Kichik nukleolyar RNK SNORD46 - Small nucleolar RNA SNORD46

Kichik nukleolyar RNK SNORD46
RF00218.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SNORD46 dan
Identifikatorlar
BelgilarSNORD46
Alt. BelgilarU40
RfamRF00218
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; C / D-quti
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000593
PDB tuzilmalarPDBe

snoRNA U46 (shuningdek, nomi bilan tanilgan SNORD46) a kodlamaydigan RNK (ncRNA) molekulasi, boshqasini modifikatsiyalashda ishlaydi kichik yadroli RNKlar (snRNAlar). Ushbu turdagi modifikatsiya qiluvchi RNK odatda nukleus snRNA biogenezining asosiy joyi bo'lgan ökaryotik hujayradan. Bu a nomi bilan tanilgan kichik nukleolyar RNK (snoRNA) va shuningdek, ko'pincha qo'llanma RNK deb nomlanadi.

snoRNA U46 ga tegishli C / D qutisi C box (UGAUGA) va D box (CUGA) deb nomlanuvchi konservalangan ketma-ketlik motiflarini o'z ichiga olgan snoRNAs klassi. C / D oilaviy qutisi a'zolarining aksariyati saytga xos 2'-O- ni boshqarishda ishlaydi.metilatsiya substrat RNKlari.[1]

U46 ning intron 2-da kodlangan ribosomal oqsil S8 geni odamda va 2'-O-riboza qoldiqlarini 28S metilatsiyasini boshqarishi uchun faraz qilingan ribosomal RNK (rRNK).[2][3] Ushbu snoRNA ning homologi Arabidopsis talianasi snoZ153 deb nomlanadi.[4] Ba'zi bir U40 sekanslari ketma-ketlik ma'lumotlar bazalarida (Genbank) U46 sifatida izohlangan.

Adabiyotlar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (oktyabr 2002). "Tozalangan quti C / D snoRNP'lar, maqsadli RNKni in vitro joyga xos 2'-O-metilatsiyasini ko'paytirishga qodir". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (iyul 1996). "Intron bilan kodlangan, antisensli kichik nukleolyar RNKlar: to'qqizta yangi turlarning tavsifi ularning to'g'ridan-to'g'ri rRNKlarning 2'-O-ribozli metilatsiyasi uchun qo'llanma sifatida ishtirok etishiga ishora qiladi". Molekulyar biologiya jurnali. 260 (2): 178–95. doi:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Chen CL, Liang D, Chjou X, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (may 2003). "O'simliklardagi snoRNAlarning xilma-xilligi: Oryza sativa dan 120 snoRNA genini aniqlash va qiyosiy o'rganish". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 31 (10): 2601–13. doi:10.1093 / nar / gkg373. PMC  156054. PMID  12736310.

Tashqi havolalar