STAXI RNK motifi - STAXI RNA motif - Wikipedia
| STAXI RNK | |
|---|---|
 STAXI RNKlarining konsensusli ikkinchi tuzilishi | |
| Identifikatorlar | |
| Belgilar | STAXI |
| Rfam | RF01728 |
| Boshqa ma'lumotlar | |
| RNK turi | sRNK |
| Domen (lar) | Enterobakteriyalar |
| PDB tuzilmalar | PDBe |
The Ssbp, Topoisomerase, Antirestriction, XerDC Integrase RNK motifi (STAXI RNK motifi) saqlanib qolgan RNK yordamida aniqlangan tuzilishga o'xshash bioinformatika.[1] STAXI RNKlari yaqin joylashgan genlar kodlash oqsillar bilan o'zaro aloqada bo'lgan DNK (SSBP, topoizomeraza, XerDC integratsiya ) yoki bunday oqsillar bilan bog'liq (antirestriktsiya inhibe qiluvchi oqsillar cheklash fermentlari ). Ushbu kuzatuv STAXI motifining holatlari, ehtimol, DNKning bir qatorli molekulalari sifatida ishlash ehtimolini oshirdi. DNKning replikatsiyasi yoki DNKni tiklash. Boshqa tomondan, STAXI motiflarida ko'pincha barqaror UNCG ga mos keladigan terminallar mavjud tetraloop, ammo bu tetraloopning (TNCG) DNK versiyasi ayniqsa barqaror emas. STAXI motiflari oddiylardan iborat pseudoknot ikki yoki undan ortiq marta takrorlanadigan struktura (diagramaga qarang).
Xuddi shu ishda bir qator boshqa RNKlar aniqlandi, shu jumladan:
- Bakteroidales-1 RNK motifi
- Xlorobi-1 RNK motifi
- JUMPstart RNK motifi
- Laktis-plazmidli RNK motifi
- Okean-V RNK motifi
- potC RNK motifi
- psaA RNK motifi
- IkkiAYGGAY RNK motifi
- ykkC-yxkD rahbari
Adabiyotlar
- ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
Tashqi havolalar
 | Bu molekulyar yoki hujayra biologiyasi maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish. |