NLRC4 - NLRC4

NLRC4
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarNLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR oilasi, 4 ta o'z ichiga olgan CARD domeni, 4 ta NLR oilaviy CARD domeni
Tashqi identifikatorlarOMIM: 606831 MGI: 3036243 HomoloGene: 10924 Generkartalar: NLRC4
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 2 (odam)
Chr.Xromosoma 2 (odam)[1]
Xromosoma 2 (odam)
NLRC4 uchun genomik joylashuv
NLRC4 uchun genomik joylashuv
Band2p22.3Boshlang32,224,453 bp[1]
Oxiri32,265,732 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

58484

268973

Ansambl

ENSG00000091106

ENSMUSG00000039193

UniProt

Q9NPP4

Q3UP24

RefSeq (mRNA)

NM_001199138
NM_001199139
NM_001302504
NM_021209

NM_001033367

RefSeq (oqsil)

NP_001186067
NP_001186068
NP_001289433
NP_067032

NP_001028539

Joylashuv (UCSC)Chr 2: 32.22 - 32.27 MbChr 17: 74.43 - 74.46 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

NLR oilaviy CARD domenini o'z ichiga olgan protein 4 a oqsil odamlarda kodlanganligi NLRC4 gen.[5][6]

Tuzilishi

NLRC4 oqsili sutemizuvchilar turlarida yuqori darajada saqlanib qolgan. Bu homologiyani o'z ichiga oladi C. elegans Ced4 oqsillari. Unda n-terminal mavjud KARTA domen, markaziy nukleotid bog'lash /NACHT domen va s-terminalli leytsinga boy takrorlash (LRR ) domen. U transkripsiya koaktivatorini o'z ichiga olgan NLR oqsillari oilasiga tegishli CIITA va kanonik yallig'lanishli oqsil NLRP3. NLRC4 kesilgan murin bu oilaning birinchi a'zosi bo'lib, uning kristalli tuzilishi hal qilingan.[7]

Funktsiya

NLRC4 ning eng yaxshi shakllanishi bilan bog'liq yallig'lanish. NLRP3 dan farqli o'laroq, NLRC4 ning ba'zi inflammasomaga bog'liq funktsiyalari, inflammasom iskala-dan mustaqil ravishda amalga oshirilishi mumkin. ASC. Inson Ced4 gomologlariga quyidagilar kiradi APAF1, NOD1 (CARD4) va NOD2 (CARD15). Ushbu oqsillar kamida 1 ga ega N-terminal KART domeni, so'ngra markazlashgan nukleotidlarni bog'laydigan domen (NBD yoki NACHT) va a C-terminali faqat sutemizuvchilardan topilgan tartibga soluvchi domen WD40 takrorlanadi yoki leytsinga boy takrorlashlar (LRR). CARD12 Ced4 oilasining a'zosi va uni chaqirishi mumkin apoptoz.[6]

O'zaro aloqalar

NLRC4 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish NAIP bilan (bitta odam NAIP mavjud, ammo sichqonlar kamida 4 ta alohida NAIP oqsilini ifoda etadi). NAIP / NLRC4 o'zaro ta'siri ligandning o'ziga xosligini aniqlab berishi mumkin.[8] NLRC4 ga bog'liq bo'lgan inflammasom faolligi faollashadi CASP1.[9] Muayyan sharoitlarda NLRC4 va NLRP3 bir xil yallig'lanishli kompleksni egallashi mumkin.[10]

Klinik ahamiyati

NLRC4 da faollashtiruvchi mutatsiyalarga ega bo'lgan odamlar rivojlanishi mumkin otoinflamatuar o'tkir isitma, gepatit, juda yuqori sarum ferritin va boshqa xususiyatlar bilan tavsiflangan sindrom Makrofagni faollashtirish sindromi (MAS). Ba'zi bemorlarda hayotga tahdid soladigan enterokolit paydo bo'lib, u erta bolalik davrida pasaygan.[11][12] Ushbu bemorlarda sarumning surunkali va favqulodda ko'tarilishi Il-18 rivojlanayotgan NLRP3 mutatsiyasiga ega bemorlardan farqli o'laroq topilgan Kriyopirin bilan bog'liq davriy sindromlar.[11] Katta yapon oilasida asosan irsiy NLRC4 mutatsiyasi natijasida kelib chiqqan sovuq ürtiker bilan bog'liq bo'lgan ancha yumshoq kasallik mavjud edi.[13]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000091106 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039193 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Geddes BJ, Vang L, Xuang VJ, Lavelli M, Manji GA, Braun M, Yurman M, Cao J, Morgenstern J, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Bertin J (iyun 2001). "Inson CARD12 - bu apoptozni keltirib chiqaradigan yangi CED4 / Apaf-1 oilasi a'zosi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 284 (1): 77–82. doi:10.1006 / bbrc.2001.4928. PMID  11374873.
  6. ^ a b "Entrez Gen: NLRC4 NLR oilasi, CARD domeni 4 ta".
  7. ^ Xu Z, Yan S, Liu P, Xuang Z, Ma R, Chjan S, Vang R, Chjan Y, Martinon F, Miao D, Deng X, Vang J, Chang J, Chay J (iyul 2013). "NLRC4 ning kristalli tuzilishi uning avtoinhibisyon mexanizmini ochib beradi". Ilm-fan. 341 (6142): 172–5. doi:10.1126 / science.1236381. PMID  23765277. S2CID  12360722.
  8. ^ Kofoed EM, Vance RE (sentyabr 2011). "NAIPlar orqali bakterial ligandlarni tug'ma immunologik tanib olish, yallig'lanishning o'ziga xos xususiyatlarini aniqlaydi". Tabiat. 477 (7366): 592–5. doi:10.1038 / tabiat10394. PMC  3184209. PMID  21874021.
  9. ^ Damiano JS, Oliveira V, Welsh K, Reed JC (Iyul 2004). "NACHT domenlari o'rtasidagi heterotipik o'zaro ta'sir: tug'ma immun javoblarni tartibga solishga ta'siri". Biokimyoviy jurnal. 381 (Pt 1): 213-9. doi:10.1042 / BJ20031506. PMC  1133779. PMID  15107016.
  10. ^ Man SM, Hopkins LJ, Nugent E, Cox S, Gluk IM, Tourlomousis P, Rayt JA, Cicuta P, Monie TP, Bryant Idoralar (may, 2014). "Inflammasomani faollashishi bir xil makromolekulyar kompleksga NLRC4 va NLRP3 ni ikki tomonlama yollashga olib keladi" (PDF). Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 111 (20): 7403–8. doi:10.1073 / pnas.1402911111. PMC  4034195. PMID  24803432.
  11. ^ a b Canna SW, de Jesus AA, Gouni S, Brooks SR, Marrero B, Liu Y, DiMattia MA, Zaal KJ, Sanches GA, Kim H, Chapelle D, Plass N, Huang Y, Villarino AV, Byankotto A, Flerayer TA, Dankan JA, O'Shea JJ, Benseler S, Grom A, Deng Z, Lakser RM, Goldbax-Manskiy R (oktyabr 2014). "Faollashtiruvchi NLRC4 inflammasom mutatsiyasi takrorlanadigan makrofag aktivatsiyasi sindromi bilan avtoinflamatsiyani keltirib chiqaradi". Tabiat genetikasi. 46 (10): 1140–6. doi:10.1038 / ng.3089. PMC  4177369. PMID  25217959.
  12. ^ Romberg N, Al Musousi K, Nelson-Uilyams C, Stigler AL, Loring E, Choi M, Overton J, Meffre E, Xoxa MK, Xattner AJ, G'arbiy B, Podoltsev NA, Boggon TJ, Kazmierczak BI, Lifton RP (oktyabr 2014) ). "NLRC4 mutatsiyasi enterokolit va avtoinflammatsiya sindromini keltirib chiqaradi". Tabiat genetikasi. 46 (10): 1135–9. doi:10.1038 / ng.3066. PMC  4177367. PMID  25217960.
  13. ^ Kitamura A, Sasaki Y, Abe T, Kano H, Yasutomo K (noyabr 2014). "NLRC4dagi irsiy mutatsiya odam va sichqonlarda autoinflamatsiyani keltirib chiqaradi". Eksperimental tibbiyot jurnali. 211 (12): 2385–96. doi:10.1084 / jem.20141091. PMC  4235634. PMID  25385754.

Qo'shimcha o'qish