ELF1 - ELF1

ELF1

Identifikatorlar

ELF1, E74 kabi ETS transkripsiyasi omil 1, EFTUD1, RIA1

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 189973 MGI: 107180 HomoloGene: 7303 Generkartalar: ELF1

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 13 (odam)^[1]

Band	13q14.11	Boshlang	40,931,924 bp^[1]
Band	13q14.11	Oxiri	41,061,440 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 14 (sichqoncha)^[2]

Band	14 \| 14 D3	Boshlang	79,481,194 bp^[2]
Band	14 \| 14 D3	Oxiri	79,582,494 bp^[2]

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi • GO: 0000980 RNK polimeraza II sis-regulyatsion mintaqa ketma-ketligiga xos DNKni bog'lash • DNK bilan bog'lanish • ketma-ketlikka xos DNK bilan bog'lanish • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNK bilan bog'langan transkripsiya faollashtiruvchisi faoliyati, RNK polimeraza II ga xos • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi, RNK polimeraza II ga xos
Uyali komponent	• hujayra yadrosi • nukleoplazma
Biologik jarayon	• sitokin ishlab chiqarishni tartibga solish • transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari • hujayralarni differentsiatsiyasi • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari • transkripsiya, DNK-andozali • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi • T xujayrasi retseptorlari signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiya • sitokin vositachiligidagi signalizatsiya yo'lini tartibga solish • B hujayra retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani tartibga solish
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


1997


13709


ENSG00000120690


ENSMUSG00000036461


P32519


Q60775

RefSeq (mRNA)

NM_001145353 NM_172373 NM_001370329 NM_001370330 NM_001370331
NM_001370332


NM_001286411 NM_001286412 NM_007920

RefSeq (oqsil)

NP_001138825 NP_758961 NP_001357258 NP_001357259 NP_001357260
NP_001357261


NP_001273340 NP_001273341 NP_031946

Joylashuv (UCSC)

Chr 13: 40.93 - 41.06 Mb

Chr 14: 79.48 - 79.58 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

E74 o'xshash omil 1 (domen transkripsiyasi omili) a oqsil odamlarda ELF1 tomonidan kodlanganligi gen.^[5]

Funktsiya

Ushbu gen E26 transformatsiyasiga tegishli kodlashni kodlaydi transkripsiya omili. Kodlangan oqsil birinchi navbatda limfoid hujayralarida ifodalanadi va turli genlarning transkripsiyasini tartibga soluvchi ham kuchaytiruvchi, ham repressor vazifasini o'tashi mumkin. Shu bilan bir qatorda qo'shilish bir nechta transkript variantlariga olib keladi.^[5]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000120690 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000036461 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b "Entrez Gen: E74 o'xshash omil 1 (domen transkripsiyasi omili)".

Qo'shimcha o'qish

Xiang P, Lo C, Argiropulos B, Lay CB, Rouhi A, Imren S, Jiang X, Mager D, Humphries RK (sentyabr 2010). "MEX1 Hox kofaktorining transkripsiya regulyatori sifatida E74 o'xshash omil 1 (ELF1) ni aniqlash". Eksperimental gematologiya. 38 (9): 798-8, 808.e1-2. doi:10.1016 / j.exphem.2010.06.006. PMC 3887005. PMID 20600580.
Juang YT, Solomou EE, Rellahan B, Tsokos GC (Mar 2002). "Elf-1ning fosforillanishi va O bilan bog'langan glikosilatsiyasi uning yadroga translokatsiyasiga va TCR zeta zanjiri promotoriga bog'lanishiga olib keladi". Immunologiya jurnali. 168 (6): 2865–71. doi:10.4049 / jimmunol.168.6.2865. PMID 11884456.
Mao S, Frank RC, Zhang J, Miyazaki Y, Nimer SD (may 1999). "AML1 oqsillari va ETS oqsillari o'rtasidagi funktsional va jismoniy o'zaro ta'sirlar, MEF: t (8; 21) ijobiy leykemiya patogeneziga ta'siri". Molekulyar va uyali biologiya. 19 (5): 3635–44. doi:10.1128 / mcb.19.5.3635. PMC 84165. PMID 10207087.
Nishiyama C, Takahashi K, Nishiyama M, Okumura K, Ra C, Ohtake Y, Yokota T (Dekabr 2000). "Elf-1 sichqonchani transkripsiya-molekulyar klonlashda uning regulyatsion funktsiyasiga ta'sir qiluvchi transkripsiya faktori Elf-1 ning izoformalari". Bioscience, biotexnologiya va biokimyo. 64 (12): 2601–7. doi:10.1271 / bbb.64.2601. PMID 11210123.
Tompson CB, Vang CY, Ho IC, Bohjanen PR, Petryniak B, iyun CH, Miesfeldt S, Zhang L, Nabel GJ, Karpinski B (Mar 1992). "interlökin-2 kuchaytiruvchisi funktsiyasi uchun zarur bo'lgan cis ta'sir ko'rsatadigan ketma-ketliklar Ets bilan bog'liq bo'lgan yangi Elf-1 oqsilini bog'laydi". Molekulyar va uyali biologiya. 12 (3): 1043–53. doi:10.1128 / mcb.12.3.1043. PMC 369536. PMID 1545787.
Tsokos GC, Nambiar MP, Juang YT (2003 yil aprel). "Ets transkripsiyasi omilini faollashtirish Elf-1 fosforillanish va glikozilatsiyani talab qiladi: faollashtirilgan Elf-1 ning nuqsonli ekspressioni tizimli eritematoz bilan kasallangan bemorlarda TCR zeta zanjiri gen ekspressionining pasayishiga olib keladi". Nyu-York Fanlar akademiyasining yilnomalari. 987: 240–5. doi:10.1111 / j.1749-6632.2003.tb06054.x. PMID 12727645.
Gunther M, Laithier M, Brison O (Iyul 2000). "Ikki gibrid skriningda aniqlangan transkripsiya faktori Sp1 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillar to'plami". Molekulyar va uyali biokimyo. 210 (1–2): 131–42. doi:10.1023 / A: 1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642.
Yang V, Tang X, Chjan Y, Tang X, Chjan J, Sun L va boshq. (Jan 2013). "Meta-tahlildan so'ng replikatsiya CDKN1B, TET3, CD80, DRAM1 va ARID5B-dagi yoki ularning atrofidagi joylarni osiyoliklarda tizimli eritematoz bilan bog'liqligini aniqlaydi". Amerika inson genetikasi jurnali. 92 (1): 41–51. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.11.018. PMC 3542470. PMID 23273568.
Bassuk AG, Anandappa RT, Leyden JM (1997 yil may). "Ets va NF-kappaB / NFAT oqsillari o'rtasidagi jismoniy o'zaro ta'sirlar ularning T hujayralarida inson immunitet tanqisligi virusini kuchaytiruvchisini kooperativ faollashtirishida muhim rol o'ynaydi". Virusologiya jurnali. 71 (5): 3563–73. doi:10.1128 / JVI.71.5.3563-3573.1997. PMC 191503. PMID 9094628.

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.

Transkripsiya omillari va hujayra ichidagi retseptorlari

(1) asosiy domenlar

(1.1) Asosiy leucine fermuar (bZIP )

Transkripsiya omilini faollashtirish
- AATF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
AP-1
- c-Fos
- FOSB
- FOSL1
- FOSL2
- JDP2
- c-iyun
- JUNB
- JunD
BACH
- 1
- 2
BATF
BLZF1
C / EBP
- a
- β
- γ
- δ
- ε
- ζ
CREB
- 1
- 3
- L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
- B
- F
- G
- K
NFE
- 2
- L1
- L2
- L3
NFIL3
NRL
NRF
- 1
- 2
- 3
XBP1

(1.2) Asosiy spiral-halqa-spiral (bHLH )

A guruhi	ASC ASCL1 ASCL2 ATOH1 QO'L 1 2 MESP2 Myogenik tartibga soluvchi omillar MyoD Myogenin MYF5 MYF6 NeuroD 1 2 Neyrogeninlar 1 2 3 OLIG 1 2 Paraksis TCF15 Skleraksis SLC LYL1 TAL 1 2 Twist
B guruhi	FIGLA Myc c-Myc l-Myc n-Myc MXD4 TCF4
C guruhi bHLH-PAS	AhR AHRR ARNT ARNTL ARNTL2 SAAT HIF 1A EPAS1 3A NPAS 1 2 3 SIM karta 1 2
D guruhi	BHLH 2 3 9 Pho4 ID 1 2 3 4
E guruhi	GES 1 2 3 4 5 6 7 HEY 1 2 L
F guruhi bHLH-COE	EBF1

(1.3) bHLH-ZIP

(1.4) NF-1

NFI
- A
- B
- C
- X
SMAD
- R-SMAD
  - 1
  - 2
  - 3
  - 5
  - 9
- I-SMAD
  - 6
  - 7
- 4 )

(1.5) RF-X

RFX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- ANK

(1.6) Asosiy spiral-span-spiral (bHSH)

AP-2
- a
- β
- γ
- δ
- ε

(2) Sink barmog'i DNK bilan bog'laydigan domenlar

(2.1) Yadro retseptorlari (Cys.)₄)

1-oila	Qalqonsimon bez gormoni a β MOSHINA FXR LXR a β PPAR a β / δ γ PXR RAR a β γ ROR a β γ Rev-ErbA a β VDR
2. kichik oila	COUP-TF (Men II Quloq-2 HNF4 a γ PNR RXR a β γ Moyak retseptorlari 2 4 TLX
3. kichik oila	Steroid gormoni Androgen Estrogen a β Glyukokortikoid Mineralokortikoid Progesteron Estrogen bilan bog'liq a β γ
4. kichik oila	NUR NGFIB NOR1 NURR1
5. kichik oila	LRH-1 SF1
6. kichik oila	GCNF
0	DAX1 SHP

(2.2) Boshqa dasturlar₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂Uning₂

Umumiy transkripsiya omillari
- TFIIA
- TFIIB
- TFIID
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
- 1
- 2
  - TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 6
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI-Kryppel oila
- 1
- 2
- 3
- Dam olish
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
sink barmog'i
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655
- 804A

(2.4) Cys₆

HIVEP1

(2.5) O'zgaruvchan kompozitsiya

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 4
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Spiral-burilish-spiral domenlar

(3.1) Homeodomain

protoHOX	ParaHox Gsx 1 2 Xlox PDX1 CDx 1 2 4 kengaytirilgan Hox: Evx1 Evx2 MEOX1 MEOX2 Uy qutisi A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 GBX1 GBX2 MNX1
metaHOX	BARHL1 BARHL2 BARX1 BARX2 BSX JB 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 HHEX HLX LBX1 LBX2 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 HMX1 HMX2 HMX3 6-1 6-2 NATO TLX1 TLX2 TLX3 VAX1 VAX2
boshqa	ARX CRX CUTL1 FHL 1 2 3 HESX1 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B NOBOX Ertak MEIS 1 2 ATB 1 2 3 PKNOX 1 2 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU domeni PIT-1 BRN-3: A B C Oktamer transkripsiyasi omili: 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 SATB2 SHOX2 Olti 1 2 3 4 5 ZEB 1 2

(3.2) bog'langan quti

PAX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
PRRX
- 1
- 2
RAX

(3.3) Vilka boshi / qanotli spiral

E2F
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
FOX oqsillari
- A1
- A2
- A3
- C1
- C2
- D3
- D4
- E1
- E3
- F1
- G1
- H1
- I1
- J1
- J2
- K1
- K2
- L2
- M1
- N1
- N3
- O1
- O3
- O4
- P1
- P2
- P3
- P4

(3.4) Issiqlik zarbasi omillari

HSF
- 1
- 2
- 4

(3.5) Triptofan klasterlari

ELF
- 2
- 4
- 5
EGF
ELK
- 1
- 3
- 4
ERF
ETS
- 1
- 2
- ERG
- SPIB
ETV
- 1
- 4
- 5
- 6
FLI1
Interferonni tartibga solish omillari
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
MYB
MYBL2

(3.6) TEA domeni

transkripsiya kuchaytiruvchi omil
- 1
- 2
- 3
- 4

(4) minor-kichik truba kontaktlari bilan iskala omillari

(4.1) Rel homologiyasi mintaqasi	NF-DB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT 1 2 3 4 5 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS qutisi	Mef2 A B C D. SRF
(4.6) TATA bilan bog'lovchi oqsillar	TBP TBPL1
(4.7) Yuqori harakatchanlik guruhi	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B SOX 1 2 3 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14 15 18 21 SRY SSRP1 TCF / LEF TCF 1 3 4 LEF1 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Sovuq zarba beruvchi domen	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Boshqa transkripsiya omillari

(0,2) HMGI (Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Cho'ntak domeni	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP-2/EREBPbog'liq omillar	Apetala 2 EREBP B3
(0,6) Turli xil	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Rho /Sigma

Shuningdek qarang transkripsiya faktori / yadro regulyatori kamchiliklari

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 13 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.