WIPI2 - WIPI2 - Wikipedia

WIPI2
Identifikatorlar
Taxalluslar	WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, WD takroriy domeni, fosfoinozit o'zaro ta'sir qiluvchi 2, IDDSSA
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 609225 MGI: 1923831 HomoloGene: 90887 Generkartalar: WIPI2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 7 (odam)
Oxiri	5,233,840 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 5 (sichqoncha)
Oxiri	142,670,588 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• fosfatidilinozitol-5-fosfat bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • fosfatidilinozitol-3-fosfat bilan bog'lanish; • fosfatidilinozitol-3,5-bifosfat bilan bog'lanish; • lipid bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• avtofagosoma; • sitozol; • avtofagosomadan oldingi tuzilish membranasi; • membrana; • avtofagosomadan oldingi tuzilish; • membrananing tashqi komponenti; • nukleoplazma; • makromolekulyar kompleks;
Biologik jarayon	• avtofagiya; • GO: 0000046 avtofagosomaning pishib etish jarayoni; • makroavtofagiya; • avtofagosoma yig'ilishi; • mitofagiya; • oqsil lipidatsiyasi; • yadroning avtofagiyasi; • avtofagosomadan oldingi tuzilishga protein lokalizatsiyasi; • avtofagosoma yig'ilishida ishtirok etadigan protein lipidatsiyasi; • ksenofagiya; • ochlikdan uyali javob;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	26100
	74781
	ENSG00000157954
	ENSMUSG00000029578
	Q9Y4P8
	Q80W47
NM_001033518; NM_001033519; NM_001033520; NM_001278299; NM_015610;
	NM_016003
	NM_178398
NP_001028690; NP_001028691; NP_001028692; NP_001265228; NP_056425;
	NP_057087; NP_056425.1
	NP_848485
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

WD takroriy domen fosfoinozit bilan ta'sir qiluvchi oqsil 2 a oqsil odamlarda kodlanganligi WIPI2 gen.^[5]^[6]

Funktsiya

WD40 takrorlanadi oqsillar ko'plab muhim biologik funktsiyalarning asosiy tarkibiy qismidir. Ular bir vaqtning o'zida va qaytariladigan oqsil-oqsillarning o'zaro ta'siri uchun beta-pervanel platformasini taqdim etish orqali ko'p proteinli komplekslarni yig'ilishini tartibga soladilar. WIP40 takroriy oqsillari, masalan, WIPI2, WIPI subfamilasining a'zolari 7-pichoqli pervanel tuzilishiga ega va fosfolipidlar bilan o'zaro ta'sir qilish uchun saqlanib qolgan motifni o'z ichiga oladi.^[5]^[6]

WIPI2 - Atg21 emas, balki Atg18 sutemizuvchisi gomologi va bir-biriga yaqin bo'lgan protein, WIPI1. WIPI2 mRNA tez-tez ishlatiladigan bir necha laboratoriya hujayra liniyalarida (HEK293A, HeLa, A431) va bir nechta saraton hujayralari liniyalarida osonlikcha aniqlanadi, WIPI1 ekspressioni esa saraton hujayralari bilan chegaralanadi [zarurat], ammo shu bilan birga ko'plab inson to'qimalarida aniqlanadi.

Atg oqsillari tartibga solinadi avtofagiya, bu a lizosomal hujayra sog'lig'ini saqlash, ozuqaviy moddalardan mahrum bo'lish davrlarida omon qolish uchun zarur bo'lgan degradatsiya yo'li, shuningdek, saraton, neyrodejeneratsiya va turli xil patogenlarga immunitet ta'sirida rol o'ynaydi.^[7] WIPI2 hosil bo'ladigan autofagosomaga DFCP-1, ULK-1 va Atg16 bilan birga erta jalb qilinadi, bu erda Atg8 (LC3) lipidatsiyasini ijobiy tartibga soladi. Bu WIPI1 uchun to'g'ri emas.

Shuningdek qarang

WIPI oqsillar oilasi

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157954 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029578 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b Proikas-Sezanne T, Vaddell S, Gaugel A, Friki T, Lupas A, Nordxaym A (2004 yil dekabr). "WIPI-1alpha (WIPI49), roman 7-pichoqli WIPI oqsillar oilasining a'zosi, inson saratonida bexosdan ifoda etilgan va ochlikdan kelib chiqqan otofagiya bilan bog'liq". Onkogen. 23 (58): 9314–25. doi:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID 15602573.
^ ^a ^b "Entrez Gen: WIPI2 WD takroriy domeni, fosfoinositid o'zaro ta'sir qiluvchi 2".
^ Orsi A, Polson HE, Tooze SA (dekabr 2009). "Avtofagiyada ishtirok etadigan membranalar savdosi hodisalari". Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. doi:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID 20036114.

* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). "Sutemizuvchilar Atg18 (WIPI2) omegasoma bilan biriktirilgan fagoforlarni lokalizatsiya qiladi va LC3 lipidatsiyasini ijobiy tartibga soladi". Avtofagiya. 6 (4): 506–22. doi:10.4161 / auto.6.4.11863. PMID  20505359.

Qo'shimcha o'qish

Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I va boshq. (2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalari rez. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Wiemann S, Arlt D, Huber V va boshqalar. (2004). "ORFeome'dan Biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom Res. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Xillier LW, Fulton RS, Fulton LA va boshq. (2003). "Inson xromosomasining DNK ketma-ketligi 7". Tabiat. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A va boshq. (2001). "Keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi bilan aniqlangan yangi oqsillarni tizimli hujayralararo lokalizatsiyasi". EMBO vakili. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R va boshq. (2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: 500 cDNA ning to'liq kodlangan oqsillarini izchillik bilan tahlil qilish". Genom Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In vitro saytga xos rekombinatsiyadan foydalangan holda DNKni klonlash". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Lay CH, Chou CY, Ch'ang LY va boshqalar. (2000). "Caenorhabditis elegans-da evolyutsion tarzda saqlanib qolgan yangi odam genlarini taqqoslash proteoimi bilan aniqlash". Genom Res. 10 (5): 703–13. doi:10.1101 / gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
(1999). "To'liq inson genomlari ketma-ketligiga". Genom Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 7 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157954 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029578 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid15602573-5] Proikas-Sezanne T, Vaddell S, Gaugel A, Friki T, Lupas A, Nordxaym A (2004 yil dekabr). "WIPI-1alpha (WIPI49), roman 7-pichoqli WIPI oqsillar oilasining a'zosi, inson saratonida bexosdan ifoda etilgan va ochlikdan kelib chiqqan otofagiya bilan bog'liq". Onkogen. 23 (58): 9314–25. doi:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID 15602573.

[entrez-6] "Entrez Gen: WIPI2 WD takroriy domeni, fosfoinositid o'zaro ta'sir qiluvchi 2".

[pmid20036114-7] Orsi A, Polson HE, Tooze SA (dekabr 2009). "Avtofagiyada ishtirok etadigan membranalar savdosi hodisalari". Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. doi:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID 20036114.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]