Kichik nukleolyar RNK SNORD17 - Small nucleolar RNA SNORD17

Kichik nukleolyar RNK SNORD17
RF00567.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SNORD17
Identifikatorlar
BelgilarSNORD17
Alt. BelgilarsnoHBI-43
RfamRF00567
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; C / D-quti
Domen (lar)Eukaryota
GOO'tish: 0006396 O'tish: 0005730
SOSO: 0000593
PDB tuzilmalarPDBe

SNORD17 (shuningdek, nomi bilan tanilgan HBI-43) a kodlamaydigan RNK (ncRNA) molekulasi, boshqalarning biogenezida (modifikatsiyasida) ishlaydi kichik yadroli RNKlar (snRNAlar). Ushbu modifikatsiya qiluvchi RNK nukleus snRNA biogenezining asosiy joyi bo'lgan ökaryotik hujayradan. Bu a nomi bilan tanilgan kichik nukleolyar RNK (snoRNA) va shuningdek, ko'pincha qo'llanma RNK deb nomlanadi.

HBI-43 ga tegishli C / D qutisi S box (UGAUGA) va D box (CUGA) deb nomlanuvchi konservalangan ketma-ketlik motiflarini o'z ichiga olgan snoRNAs sinfi. C / D oilaviy qutisi a'zolarining aksariyati saytga xos 2'-O- ni boshqarishda ishlaydi.metilatsiya substrat RNKlari.[1]

Ushbu snoRNA sichqonchaning HBI-43 inson orlogidir.[2] HBII-43 28s ning 2'O-ribozli metilatsiyasini boshqarishi taxmin qilinmoqda ribosomal RNK (rRNA) U3797 holatida.[3] Ushbu qoldiq (U3797), shuningdek, psevdouridilatlangan bo'lishi taxmin qilinmoqda ( siydik qoldiq konvertatsiya qilinadi pseudouridin ) tomonidan H / ACA qutisi snoRNA ACA48.[3]

Adabiyotlar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (oktyabr 2002). "Tozalangan quti C / D snoRNP'lar, maqsadli RNKni in vitro joyga xos 2'-O-metilatsiyasini ko'paytirishga qodir". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (iyun 2001). "RNomics: sichqonchada yangi, kichik, messenjer bo'lmagan RNKlarga 201 nomzodni aniqlaydigan eksperimental yondashuv". EMBO jurnali. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.
  3. ^ a b Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

Tashqi havolalar