EMBnet - EMBnet

The Evropa molekulyar biologiya tarmog'i (EMBnet) rivojlanishni maqsad qilgan xalqaro ilmiy tarmoq va qiziqish guruhidir bioinformatika bioinformatika bo'yicha tajriba va imkoniyatlarni birlashtirish orqali xizmatlar.[1] 2011 yilda EMBnet-ning 32 ta davlatga tarqalgan 37 ta tugunlari mavjud. Tugunlarga tegishli bioinformatika kiradi universitet bo'limlar, ilmiy-tadqiqot institutlari va milliy xizmat ko'rsatuvchi provayderlar.

Amaliyotlar

Ko'pgina EMBnet tugunlarining asosiy vazifasi ularning milliy ilmiy jamoatchiligiga kirish imkoniyatini berishdir bioinformatika ma'lumotlar banklari, ixtisoslashgan dasturiy ta'minot va etarli hisoblash resurslari va tajriba. EMBnet shuningdek bioinformatika o'qitish va dasturiy ta'minotni ishlab chiqish. EMBnet a'zolari tomonidan yaratilgan dasturiy ta'minotga misollar: EMBOSS, wEMBOSS,[2] UTOPIA.

EMBnet keng foydalanuvchilar guruhini ifodalaydi va EMBL kabi ma'lumotlar bazalari ishlab chiqaruvchilari bilan yaqin hamkorlik qiladi Evropa bioinformatika instituti (EBI), Shveytsariya bioinformatika instituti (Shveytsariya-Prot ), the Proteinlar ketma-ketligi bo'yicha Myunxen axborot markazi (MIPS), xizmatlarning bir xil qamrovini ta'minlash maqsadida Evropa. EMBnet ro'yxatdan o'tgan Gollandiya jamoat fondi sifatida (Stichting ).

1988 yilda tashkil topganidan beri, EMBnet xizmat ko'rsatuvchi shaxslarning norasmiy tarmog'idan rivojlanib keldi biologik ma'lumotlar bazalari bioinformatika mutaxassislarini kengayib borayotgan sohalarga xizmat ko'rsatish uchun birgalikda ishlashga jalb qiluvchi yagona dunyo tashkilotiga genetika va molekulyar biologiya. Asosan akademik tugunlardan tashkil topgan bo'lsa-da, EMBnet sanoat a'zolaridan muhim qo'shimcha hajmga ega bo'ladi. EMBnet-ning muvaffaqiyati tashqarida joylashgan tashkilotlarning sonini ko'paytiradi Evropa qo'shilmoq.

EMBnet o'quv kurslarini tashkil etish, texnik yordam berish va o'z a'zolariga samarali ta'sir o'tkazish va biologik tadqiqotlarning tez o'zgaruvchan ehtiyojlarini qondirish uchun biron bir institut qila olmaydigan tarzda yordam berish uchun sinovdan o'tgan infratuzilmaga ega.

2005 yilda tashkilot har bir mamlakat uchun bir nechta a'zolarga ruxsat berish uchun qo'shimcha tugun turlarini yaratdi. Yangi toifadagi nominatsiya - "bog'langan tugun".

Muvofiqlashtirish va tashkil etish

EMBnet yillik umumiy yig'ilishlar (AGM) tomonidan boshqariladi va uchta loyiha qo'mitalari faoliyatini boshqaruvchi Ijroiya Kengashi tomonidan muvofiqlashtiriladi:

  • Ta'lim va tarbiya qo'mitasi (E&T). Ta'limni qo'llab-quvvatlashga a'zo mamlakatlar va tillarda tashkil etilgan bir qator kurslar kiradi, shuningdek, qo'mita on-layn ma'lumotlarini doimiy ravishda ishlab chiqish bo'yicha ishlaydi.
  • Jamoatchilik va jamoatchilik bilan aloqalar qo'mitasi (P&PR). Ushbu qo'mita EMBnet faoliyatining har qanday turini targ'ib qilish, EMBnet hamjamiyati tomonidan taqdim etiladigan mahsulot va xizmatlarning reklamasi uchun, shuningdek EMBnet ko'rinishini oshirishga qaratilgan yangi strategiyalarni taklif qilish va ishlab chiqish hamda EMBnet jamoalari bilan jamoatchilik bilan aloqalar to'g'risida g'amxo'rlik qilish uchun javobgardir. va tegishli tarmoqlar / jamiyatlar.
  • Texnik menejer qo'mitasi (TM). TM PC qatnashuvchi tugunlarga va ularning foydalanuvchilariga yordam va amaliy yordam beradi.

Yutuqlar

Birinchisi EMBnet edi gopher va Butunjahon tarmog'i serverlar biologiya (CSC BioBox)

EMBnet Internet (NDT), tarqatilgan hisoblash (HASSLE) va ma'lumotlar bazasini samarali ko'rib chiqish va bog'lash (Sequence Retrieval System, SRS) dan foydalangan holda ma'lumotlar bazasini kunlik yangilash uchun echimlarni taklif qildi.

Ping loyihasi butun tarmoq samaradorligi to'g'risida doimiy ma'lumot olish vositasi sifatida yaratilgan Evropa.

EMBnet eng so'nggi dasturiy ta'minotni taqdim etishga sodiqdir algoritmlar foydalanuvchiga bepul (Kengaytirilgan GCG yoki EGCG[3]) va eng zamonaviy davlat dasturiy ta'minotini ishlab chiqishda davom etmoqda (EMBOSS ).

EMBER: Evropa multimedia bioinformatika ta'limi manbai. EMBER Evropa Ittifoqi (Evropa Ittifoqi) tomonidan moliyalashtirilgan bo'lib, uning to'plamini ishlab chiqishni maqsad qilgan multimedia bioinformatika ta'lim vositalari [4]. EMBER o'zboshimchalik bilan, interfaol Veb-qo'llanma bioinformatika va unga teng keladigan mustaqil kurs CD-ROM.

EMBnet hamjamiyati ekspertlar jurnalini yaratishda ishtirok etdi Bioinformatika bo'yicha brifinglar (BiB). BiB shuningdek, EMBnet-ning ta'lim granti tomonidan qo'llab-quvvatlandi.

The Bioinformatikani o'rganish, o'qitish va o'qitish bo'yicha global tashkilot (GOBLET) 2012 yil EMBnet yillik yig'ilishida notijorat fond sifatida tashkil etilgan.[5][6]

Jurnal

EMBnet.journal  
EMBnet.journal cover.jpg
IntizomBioinformatika
TilIngliz tili
Tahrirlangan tomonidanErik Bongkam-Rudloff
Nashr tafsilotlari
Tarix2010 yildan hozirgi kungacha
Nashriyotchi
EMBnet
ChastotaniHar chorakda
Ha
Standart qisqartmalar
ISO 4EMBnet.journal
Indekslash
ISSN2226-6089
Havolalar

1994 yildan 2009 yilgacha EMBnet nashr qilindi EMBnet.news.[7] Uning asosiy maqsadi foydalanuvchilarga hamjamiyatga tarmoqdagi so'nggi yangiliklar va o'zgarishlar haqida ma'lumot berish va hisobot berish edi.

2010 yilda tashkil etilgan EMBnet.news (ovozli raqamlash uzluksiz davom etganda), EMBnet.journal a ekspertlar tomonidan ko'rib chiqilgan ochiq kirish ilmiy jurnal original tadqiqot va texnik hujjatlarni nashr etish bioinformatika.[8][9] Jurnal ikkita asosiy bo'limni o'z ichiga oladi, ulardan biri tadqiqot maqolalari, sharhlar va texnik eslatmalar uchun, ikkinchisi esa sharhlar, reportajlar, foydalanuvchi qo'llanmalari, o'quv ma'lumotlari va yangiliklar uchun ko'rib chiqilmagan. EMBnet.journal konferentsiya materiallari va yig'ilish tezislarini qo'shimcha sifatida nashr etadi.

Adabiyotlar

  1. ^ Domenika D'Elia; Andreas Gisel; Nils-Einar Eriksson; Sofiya Kossida; Kimmo Mattila; Lyubos Klyukar va Erik Bongkam-Rudloff (2009). "EMBnet-ning 20 yilligi: Hayot fanlari hamjamiyati uchun 20 yillik bioinformatika". BMC Bioinformatika. 10: S1. doi:10.1186 / 1471-2105-10-S6-S1. PMC  2697632. PMID  19534734.
  2. ^ Martin Sarachu; Mark Kolet (2005). "wEMBOSS: EMBOSS uchun veb-interfeys". Bioinformatika. 21 (4): 540–541. doi:10.1093 / bioinformatika / bti031. PMID  15388516.
  3. ^ "EGCG 8.0". cmgm.stanford.edu.
  4. ^ T.K.Attvud; I.Selimas; R. Buis; R.Altenburg; R. Xerzog; V.Ledent; V.Gita; P.Fernandes; I. Markes; M. Brugman (2005). "EMBER loyihasi bo'yicha hisobot - Evropa multimedia bioinformatika ta'lim resursi". Bioscience Education elektron jurnali. 6–4. Arxivlandi asl nusxasi 2011-12-09 kunlari. Olingan 2011-11-24.
  5. ^ "GOBLET | EMBnet". www.embnet.org. Olingan 26 avgust 2016.
  6. ^ Atvud, Tereza K.; Bongkam-Rudloff, Erik; Brazas, Mishel E.; Corpas, Manuel; Gaudet, Paskal; Levit, Fran; Mulder, Nikola; Palagi, Patrisiya M.; Shnayder, Mariya Viktoriya; van Gelder, Celia W. G.; Welch, Lonni (2015 yil 9-aprel). "GOBLET: Bioinformatikani o'rganish, o'qitish va o'qitish bo'yicha global tashkilot". PLOS hisoblash biologiyasi. 11 (4): e1004143. doi:10.1371 / journal.pcbi.1004143. PMC  4391932. PMID  25856076.
  7. ^ "Arxivlar". journal.embnet.org.
  8. ^ Domenika D'Elia; Andreas Gisel; Nils-Einar Eriksson; Sofiya Kossida; Kimmo Mattila; Lyubos Klyukar va Erik Bongkam-Rudloff (2009). "EMBnet-ning 20 yilligi: Hayot fanlari hamjamiyati uchun 20 yillik bioinformatika". BMC Bioinformatika. 10: S1. doi:10.1186 / 1471-2105-10-S6-S1. PMC  2697632. PMID  19534734.
  9. ^ Dublin, Metyu. "EMBnet.news morflar yangi bioinformatika jurnaliga aylandi". genomeweb.com. Olingan 14 yanvar 2013.

Tashqi havolalar