UBX protein domeni - UBX protein domain

UBX
PDB 1wj4 EBI.jpg
kiaa0794 oqsilining ubx domenining eritma tuzilishi
Identifikatorlar
BelgilarUBX
PfamPF00789
Pfam klanCL0072
InterProIPR001012
AqlliUBX
SCOP21i42 / QOIDA / SUPFAM

Molekulyar biologiyada UBX protein domeni topilgan hamma joyda a'zolari bo'lgan tartibga soluvchi oqsillar hamma joyda yo'l, shuningdek, boshqa bir qator ubikuitinga o'xshash oqsillar shu jumladan FAF-1 (FAS bilan bog'liq omil 1), inson Rep-8 ko'payish oqsili va bir nechta gipotetik oqsillar dan xamirturush. UBX domenini o'z ichiga olgan parranda FAF-1 parchasi sabab bo'lishiga qaramay UBX domenining vazifasi noma'lum. apoptoz transfekte qilingan hujayralar.

Funktsiya

Hozircha, hali UBX domeni uchun umumiy funktsiya hali paydo bo'lgan emas.[1] Bundan tashqari, a yo'qligi karboksi-terminal ikki xilglitsin motif, ammo UBX domenlari yo'qligini ko'rsatadi kovalent ravishda maqsadli oqsillarga hamma joyda o'xshash tarzda biriktirilgan.[2]

Tuzilishi

UBX domeni 80 ga yaqinni o'z ichiga oladi aminokislota qoldiqlar. Ular tez-tez modulli domen me'morchiligini namoyish etadigan katta miqdordagi oqsillar oilasini belgilaydigan UBX domenlarining uch o'lchovli tuzilmalari Ubikuitin bilan muhim tarkibiy tuzilishga ega ekanligini aniqlaydi. ketma-ketlik gomologiyasi[2]

Gomologiya

UBX domeni ubiquitinga juda o'xshaydi, bu bizga ba'zi bir ma'lumot beradi evolyutsiya. Ubiqitinli birlashma mavjud, ular uchun foydali ko'rinadi ribosomal subunit katlama.[2]

Adabiyotlar

  1. ^ Buchberger A (2002 yil may). "UBA dan UBXgacha: hamma joyda so'z birikmalaridagi yangi so'zlar". Hujayra biologiyasining tendentsiyalari. 12 (5): 216–21. doi:10.1016 / S0962-8924 (02) 02269-9. PMID  12062168.
  2. ^ a b v Schuberth C, Buchberger A (2008 yil avgust). "UBX domeni oqsillari: AAA ATPase Cdc48 / p97 ning asosiy regulyatorlari". Uyali va molekulyar hayot haqidagi fanlar. 65 (15): 2360–71. doi:10.1007 / s00018-008-8072-8. PMID  18438607.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR001012