Ko'p mikroblarga qarshi ekstruziya oqsili - Multi-antimicrobial extrusion protein

Boshqa maqsadlar uchun qarang Mate.
Ko'p mikroblarga qarshi ekstruziya oqsili
Identifikatorlar
BelgilarMatE
PfamPF01554
Pfam klanCL0222
InterProIPR002528
TCDB2. A.66
OPM superfamily220
OPM oqsili3mkt

Mnihoyatdaantmikroblarga qarshi extrusion oqsil (MATE) shuningdek, nomi bilan tanilgan ko'p dori va toksin ekstruziyasi yoki ko'p dori va toksik birikma ekstruziyasi oila oqsillar dori / natriy yoki proton sifatida ishlaydigan antiporters.[1][2][3]

Funktsiya

MATE oqsillari bakteriyalar, arxey va eukaryotlar metabolik va ksenobiotik organik kationlarning asosiy tashuvchilari sifatida ishlaydi.[2][3]

Tuzilishi

Ushbu oqsillarda 12 ta bo'lishi taxmin qilinmoqda alfa-spiral transmembran mintaqalarda, ba'zi hayvon oqsillari qo'shimcha bo'lishi mumkin C-terminali spiral.[4] NorM ning rentgen tuzilishi 3,65 to ga teng bo'lib, membrananing tashqi varag'iga ikkita portal ochilgan holda tashqi tomonga yo'naltirilgan konformatsiya va bashorat qilingan 12 ta transmembranli spirallarning boshqa topilmasi va boshqa ma'lum bo'lgan ko'p dori-darmonlarga chidamli transporterlaridan farqli o'laroq aniqlandi.[5]

Kashfiyot

Ko'p dori oqish transport vositasi NorM dan V. parahaemolyticus bu ko'plab antimikrobiyal vositalarga qarshilik ko'rsatishda vositachilik qiladi (norfloksatsin, kanamitsin, bridli etidiy va boshqalar) va uning homologi E. coli 1998 yilda aniqlangan.[6] NorM dori / natriy sifatida ishlaydi antiporter bu Na ning birinchi misoli+- birlashtirilgan ko'p dori oqish transport vositasi topildi.[7] NorM - bu yangi prototip transport vositasi oila va Braun va boshq. uni ko'p dori va toksik birikma ekstruziyasi oilasi deb nomladi.[1] NorM "Ko'p dori-darmonlarni tashuvchisi" laqabini oldi, chunki u funktsional va tizimli ravishda kashf etilgan so'nggi ko'p dori-darmon hisoblanadi.[8]

Genlar

Quyidagi inson genlari MATE oqsillarini kodlaydi:

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Braun MH, Polsen IT, Skurray RA (1999 yil yanvar). "Ko'p dori-darmonli oqsil NorM yangi transportyorlar oilasining prototipidir". Mol. Mikrobiol. 31 (1): 394–5. doi:10.1046 / j.1365-2958.1999.01162.x. PMID  9987140.
  2. ^ a b Kuroda T, Tsuchiya T (dekabr 2008). "MATE oilasidagi ko'p dori efflux tashuvchilar". Biokimyo. Biofiz. Acta. 1794 (5): 763–8. doi:10.1016 / j.bbapap.2008.11.012. PMID  19100867.
  3. ^ a b Omote H; va boshq. (2006). "MATE oqsillari metabolik va ksenobiotik organik kationlarning asosiy tashuvchisi sifatida". Farmakologiya fanlari tendentsiyalari. 27 (11): 587–93. doi:10.1016 / j.tips.2006.09.001. PMID  16996621.
  4. ^ Hvorup RN, Winnen B, Chang AB, Jiang Y, Zhou XF, Saier MH (mart 2003). "Ko'p dori / oligosakkaridil-lipid / polisaxarid (MOP) eksport qiluvchi superfamil". Yevro. J. Biokimyo. 270 (5): 799–813. doi:10.1046 / j.1432-1033.2003.03418.x. PMID  12603313.
  5. ^ He X, Szewczyk P, Karykin A, Hong WX, Zhang Q, Chang G (2010). "Kation bilan bog'langan ko'p dori va zaharli aralash ekstruziya tashuvchisi". Tabiat. 467 (7318): 991–994. Bibcode:2010 yil natur.467..991H. doi:10.1038 / nature09408. PMC  3152480. PMID  20861838.
  6. ^ Morita Y, Kodama K, Shiota S, Mine T, Kataoka A, Mizushima T, Tsuchiya T (iyul 1998). "NorM, Vibrio parahaemolyticus va uning Escherichia coli-dagi gomologining ko'p miqdordagi effluks oqsili". Mikrobga qarshi. Agentlar Chemother. 42 (7): 1778–82. doi:10.1128 / AAC.42.7.1778. PMC  105682. PMID  9661020.
  7. ^ Morita Y, Kataoka A, Shiota S, Mizushima T, Tsuchiya T (dekabr 2000). "NorM of Vibrio parahaemolyticus - bu Na + bilan boshqariladigan, ko'p dori bilan ta'minlangan effluks nasos". J. Bakteriol. 182 (23): 6694–7. doi:10.1128 / JB.182.23.6694-6697.2000. PMC  111412. PMID  11073914.
  8. ^ van Veen HW (2010). "Strukturaviy biologiya: ko'p dori vositalarining oxirgi qismi". Tabiat. 467 (7318): 926–7. Bibcode:2010 yil natur.467..926V. doi:10.1038 / 467926a. PMID  20962836. S2CID  4338964.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR002528