Genom tadqiqotlari bo'yicha nemis resurs markazi - German Resource Center for Genome Research

Genom tadqiqotlari bo'yicha nemis resurs markazi
xizmat ko'rsatish markazi
Bosh ofisBerlin-Sharlottenburg
Geydelberg
Xizmat ko'rsatiladigan maydon
Germaniya
London
Xizmatlar
  • genomik hujayra klonlari va cDNA ma'lumotlar bazalari
  • hujayra madaniyati
  • mikroarraylar
  • ifoda profillari
  • affymetrix xizmatlari
  • PCR takliflari

The Genom tadqiqotlari bo'yicha nemis resurs markazi (RZPD, Resourcenzentrum Primardatenbank) xizmat ko'rsatish markazi bo'lgan gen va genom tadqiqot Berlin -Sharlottenburg va Geydelberg.

Tarix

1987 yilda Xans Lexrax va Gyunter Zehetner asos solgan Ma'lumotnoma kutubxonasi / asosiy ma'lumotlar bazasi (RLDB) da Imperial saraton tadqiqotlari fondi (ICRF) London.[1] RLDB tarqatildi makroarraysalar ICRFda dunyo bo'ylab tadqiqot guruhlari uchun yaratilgan. Makro-massivlar quyidagilardan iborat edi klonlar ning genomik va cDNA kutubxonalar ICRF da Zehetner tomonidan ishlab chiqilgan robotlar yordamida 22 × 22 sm neylon filtrlarga o'tkazildi. Standartlashtirilgan materiallar bilan o'tkazilgan eksperimental natijalar tadqiqotlar natijalari to'g'risida xabar berildi va yig'ildi Birlamchi ma'lumotlar bazasi.[2]

Spotting
bosh>
(Z o'qi)
^ Makroarray
filtr
^ Mikro titr
plastinka
Bosh
sterilizatsiya qilish
hammom v
quritish
mat v
kompyuter
monitor
ICRF-da ishlab chiqarilgan spotting robotining dastlabki versiyasi makroarray klonlardan filtrlangan membranalar mikrotiter plitalari.

1995 yil boshida RLDB Berlinga ko'chib o'tdi Maks Plank molekulyar genetika instituti, u erda o'z ishini davom ettirdi.[3]

1995 yil yozida Germaniya tarkibida Resurs markazi tashkil etildi Inson genomining loyihasi (DHGP) Hans Lehrach (Maks Plank Molekulyar Genetika Instituti (MPIMG)), Berlin-Dahlem ), Gyunter Zehetner (MPIMG, 2000 yil iyulgacha Berlin Resurs Markazining ilmiy direktori) va Annemarie Poustka (Germaniyaning saraton kasalligini o'rganish markazi (DKFZ), Heidelberg). Sifatida Resurs markazi / Birlamchi ma'lumotlar bazasi (RZPD) RLDB ishini o'z zimmasiga oldi. U tomonidan moliyalashtirildi Federal ta'lim va tadqiqot vazirligi (BMBF) DHGP a'zolariga materiallarni bepul taqdim etish maqsadida, boshqa tadqiqotchilar uchun esa mukofot puli bilan ta'minlandi. RZPD eng katta bo'ldi ma'lumotlar bazasi butun dunyo bo'ylab genetik klonlar uchun va ko'plab milliy va xalqaro gen va genom tadqiqot loyihalari bilan bog'liq edi.

Kutubxona klonlari bilan muzlatilgan mikrotiter plitalari

RZPD Evropadagi ikkita distribyutorlardan biri edi CDNA klonlarini IMAGE va o'z-o'zidan qurilgan plazmid, kosmid, YAC va cDNA kutubxonalar. Har bir klon 96 yoki 384 quduq qudug'ida saqlangan mikrotitr plitasi, ularni aniqlash uchun ishlatilmaganda -80 ° C darajadagi chuqur muzlatgichlarda saqlandi.

2000 yil 1-iyulda RZPD a ga aylantirildi Notijorat -Gesellschaft mit beschränkter Haftung (gGmbH). Bu mas'uliyati cheklangan kompaniya Germaniyaning uchta eng muhim tadqiqot kompaniyalari tomonidan qo'llab-quvvatlandi: Maks Plank jamiyati, Germaniyaning saraton kasalligini o'rganish markazi va Maks Delbruk molekulyar tibbiyot markazi (MDC Berlin-Buch ). Ilmiy kompaniya a'zolari sifatida Xans Lehrax (MPIMG), Annemarie Poustka (DKFZ), Jens Reyx (MDC) Mattias Uhlen (Karolinska instituti, Stokgolm ) va Xarald zur Xauzen (DKFZ).

2007 yil 31 iyulda notijorat kompaniya tugatildi. Mavjud xizmatlarning katta qismini ikkita yangi kompaniya o'z zimmasiga oldi. ImaGenes (RZPD-ning sobiq boshqaruvchi direktorlari tomonidan boshlangan kompaniya) va ATLAS Biolabs GmbHLehrach tomonidan RZPDning sobiq bo'lim boshliqlari Uve Radelof und Bernd Drescher bilan birgalikda tashkil etilgan.[4]

Xizmatlar

Berlinda neo-barokko instituti binosi

Xizmat doirasi doimiy ravishda kengayib bordi va genomik hujayralar klonlari va cDNA ma'lumotlar bazalarini taqdim etishni o'z ichiga oldi, hujayra madaniyati, mikroarraylar, ifoda profillar, Affimetriya xizmatlar va PCR takliflar. Da to'plangan ma'lumotlar Birlamchi ma'lumotlar bazasi markaz tomonidan taqdim etilgan global standartlashtirilgan materialdan foydalangan holda tadqiqotlar natijasida eksperimental natijalarni taqqoslash uchun imkoniyat yaratildi.[5]

Joylar

Qirollik jarrohlar kolleji (markazda) va Imperial Cancer Research Fund (o'ngda), London

Londondagi RLDB ofisi ICRF ning asosiy binosida joylashgan Linkolnning Inn Fields, Xolborn va keyinchalik qo'shni katta binolarga ko'chib o'tdi Qirollik jarrohlar kolleji bino.

Berlinda RZPD dastlab Maks-Plank nomidagi Berlin-Dahlemdagi Molekulyar Genetika Institutida joylashgan va keyinchalik yaqinda Xarnak yo'lidagi joyga ko'chib o'tgan (bugungi kunda bu Maks Plank nomidagi Fan tarixi instituti ) markaz sobiq binosidagi so'nggi manziliga ko'chib o'tishdan oldin Empress Ogyust Viktoriya Bolalar uyi Berlin-Sharlottenburgdagi Heubnerwegda. The Neo-barok bino 1907-1909 yillarda rahbarligida qurilgan me'mor va shahar rejalashtirish bo'yicha Berlin shahar komissari Lyudvig Xofmann rejalashtirilganligi me'mor tomonidan sezilarli ta'sir ko'rsatgan bo'lsa, o'rnatildi Alfred Messel. Markazning kichik Heidelberg komponenti DKFZ tarkibida joylashgan.

Adabiyotlar

  1. ^ Ma'lumotli kutubxona tizimi - biologik materiallar va eksperimental ma'lumotlar bilan bo'lishish. Gyunter Zetner va Xans Lehrax (1994 yil 3 fevral). Tabiat, 367-jild, 489-491-betlar
  2. ^ Genomik klonlar bilan yuqori zichlikdagi cDNA massivlarini tayyorlash va skrining qilish (Molekulyar biologiyadagi usullar, jild 175:. Genomika protokollari, tahrirlangan: MP Starkey va R. Elaswarapu, Humana Press Inc., Totova, NJ), Gyunter Zehetner, Mariya Pack , va Katja Schäfer (2001), 169-188 betlar
  3. ^ Maks-Plank-Institut Gen-Bankni o'z ichiga oladi, Die Welt, 1995 yil 31 may
  4. ^ RZPD wird ImaGenes - Wirtschaftlicher Erfolg ermöglicht Änderung der Rechtsform GenomXPress 3/07, 2007 yil
  5. ^ Genomik biologik resurs markazlari tomonidan taklif qilinadigan ilmiy xizmatlarning rivojlanishi va istiqbollari, Oksford jurnallari, Funktsional Genomika va Proteomika 2007 yildagi brifinglar, 6-jild, 3-son, 163-170-betlar.