Calponin homologiyasi domeni - Calponin homology domain - Wikipedia

Kalponin homologiyasi (CH) domeni
2RR8.pdb.jpg
IQGAP1 kalponin homologiyasi sohasining eritma tuzilishi[1]
Identifikatorlar
BelgilarCH
PfamPF00307
InterProIPR001715
AqlliCH
PROSITEPDOC00019
SCOP21aoa / QOIDA / SUPFAM
CDDCD00014

Calponin homologiyasi domeni (yoki CH domeni) oila aktin ikkala sitoskeletal oqsillarda va signal o'tkazuvchan oqsillarda mavjud bo'lgan majburiy domenlar.[2] Domen uzunligi taxminan 100 ta aminokislotadan iborat va to'rtta alfa spiraldan iborat.[3] U aktin bilan bog'laydigan domenlarning quyidagi guruhlarini o'z ichiga oladi:

Ushbu turdagi aktin bilan bog'lanadigan domenlarni o'z ichiga olgan oqsillarni har tomonlama ko'rib chiqish berilgan.[4]

CH domeni oilaning ba'zi a'zolarida aktin bilan bog'lanishda ishtirok etadi. Shu bilan birga, kalponinlarda CH domeni uning aktin bilan bog'lanish faoliyatiga aloqador emasligi haqida dalillar mavjud.[5] Ko'pgina oqsillarda CH domenining ikki nusxasi mavjud, ammo kalponin va inson vav proto-onkogen kabi ba'zi oqsillar (P15498) faqat bitta nusxada bo'lishi kerak. Masalan CH domenining tuzilishi yordamida aniqlandi Rentgenologik kristallografiya.[6]

Misollar

Kalponin homolog domen tarkibidagi oqsillarni kodlovchi inson genlariga quyidagilar kiradi.

Adabiyotlar

  1. ^ PDB: 2RR8​; Umemoto R, Nishida N, Ogino S, Shimada I (sentyabr 2010). "Insonning IQGAP1 kalponin homologiyasi domenining NMR tuzilishi va uning aktinni aniqlash rejimiga ta'siri". J. Biomol. NMR. 48 (1): 59–64. doi:10.1007 / s10858-010-9434-8. PMID  20644981. S2CID  25649748.
  2. ^ Saraste M, Kastresana J (1995). "Vav CH-domeni orqali F-aktin bilan bog'lanadimi?". FEBS Lett. 374 (2): 149–151. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 01098-Y. PMID  7589522. S2CID  29667309.
  3. ^ Korenbaum, E .; Rivero, F. (2002 yil sentyabr). "Calponin homologiyasi domenlari bir qarashda". J Uyali ilmiy ish. 115 (Pt 18): 3543-5. CiteSeerX  10.1.1.608.8653. doi:10.1242 / jcs.00003. PMID  12186940. S2CID  38137068.
  4. ^ Xartvig JH (1995). "Aktin bilan bog'langan oqsillar. 1: Spektrin super oilasi". Protein prof. 2 (7): 703–800. PMID  7584474.
  5. ^ Gimona M, Mital R (1998). "Kalponinning yagona CH domeni F-aktin bilan bog'lanish uchun etarli emas va kerak emas". J. Cell Sci. 111: 1813–1821. PMID  9625744.
  6. ^ Saraste M, Carugo KD, Banuelos S (1997). "Kalponin homologiyasi domenining kristalli tuzilishi". Nat. Tuzilishi. Biol. 4 (3): 175–179. doi:10.1038 / nsb0397-175. PMID  9164454. S2CID  1428195.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR001715