Intron vositachilik bilan takomillashtirish - Intron-mediated enhancement

Intron vositachilik bilan takomillashtirish (IME) - bu qobiliyat intron oshirish uchun ketma-ketlik ifoda a gen shu intronni o'z ichiga olgan. Xususan, intron ko'chirildi kengayish uchun genning mintaqasi, IMEni odatdagi ta'siridan farq qiladi transkripsiya kuchaytirgichlari.[1] Ushbu hodisaning tavsiflari birinchi marta madaniyatli nashr etilgan makkajo'xori hujayralar 1987 yilda,[2] va keyinchalik "intron vositachilik bilan takomillashtirish" atamasi 1990 yilda paydo bo'ldi.[3] Bir qator nashrlar ushbu hodisaning saqlanib qolganligini namoyish etdi eukaryotlar odamlar, shu jumladan,[4] sichqonlar,[5] Arabidopsis,[6] guruch,[7][8] va C. elegans.[9] Biroq, IME ishlaydigan mexanizm (lar) hali to'liq tushunilmagan.[10]

Har qanday intron gen ekspressionini kuchaytiradimi yoki yo'qligini tekshirishda, ikkitasining ifodasini taqqoslash odatiy holdir konstruktsiyalar, bittasi intronni, ikkinchisi esa unsiz va ikkala natija o'rtasidagi farqni "baravar o'sish "qo'shimcha ravishda. Keyingi eksperimentlar ekspressionni kuchaytirilishining sababi sifatida IME-ni ko'rsatishi mumkin - eng keng tarqalgan usullardan biri transkripsiyani boshlash joyining intronini transkriptdan olib tashlashdir. Agar intron endi ifodani kuchaytira olmasa, keyin intronning transkriptga kiritilishi muhim va intron IME ni keltirib chiqarishi mumkin.

Hamma intronlar gen ekspressionini kuchaytirmaydi, ammo ular intronsiz boshqaruvga nisbatan ekspressionni 2 dan 1000 baravargacha oshirishi mumkin.[11] Yilda Arabidopsis va boshqa o'simlik turlari, IMEter intron ketma-ketligi gen ekspressionini kuchaytirishi ehtimolini hisoblash uchun ishlab chiqilgan.[12] Buning naqshlari asosida ballni hisoblash orqali amalga oshiriladi nukleotid maqsadli ketma-ketlikdagi ketma-ketliklar. Intronning transkript ichidagi o'rni ham muhimdir - intron yozuvning boshlanishiga (5 'oxiri) qanchalik yaqin bo'lsa, uning gen ekspressionini kuchaytiradi.[13]

Adabiyotlar

  1. ^ Rose, A. B. (2008-01-01). "Gen ekspressionining intron vositachilik bilan boshqarilishi". Mikrobiologiya va immunologiyaning dolzarb mavzulari. 326: 277–290. ISSN  0070-217X. PMID  18630758.
  2. ^ Kallis, J .; Fromm, M.; Walbot, V. (1987-12-01). "Intronlar madaniylashtirilgan makkajo'xori hujayralarida gen ekspressionini oshiradi". Genlar va rivojlanish. 1 (10): 1183–1200. doi:10.1101 / gad.1.10.1183. ISSN  0890-9369. PMID  2828168.
  3. ^ Maskarenxas, D; Mettler, IJ; Pirs, DA; Lowe, HW (1990). "Makkajo'xori tarkibidagi heterologik gen ekspressionini intron vositachilik bilan kuchaytirish". O'simliklar molekulyar biologiyasi. 15 (6): 913–920. doi:10.1007 / BF00039430. PMID  2103480. yo'q
  4. ^ Jonsson, JJ; Foresman, tibbiyot fanlari doktori; Uilson, N; McIvor, RS (1990). "Inson purinli nukleosid fosforilaza genini ekspressioni uchun intron talab". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 20 (12): 3191–3198. doi:10.1093 / nar / 20.12.3191. PMC  312458. PMID  1620616.
  5. ^ Palmiter, RD; Sandgren, RaI; Avarbok, MR; Allen, DD; Brinster, RL (1991). "Geterologik intronlar sichqonlardagi transgenlarning ta'sirini kuchaytirishi mumkin". PNAS. 88 (2): 478–482. doi:10.1073 / pnas.88.2.478. PMC  50834. PMID  1988947. yo'q
  6. ^ Rose, AB; Oxirgi, RL (2003). "Intronlar transkripsiyadan so'ng Arabidopsis taliana triptofan yo'l genining PAT1 ekspressionini oshirish uchun harakat qiladi". O'simlik jurnali. 11 (3): 455–464. doi:10.1046 / j.1365-313X.1997.11030455.x. PMID  9107035.
  7. ^ Jeon, JS; Li, S; Jung, KH; Iyun, SH; Kim, C; An, G (2000). "Birinchi intron vositachiligida OsTubA1 bo'lgan guruch a-tubulin genining to'qimalarining imtiyozli ifodasi". O'simliklar fiziologiyasi. 123 (3): 1005–1014. doi:10.1104 / s.123.3.1005. PMC  59063. PMID  10889249.
  8. ^ Morello, L; Bardini, M; Sala, F; Breviario, D (2002). "Ostub16 guruch b-tubulin genining uzoq etakchi introni yuqori darajadagi gen ekspressioni uchun talab qilinadi va transkripsiyani in vivo va in vitro avtonom tarzda rivojlantirishi mumkin". O'simlik jurnali. 29 (1): 33–44. doi:10.1046 / j.0960-7412.2001.01192.x. PMID  12060225.
  9. ^ Xo, SH; Shunday qilib, GMK; Chou, KL (2001). "Caenorhabditis elegans mab-21 ning postembrional ifodasi va uning sezgir nurlar differentsiatsiyasida ehtiyoji". Rivojlanish dinamikasi. 221 (4): 422–430. doi:10.1002 / dvdy.1161. PMID  11500979.
  10. ^ Gallegos, Jenna E .; Rose, Alan B. (2015-08-01). "Intron vositachilik bilan yaxshilanishning doimiy sirlari". O'simlikshunoslik. 237: 8–15. doi:10.1016 / j.plantsci.2015.04.017. ISSN  1873-2259. PMID  26089147.
  11. ^ Rose, A (2002). "Arabidopsisda gen ekspressionini intron vositachilik bilan kuchaytirishga qo'yiladigan talablar". RNK. 8 (11): 1444–53. doi:10.1017 / S1355838202020551. PMC  1370350. PMID  12458797.
  12. ^ Rose, Alan B.; Elfersi, Tali; Parra, Genis; Korf, Yan (2008-03-01). "Arabidopsis thaliana-dagi promotor-proksimal intronlar gen ekspressionini oshiradigan tarqoq signallar bilan boyitilgan". O'simlik hujayrasi. 20 (3): 543–551. doi:10.1105 / tpc.107.057190. ISSN  1532-298X. PMC  2329928. PMID  18319396.
  13. ^ Rose, Alan B. (2004-12-01). "Arabidopsisda gen ekspressionining intron vositachiligida intron joylashuvining ta'siri". O'simlik jurnali. 40 (5): 744–751. doi:10.1111 / j.1365-313X.2004.02247.x. ISSN  1365-313X. PMID  15546357.