TIMP2 - TIMP2

TIMP2
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1BR9, 1GXD, 2TMP, 4ILW
Identifikatorlar
Taxalluslar	TIMP2, CSC-21K, DDC8, TIMP metallopeptidaza inhibitori 2
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 188825 MGI: 98753 HomoloGene: 2444 Generkartalar: TIMP2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	17-xromosoma (odam)
Oxiri	78,925,387 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 11 (sichqoncha)
Oxiri	118,355,740 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• peptidaza inhibitori faoliyati; • GO: 0048551 ferment inhibitori faolligi; • metall ionlari bilan bog'lanish; • integralni bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • proteaz bilan bog'lanish; • metalloendopeptidaza inhibitori faoliyati; • rux ioni bilan bog'lash;
Uyali komponent	• o'sish konusi; • hujayradan tashqari mintaqa; • hujayra yuzasi; • neyron hujayralar tanasi; • neyron proektsiyasi; • hujayra tashqari ekzozoma; • hujayradan tashqari matritsa; • hujayradan tashqari; • o'ziga xos granulalar lümeni; • uchinchi darajali granulalar lümeni; • fikolin-1 ga boy granulalar lümeni; • kollagen o'z ichiga olgan hujayradan tashqari matritsa;
Biologik jarayon	• proteolizning salbiy regulyatsiyasi; • sitokinga javob; • peptidaza faolligining salbiy regulyatsiyasi; • adenilat siklaza faolligini ijobiy tartibga solish; • qarish; • hujayradan tashqari matritsani demontaj qilish; • Ras oqsil signalini o'tkazishni salbiy regulyatsiyasi; • markaziy asab tizimining rivojlanishi; • neyronlarning farqlanishini ijobiy tartibga solish; • gormonga javob; • membrana oqsili ektodomain proteolizining salbiy regulyatsiyasi; • giyohvandlikka javob; • MAPK kaskadining ijobiy regulyatsiyasi; • hujayralar ko'payishini salbiy tartibga solish; • mitoz hujayra siklining salbiy regulyatsiyasi; • Rap oqsil signalining o'tkazilishini tartibga solish; • endopeptidaza faolligining salbiy regulyatsiyasi; • neytrofil degranulyatsiyasi; • metallopeptidaza faolligining salbiy regulyatsiyasi; • organik moddaga javob;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	7077
	21858
	ENSG00000035862
	ENSMUSG00000017466
	P16035
	P25785
	NM_003255
	NM_011594
	NP_003246
	n / a
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Metalloproteinazlarning to'qima inhibitori 2 (TIMP2) a gen va tegishli oqsil. Gen - a'zosi TIMP genlar oilasi. Protein a metastaz supressori.^{[iqtibos kerak ]}

Funktsiya

Ushbu genlar oilasi tomonidan kodlangan oqsillar ning tabiiy inhibitorlari hisoblanadi matritsali metalloproteinazalar (MMP), bir guruh peptidazlar hujayradan tashqari matritsaning degradatsiyasida ishtirok etadi. Metallloproteinazalarga qarshi inhibitiv roldan tashqari, kodlangan oqsil TIMP oila a'zolari orasida uning tarqalishini to'g'ridan-to'g'ri bostirish qobiliyatida o'ziga xos rol o'ynaydi. endoteliy hujayralar. Natijada, kodlangan oqsil to'qimalarni saqlash uchun juda muhim bo'lishi mumkin gomeostaz bunga javoban tinchlangan to'qimalarning ko'payishini bostirish orqali angiogen omillar va hujayradan tashqari matritsani qayta qurish jarayonidagi to'qimalarda proteaz faolligini inhibe qilish.^[5] TIMP2 ham MMP inhibitori, ham aktivator sifatida ishlaydi. TIMPlar faol MMPlarni inhibe qiladi, ammo har xil TIMPlar boshqalarga qaraganda yaxshiroq har xil MMPlarni inhibe qiladi. Masalan, TIMP-1 MMP-7, MMP-9, MMP-1 va MMP-3 ni TIMP-2ga qaraganda yaxshiroq inhibe qiladi va TIMP-2 boshqa TIMPlarga qaraganda MMP-2 ni samaraliroq inhibe qiladi.^[6]

Melanotsitik hujayralarda TIMP2 gen ekspressioni tartibga solinishi mumkin MITF.^[7]

Yaqinda o'tkazilgan kashfiyot shundaki, TIMP2 muhim rol o'ynaydi gipokampal funktsiyasi va kognitiv funktsiyasi. Bu odamga berilganda eski sichqonlarga beriladigan foyda uchun hal qiluvchi rol o'ynaydi kindik qoni.^[8]^[9]

O'zaro aloqalar

TIMP2 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

MMP14^[10] va
MMP2.^[11]^[12]^[13]^[14]

Shuningdek qarang

TIMP1, TIMP3, TIMP4

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000035862 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000017466 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Entrez Gen: TIMP2 TIMP metallopeptidaza inhibitori 2".
^ Burboulia D, Stetler-Stivenson WG (iyun 2010). "Matritsali metalloproteinazlar (MMP) va metalloproteinazalarning to'qima inhibitörleri (TIMP): o'simta hujayralari yopishqoqligining ijobiy va salbiy regulyatorlari". Saraton biologiyasi bo'yicha seminarlar. 20 (3): 161–8. doi:10.1016 / j.semcancer.2010.05.002. PMC 2941566. PMID 20470890.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). "Ikki bosqichli DNK mikroarray strategiyasi yordamida aniqlangan yangi MITF maqsadlari". Pigment hujayralari melanomasi rez. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ Jozef Kastellano; va boshq. (2017 yil 27-aprel). "Odamning kindik ichakchasidagi plazma oqsillari keksa sichqonlarda gipokampal funktsiyani jonlantiradi". Tabiat. 544 (7651): 488–492. doi:10.1038 / nature22067. PMC 5586222. PMID 28424512.
^ "Odamlarning qoni keksa sichqonlarning miyasini yana yosh qiladi". Yangi olim. 2017 yil 29-aprel.
^ Zucker S, Drews M, Conner C, Foda HD, DeClerck YA, Langley KE, Bahou WF, Docherty AJ, Cao J (yanvar, 1998). "Metalloproteinaz-2 (TIMP-2) to'qimalarining inhibitori hujayra yuzasi retseptorlari katalitik sohasiga, membrana turi 1-matritsali metalloproteinaz 1 (MT1-MMP) bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 273 (2): 1216–22. doi:10.1074 / jbc.273.2.1216. PMID 9422789.
^ Morgunova E, Tuuttila A, Bergmann U, Tryggvason K (may 2002). "Metalloproteinaza 2 ning to'qima inhibitori bilan yashirin matritsali metalloproteinaza 2 ning kompleks shakllanishi to'g'risida tizimli tushuncha". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (11): 7414–9. doi:10.1073 / pnas.102185399. PMC 124245. PMID 12032297.
^ Umuman olganda CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF, King AE, Roberts CR (dekabr 2000). "Jelatinaza A.TIMP-2.MT1-MMP faollashuv kompleksidagi domenlarning o'zaro ta'siri. 1-turdagi matritsa metalloproteinaza membranasining 44-kDa shaklidagi ektodomain jelatinaza A aktivatsiyasini modulyatsiya qilmaydi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (50): 39497–506. doi:10.1074 / jbc.M005932200. PMID 10991943.
^ Bigg HF, Shi YE, Liu YE, Steffensen B, Umumiy CM (iyun 1997). "Metalloproteinazlar-4 (TIMP-4) to'qimalarining inhibitori odamning jelatinaz A ning COOH-terminal gemopeksinga o'xshash domeniga o'ziga xos, yuqori yaqinlik bilan bog'lanishi. TIMP-4 progelatinaza A va COOH-terminal domenini TIMP ga o'xshash tarzda bog'laydi. -2 ". J. Biol. Kimyoviy. 272 (24): 15496–500. doi:10.1074 / jbc.272.24.15496. PMID 9182583.
^ Kay HS, Butler GS, Morrison CJ, King AE, Pelman GR, Umuman CM (dekabr 2002). "Metalloproteinaza (TIMP) -4 va TIMP-2 C-terminal domeni va dumlari mutagenezi bilan to'qima inhibitori uchun xarakterli yangi rekombinant miyoglobin termoyadroviy oqsil ekspression tizimidan foydalanish. Kislota qoldiqlarining MMP-2 gemopeksin C- ni bog'lashdagi ahamiyati domen". J. Biol. Kimyoviy. 277 (50): 48696–707. doi:10.1074 / jbc.M209177200. PMID 12374789.

Qo'shimcha o'qish

Liotta LA, Stetler-Stivenson V, Stig PS (1991). "Metastazni bostiruvchi genlar". Muhim Adv. Onkol.: 85–100. PMID 1869284.
Stetler-Stivenson WG, Seo DW (2005). "TIMP-2: angiogenezning endogen inhibitori". Molekulyar tibbiyot tendentsiyalari. 11 (3): 97–103. doi:10.1016 / j.molmed.2005.01.007. PMID 15760767.

Tashqi havolalar

The MEROPS peptidazalar va ularning inhibitorlari uchun onlayn ma'lumotlar bazasi: I35.002
Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: P16035 (Metalloproteinaza inhibitori 2) da PDBe-KB.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 17 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000035862 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000017466 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[5] "Entrez Gen: TIMP2 TIMP metallopeptidaza inhibitori 2".

[6] Burboulia D, Stetler-Stivenson WG (iyun 2010). "Matritsali metalloproteinazlar (MMP) va metalloproteinazalarning to'qima inhibitörleri (TIMP): o'simta hujayralari yopishqoqligining ijobiy va salbiy regulyatorlari". Saraton biologiyasi bo'yicha seminarlar. 20 (3): 161–8. doi:10.1016 / j.semcancer.2010.05.002. PMC 2941566. PMID 20470890.

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). "Ikki bosqichli DNK mikroarray strategiyasi yordamida aniqlangan yangi MITF maqsadlari". Pigment hujayralari melanomasi rez. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[8] Jozef Kastellano; va boshq. (2017 yil 27-aprel). "Odamning kindik ichakchasidagi plazma oqsillari keksa sichqonlarda gipokampal funktsiyani jonlantiradi". Tabiat. 544 (7651): 488–492. doi:10.1038 / nature22067. PMC 5586222. PMID 28424512.

[9] "Odamlarning qoni keksa sichqonlarning miyasini yana yosh qiladi". Yangi olim. 2017 yil 29-aprel.

[pmid9422789-10] Zucker S, Drews M, Conner C, Foda HD, DeClerck YA, Langley KE, Bahou WF, Docherty AJ, Cao J (yanvar, 1998). "Metalloproteinaz-2 (TIMP-2) to'qimalarining inhibitori hujayra yuzasi retseptorlari katalitik sohasiga, membrana turi 1-matritsali metalloproteinaz 1 (MT1-MMP) bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 273 (2): 1216–22. doi:10.1074 / jbc.273.2.1216. PMID 9422789.

[pmid12032297-11] Morgunova E, Tuuttila A, Bergmann U, Tryggvason K (may 2002). "Metalloproteinaza 2 ning to'qima inhibitori bilan yashirin matritsali metalloproteinaza 2 ning kompleks shakllanishi to'g'risida tizimli tushuncha". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (11): 7414–9. doi:10.1073 / pnas.102185399. PMC 124245. PMID 12032297.

[pmid10991943-12] Umuman olganda CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF, King AE, Roberts CR (dekabr 2000). "Jelatinaza A.TIMP-2.MT1-MMP faollashuv kompleksidagi domenlarning o'zaro ta'siri. 1-turdagi matritsa metalloproteinaza membranasining 44-kDa shaklidagi ektodomain jelatinaza A aktivatsiyasini modulyatsiya qilmaydi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (50): 39497–506. doi:10.1074 / jbc.M005932200. PMID 10991943.

[pmid9182583-13] Bigg HF, Shi YE, Liu YE, Steffensen B, Umumiy CM (iyun 1997). "Metalloproteinazlar-4 (TIMP-4) to'qimalarining inhibitori odamning jelatinaz A ning COOH-terminal gemopeksinga o'xshash domeniga o'ziga xos, yuqori yaqinlik bilan bog'lanishi. TIMP-4 progelatinaza A va COOH-terminal domenini TIMP ga o'xshash tarzda bog'laydi. -2 ". J. Biol. Kimyoviy. 272 (24): 15496–500. doi:10.1074 / jbc.272.24.15496. PMID 9182583.

[pmid12374789-14] Kay HS, Butler GS, Morrison CJ, King AE, Pelman GR, Umuman CM (dekabr 2002). "Metalloproteinaza (TIMP) -4 va TIMP-2 C-terminal domeni va dumlari mutagenezi bilan to'qima inhibitori uchun xarakterli yangi rekombinant miyoglobin termoyadroviy oqsil ekspression tizimidan foydalanish. Kislota qoldiqlarining MMP-2 gemopeksin C- ni bog'lashdagi ahamiyati domen". J. Biol. Kimyoviy. 277 (50): 48696–707. doi:10.1074 / jbc.M209177200. PMID 12374789.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]