Patogenligi oroli - Pathogenicity island
Patogenligi orollar (PAI), 1990 yilda aytilganidek, alohida sinf genomik orollar tomonidan sotib olingan mikroorganizmlar orqali gorizontal genlarning uzatilishi.[1][2] Patogenlik orollari hayvon va o'simlik qo'zg'atuvchilarida ham uchraydi.[2] Bundan tashqari, PAI ikkalasida ham mavjud grammusbat va grammusbat bakteriyalar.[2] Ular gorizontal genlarni uzatish kabi hodisalar orqali uzatiladi, masalan a plazmid, fag yoki konjugativ transpozon.[3] Shuning uchun PAI mikroorganizmlarning rivojlanish qobiliyatiga yordam beradi.
Bir turdagi bakteriyalar bir nechta PAIga ega bo'lishi mumkin. Masalan, Salmonella kamida beshta.
Shunga o'xshash genomik tuzilish rizobiya deb nomlanadi a simbiyoz oroli.
Xususiyatlari
Patogenlik orollari (PAI) - bu tarkibiga kiritilgan gen klasterlari genom, patogen organizmlarning xromosomal yoki ekstrakromosomal, ammo odatda ularda yo'q patogen bo'lmagan organizmlar bir xil yoki bir-biriga yaqin turlarning.[2][4][5] Ular bakterial xromosomada joylashgan bo'lishi yoki a ichida o'tkazilishi mumkin plazmid yoki bakteriofag genomlarida topish mumkin.[2] The GK-tarkib va patogenlik orollarining kodondan foydalanishi ko'pincha qolganlaridan farq qiladi genom, agar donor va PAI qabul qiluvchisi o'xshash GC tarkibiga ega bo'lmasa, ularni ma'lum bir DNK ketma-ketligida aniqlashga yordam berishi mumkin.[2]
PAI - bu to'g'ridan-to'g'ri takroriy takrorlash, qo'shilish ketma-ketligi yoki tNK genlari bilan ajralib turadigan alohida-alohida genetik birliklar, bu DNKga rekombinatsiya joylari vazifasini bajaradi. Kriptografik harakatchanlik genlari ham mavjud bo'lishi mumkin, bu transduktsiya ekanligini isbotlaydi.[3] PAI to'g'ridan-to'g'ri takrorlash bilan yonma-yon joylashgan; kiritilgan ketma-ketlikning ikki uchidagi asoslar ketma-ketligi bir xil. Ular funktsional genlarni, masalan birlashadi, transpozazlar, fagotsitoz yoki uning bir qismi qo'shilish ketma-ketliklari, mezbon DNKga kiritishni ta'minlash uchun.[2] PAI ko'pincha bog'liqdir tRNK ushbu integratsiya hodisasi uchun saytlarni maqsad qilgan genlar.[2] Ular bitta bo'linma sifatida yangi bakterial hujayralarga o'tkazilishi mumkin, shuning uchun ilgari benign shtammlarga virulentlik beradi.[4]
PAI, bir turi mobil genetik element, 10-200 gacha bo'lishi mumkin kb va kodlash genlar ga hissa qo'shadigan zaharlanish tegishli patogenning.[2] Patogenlik orollari bir yoki bir nechta virusli omillarni kodlovchi genlarni o'z ichiga oladi, shu jumladan, lekin ular bilan cheklanmagan holda yopishqoq moddalar, sekretsiya tizimlari (kabi) III turdagi sekretsiya tizimi ), toksinlar, invazinlar, modulinlar, effektorlar, superantigenlar, temirni qabul qilish tizimlari, o-antigen sintezi, sarumga qarshilik, immunoglobulin A proteazlar, apoptoz, kapsula orqali sintez va o'simlik o'simogenezi A. tumefaciens.[2]
Patogenlik orollarini o'z ichiga olgan tartibga solishning turli xil kombinatsiyalari mavjud. Birinchi kombinatsiya shundaki, patogenlik orolida PAIda kodlangan virulentlik genlarini tartibga solish uchun genlar mavjud.[2] Ikkinchi birikma shundaki, patogenlik orolida patogenlik orolidan tashqarida joylashgan genlarni tartibga solish uchun genlar mavjud.[2] Bundan tashqari, PAIdan tashqarida tartibga soluvchi genlar patogenlik orolidagi virulentlik genlarini tartibga solishi mumkin.[2] Odatda PAIlarda kodlangan regulyatsiya genlariga AraCga o'xshash oqsillar va ikki komponentli javob regulyatorlari kiradi.[2]
PAIlarni beqaror DNK mintaqalari deb hisoblash mumkin, chunki ular o'chirishga yoki safarbarlikka moyil.[2] Buning sababi PAIlarning tuzilishi, to'g'ridan-to'g'ri takrorlash, qo'shilish ketma-ketligi va yuqori chastotalarda o'chirish va mobilizatsiya qilishga imkon beradigan tRNK bilan bog'liqligi bo'lishi mumkin.[3] Bundan tashqari, genomga kiritilgan patogenlik orollarini yo'q qilish tRNKning buzilishiga olib keladi va keyinchalik hujayraning metabolizmiga ta'sir qiladi.[4]
Misollar
- The P fimbriae orolda gemolizin, pili, sitotoksik nekrozlash omili va uropatogenik o'ziga xos oqsil (USP) kabi virulentlik omillari mavjud.[6]
- Yersinia pestis patogenligi yuqori orol I temirni qabul qilish va saqlashni tartibga soluvchi genlarga ega.
- Salmonella SP1 va SP2 saytlari.[4]
- Rhodococcus equi virusli plazmid patogenligi oroli makrofaglarda ko'payish uchun virulentlik omillarini kodlaydi.
- The SaPI oilasi Staphylococcus aureus patogenlik orollari, ko'chma genetik elementlar, kodlash superantigenlar uchun gen, shu jumladan toksik shok sindromi toksin va yuqori chastotalarda o'ziga xos xususiyati bo'yicha safarbar qilinadi bakteriofaglar.[7]
- Faj vabo toksini kodlangan Vibrio vabo, Difteriya toksini Corynebacterium difteriya, Ning neyrotoksinlari Clostridium botulinum va sitotoksin Pseudomonas aeruginosa.[3]
- H. pylori mavjudligi sababli ikki shtammga ega, biri ikkinchisiga qaraganda zaharlidir Cag patogenlik oroli.[3]
Adabiyotlar
- ^ Xaker, J; Bender, L; Ott, M; Wingender, J; Lund, B; va boshq. (1990). "Fimbriyalar va gemolizinlar uchun kodlovchi xromosomal mintaqalarning o'chirilishi in vivo jonli ravishda va in vitro turli xil ichakdan tashqarida bo'lgan ichak tayoqchalari izolatlarida uchraydi". Mikrob. Patogg. 8 (3): 213–25. doi:10.1016 / 0882-4010 (90) 90048-U. PMID 1974320.
- ^ a b v d e f g h men j k l m n o Xaker, J; Kaper, JB (2000). "Patogenlik orollari va mikroblarning rivojlanishi". Annu Rev Microbiol. 54: 641–679. doi:10.1146 / annurev.micro.54.1.641. PMID 11018140.
- ^ a b v d e Xaker J.; Blum-Oler, G.; Muhldorfer, I .; Tschape, H. (1997). "Virusli bakteriyalarning patogen orollari: tuzilishi, funktsiyasi va mikrob evolyutsiyasiga ta'siri". Molekulyar mikrobiologiya. 23 (6): 1089–1097. doi:10.1046 / j.1365-2958.1997.3101672.x. PMID 9106201.
- ^ a b v d Groisman E (1996). "Patogenlik orollari: Kvant pog'onalarida bakteriyalar evolyutsiyasi". Hujayra. 87 (5): 791–794. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81985-6. PMID 8945505.
- ^ Kaper JB, Hacker J, nashr. 1999. Patogenlik orollari va boshqa mobil virusli elementlar. Vashington, DC: Am. Soc. Mikrobiol. 1-11.
- ^ Nakano M. va boshq. 2001 yil USP oqsilini kodlovchi uropatogen Escherichia coli patogenligi orolining tuzilishi va ketma-ketligi xilma-xilligi
- ^ Lindsay, JA; Ruzin, A; Ross, HF; Kurepina, N; Novick, RP (Iyul 1998). "Toksik shok toksinining genini Staphylococcus aureus tarkibidagi mobil patogenlik orollari oilasi olib boradi". Molekulyar mikrobiologiya. 29 (2): 527–43. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00947.x. PMID 9720870.