GMP sintazasi - GMP synthase - Wikipedia

GMP sintetazasi
(glutamin-gidrolizlash)
2vxo.jpg
GMP sintetazasi, inson
Identifikatorlar
EC raqami6.3.5.2
CAS raqami37318-71-1
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Gen ontologiyasiAmiGO / QuickGO
GMP sintetaza C terminal domeni
PDB 1gpm EBI.jpg
amcher va pirofosfat bilan komplekslangan escherichia coli gmp sintetaza.[1]
Identifikatorlar
BelgilarGMP_synt_C
PfamPF00958
InterProIPR001674
PROSITEPDOC00405
SCOP21 gigabayt / QOIDA / SUPFAM
GMPS
Protein GMPS PDB 2VPI.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarGMPS, GMP sintaz, guanin monofosfat sintaz, GATD7, GMP sintaz
Tashqi identifikatorlarOMIM: 600358 MGI: 2448526 HomoloGene: 68367 Generkartalar: GMPS
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 3 (odam)
Chr.Xromosoma 3 (odam)[2]
Xromosoma 3 (odam)
GMPS uchun genomik joylashuv
GMPS uchun genomik joylashuv
Band3q25.31Boshlang155,870,650 bp[2]
Oxiri155,944,020 bp[2]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE GMPS 214431 da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

8833

229363

Ansambl

ENSG00000163655

ENSMUSG00000027823

UniProt

P49915

Q3THK7

RefSeq (mRNA)

NM_003875

NM_001033300

RefSeq (oqsil)

NP_003866

NP_001028472

Joylashuv (UCSC)Chr 3: 155.87 - 155.94 MbChr 3: 63.98 - 64.02 Mb
PubMed qidirmoq[4][5]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Guanozin monofosfat sintetaza, (EC 6.3.5.2) sifatida ham tanilgan GMPS bu ferment o'zgartiradi ksantosin monofosfat ga guanozin monofosfat.[6]

Purein nukleotidlarining de novo sintezida IMP bu shoxli metabolit bo'lib, u erda yo'l guanin yoki adenin nukleotidlarining sinteziga qarab ajralib chiqadi. Guanin nukleotid yo'lida IMPni GMP ga aylantirishda ishtirok etadigan 2 ta ferment, ya'ni IMPning XMP ga oksidlanishini katalizlovchi IMP dehidrogenaza (IMPD1) va XMP ning aminatsiyasini GMP ga katalizlovchi GMP sintetaz mavjud.[6]

Enzimologiya

Yilda enzimologiya, a GMP sintetaz (glutamin-gidroliz) (EC 6.3.5.2 ) an ferment bu kataliz qiladi The kimyoviy reaktsiya

ATP + ksantozin 5'-fosfat + L-glutamin + H2O AMP + difosfat + GMP + L-glutamat

4 substratlar bu fermentlar ATP, ksantosin 5'-fosfat, L-glutamin va H2O, ammo uning 4 mahsulotlar bor AMP, difosfat, GMP va L-glutamat.

Ushbu ferment. Oilasiga tegishli ligazlar uglerod-azotli ligazlarni glutamin bilan amido-N-donor sifatida bog'laydiganlar. The sistematik ism bu fermentlar sinfiga kiradi ksantosin-5'-fosfat:L-glutamin amido-ligaza (AMP hosil qiluvchi). Umumiy foydalanishdagi boshqa nomlarga quyidagilar kiradi GMP sintetaz (glutamin-gidroliz), guanilat sintetaza (glutamin-gidroliz), guanozin monofosfat sintetaza (glutamin-gidroliz), ksantosin 5'-fosfat amidotransferazava guanozin 5'-monofosfat sintetaza. Ushbu ferment ishtirok etadi purin metabolizmi va glutamat metabolizmi. Kamida bitta birikma, Psikofuranin uchun ma'lum ushbu fermentni inhibe qiling.

Strukturaviy tadqiqotlar

2007 yil oxiriga kelib, 5 tuzilmalar bilan, bu fermentlar sinfi uchun hal qilingan PDB qo'shilish kodlari 1GPM, 1WL8, 2A9V, 2D7J va 2DPL.

Adabiyotlar

  1. ^ Tesmer JJ, Klem TJ, Deras ML, Devisson VJ, Smit JL (yanvar 1996). "GMP sintetazaning kristalli tuzilishi yangi katalitik uchlikni ochib beradi va ikkita ferment oilasi uchun strukturaviy paradigma hisoblanadi". Tabiatning strukturaviy biologiyasi. 3 (1): 74–86. doi:10.1038 / nsb0196-74. PMID  8548458. S2CID  30864133.
  2. ^ a b v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000163655 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027823 - Ansambl, 2017 yil may
  4. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  6. ^ a b "Entrez Gen: GMPS guanin monfosfat sintetaza".

Qo'shimcha o'qish

  • Sahifa T, Bakay B, Nyhan WL (1984). "Inson GMP sintetazasi". Xalqaro biokimyo jurnali. 16 (1): 117–20. doi:10.1016 / 0020-711X (84) 90061-2. PMID  6698284.
  • Nakamura J, Straub K, Vu J, Lou L (oktyabr 1995). "Inson GMP sintetazasining glutamin gidroliz funktsiyasi. Sisteinning muhim faol joyini aniqlash". Biologik kimyo jurnali. 270 (40): 23450–5. doi:10.1074 / jbc.270.40.23450. PMID  7559506.
  • Nakamura J, Lou L (1995 yil mart). "Inson GMP sintetazasining biokimyoviy tavsifi". Biologik kimyo jurnali. 270 (13): 7347–53. doi:10.1074 / jbc.270.13.7347. PMID  7706277.
  • Xirst M, Xelidey E, Nakamura J, Lou L (sentyabr 1994). "Inson GMP sintetazasi. Proteinlarni tozalash, klonlash va cDNA ning funktsional ifodasi". Biologik kimyo jurnali. 269 (38): 23830–7. PMID  8089153.
  • Maruyama K, Sugano S (1994 yil yanvar). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Fedorova L, Kost-Alimova M, Gizatullin RZ, Alimov A, Zabarovska VI, Szeles A va boshq. (1997). "Ekspluatatsiya qilingan genlarni o'z ichiga olgan, guanosin 5'-monofosfat sintetaza genini odam xromosomasi 3 ga bog'laydigan yigirma uchta NotI-bog'lovchi noyob klonlarni tayinlash va buyurtma qilish". Evropa inson genetikasi jurnali. 5 (2): 110–6. doi:10.1159/000484744. PMID  9195163.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997 yil oktyabr). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Pegram LD, Megonigal MD, Lange BJ, Nowell PC, Rowley JD, Rappaport EF, Feliks CA (Dekabr 2000). "davolash bilan bog'liq o'tkir miyeloid leykemiyada t (3; 11) translokatsiya MLLni GMPS (GUANOSINE 5 'MONOFOSFAT SYNTHETASE) geni bilan birlashtiradi". Qon. 96 (13): 4360–2. doi:10.1182 / qon.V96.13.4360. PMID  11110714.
  • Guo D, Xan J, Adam BL, Kolbern NH, Vang MH, Dong Z va boshq. (2005 yil dekabr). "HEK293 hujayralaridagi sarum ochligidan kelib chiqqan stress ostida SUMO4 substratlarini proteomik tahlil qilish". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 337 (4): 1308–18. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
  • Abrams R, Bentli M (1959). "Nuklein kislota purinlarining biosintezi. III. Ksantosin 5'-fosfat va L-glutamindan guanosin 5'-fosfat hosil bo'lishi". Arch. Biokimyo. Biofiz. 79: 91–110. doi:10.1016/0003-9861(59)90383-2.
  • Lagerkvist U (1958 yil iyul). "Guanozin 5'-fosfatning biosintezi. II. Ksantosin 5'-fosfatning kaptar jigaridan tozalangan ferment bilan aminatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 233 (1): 143–9. PMID  13563458.

Tashqi havolalar