Geme oksigenaz - Heme oxygenase

gem oksigenaz
Identifikatorlar
EC raqami1.14.99.3
CAS raqami9059-22-7
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Gen ontologiyasiAmiGO / QuickGO
Geme oksigenaz
PDB 1twr EBI.jpg
Inson gem oksigenaz-1 bo'lgan kompleksda qora va temirli verdohema shakllarining kristalli tuzilmalari: gemning parchalanishiga katalitik ta'sir.
Identifikatorlar
BelgilarGeme_oksigenaza
PfamPF01126
Pfam klanCL0230
InterProIPR016053
PROSITEPDOC00512
SCOP21qq8 / QOIDA / SUPFAM
Membranom532

Geme oksigenaz yoki gem oksigenaza (HO) an ferment bu kataliz qiladi degradatsiyasi heme. Bu ishlab chiqaradi biliverdin, qora temir va uglerod oksidi.[1][2] HO birinchi marta 1960-yillarning oxirida Raimo Tenhunen gem katabolizmi uchun fermentativ reaktsiyasini namoyish qilganida tasvirlangan.[3] HO endogen karbon monoksit (CO) ishlab chiqarishning asosiy manbai hisoblanadi. Darhaqiqat, nazorat qilinadigan oz miqdordagi CO terapevtik foydasi uchun o'rganilmoqda.[4]

Geme oksigenaz

Geme oksigenaza - tarkibida gem tarkibidagi a'zodir issiqlik zarbasi oqsili (HSP) deb nomlangan oila HSP32. HO-1 - 288 ni o'z ichiga olgan 32kDa fermenti aminokislotalar qoldiqlari.[5] HO joylashgan endoplazmatik to'r, bu haqda ham xabar berilgan bo'lsa-da mitoxondriya, hujayra yadrosi va plazma membranasi.[6]

HO gemogning degradatsiyasini katalizlaydi biliverdin /bilirubin, temir temir va uglerod oksidi. Tanada mavjud bo'lsa ham, HO organizmda sezilarli faollikka ega taloq degradatsiyasida gemoglobin davomida eritrotsit qayta ishlash (kuniga eritrotsitlar havzasining 0,8%), bu gemadan hosil bo'lgan endogen CO ishlab chiqarishning ~ 80% ni tashkil qiladi. Gemdan olingan CO ishlab chiqarishning qolgan 20% asosan jigar katabolizmiga bog'liq gemoproteinlar (miyoglobin, sitoxromlar, katalaza, peroksidazlar, eruvchan guanilat siklaza, azot oksidi sintezi ) va samarasiz eritropoez yilda ilik.[7] HO fermentlari orqali parchalanadi hamma joyda.[8] Odamlarda uchta izoformlar gem oksigenazasi ma'lum.

Geme oksigenaz 1

Geme oksigenaz 1 (HO-1) - bu butun organizmda mavjud bo'lgan, taloq, jigar va buyraklardagi eng yuqori kontsentratsiyaga ega bo'lgan stressga bog'liq izoform.[9] HO-1 288 ni o'z ichiga olgan 32kDa fermentidir aminokislotalar qoldiqlari tomonidan kodlangan HMOX1 gen. Tadqiqot natijalariga ko'ra o'pka to'qimasida HO-1 darajasi infektsiyaga bevosita bog'liq edi Sil kasalligi yoki infektsiyasiz joylar va nokaut sichqonlari ushbu fermentning muhim rolini ko'rsatadigan ta'sirchan deb topildi.[10]

Geme oksigenaza 2

Geme oksigenaza 2 (HO-2) - bu gomeostatik sharoitda moyaklar, endotelial hujayralar va miyada ifodalangan konstruktiv izoform.[11] HO-2 kodlangan HMOX2 gen. HO-2 36 kDa ni tashkil qiladi va HO-1 aminokislotalar ketma-ketligi bilan 47% o'xshashlikka ega.

Geme oksigenaz 3

Uchinchi gem oksigenaza (HO-3) katalitik ravishda faol emas deb hisoblanadi va gemni sezish yoki gem bog'lashda ishlaydi deb o'ylashadi. HO-3 33 kDa ni tashkil qiladi, bu jigar, prostata va buyraklarda eng ko'p mavjud.[9]

Mikrobial gem oksigenaz

Geme oksigenaza filogenetik qirolliklarda saqlanib qoladi.[12] The Evropa bioinformatika instituti InterPro taksonomiyasi ma'lumotlar bazasida 4347 bakteriya turi, 552 zamburug'lar turi va 6 ta arxey turlari mavjud bo'lib, ular HO-1 o'xshash fermentlarni ifodalaydi. Mikrobial HO gomologlar kabi turli xil qisqartmalardan foydalaning, masalan HMX1 in Saccharomyces cerevisiae,[13] Hmu O in Corynebacterium difteriya,[14] va Chu S in Escherichia coli.[15] Ning muhim roli prokaryotik HO tizimlari a dan temir moddasini olishni osonlashtirishdir ökaryotik mezbon.[16] Ba'zi HO ga o'xshash prokaryotik fermentlar passiv yoki CO ni ajratib chiqarmaydi. Escherichia coli ning ba'zi shtammlari CO hosil bo'lmagan Chu W izoformini ifodalaydi, boshqa mikroblarda HO ga o'xshash fermentlar ishlab chiqarishi haqida xabar berilgan. formaldegid.[17][18]

The inson mikrobiomi endogenga hissa qo'shadi uglerod oksidi odamlarda ishlab chiqarish.[19]

Reaksiya

Geme oksigenaz alfa-meten ko'prigidagi gem halqasini biliverdin hosil qilish uchun ajratadi yoki agar gema hali ham biriktirilgan bo'lsa globin, verdoglobin. Keyinchalik Biliverdin konvertatsiya qilinadi bilirubin tomonidan biliverdin reduktaza. Reaksiya uchta bosqichni o'z ichiga oladi, ular quyidagilar bo'lishi mumkin:[20]

Heme b3+ + O
2
+ NADPH + H+
a-meso-gidroksiema3+ + NADP+
+ H
2
O
a-meso-gidroksiema3+ + H+
+ O
2
→ verdoheme4+ + CO + H2O
verdoheme4+ + 7/2 NADPH + O
2
+ 3/2 H+
→ biliverdin + Fe2+ + 7/2 NADP+
+ H
2
O

Ushbu reaktsiyalarning yig'indisi:

Heme b3+ + 3O
2
+ 9/2 NADPH + 7/2 H+
→ biliverdin + Fe2+ + CO + 9/2 NADP+
+ 3H
2
O

Agar temir dastlab +2 holatida bo'lsa, reaktsiya quyidagicha bo'lishi mumkin:

Heme b2+ + 3O2 + 4 NADPH + 4 H+ → biliverdin + Fe2+ + CO + 4 NADP+ + 3H2O
Gemning degradatsiyasi ko'karganning davolovchi tsiklida ko'rinib turganidek, uchta aniq xromogen hosil qiladi

Ushbu reaktsiya deyarli har bir hujayrada sodir bo'lishi mumkin; klassik misol a shakllanishi kontuziya, bu turli xil xromogenlar u asta-sekin davolaydi: (qizil) gemadan (yashil) biliverdingacha (sariq) bilirubinga. Molekulyar mexanizmlar nuqtai nazaridan ferment gemadagi bitta mezo uglerod markazining molekula ichidagi gidroksillanishini osonlashtiradi.[21]

Induktorlar

HO-1 son-sanoqsiz molekulalar tomonidan induktsiya qilinadi og'ir metallar, statinlar, paklitaksel, rapamitsin, probukol, azot oksidi, sildenafil, uglerod oksidi, uglerod oksidi chiqaradigan molekulalar va porfirinlar.[22]

Fitokimyoviy HO induktorlariga quyidagilar kiradi. kurkumin, resveratrol, piceatannol, kofeik kislota fenetil Ester, dimetil fumarat, fumarik kislota efirlari, flavonoidlar, xalkonlar, ginkgo biloba, antrotsianinlar, florotanninlar, karnosol, rozolik kislota va boshqa ko'plab narsalar tabiiy mahsulotlar.[22][23]

Endogen induktorlarga i) kiradi lipidlar kabi lipoksin va epoksiikosatrienoik kislota; va ii) peptidlar kabi adrenomedullin va apolipoprotein; va iii) hemin.[22]

NRF2 quyi oqimdagi HO-1 induksiyasiga ega induktorlarga quyidagilar kiradi: genistein, 3-gidroksikumarin, oleanolik kislota, izoliquiritigenin, PEITC, Diallil trisulfid, oltipraz, benfotiamin, auranofin, asetaminofen, nimesulid, paraquat, etoksikin, dizel chiqindi zarralari, kremniy, nanotubalar, 15 eo deoksi ‐ -12,14 prostaglandin J2, nitro-oleyk kislotasi, vodorod peroksid va süksinilaseton.[24]

Fiziologiyadagi rollar

Geme oksigenaz ekspressioni oksidlanish stresi bilan vujudga keladi va hayvon modellarida bu ekspresyonning ko'payishi himoya xususiyatiga ega. Gem oksigenaza reaktsiyalaridan ajralib chiqadigan uglerod oksidi qon tomir tonusiga mustaqil ta'sir qilishi yoki azot oksidi sintazining ishiga ta'sir qilishi mumkin.[iqtibos kerak ]

Endogen uglerod oksidi

Odamlarda birinchi marta CO ni aniqlash 1949 yilda sodir bo'lgan.[25] Sjöstrand CO ning alfa-meten uglerodidan kelib chiqqanligini aniqladi heme,[26] orasidagi mollar nisbati uchun sahnani o'rnatish hemin tanazzulga uchrashi va CO ishlab chiqarilishi.[27] So'nggi yillarda boshqa kichik hissadorlar aniqlangan bo'lsa ham, HO endogen CO ishlab chiqarishning asosiy manbai hisoblanadi. CO inson tanasida 16,4 olmol / soat tezlikda hosil bo'ladi, ~ 86% gem oksigenaz orqali gemadan va ~ 14% gem bo'lmagan manbalardan, shu jumladan: fotoksidlanish, lipid peroksidatsiyasi va ksenobiotiklardan.[19] O'rtacha karboksigemoglobin Chekmaydigan odamda (CO-Hb) darajasi 0,2% dan 0,85% gacha CO-Hb (chekuvchi 4% dan 10% gacha CO-Hb bo'lishi mumkin),[28] geografik joylashuvi, mashg'uloti, sog'lig'i va xulq-atvori o'zgaruvchiga yordam beradi. Bular orasida ovqat hazm qilish traktidagi mikrobial HO tizimi CO-Hb tizimli konsentratsiyasiga hissa qo'shadi deb ishoniladi.[29]

Adabiyotlar

  1. ^ Kikuchi G, Yoshida T, Noguchi M (2005). "Geme oksigenaz va gem degradatsiyasi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 338 (1): 558–567. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.08.020. PMID  16115609.
  2. ^ Ryter SW, Alam J, Choi AM (2006). "Geme oksigenaz-1 / uglerod oksidi: asosiy fanlardan terapevtik qo'llanmalargacha". Fiziologik sharhlar. 86 (2): 583–650. doi:10.1152 / physrev.00011.2005. PMID  16601269.
  3. ^ Tenxunen R, Marver XS, Shmid R (1969). "Mikrosomal gem oksigenaza. Fermentning xarakteristikasi". Biologik kimyo jurnali. 244 (23): 6388–6394. PMID  4390967.
  4. ^ Motterlini R, Otterbein LE (2010). "Uglerod oksidining terapevtik salohiyati". Tabiat sharhlari. Giyohvand moddalarni kashf etish. 9 (9): 728–743. doi:10.1038 / nrd3228. PMID  20811383.
  5. ^ Barton SG, Rampton DS, Winrow VR, Domizio P, Feakins RM (2003). "Oddiy va yallig'langan oshqozon va yo'g'on ichakdagi issiqlik shoki oqsilining 32 (gemoksigenaza-1) ifodasi: immunohistokimyoviy tadqiqotlar". Uyali stress va shaperonlar. 8 (4): 329–334. doi:10.1379 / 1466-1268 (2003) 008 <0329: eohsph> 2.0.co; 2. PMC  514904. PMID  15115285.
  6. ^ Hopper CP, Meinel L, Steiger C, Otterbein LE (2018). "Geme oksigenaz-1 / uglerod oksidi terapiyasini davolashning klinik yutug'i qayerda?". Amaldagi farmatsevtika dizayni. 24 (20): 2264–2282. doi:10.2174/1381612824666180723161811. PMID  30039755.
  7. ^ Breman HJ, Vong RJ, Stivenson DK (2001). "15-bob: Uglerod oksidining manbalari, chig'anoqlari va o'lchovi". Vangda R (tahrir). Uglerod oksidi va yurak-qon tomir funktsiyalari (2-nashr). CRC Press. ISBN  978-0-8493-1041-6.
  8. ^ Lin, P (2008). "Ubiquitin-proteazom tizimi endoplazmatik retikulum bilan bog'liq degradatsiyaga uchragan yo'l orqali gem oksigenaza-1 parchalanishiga vositachilik qiladi". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Molekulyar hujayralarni tadqiq qilish. 1783 (10): 1826–1834. doi:10.1016 / j.bbamcr.2008.05.008. PMID  18544348.
  9. ^ a b Elbirt K, Bonkovskiy H (1999). "Geme oksigenaz: uning regulyatsiyasi va rolini tushunishda so'nggi yutuqlar". Amerika shifokorlari assotsiatsiyasi materiallari. 111 (5): 438–447. doi:10.1111 / paa.1999.111.5.438.
  10. ^ https://medicalxpress.com/news/2018-11-enzyme-immune-cells-essential-role.html
  11. ^ Muñoz-Sánchez J, Chánez-Kardenas ME (2014). "Gemeoksigenaza-2 bo'yicha sharh: uyali himoya va kislorod ta'siriga e'tibor". Oksidlovchi tibbiyot va uyali uzoq umr ko'rish. 2014 (1): 604981. doi:10.1155/2014/604981. PMC  4127239. PMID  25136403.
  12. ^ Li C, Stocker R (2013). "Geme oksigenaza va temir: bakteriyalardan odamlarga". Redoks hisoboti. 14 (3): 95–101. doi:10.1179 / 135100009X392584. PMID  19490750.
  13. ^ Protchenko O, Shakoury-Elizeh M, Keane P, Storey J, Androphy R, Philpott CC (2008). "Saccharomyces cerevisiae-da indüksiyon porfirin va gemni tashishda PUG1 ning roli". Eukaryotik hujayra. 7 (5): 859–871. doi:10.1128 / EC.00414-07. PMC  2394968. PMID  18326586.
  14. ^ Uilks A, Shmitt MP (1998). "Korinebakterium difteriyasidan gem oksigenaz (Hmu O) ning ifodalanishi va tavsifi. Temir olish uchun gema makrosiklining oksidlanishli bo'linishi kerak". Biologik kimyo jurnali. 273 (2): 837–841. doi:10.1074 / jbc.273.2.837. PMID  9422739.
  15. ^ Maharshak N, Ryu HS, Fan TJ, Onyiah JK, Schulz S, Otterbein SL, Vong R, Hansen JJ, Otterbein LE, Carroll IM, Plevy SE (2015). "Escherichia coli heme oksigenaza mezbonlarning tug'ma immunitet reaktsiyalarini modulyatsiya qiladi".. Mikrobiologiya va immunologiya. 59 (8): 452–465. doi:10.1111/1348-0421.12282. PMC  4582649. PMID  26146866.
  16. ^ Frankenberg-Dinkel, Nikol (2004). "Bakterial Heme oksigenazlari". Antioksidantlar va oksidlanish-qaytarilish signalizatsiyasi. 6 (5): 825–834. doi:10.1089 / ars.2004.6.825. PMID  15345142.
  17. ^ LaMattina JW, Nix DB, Lanzilotta WN (2016). "Escherichia coli O157: H7 da gemog degradatsiyasi uchun tubdan yangi paradigma". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 113 (43): 12138–12143. doi:10.1073 / pnas.1603209113. PMC  5087033. PMID  27791000.
  18. ^ Matsui T, Nambu S, Ono Y, Goulding CW, Tsumoto K, Ikeda-Saito M (2013). "IsdG va IsdI Staphylococcus aureus tomonidan gemaning parchalanishi uglerod oksidi o'rniga formaldegidni ajratadi". Biokimyo. 52 (18): 3025–3027. doi:10.1021 / bi400382p. PMC  3672231. PMID  23600533.
  19. ^ a b Vang R, tahrir. (2001). Uglerod oksidi va yurak-qon tomir funktsiyalari. CRC Press. p. 5. ISBN  978-1-4200-4101-9.
  20. ^ Evans JP, Niemevz F, Buldain G, de Montellano PO (2008). "Gem oksigenaza katalizidagi izoporfirin qidiruv vositasi. Alfa-mezo-fenilhemaning oksidlanishi". J. Biol. Kimyoviy. 283 (28): 19530–19539. doi:10.1074 / jbc.M709685200. PMC  2443647. PMID  18487208. Malumot har bir reaktsiyaning aniq stokiometriyasini bermaydi.
  21. ^ Yoshida T, Taiko Migita S (2000). "Gem oksigenaz bilan gem degradatsiyasini diqqat bilan ko'rib chiqish mexanizmi". Anorganik biokimyo jurnali. 82 (1–4): 33–41. doi:10.1016 / S0162-0134 (00) 00156-2. PMID  11132636.
  22. ^ a b v Ferrandiz ML, Devesa I (2008). "Gem oksigenaz-1 induktorlari". ko'rib chiqish. Amaldagi farmatsevtika dizayni. 14 (5): 473–86. doi:10.2174/138161208783597399. PMID  18289074.
  23. ^ Korrea-Kosta M, Otterbein LE (2014). "Davolash uchun ovqatlaning: Geme Oksigenaza-1 tizimining tabiiy induktorlari.". Folkerts G, Garssen J (tahrir). Farmatsevtika. ikkilamchi. Farmatsevtika fanlari seriyasidagi AAPS yutuqlari. 12. Springer, Xam. 243–256 betlar. doi:10.1007/978-3-319-06151-1_12. ISBN  978-3-319-06150-4.
  24. ^ Ma Q, X X (2012). "Elektrofil va oksidlanish himoyasining molekulyar asoslari: Nrf2 ning va'dalari va xavfi". Farmakol. Vah. 64 (4): 1055–1081. doi:10.1124 / pr.110.004333. PMC  4648289. PMID  22966037.
  25. ^ Syöstrand T (1949). "Oddiy va patologik sharoitlarda insonda uglerod oksidining endogen shakllanishi". Skandinaviya Klinik va laboratoriya tadqiqotlari jurnali. 1 (3): 201–214. doi:10.3109/00365514909069943.
  26. ^ Systrand T (1952). "Qonda uglerod oksidining in vitro shakllanishi". Acta Physiologica Scandinavica. 24 (4): 314–332. doi:10.1111 / j.1748-1716.1952.tb00848.x. PMID  14952314.
  27. ^ Koburn RF (1973). "Endogen uglerod oksidi metabolizmi". Tibbiyotning yillik sharhi. 24: 241–250. doi:10.1146 / annurev.me.24.020173.001325. PMID  4575855.
  28. ^ Thom SR (2008). "15-bob: Uglerod oksidi patofizyologiyasi va davolash". Neyman TSda Thom SR (tahr.). Giperbarik kislorod terapiyasining fiziologiyasi va tibbiyoti. 321-34 betlar. doi:10.1016 / B978-1-4160-3406-3.50020-2. ISBN  9781416034063.
  29. ^ Oleskin AV, Shenderov BA (2016). "Odam simbiotik mikrobiota tomonidan ishlab chiqarilgan SCFA va gazotransmitterlarning neyromodulyator ta'sirlari va maqsadlari". Mikrob. Ekol. Sog'liqni saqlash Dis. 27: 30971. doi:10.3402 / mehd.v27.30971. PMC  4937721. PMID  27389418.

Tashqi havolalar