genetik kasalligiga hissa qo'shishini bilar edilar, ammo yangi va kam sonli patogen nusxa variantlarining ko'pchiligining amaldagi mexanizmlari ma'lum bo'lmagan. Ular nusxa ko'chirish raqamlari variantlarining eng katta va eng chuqur tahlili bo'lgan ko'plab noyob patogen nusxalar variantlarining to'xtash nuqtalarini ketma-ketlikda ketma-ketlik texnologiyalaridan foydalanganlar. Ular genomik me'moriy xususiyatlar inson genomida juda muhim ahamiyatga ega ekanligini ko'rdilar va ular taxminan seksen bir foiz uzilish nuqtalari bilan bog'liq edi.[8] Ular kamdan-kam uchraydigan va patogen bo'lgan tandem dublyajlari va mikroelementlar tasodifan inson genomida sodir bo'lmaydi degan xulosaga kelishdi. Buning o'rniga, ular turli xil genomik me'moriy xususiyatlardan kelib chiqadi.[8] Bu juda qiziqarli natija edi, chunki genomning ba'zi me'moriy xususiyatlari jismonan kamdan-kam uchraydigan va patogen tuzilmaviy variantlarni ishlab chiqishga imkon berdi.

Strukturaviy o'zgarishni evolyutsiyaga moslashish uchun genomni o'zgartirish yo'li sifatida ko'rish mumkin. Ajdodlarning ratsioni va inson amilaza genining nusxasi evolyutsiyasi bo'yicha tadqiqot o'tkazildi. Kraxmalni iste'mol qilish qishloq xo'jaligi jamiyatlari rivojlanishi bilan inson ratsionining ulkan tarkibiy qismiga aylandi. Amilaza - bu kraxmalni parchalaydigan ferment va uning nusxasi har xil.[9] Ushbu kuzatishlar turli populyatsiyalar o'rtasidagi kraxmal iste'molidagi farqlar amilaza fermentiga tabiiy selektsiya bosimini yaratdimi yoki yo'qmi degan savolga olib keldi. Ular turli xil populyatsiyalardan tupurikdagi amilaza oqsillari ekspresiyasining farqlarini sinab ko'rishdi va ularning ekspressionlarini o'zlarining tegishli genomlaridagi nusxa soni bilan taqqoslashdi.[9] Keyin ular turli xil populyatsiyalarning kraxmal iste'molini amilaza genining nusxalari bilan taqqosladilar. Ularning genomida amilaza nusxasi yuqori bo'lgan odamlarning tupuriklarida amilaza oqsilining ekspresiyasi ko'proq bo'lganligi va yuqori kraxmalli dietaga ega bo'lgan odamlar guruhi va amilaza genining nusxasi kattaroq bo'lganligi aniqlandi.[9] Ushbu tadqiqot hayajonli natijalarga olib keldi, chunki tarkibiy o'zgarishlar vaqt o'tishi bilan amilaza nusxasini ko'paytirish orqali insoniyat evolyutsiyasida ishtirok etganligini isbotladi.

1000 genom loyihasi inson genomining DNK ketma-ketligini muvaffaqiyatli ishlab chiqara oldi. Ular tahlil qilish uchun ko'plab populyatsiyalarning ketma-ketlik ma'lumotlarini hamda taqqoslash va kelajakdagi tadqiqotlar uchun mos yozuvlar inson genomini taqdim etdilar. Bitta tadqiqot ushbu genomandan butun genom ketma-ketligi ma'lumotlaridan genomlar o'rtasidagi tarkibiy o'zgaruvchanliklarni shubha ostiga olish uchun foydalandi. Ma'lumki, odamlarning kasalliklari takrorlanish va o'chirilishdan ta'sirlanadi va nusxa ko'chirish raqamlarini tahlil qilish odatiy holdir, ammo nusxa ko'chirish raqamlarining ko'p millatli variantlari (mCNV) yaxshi o'rganilmagan. Tadqiqotchilar o'zlarining ma'lumotlarini 1000 genomlar loyihasidan olishdi va katta mCNVlarni topish uchun ketma-ket joylashtirilgan turli populyatsiyalarning 849 xil genomlarini tahlil qildilar.[10] Ular o'zlarining tahlillaridan mCNVlarning boshqa tuzilish variantlari bilan taqqoslaganda genlar dozasida ko'p genetik o'zgarishni yaratishini va genlarning ekspression o'zgarishini mCNVlar tomonidan yaratilgan genlarning dozalash xilma-xilligi bilan yaratilishini aniqladilar.[10] Tadqiqot strukturaviy variantlarning, ayniqsa mCNVlarning, genlarning dozalanishida katta ahamiyatga ega ekanligini ta'kidlab o'tdi, bu esa o'zgaruvchan genlarning ifodalanishiga va populyatsiyada insonning fenotipik xilma-xilligiga olib keladi.

Kasallikning oqibatlari

Charcot-Marie Tooth (CMT) kasalligi

Inson genomida kuzatilgan, ammo hech qanday aniq fenotipik ta'sirga olib kelmagan bir nechta tarkibiy variantlar mavjud.[1] Biroq, genlarni dozalashda rol o'ynaydigan, genetik kasalliklar yoki alohida fenotiplarga olib kelishi mumkin bo'lganlar bor. Strukturaviy variantlar to'g'ridan-to'g'ri gen ekspressioniga ta'sir qilishi mumkin, masalan, nusxa ko'chirish raqamlari variantlari bilan yoki bilvosita pozitsiya effektlari orqali.[1] Ushbu ta'sirlar kasallikka moyillikda sezilarli ta'sir ko'rsatishi mumkin. Kuzatilgan va irsiy DNKning qayta tuzilishidan kelib chiqqan autosomal dominant kasallik deb hisoblangan birinchi gen dozalash ta'siri Charcot-Marie Tooth (CMT) kasalligi edi. CMT bilan topilgan uyushmalarning aksariyati PMP22 genida 17p11.2-p12 da 1,5 Mb tandem takrorlanishi bilan bo'lgan.[11] Strukturaviy o'zgarishning taklif etilayotgan mexanizmi 2-rasmda keltirilgan. Odamda normal genning uchta nusxasi bo'lsa, bu kasallik fenotipiga olib keladi.[11] Agar biron bir kishida faqat bitta PMP22 genining nusxasi bo'lsa, boshqa tomondan, natijada bosim falajlari uchun javobgarlikka ega bo'lgan klinik jihatdan boshqacha irsiy neyropati paydo bo'ldi.[11] Genlarni dozalashdagi farqlar juda xilma-xil kasallik fenotiplarini vujudga keltirdi, bu esa tarkibiy o'zgarishning fenotip va kasallikka moyilligi borasidagi muhim rolni ochib berdi.

OIVga moyillik

Strukturaviy o'zgarishlarni o'rganish inson genomidagi mumkin bo'lgan rollari va ta'sirlarini aniqlash tufayli tobora ommalashib bormoqda. Nusxa nusxalarining o'zgarishi - bu strukturaviy o'zgarishning juda muhim turi va u keng o'rganilgan. CCL3L1 genining ta'siriga oid tadqiqot OIV -1/OITS CCL3L1 genining nusxa ko'chirish raqami odamning OIV-1 / OITSga ta'sirchanligiga ta'sir qiladimi, sezuvchanlik tekshirildi. Ular CCL3L1 nusxasi uchun bir nechta turli xil shaxslar va populyatsiyalardan namunalar olishdi va ularni OIV bilan kasallanish xavfi bilan taqqosladilar. Ular CCL3L1 nusxasi sonining yuqori miqdori bilan OIV va OITSga moyilligi o'rtasida bog'liqlik borligini aniqladilar, chunki OIVga ko'proq moyil bo'lgan shaxslarning CCL3L1 nusxasi kam bo'lgan.[12] Nusxa sonidagi bu farq ushbu assotsiatsiya tufayli OIV infeksiyasiga moyil bo'lishida katta rol o'ynashi ko'rsatilgan. NPY4R genining tarkibiy o'zgarishi semirishda muhim bo'lganligini tekshirgan odam semirishining patogeneziga qaratilgan yana bir tadqiqot. Tadqiqotlar ilgari 10q11.22 CNV semirish bilan bog'liqligini va bir nechta nusxa nusxalari semirish bilan bog'liqligini ko'rsatdi. Ularning CNV tahlillari shuni ko'rsatdiki, NPY4R geni bemorlar populyatsiyasida 10q11.22 CNV yo'qotish chastotasi ancha yuqori bo'lgan.[13] Boshqa tomondan, nazorat qilinadigan aholi, xuddi shu mintaqada ko'proq CNV daromadiga ega edi. Bu tadqiqotchilarga NPY4R genining nusxasi sonining o'zgarishi sababli semirish patogenezida muhim rol o'ynagan degan xulosaga keldi.[13] Nusxa o'zgarishi va boshqa tizimli variantlarni o'z ichiga olgan tadqiqotlar, struktura variantlari inson genomidagi muhim rollarga yangi tushunchalar kiritdi.

Shizofreniya

Shizofreniya rivojlanishiga yordam beradigan omillar keng o'rganilgan. Shizofreniya rivojlanishiga javobgar bo'lgan mexanizm va genlar bo'yicha yaqinda bir tadqiqot o'tkazildi. Ilgari MHC lokusidagi o'zgarish shizofreniya rivojlanishi bilan bog'liqligi ko'rsatilgan edi. Ushbu tadqiqot shuni ko'rsatdiki, assotsiatsiyani qisman komplement komponenti 4 (C4) genlari keltirib chiqaradi va shu sababli C4 genlarining allel variantlari shizofreniya rivojlanishiga hissa qo'shadi.[14] Bog'lanish nomutanosibligi tadqiqotchilarga SNP haplotiplariga qarab shaxsning qaysi C4 strukturaviy variantini aniqlashga yordam berdi. SNP haplotiplari va C4 allellari bir-biriga bog'langan edi, shuning uchun ular o'zaro bog'liqlik muvozanatiga ega edi, ya'ni ular bir-biridan ajralib chiqdi.[14] Bitta strukturaviy C4 varianti juda ko'p turli xil SNP haplotiplari bilan bog'liq edi, ammo faqat bitta C4 strukturaviy variant bilan bog'liq bo'lgan turli xil SNP haplotiplari.[14] Bu tadqiqotchilarga SNP haplotipiga qarab, C4 strukturaviy variantini osongina aniqlashga imkon beradigan bog'lanish nomutanosibligi bilan bog'liq edi. Ularning ma'lumotlari shuni ko'rsatdiki, natijalar shuni ko'rsatdiki, C4 ning tuzilish variantlari C4A oqsilini turli darajalarda ifodalaydi va yuqori C4A oqsillari farqi shizofreniya rivojlanishining yuqori darajasi bilan bog'liq.[14] Xuddi shu genning turli xil tuzilish variantli allellarida turli xil fenotiplar va kasalliklarga moyilligi ko'rsatilgan. Ushbu tadqiqotlar inson genomidagi tarkibiy o'zgarishning ishtiroki va ahamiyati kengligini namoyish etadi. Uning ahamiyati fenotipik xilma-xillik va kasalliklarga sezgir bo'lishiga qo'shgan hissasi bilan namoyon bo'ladi.

Kelajakdagi yo'nalishlar

Inson genomining tarkibiy o'zgarishini yaxshiroq tushunish uchun ko'plab tadqiqotlar o'tkazildi. Tadqiqotda katta yutuqlar bo'lgan, ammo uning ahamiyati hali ham to'liq tushunilmagan. Hali ham javobsiz qolgan bir nechta savol bor, ular ushbu mavzu bo'yicha qo'shimcha tadqiqotlar o'tkazishni iltimos qiladilar. Hozirgi tadqiqotlar odatda genomning "o'ziga xos" joylariga qaratilgan, ammo juda takrorlanadigan, takrorlanadigan va murakkab genomik sohalarda struktur variantlarning fenotipik ta'sirini aniqlay olmaydi.[15] Buni bugungi kunda genomik texnologiya bilan o'rganish juda qiyin, ammo kelajakda ketma-ketlik texnologiyalarining rivojlanishi bilan bu o'zgarishi mumkin. Strukturaviy variantlarning fenotipik ta'sirini yaxshiroq tushunish uchun aniq assotsiatsiyalarni yaratish uchun shaxslarning genotiplari va fenotiplarining katta ma'lumotlar bazalari yaratilishi kerak. Rivojlanish buzilishlarini echish, UK10K va Sitogenomik massivlar xalqaro standartlari konsortsiumi kabi ulkan loyihalar tadqiqotchilar uchun ushbu tadqiqotlarni osonroq olib borishlari uchun ma'lumotlar bazalarini yaratishga yo'l ochib berdi.[15]

Bundan tashqari, o'ziga xos kasalliklarga ega bo'lgan induktsiyali pluripotent ildiz hujayralarini yaratish texnologiyasida o'sish va rivojlanish kuzatildi. Bu translokatsiyalar, takrorlanishlar va inversiyalar kabi tizimli variantlarni keltirib chiqaradigan kasalliklarni qayta tiklash uchun tegishli model tizimlarini joriy etadi.[15] Kelajakda texnologiyalarni rivojlantirish va ma'lumotlar bazasining katta sa'y-harakatlari yanada sifatli tadqiqotlar olib borishga va inson genomining tarkibiy o'zgarishini ancha yaxshi tushunishga yordam beradi.

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d e f g h men j k l m n o Feuk, L .; Karson, A.R .; Schere, S.W. (2006). "Inson genomidagi tarkibiy o'zgarish". Genetika haqidagi sharhlar. 7 (2): 85–97. doi:10.1038 / nrg1767. PMID  16418744.
  2. ^ a b Nguyen, D.Q .; Uebber, C .; Ponting, C.P. (2006). "Insonning nusxa ko'chirish raqamlari variantlari bo'yicha tanlovning noto'g'ri tomoni". PLOS Genetika. 2: e20. CiteSeerX  10.1.1.276.7715. doi:10.1371 / journal.pgen.0020020.
  3. ^ Kidd, JM .; Kuper, G.M .; Donaxue, VF; Xeyden, X.S.; Sampas, N .; Qabrlar, T .; Xansen, N .; Choy, B .; Alkan, C .; Antonacci, F.; Xaugen, E .; Zerr, T .; Yamada, N.A .; Tsang, P .; Nyuman, T.L .; Tuzun, E .; Cheng, Z .; Ebling, XM; Tusneem, N .; Devid, R .; Gillett, V.; Felps, K.A .; To'quvchi, M .; Saranga, D .; Brend, A .; Tao, V.; Gustafson, E .; MakKernan, K .; Chen, L .; Malig M.; Smit, JD .; Korn, JM .; Makkarol, S.A .; Altshuler, D.A .; Peiffer, D.A .; Dorschner, M .; Stamatoyannopulos, J.; Shvarts, D.; Nikerson, D.A.; Mullikin, JK .; Uilson, R.K .; Brun, L .; Olson, M.V .; Kaul, R .; Smit, D.R .; Eichler, E.E. (2008). "Sakkizta inson genomidan tuzilish o'zgarishini xaritalash va ketma-ketligi". Tabiat. 453 (7191): 56–64. doi:10.1038 / nature06862. PMC  2424287. PMID  18451855.
  4. ^ a b Lakich, D .; Kazazian, H.H .; Antonarakis, S.E .; Gitschier, J. (1993). "VIII omil genini buzadigan inversiyalar og'ir gemofiliya A ning keng tarqalgan sababidir". Nat. Genet. 5 (3): 236–241. doi:10.1038 / ng1193-236. PMID  8275087.
  5. ^ a b Giglio, S .; Broman, KW; Matsumoto, N .; Kalvari, V .; Gimelli, G.; Neyman, T .; Ohashi, X.; Vuller, L .; Larizza, D .; Giorda, R .; Weber, J.L .; Ledbetter, D.X .; Zuffardi, O. (2001). "Olfaktor retseptorlari-gen klasterlari, genom-inversiya polimorfizmlari va xromosomalarning keng tarqalgan qayta tuzilishi". Amerika inson genetikasi jurnali. 68 (4): 874–83. doi:10.1086/319506. PMC  1275641. PMID  11231899.
  6. ^ a b v Redon, R .; Ishikava, S .; Fitch, K.R .; Feuk, L .; Perri, G.H .; Endryus, T.D .; Figler, X .; Shapero, M.X .; Karson, A.R .; Chen, V.; Cho, E.K .; Dallaire, S .; Friman, J.L .; Gonsales, JR .; Gratakos, M.; Xuang, J .; Kalaytsopulos, D. Komura, D.; Makdonald, JR .; Marshall, KR .; Mei, R .; Montgomeri, L .; Nishimura, K .; Okamura, K .; Shen, F.; Somerville, MJ .; Tchinda, J .; Valsesiya, A .; Vudvark, S .; Yang, F.; Chjan, J .; Zerjal, T .; Chjan, J .; Armengol, L .; Konrad, D.F .; Estivill, X .; Tayler-Smit, C .; Karter, N.P.; Aburatani, H.; Li, C .; Jons, KV.; Shere, S.W .; Hurles, ME (2006). "Inson genomidagi nusxa sonining global o'zgarishi". Tabiat. 444 (7118): 444–454. doi:10.1038 / nature05329. PMC  2669898. PMID  17122850.
  7. ^ a b Nyuman, S .; Hermetz, K.E .; Wekkselblatt, B.; Rud, M.K. (2015). "CNV-larning takrorlanishini keyingi avlod ketma-ketligi shuni ko'rsatadiki, ko'plari tandem, ba'zilari esa chiqish nuqtalarida sintez genlarini yaratadilar". Amerika inson genetikasi jurnali. 96 (2): 208–220. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.12.017. PMC  4320257. PMID  25640679.
  8. ^ a b Vissers, L.E .; Bxatt, S.S .; Yanssen, I.M .; Xia, Z.; Lalani, S.R .; Pfundt, R .; Dervinska, K .; de Vriz, B.B.; Gilissen, C .; Xoyschen, A .; Nesteruk, M.; Wisniowiecka-Kovalnik, B.; Smik, M.; Brunner, H.G .; Cheung, SS; van Kessel, A.G .; Veltman, JA; Stankievicz, P. (2009). "Nodir patogen mikroelementlar va tandemning takrorlanishi mikroxomologiya vositasida va mahalliy genomik arxitektura tomonidan rag'batlantiriladi". Inson molekulyar genetikasi. 18 (19): 3579–3593. doi:10.1093 / hmg / ddp306. PMID  19578123.
  9. ^ a b v Perri, G.H .; Domini, N.J .; Claw, K.G .; Li, A. S.; Figler, X .; Redon, R .; Verner, J .; Villanea, F.A .; Tog', J.L .; Misra, R .; Karter, N.P.; Li, C .; Stone, AC (2007). "Diyet va odam amilazasi genlarining nusxasi sonining o'zgarishi evolyutsiyasi". Tabiat genetikasi. 39 (10): 1256–60. doi:10.1038 / ng2123. PMC  2377015. PMID  17828263.
  10. ^ a b Handsaker, R.E .; Van Doren, V .; Berman, JR .; Genovese, G .; Kashin, S .; Boettger, L.M.; Makkarrol, SA (2015). "Odamlarda katta multiallelik nusxa ko'chirish raqamlarining o'zgarishi" (PDF). Tabiat genetikasi. 47 (3): 296–303. doi:10.1038 / ng.3200. PMC  4405206. PMID  25621458.
  11. ^ a b v Lupski, J.R .; de Oka-Luna, R.M.; Slaugenhaupt, S; Pentao, L .; Guzzetta, V .; Trask, B.J .; Sucedo-Cardenas, O .; Barker, D.F.; Killian, JM .; Garsiya, K.A .; Chakravarti, A .; Patel, P.I. (1991). "Charcot-Marie-Tooth kasalligi 1A turi bilan bog'liq bo'lgan DNKning takrorlanishi". Hujayra. 66 (2): 219–232. doi:10.1016/0092-8674(91)90613-4.
  12. ^ Gonsales, E .; Kulkarni, H .; Bolivar, X.; Mangano, A .; Sanches, R .; Katano, G.; Nibbs, R.J .; Fridman, B.I .; Xinones, M.P .; Bamshad, M.J .; Murty, K.K .; Rovin, BH; Bredli, V.; Klark, RA .; Anderson, S.A .; O'Konnel, J .; Agan, B.K .; Ahuja, S.S; Boloniya, R .; Sen, L .; Dolan, M.J .; Ahuja, S.K. (2005). "CCL3L1 geni tarkibidagi segmentar takrorlanishlarning OIV-1 / OITSga moyilligiga ta'siri". Ilm-fan. 307 (5714): 1434–40. doi:10.1126 / science.1101160. PMID  15637236.
  13. ^ a b Aerts, E .; Bekers, S .; Zegers, D .; Van Xorenbek, K .; Massa, G.; Verrijken, A .; Verxulst, S.L .; Van Gal, L.F .; Van Xul, V. (2016). "CNV tahlili va mutatsion skrining inson semirishida NPY4R geni uchun muhim rol o'ynaydi". Semirib ketish. 24 (4): 970–6. doi:10.1002 / oby.21435.
  14. ^ a b v d Sekar, A .; Bialas, A.R .; de Rivera, X.; Devis, A .; Xammond, T.R .; Kamitaki, N .; Tuli, K .; Presumey, J .; Baum, M .; Van Doren, V .; Genovese, G .; Rose, S.A .; Handsaker, R.E .; Deyli, M.J .; Kerol, MC; Stivens B.; Makkarrol, SA (2016). "Komplementning 4-komponentining murakkab o'zgarishi natijasida shizofreniya xavfi". Tabiat. 530 (7589): 177–83. doi:10.1038 / tabiat16549. PMC  4752392. PMID  26814963.
  15. ^ a b v Vayshenfeldt, J .; Simmons, O .; Shpits, F.; Korbel, J.O. (2013). "Genomik tarkibiy o'zgarishlarning fenotipik ta'siri: inson kasalligi va uning tushunchalari". Genetika haqidagi sharhlar. 14 (2): 125–138. doi:10.1038 / nrg3373. PMID  23329113.