Treponema - Treponema

Treponema
Treponema pallidum spiroxetlar
Ilmiy tasnif e
Domen:Bakteriyalar
Filum:Spirochaetes
Buyurtma:Spirochaetales
Oila:Spirochaetaceae
Tur:Treponema
Shoudin 1905 yuborish. Abt, Göker & Klenk 2013 yil
Turlar[1]
Sinonimlar
  • "Spironema" Villemin 1905 yil emas Klebs 1892 yil Leger va Gessen 1922 yil bo'lmaganlar Rafinesk 1838 ta emas Xoxst. 1842 yil Lindli emas 1840 yil Melek emas 1864 yil
  • "Mikrospironema" Stillar & Pfender 1905

Treponema - bu spiral shaklida bakteriyalar. Odam qo'zg'atuvchilarining asosiy treponem turlari Treponema pallidum kabi kasalliklarga javobgar bo'lgan pastki turlari sifiliz, bejel va yaws. Treponema karateum sababidir pinta.[2] Treponema paraluiscuniculi in sifilis bilan bog'liq quyonlar.[3] Treponema succinifaciens an'anaviy qishloq aholisi ichak mikrobiomida topilgan.[4]

Filogeniya

Filogeniya 16S rRNK asosidagi LTP chiqarilishiga asoslanadi 123 tomonidan "Hamma turdagi yashovchi daraxt" loyihasi.[5]

T. kaldarium (Pohlschroeder va boshq. 1995) Abt, Göker va Klenk 2013

T. stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker va Klenk 2013

T. izopterikolenlar Dröge va boshq. 2008 yil

T. azotonutricium Graber va boshq. 2004 yil

T. primitia Graber va boshq. 2004 yil

T. zuelzerae (sobiq Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 yildagi. Abt, Göker va Klenk 2013

T. o'rta

T. m. bovisEvans va boshq. 2006 yil

T. m. o'rtaUmemoto va boshq. 1997 yil

T. pedis Evans va boshq. 2009 yil

T. dentikola (sobiq Flügge 1886) Chan va boshq. 1993 yil

T. putidum Wyss va boshq. 2004 yil

T. lesitinolyticum Wyss va boshq. 1999 yil

T. maltofilum Wyss va boshq. 1996 yil

T. brennaborense Schrank va boshq. 1999 yil

T. saccharophilum Paster va Canale-Parola 1986 yil

T. berlinense Nordxof va boshq. 2005 yil

T. pektinovorum Smibert va Burmeister 1983 yil

T. bryantii Stanton va Kanale-Parola 1980 yil

T. porcinum Nordxof va boshq. 2005 yil

T. succinifaciens Cwyk va Canale-Parola 1981 yil

T. parvum Wyss va boshq. 2001 yil

T. amylovorum Wyss va boshq. 1997 yil

T. socranskii

T. s. paredis Smibert va boshq. 1984 yil

T. s. bukkal Smibert va boshq. 1984 yil

T. s. socranskii Smibert va boshq. 1984 yil

Taksonomiya

Hozirda qabul qilingan taksonomiya quyidagilarga asoslangan Nomenklaturada turgan prokaryotik ismlarning ro'yxati (LPSN)[6] va Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI).[7]

Izohlar:
♦ yo'qolgan yoki mavjud bo'lmagan turdagi shtamm
. Shtammlari Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI), lekin ro'yxatda yo'q Nomenklaturada turgan prokaryotik ismlarning ro'yxati (LSPN)
♥ Joylashmagan shtammlar Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) yoki Nomenklaturada turgan prokaryotik ismlarning ro'yxati (LPSN)

Turlar Treponema hyodysenteriae va Treponema aybsiz deb qayta tasniflangan Serpulina hyodysenteriae va Serpulina aybsiz.[8]

Adabiyotlar

  1. ^ "Treponema" (HTML). NCBI taksonomiyasi. Bethesda, MD: Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 27 fevral 2019.
  2. ^ Antal GM, Lukehart SA, Meheus AZ (2002 yil yanvar). "Endemik treponematozlar". Mikroblarni yuqtirish. 4 (1): 83–94. doi:10.1016 / S1286-4579 (01) 01513-1. PMID  11825779.
  3. ^ Harper KN, Liu H, Ocampo PS va boshqalar. (2008 yil avgust). "Kislota bilan takrorlanadigan oqsil (arp) genining ketma-ketligi jinsiy va noreal bo'lmaganlarni farq qiladi Treponema pallidum subspecies va gen sifilizni keltirib chiqaradigan pastki turlarida kuchli ijobiy selektsiya ostida rivojlangan ". FEMS Immunol. Med. Mikrobiol. 53 (3): 322–32. doi:10.1111 / j.1574-695X.2008.00427.x. PMID  18554302. Arxivlandi asl nusxasi 2013-01-05 da.
  4. ^ Angelakis E, Bachar D, Yasir M, Musso D, Djossou F, Gaborit B va boshq. (2019 yil yanvar). "Treponema turlari an'anaviy qishloq aholisining ichak mikrobiotasini boyitadi, lekin shahar aholisida yo'q".. Yangi mikroblar va yangi infektsiyalar. 27: 14–21. doi:10.1016 / j.nmni.2018.10.009. PMC  6276622. PMID  30555706.
  5. ^ "Hamma turdagi yashovchi daraxt" loyihasi."16S rRNA asosidagi LTP versiyasi 123 (to'liq daraxt)" (PDF). Silva Ribozomal RNK bo'yicha ma'lumotlar bazasi. Olingan 2013-03-20.
  6. ^ J.P.Euzéby. "Treponema". Nomenklaturada turgan prokaryotik ismlarning ro'yxati (LPSN). Olingan 2016-03-20.
  7. ^ Sayers; va boshq. "Treponema". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) taksonomiya ma'lumotlar bazasi. Olingan 2016-03-20.
  8. ^ Stanton TB, Jensen NS, Keysi TA, Tordoff LA, Dewhirst FE, Paster BJ (yanvar 1991). "Treponema hyodysenteriae ning qayta tasnifi va Treponema aybsiz yangi turda, Serpula gen. nov., Serpula hyodysenteriae tarağı sifatida. nov va Serpula taroqni zararsizlantiradi. nov ". Int. J. Syst. Bakteriol. 41 (1): 50–8. doi:10.1099/00207713-41-1-50. PMID  1704792.