Whalefall-1 RNK motifi - Whalefall-1 RNA motif

Whalefall-1 RNK motifi
Whalefall-1-RNA.svg
Whalefall-1 RNKlarining konsensusli ikkinchi tuzilishi
Identifikatorlar
Belgilarwf-1
RfamRF01762
Boshqa ma'lumotlar
RNK turisRNK
Domen (lar)Balina metagenomga aylanadi
PDB tuzilmalarPDBe

The Whalefall-1 RNK motifi (shuningdek, deyiladi wf-1) saqlanganga ishora qiladi RNK yordamida topilgan struktura bioinformatika.[1][2] Strukturaviy ravishda, motiv ikkitadan iborat poyalar (diagramaga qarang), ikkinchisi ko'pincha CUUG tomonidan bekor qilinadi tetraloop, bu energetik jihatdan qulay bo'lgan RNK ketma-ketligi. Balina-1 RNKlari faqat shu erda uchraydi DNK ishlov berilmagan joydan olingan bakteriyalar topilgan kit tushishi, ya'ni a kit tana go'shti. 2010 yildan boshlab Whalefall-1 RNKlari ma'lum bo'lgan, etishtirilgan bakteriyalar turlarida aniqlanmagan va shuning uchun ular bir nechta Atrof muhit namunalarida mavjud bo'lgan RNKlar.

Adabiyotlar

  1. ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (dekabr 2009). "Bakterial metagenom tahlillari natijasida aniqlangan istisno tuzilgan kodlash bo'lmagan RNKlar". Tabiat. 462 (7273): 656–9. doi:10.1038 / nature08586. PMC  4140389. PMID  19956260.

Tashqi havolalar