Kalbindin - Calbindin - Wikipedia

kalbindin 1, 28kDa
Calbindin2G9B.pdb.png
Ca ning NMR eritmasi tuzilishi2+- kalbindin D28K yuklangan.[1]
Identifikatorlar
BelgilarCALB1
Alt. belgilarKALB
NCBI geni793
HGNC1434
OMIM114050
RefSeqNM_004929
UniProtP05937
Boshqa ma'lumotlar
LokusChr. 8 p11
kalbindin 2, 29kDa (kalretinin)
Identifikatorlar
BelgilarCALB2
NCBI geni794
HGNC1435
OMIM114051
RefSeqNM_001740
UniProtP22676
Boshqa ma'lumotlar
LokusChr. 16 q22.1

Kalbindinlar uch xil kaltsiyni bog'laydigan oqsillar: kalbindin, kalretinin va S100G. Ular dastlab quyidagicha ta'riflangan D vitamini bilan bog'liq bo'lgan kaltsiyni bog'laydigan oqsillar jo'ja va sutemizuvchilarda ichak va buyrakda. Ular endi turlicha tasniflanadi subfamilies chunki ular Ca miqdori bilan farq qiladi2+ majburiy EF qo'llari.

Kalbindin 1

Kalbindin 1 yoki oddiygina kalbindin avval qushlarda ichakda ekanligi, so'ngra sutemizuvchilar buyragida bo'lganligi isbotlangan. Shuningdek, u bir qator neyronal va endokrin hujayralarda, xususan serebellum. Bu odamlarda kodlangan 28 kDa oqsilidir CALB1 gen.

Kalbindin tarkibida 4 ta faol kaltsiyni bog'laydigan moddalar mavjud domenlar, va kaltsiy bilan bog'lanish qobiliyatini yo'qotgan 2 ta o'zgartirilgan domen. Kalbindin kaltsiy tamponu va kaltsiy sensori vazifasini bajaradi va to'rtta Ca ni ushlab turishi mumkin2+ ichida EF qo'llar EF1, EF3, EF4 va EF5 ko'chadan. Sichqoncha kalbindinining tuzilishi dastlab yadro magnit-rezonansi bilan hal qilingan va keyinchalik ushbu usul bilan aniqlangan eng katta oqsillardan biri bo'lgan.[1] Kalbindinning ketma-ketligi 263 qoldiqdan iborat va faqat bitta zanjirga ega. Ketma-ketlik asosan alfa spirallardan iborat, ammo beta varaqlar mavjud emas. NMR PDB (PDB yozuvi 2G9B) ga muvofiq[2] 117 ta qoldiqni o'z ichiga olgan 14 ta spiral bilan 44% spiral va 13 ta qoldiqni o'z ichiga olgan 9 ta ip bilan 4% beta-varaq. 2018 yilda inson kalbindinining rentgen-kristalli tuzilishi nashr etildi (PDB yozuvi 6FIE).[3][4] Sichqoncha va inson izoformalari o'rtasida 98% ketma-ketlik identifikatsiyasiga qaramay, yadro magnit-rezonansi va kristal tuzilishi o'rtasida farqlar mavjud edi. Kichik burchakli rentgen nurlari kristalli tuzilish kalbindinning eritmadagi xususiyatlarini yadro magnit-rezonansi bilan aniqlangan tuzilishga nisbatan yaxshiroq bashorat qilishini ko'rsatadi.

Kalbindin a D vitamini - ko'plab to'qimalarda, xususan, kaltsiyning emilimida vositachilik qilishda aniq funktsiyaga ega bo'lgan jo'ja ichaklarida javob beradigan gen.[5] Miyada uning sintezi D-vitaminidan mustaqildir.

Kalbindin 2 (Kalretinin)

Calretindin 2 nomi bilan ham tanilgan Calretinin 29 kDa protein bo'lib, kalbindin 1 ga nisbatan 58% homologiyaga ega va asosan asab to'qimalarida uchraydi.[6] U odamlarda kodlangan CALB2 gen va ilgari sifatida tanilgan kalbindin-D29k.

Kalbindin 3 (S100G)

S100G, ilgari kalbindin 3 va kalbindin-D9k, sutemizuvchilarda mavjud enterotsitlar (ichakning epiteliya hujayralari). S100G buyrakda ham bo'lishi mumkin bachadon ba'zi sutemizuvchilar turlarida. U odamlarda kodlangan S100G gen deb nomlangan CALB3. Shunga qaramay, yo'q homologiya kalbindin 1 va S100G o'rtasida, ularning kaltsiy bilan bog'lanish sohalaridan tashqari (EF qo'llar ): S100G ikkita EF qo'lga ega, kalbindin 1 esa oltitaga ega. Calbindin 1 va 2 dan farqli o'laroq, S100G ning a'zosi S100 oilasi kaltsiyni bog'laydigan oqsillar.

S100G kaltsiyni enterotsitlar orqali apikal tomondan tashib o'tishda vositachilik qiladi, bu erda kirish tartibga solinadi. kaltsiy kanali TRPV6, bazolateral tomonga, qaerda kaltsiy nasoslari kabi PMCA 1 hujayra ichidagi foydalanish adenozin trifosfat kaltsiyni qonga quyish uchun.[7] Enterotsitlar sitoplazmasi bo'ylab kaltsiyni tashish ichakdagi kaltsiyni singdirish uchun tezlikni cheklaydigan ko'rinadi; kalbindin borligi, erkin kontsentratsiyani oshirmasdan hujayradan o'tadigan kaltsiy miqdorini oshiradi.[8] S100G, shuningdek, bazolateral kaltsiy pompalanishini rag'batlantirishi mumkin ATPazlar. Ifoda S100G ning, xuddi kalbindin 1 kabi, faol D vitamini tomonidan rag'batlantiriladi metabolit, kalsitriol aniq mexanizmlar hali ham bahsli bo'lsa-da.[9] Sichqonlarda D vitamini retseptorlari ifoda etilmagan, S100G unchalik ko'p emas, lekin yo'q emas.[iqtibos kerak ]

Kashfiyot

Tovuqning sitosolik fraktsiyalarida D vitaminiga bog'liq kaltsiyni biriktiruvchi oqsillar topilgan ichak, keyinchalik Robert Vasserman, shu jumladan tadqiqotchilar tomonidan sutemizuvchilarning ichaklari va buyraklarida Kornell universiteti.[10][11] Bunday oqsillar bog'langan kaltsiy mikromolyar diapazonda va juda kamaygan D vitamini - etishmayotgan hayvonlar. Ushbu hayvonlarni davolash orqali ifoda etish mumkin D vitamini kabi metabolitlar kalsitriol.

Ular ikkita aniq o'lchamda mavjud bo'lganligi aniqlandi a molekulyar og'irlik taxminan 9 kDa va 28 kDa dan iborat bo'lib, ular kalbindinlar deb o'zgartirildi.

Adabiyotlar

  1. ^ a b PDB: 2G9B​; Kojetin DJ, Venters RA, Kordys DR, Tompson RJ, Kumar R, Cavanagh J (2006 yil iyul). "Ca2 + yuklangan kalbindin-D (28K) ning tuzilishi, bog'lanish interfeysi va gidrofobik o'tishlari". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 13 (7): 641–7. doi:10.1038 / nsmb1112. PMID  16799559. S2CID  29426332.
  2. ^ Kojetin, Duglas J; Venters, Ronald A; Kordis, Devid R; Tompson, Rishele J; Kumar, Rajiv; Cavanagh, Jon (2006 yil iyul). "Ca2 + yuklangan kalbindin-D28K ning tuzilishi, bog'lanish interfeysi va gidrofobik o'tishlari". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 13 (7): 641–647. doi:10.1038 / nsmb1112. ISSN  1545-9993. PMID  16799559. S2CID  29426332.
  3. ^ Noble, J. V.; Olmalki, R .; Ro, S. M.; Vagner, A .; Duman, R .; Atack, J. R. (2018). "Odam kalbindin-D28K ning rentgen tuzilishi: takomillashtirilgan model". Acta Crystallogr D. 74 (Pt 10): 1008-1014. doi:10.2210 / pdb6fie / pdb. PMC  6173056. PMID  30289411.
  4. ^ Noble JW, Almalki R, Roe SM, Vagner A, Duman R, Atack JR (oktyabr 2018). "Odam kalbindin-D28K ning rentgen tuzilishi: takomillashtirilgan model". Acta Crystallographica bo'limi D. 74 (Pt 10): 1008-1014. doi:10.1107 / S2059798318011610. PMC  6173056. PMID  30289411.
  5. ^ Wasserman RH, Fullmer CS (1989). "Ichakdagi kaltsiyni tashishning molekulyar mexanizmi to'g'risida". Eksperimental tibbiyot va biologiyaning yutuqlari. 249: 45–65. doi:10.1007/978-1-4684-9111-1_5. ISBN  978-1-4684-9113-5. PMID  2543194.
  6. ^ Rojers JH (1987 yil sentyabr). "Kalretinin: asosan neyronlarda ifodalangan yangi kaltsiyni bog'lovchi oqsil uchun gen". Hujayra biologiyasi jurnali. 105 (3): 1343–53. doi:10.1083 / jcb.105.3.1343. PMC  2114790. PMID  3654755.
  7. ^ Wasserman RH, Chandler JS, Meyer SA, Smit KA, Brindak ME, Fullmer CS va boshq. (1992 yil mart). "Bazolateral membranadagi ichak kaltsiyni tashish va kaltsiy ekstruziyasi jarayonlari". Oziqlanish jurnali. 122 (3 ta qo'shimcha): 662-71. doi:10.1093 / jn / 122.suppl_3.662. PMID  1311756.
  8. ^ Feher JJ, Fullmer CS, Vasserman RH (1992 yil fevral). "Ichakdagi kaltsiyni emirilishida kalbindin yordamida kaltsiyning tezlashtirilgan diffuziyasining roli". Amerika fiziologiyasi jurnali. 262 (2 Pt 1): C517-26. doi:10.1152 / ajpcell.1992.262.2.C517. PMID  1539638.
  9. ^ Arpa NF, Prathalingam SR, Zhi P, Legon S, Xovard A, Uolters JR (avgust 1999). "Odam kalbindin-D9k genining o'n ikki barmoqli ichak ekspressionida ishtirok etuvchi omillar". Biokimyoviy jurnal. 341 (Pt 3) (3): 491-500. doi:10.1042/0264-6021:3410491. PMC  1220384. PMID  10417310.
  10. ^ Vasserman RH, Teylor AN (1966 yil may). "Jo'ja ichak shilliq qavatida vitamin D3 bilan bog'liq kaltsiyni biriktiruvchi oqsil". Ilm-fan. 152 (3723): 791–3. Bibcode:1966Sci ... 152..791W. doi:10.1126 / science.152.3723.791. PMID  17797460. S2CID  8221178.
  11. ^ Vasserman RH, Corradino RA, Teylor AN (iyul 1969). "Mumkin transport funktsiyasi bilan hayvonlardan oqsillarni bog'lash". Umumiy fiziologiya jurnali. 54 (1): 114–37. doi:10.1085 / jgp.54.1.114. PMC  2225897. PMID  19873640.

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.