Bioinformatika resurs markazlari - Bioinformatics Resource Centers

The Bioinformatika resurs markazlari (BRClar) besh kishilik guruhdir Internetga asoslangan tadqiqot markazlari 2004 yilda tashkil etilgan va NIAID tomonidan moliyalashtirilgan Milliy allergiya va yuqumli kasalliklar instituti.)^[1] BRClar paydo bo'lgan va qayta tiklanayotgan tahdidlarga javoban tuzilgan patogenlar, ayniqsa Kasalliklarni nazorat qilish va oldini olish markazlari (CDC) A, B va C toifali patogenlar,^[2] va ulardan potentsial foydalanish bioterrorizm. NIAIDning ularni moliyalashtirish niyati bioinformatika markazlar ushbu kasallik qo'zg'atuvchilarini eksperimental tavsiflashda ishtirok etadigan tadqiqotchilarga yordam berishdir giyohvand moddalar, vaksinalar yoki ularga qarshi kurashish uchun diagnostika vositalari.

BRKlarning asosiy maqsadlari quyidagilardan iborat:

1) keng qamrovli yaratish ma'lumotlar bazalari ishonchli, zamonaviy bioinformatik ma'lumotlar (genetik, proteomik, biokimyoviy, yoki mikrobiologik ) qiziqishning patogenlari bilan bog'liq;
2) tadqiqotchilarga ushbu ma'lumotlarga Internet orqali qidirish va ma'lumotlarni qidirish orqali oson kirish imkoniyatini berish foydalanuvchi interfeyslari;
3) Tadqiqotchilarga dolzarb va zamonaviy texnologiyalarni taqdim etish hisoblash vositalari ushbu ma'lumotlarni bioinformatik tahlil qilish uchun.

Beshta BRClar butun davlat tomonidan ham xususiy, ham xususiy tashkilotlar tomonidan qo'llab-quvvatlanadi AQSH va Kanada. Har bir BRC patogenlarning boshqa guruhiga qaratilgan. The Patogenlar portali umumiy ombor sifatida xizmat qiladi va BRC haqida qisqacha ma'lumot va ularga bog'lanishni ta'minlaydi.

Bioinformatika resurs markazlari
Ism	Acrono nomi	Hissa beruvchi tashkilot (lar)	Qoplangan organizmlar soni	Qoplangan organizmlar (CDC toifasi)
Eukaryotik patogenlar uchun ma'lumotlar bazasi manbalari	EuPathDB	Pensilvaniya universiteti Jorjiya universiteti	13 naslda 45 ta	Kritidiya (Boshqa) Kriptosporidiy (B) Ensefalitozoon (I guruh) Entamoeba (B) Enterotsitozoon (I guruh) Giardiya (B) Leyshmaniya (Boshqa) Neospora (Boshqa) Plazmodium (Boshqa) Teileriya (Boshqa) Toksoplazma (B) Trichomonas (Boshqa) Tripanozoma (Boshqa)
Grippni o'rganish bo'yicha ma'lumotlar bazasi	IRD	Northrop Grumman Axborot texnologiyalari J. Kreyg Venter instituti Vecna Technologies	1	Gripp virusi (gripp) (C)
PathoSystems Resurslarni Integratsiya Markazi	VATRIK	Virjiniya bioinformatika instituti Chikago universiteti Matnni qazib olish bo'yicha milliy markaz	22 nasl	Bacillus (A) Bartonella (I guruh) Borreliya (I guruh) Brusella (B) Burxolderiya (B) Kampilobakter (B) Xlamidofila (B) Klostridium (A) Koksiyella (B) Erlichiya (I guruh) Esherichiya (B) Frensisella (A) Helicobacter (I guruh) Listeriyalar (B) Mikobakteriya (C) Rikketsiya (B, C) Salmonella (B) Shigella (B) Stafilokokk (B) Vibrio (B) Yersiniya (A, B) Boshqalar Bakteriyalar
Virus patogenlari uchun ma'lumotlar bazasi va tahlil manbai	ViPR	Northrop Grumman Axborot texnologiyalari J. Kreyg Venter instituti Vecna Technologies	13 oila	Arenaviridae (A) Bunyaviridae (A) Filoviridae (A) Flaviviridae (A) Poxviridae (A) Caliciviridae (B) Togaviridae (B) Gepatit A virus (B) Coronaviridae (C) Paramyxoviridae (C) Lisavirus (C) Gepatit E Herpesviridae Reoviridae
VectorBase	VB	Notre Dame universiteti Evropa bioinformatika instituti London Imperial kolleji	30	Anopheles gambiae (Boshqa) Anofellar turlar (x16) (Boshqalar) Aedes aegypti (Boshqa) Biomphalaria glabrata (Boshqa) Culex quinquefasciatus (Boshqa) Glossina turlar (x5) (Boshqalar) Ixodes scapularis (Boshqa) Lutzomiya longipalpis (Boshqa) Musca domestica (Boshqa) Pediculus humanus (Boshqa) Flebotomus papatasi (Boshqa)
Patogenlar portali	yo'q	Virjiniya bioinformatika instituti	13 turdagi ma'lumotlar: Gen ifodasi, proteomika	Vaksiniya (Boshqa) Variola (A) Monkeypox (A) Koronavirus (C) Brucella abortus (B) Bacillus antracis (A) Salmonella typhimurium (B) Yersinia pestis (A) Vibrio vabo (B) Cryptosporidium parvum (B) Toxoplasma gondii (B) Homo sapiens (Boshqa) Muskul mushak (Boshqa)

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

^ Umumiy nuqtai, Bioinformatika resurs markazlari Arxivlandi 2008 yil 15 may, soat Orqaga qaytish mashinasi, Milliy allergiya va yuqumli kasalliklar instituti (NIAID), 2008 yil 10-yanvar.
^ CDC Bioterrorizm agentlari va kasalliklari (toifalar bo'yicha) Arxivlandi 2014-07-22 da Orqaga qaytish mashinasi, Kasalliklarni nazorat qilish va oldini olish markazlari (Sog'liqni saqlash va aholiga xizmat ko'rsatish boshqarmasi), 2008 yil 8-iyulda kirishgan.

Tashqi havolalar

NIAID uy sahifasi
Bioinformatika resurs markazlari BRClarning maqsadlari va faoliyatini tavsiflovchi NIAID sahifasi
Patogen patort BRClar uchun uyadan joy; qisqacha ma'lumot beradi
EuPathDB Eukaryotik patogenlar BRC
IRD Grippni o'rganish bo'yicha ma'lumotlar bazasi BRC
ViPR Viruslar ma'lumotlar bazasi va tahlil resurslari BRC
VATRIK PathoSystems Resurslarni Integratsiya Markazi
VectorBase VectorBase BRC

[Overview,_Bioinformatics_Resource_Centers-1] Umumiy nuqtai, Bioinformatika resurs markazlari Arxivlandi 2008 yil 15 may, soat Orqaga qaytish mashinasi, Milliy allergiya va yuqumli kasalliklar instituti (NIAID), 2008 yil 10-yanvar.

[CDC_Bioterrorism_Agents-2] CDC Bioterrorizm agentlari va kasalliklari (toifalar bo'yicha) Arxivlandi 2014-07-22 da Orqaga qaytish mashinasi, Kasalliklarni nazorat qilish va oldini olish markazlari (Sog'liqni saqlash va aholiga xizmat ko'rsatish boshqarmasi), 2008 yil 8-iyulda kirishgan.

[1]

[2]