VPS35 - VPS35

VPS35
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarVPS35, MEM3, PARK17, VPS35 retromer kompleks komponenti, retromer kompleks komponent
Tashqi identifikatorlarOMIM: 601501 MGI: 1890467 HomoloGene: 6221 Generkartalar: VPS35
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 16 (odam)
Chr.Xromosoma 16 (odam)[1]
Xromosoma 16 (odam)
VPS35 uchun genomik joylashuv
VPS35 uchun genomik joylashuv
Band16q11.2Boshlang46,656,132 bp[1]
Oxiri46,689,518 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE VPS35 217727 x da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_018206

NM_022997

RefSeq (oqsil)

NP_060676

NP_075373

Joylashuv (UCSC)Chr 16: 46.66 - 46.69 MbChr 8: 85.26 - 85.3 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Vakuolyar oqsillarni saralash bilan bog'liq oqsil 35 a oqsil odamlarda kodlanganligi VPS35 gen.[5][6]

Ushbu gen bir guruhga tegishli vakuolyar oqsillarni saralash (VPS) genlari. Kodlangan oqsil katta multimerik kompleksning tarkibiy qismidir retromer murakkab, oqsillarni retrograd transportida ishtirok etadi endosomalar uchun Golgi tarmog'i. Ushbu kompleksni tashkil etuvchi xamirturush va odam oqsillari o'rtasidagi yaqin tizimli o'xshashlik funktsiyalarning o'xshashligini ko'rsatadi. Xamirturush va sutemizuvchi hujayralardagi ekspression tadqiqotlari shuni ko'rsatadiki, bu protein to'g'ridan-to'g'ri retromer kompleksining yadrosi bo'lib xizmat qiladigan VPS35 bilan o'zaro ta'sir qiladi.[6]

Tuzilishi

Vps35 - bu eng katta kichik birlik retromer molekulyar og'irligi 92 kDa va yig'ilish uchun markaziy platforma vazifasini bajaradi Vps26 va Vps29.[7] Vps35 boshqa ko'p narsalarga o'xshaydi spiral solenoid oqsillari qoplamali vezikula savdosida ishtirok etadigan doimiy superhelix tartibida takroriy strukturaviy birliklar bilan ajralib turadigan AP adapteri oqsil komplekslari. 6 juft raqamli egri yuzasi spirallar elektromagnit tuzilish ichida bir qator tizmalar ajralib turadi hidrofob oluklar potentsial yuklarni bog'lash joylari sifatida ishlaydi.[8] Vps35 ning C-terminalida Vps29 ning metall bog'laydigan cho'ntagiga kiradigan a-solenoid burmasi mavjud.[9]

Da saqlanib qolgan PRLYL motifi N-terminali Vps35 ning Vps26 bilan bog'lanishida ishtirok etadi.[10][11] Strukturaviy majburiy motiflar ushbu kichik birlikni va o'rtasida bog'lovchi vazifasini bajarishini ta'minlaydi SNX dimerlar va Vps trimer kompleksi va SNX subbirliklarining N-terminal mintaqasiga yo'naltirilgan bog'lanish joylari trimerning ikkala uchida joylashgan. Tadqiqot shuni ko'rsatdiki, Vps35 ning nokdauni odamda HEp-2 epiteliya hujayralarida nuqson bor edi endosomal qayta ishlash transferrin tomonidan DMT1 DMT1-II ning lizosomal membranaga bog'langan oqsilga noto'g'ri saralashi sababli (LAMP2 ) tuzilmalar.[12]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000069329 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031696 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Zhang P, Yu L, Gao J, Fu Q, Dai F, Zhao Y, Zheng L, Zhao S (Yanvar 2001). "VPS35 va sichqonchaning Vps35 klonlashi va tavsifi va VPS35 ning inson xromosomasiga 16q13-q21 xaritasi". Genomika. 70 (2): 253–7. doi:10.1006 / geno.2000.6380. PMID  11112353.
  6. ^ a b "Entrez Gene: VPS35 vakuoler oqsilni saralash 35 homolog (S. cerevisiae)".
  7. ^ Hierro A, Rojas AL, Rojas R, Murty N, Effantin G, Kajava AV, Steven AC, Bonifacino JS, Hurley JH (oktyabr 2007). "Retromer yuklarni tanib olish kompleksining funktsional arxitekturasi". Tabiat. 449 (7165): 1063–7. doi:10.1038 / nature06216. PMC  2377034. PMID  17891154.
  8. ^ Nothwehr SF, Bruinsma P, Strawn LA (1999 yil aprel). "Vps35p ichidagi alohida domenlar xamirturush prekakuolyar / endosomal bo'linmasidan ikki xil yuk oqsillarini olishda vositachilik qiladi".. Mol. Biol. Hujayra. 10 (4): 875–90. doi:10.1091 / mbc.10.4.875. PMC  25208. PMID  10198044.
  9. ^ Collins BM, Skinner CF, Watson PJ, Seaman MN, Owen DJ (iyul 2005). "Vps29-da retromer yig'ilishi uchun oqsil bilan o'zaro iskala vazifasini bajaradigan fosfoesteraza katlami mavjud". Nat. Tuzilishi. Mol. Biol. 12 (7): 594–602. doi:10.1038 / nsmb954. PMID  15965486. S2CID  30658528.
  10. ^ Reddy QK, Seaman MN (oktyabr 2001). "Vps26p, retromerning tarkibiy qismi, Vps35p ning o'zaro ta'sirini endosomadan Goljiga qaytarishda yo'naltiradi". Mol. Biol. Hujayra. 12 (10): 3242–56. doi:10.1091 / mbc.12.10.3242. PMC  60170. PMID  11598206.
  11. ^ Zhao X, Nothwehr S, Lara-Lemus R, Zhang BY, Peter H, Arvan P (dekabr 2007). "Sutemizuvchi Vps35 ning xamirturushdagi dominant-salbiy xatti-harakatlari retromer yig'ilishida ishtirok etgan saqlanib qolgan PRLYL motifini talab qiladi". Yo'l harakati. 8 (12): 1829–40. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00658.x. PMC  2532708. PMID  17916227.
  12. ^ Tabuchi M, Yanatori I, Kawai Y, Kishi F (mart 2010). "Retromer vositachiligida to'g'ridan-to'g'ri saralash DMT1 sutemizuvchilar temir tashuvchisini to'g'ri endosomal qayta ishlash uchun talab qilinadi". J. Cell Sci. 123 (Pt 5): 756-66. doi:10.1242 / jcs.060574. PMID  20164305.

Qo'shimcha o'qish