Tubby oqsili - Tubby protein

Tubby protein
Tubby-1c8z-pymol.png
Sichqoncha miyasida ifodalangan tubub oqsili
Identifikatorlar
BelgilarTub
PfamPF01167
InterProIPR000007
PROSITEPDOC00923
SCOP21c8z / QOIDA / SUPFAM
OPM superfamily104
OPM oqsili1i7e

The tubby oqsili tomonidan kodlangan TUB gen. Bu oqim oqimidir hujayra signalizatsiyasi oqsil ko'p hujayrali uchun umumiy eukaryotlar. Birinchi tubby geni aniqlandi sichqonlar va ular tarkibidagi oqsillar gomologik to tubby "tubbiga o'xshash oqsillar" (TULP) deb nomlanadi. Ular umumiy va xarakterli xususiyatlarga ega uchinchi darajali tuzilish a dan iborat beta barrel atrofida qadoqlangan alfa spirali markaziy teshikda. Gen o'z nomini metabolizmdagi rolidan kelib chiqadi; mutbiya qilingan tubbi geni bo'lgan sichqonlar kech boshlanishini rivojlantiradi semirish, sensorli eshitish qobiliyatini yo'qotish va retinaning degeneratsiyasi.[1][2][3]

Tuzilishi

Tubby oqsillari quyidagicha tasniflanadi a + b oqsillar va 12-beta yopiq markaziy alfa spirali atrofidagi bochka. Tubby oqsillari kichkintoyni bog'lashi mumkin hujayra signalizatsiyasi molekula fosfatidilinozitol, odatda uchun mahalliylashtirilgan hujayra membranasi. Tubbiga o'xshash strukturaviy katlama oqsillar singari aniqlangan Scramblase oqsillar oilasi.[4]

Funktsiya

Tubby oqsillari quyidagicha taalluqlidir transkripsiya omillari[5] va potentsial signalizatsiya omillari bilan birgalikda G-oqsil faoliyat.[6] Ular bilan bog'liq neyronal farqlash va rivojlanish va sutemizuvchilar qachon uchta kasallik jarayoniga aloqador mutatsiyaga uchragan: semirish, setchatka degeneratsiya va eshitish qobiliyatini yo'qotish.[5] Sichqonlarda tubb oqsillaridagi mutatsiyalar ta'sir qilishi ma'lum hayot davomiyligi va yog ' saqlash[7] shu qatorda; shu bilan birga uglevod metabolizm.[8] Tubby domenlari sitoplazmatik tomoni bilan bog'lanadi hujayra membranalari boshqasini bog'lash orqali fosfoinozitidlar[9]

Ushbu domenni o'z ichiga olgan inson oqsillari

TUB; TULP1; TULP2; TULP3; TULP4;

Tashqi havolalar

Adabiyotlar

  1. ^ Noben-Trauth, K .; Naggert, J. K .; Shimoliy, M. A .; Nishina, P. M. (1996). "Sichqonning mutatsion tubbi uchun nomzod geni". Tabiat. 380 (6574): 534–538. Bibcode:1996 yil Natur.380..534N. doi:10.1038 / 380534a0. PMID  8606774. S2CID  4272027.
  2. ^ Kleyn, P. V.; Fan, V.; Kovats, S. G.; Li, J. J .; Pulido, J. C .; Vu Y.; Berkemeier, L. R .; Misumi, D. J .; Holmgren, L .; Charlat, O .; Vulf, E. A .; Tayber, O .; Brodi, T .; Shu, P .; Xokins, F.; Kennedi, B .; Baldini, L .; Ebeling, C .; Alperin, G. D .; Amallar, J .; Lakey, N. D .; Kalpepper, J.; Chen, X .; Glücksmann-Kuis, M. A .; Karlson, G. A .; Dyuk, G. M .; Mur, K. J. (1996). "Sichqoncha semirish gen tubbini aniqlash va tavsifi: yangi genlar oilasining a'zosi". Hujayra. 85 (2): 281–290. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID  8612280. S2CID  15670925.
  3. ^ Ohlemiller, KK; Xyuz, RM; Mozinger-Ogilvi, J; Speck, JD; Grosof, DH; Silverman, MS (1995). "Tubby sichqonchasida koklear va retinaning degeneratsiyasi". NeuroReport. 6 (6): 845–9. doi:10.1097/00001756-199504190-00005. PMID  7612867. S2CID  8311280.
  4. ^ Bateman A, Finn RD, Sims PJ, Vidmer T, Biegert A, Söding J (yanvar 2009). "Fosfolipidli skrambrazalar va Tubbiga o'xshash oqsillar membrananing bog'langan transkripsiyasi omillarining yangi superfamilasiga tegishli". Bioinformatika. 25 (2): 159–62. doi:10.1093 / bioinformatics / btn595. PMC  2639001. PMID  19010806.
  5. ^ a b Boggon, TJ; Shan, WS; Santagata, S; Myers, SC; Shapiro, L (1999). "Tubbi oqsillarini strukturaga asoslangan funktsional tahlil orqali transkripsiya omillari sifatida ta'siri" Ilm-fan. 286 (5447): 2119–25. doi:10.1126 / science.286.5447.2119. PMID  10591637.
  6. ^ Kerol, K; Gomes, C; Shapiro, L (2004). "Tubby oqsillari: fitna qalinlashadi". Nat Rev Mol Hujayra Biol. 5 (1): 55–63. doi:10.1038 / nrm1278. PMID  14708010. S2CID  7065010.
  7. ^ Mukhopadhyay, A; Deplanke, B; Walhout, AJ; Tissenbaum, XA (2005). "C. elegans tubby ikki mustaqil mexanizm yordamida hayot davomiyligi va yog'ni saqlashni tartibga soladi". Hujayra Metab. 2 (1): 35–42. doi:10.1016 / j.cmet.2005.06.004. PMID  16054097.
  8. ^ Vang, Y; Seburn, K; Bechtel, L; Li, BY; Szatkievich, JP; Nishina, Bosh vazir; Naggert, JK (2006). "Tubbiya mutatsiyasi uchun homozigotli sichqonlarda uglevod almashinuvi nuqsoni". Fiziol genomikasi. 27 (2): 131–40. doi:10.1152 / fiziolgenomika.00239.2005. PMID  16849632.
  9. ^ Cho, W. va Stahelin, R.V. (Iyun 2005). "Hujayra signalizatsiyasi va membranalar savdosidagi membrana-oqsillarning o'zaro ta'siri". Biofizika va biomolekulyar tuzilishni yillik sharhi. 34: 119–151. doi:10.1146 / annurev.biophys.33.110502.133337. PMID  15869386.