NLRP1 - NLRP1

NLRP1
PDB 1pn5 EBI.jpg
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarNLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L / S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR oilasi, tarkibida 1 bo'lgan pirin domeni, 1 tarkibida NLR oilaviy pirin domeni, MSPC, AIADK, JRRP
Tashqi identifikatorlarOMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 Generkartalar: NLRP1
Gen joylashuvi (odam)
17-xromosoma (odam)
Chr.17-xromosoma (odam)[1]
17-xromosoma (odam)
NLRP1 uchun genomik joylashuv
NLRP1 uchun genomik joylashuv
Band17p13.2Boshlang5,499,427 bp[1]
Oxiri5,619,424 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE NLRP1 210113 s da fs.png

PBB GE NLRP1 211824 x da fs.png

PBB GE NLRP1 211822 s da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

22861

637515

Ansambl

ENSG00000091592

ENSMUSG00000070390

UniProt

Q9C000

Q2LKV5
Q2LKV2
Q2LKW6
Q0GKD5

RefSeq (mRNA)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq (oqsil)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_001155886

Joylashuv (UCSC)Chr 17: 5.5 - 5.62 MbChr 11: 71.15 - 71.23 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

NLRP1 kodlaydi NACHT, LRR, FIIND, CARD domeni va PYD domenlarini o'z ichiga olgan protein 1 odamlarda.[5][6][7] NLRP1 birinchi bo'ldi oqsil hosil qilish uchun ko'rsatilgan yallig'lanish.[8] NLRP1 xilma-xilligi bilan ifodalanadi hujayra turlari, ular asosan gemopoetik. Ekspression shuningdek, glandular epiteliya tuzilmalarida, shu jumladan, ichki qatlamda ham ko'rinadi ingichka ichak, oshqozon.[9] NLRP1 polimorfizmlari CDdagi ichakdan tashqari teri ko'rinishlari bilan bog'liq.[9] Uning eng yuqori ifodasi inson terisida aniqlandi toshbaqa kasalligi va in vitiligo. NLRP1 ning polimorfizmlari topilgan qizil yuguruk eritematozi va diabet turi 1.[10] Sichqonchaning NLRP1 variantlari N-terminal yorilishi paytida faollashtirilganligi aniqlandi proteaz yilda kuydirgi o'limga olib keladigan omil.[8]

Funktsiya

Ushbu gen Ced-4 oilasining a'zosini kodlaydi apoptoz oqsillar. Ced-oila a'zolari tarkibiga a kaspaz yollash domeni (CARD) va ularning asosiy vositachilari ekanligi ma'lum dasturlashtirilgan hujayralar o'limi. Kodlangan oqsil aniq N-terminalni o'z ichiga oladi piringa o'xshash motif, ehtimol bu bilan bog'liq oqsil va oqsillarning o'zaro ta'siri. NLRP1 oqsillari kuchli ta'sir o'tkazadi kaspaz 2 va zaif kaspaz 9. Buning haddan tashqari ifodasi gen hujayralarda apoptozni keltirib chiqarishi isbotlangan. Bir nechta muqobil ravishda qo'shilgan Ushbu gen uchun alohida izoformlarni kodlovchi transkript variantlari topilgan, ammo ba'zi variantlarning biologik asosliligi aniqlanmagan.[7]

Aktivizatsiya mexanizmi

NLRP1 antibakterialni faollashtiradi immunitet reaktsiyasi. Antibakterial immunitet reaktsiyasi ning yo'qotilishini qoplaydi MAP kinazasi javob. Odamlar NLRP1 ishlab chiqaradi, ammo inson NLRP1 o'ldiruvchi omil tomonidan faollashtirilmaydi.[8] NLRP1 proteolitik parchalanish natijasida faollashtirilishi mumkin, natijada avtomatik inhibitor PYD olib tashlanadi va kaspaza-1ning faol shaklida pro-kaspaz-1ni ishga olish va faollashtirish uchun mas'ul bo'lgan CARD domeni bo'shatiladi.[8] Ammo insonning NLRP1 aktivatsiyasi mexanizmi va funktsiyasi immunitet aniq emas.[8]

O'zaro aloqalar

NLRP1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan kaspaz 9[11][12] va APAF1.[11]

Sichqonlarda NLRP1 variantlari

Sichqonlarda uchta paralog mavjud Nlrp1 gen (Nlrp1a, b, v). Nlrp1c bu psevdogen.[13] Sichqoncha NLRP1B retseptorlari-ligand turi mexanizmi bilan faollashtirilmaydi. Sichqonchaning ba'zi tug'ma shtammlaridan NLRP1B variantlari, BALB / c va 129, o'limga olib keladigan omil (LF) bilan faollashtirilishi mumkin. proteaz. O'lim omili proteaz tomonidan ishlab chiqarilgan va yashiringan Bacillus antrasis, agenti kuydirgi.[14] Himoya antigeni (PA) bilan birgalikda LF ikki o'lchovli toksin, Lethal Toxin hosil qiladi. PA-ning roli a ni shakllantirishdan iborat translokatsiya LF-ni xost hujayrasiga etkazib beradigan kanal sitozol, bu erda LF MAP kinazlarini ajratish va inaktivatsiya qilish orqali immunitet ta'sirida rol o'ynaydi.[15][16] LF to'g'ridan-to'g'ri NLRP1B ni unga yaqinlashtiradi N-terminali, bu NLRP1B uchun zarur va etarli yallig'lanish shakllantirish va CASP1 faollashtirish.[17] NLRP1B ga bog'liqligini faollashtirish yallig'lanish javoblar IL-1β va kabi mexanizm bilan xost himoyasida paydo bo'ladi neytrofillar.[18][19] NLRP1B sensori sifatida ishlashi mumkin bakterial proteazlar, immunitet reaktsiyalari maxsus tomonidan faollashtiriladi zaharlanish omillar.[20][21]

NLRP1A-ni, boshqa taniqli funktsional murin NLRP1 paralogini qanday stimullar faollashtirishi mumkinligi aniq emas. Tadqiqotda funktsiyani kuchaytiradigan sichqon aniqlandi mutatsiya faol bo'lgan NLRP1A (Q593P) da yallig'lanish javoblar. Mexanizmi yovvoyi tip NLRP1A aktivatsiyasi aniq emas.[22]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000091592 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000070390 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Bek S (1996 yil oktyabr). "Filogeniya va RING3 genining tuzilishi". Immunogenetika. 44 (5): 391–6. doi:10.1007 / BF02602785. PMID  8781126. S2CID  44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Berns K (2003 yil fevral). "NALPs: yallig'lanish bilan shug'ullanadigan yangi oqsil oilasi". Tabiat sharhlari. Molekulyar hujayra biologiyasi. 4 (2): 95–104. doi:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
  7. ^ a b "Entrez Gen: NLRP1 NLR oilasi, 1 tarkibidagi pirin domeni".
  8. ^ a b v d e Chavarriya-Smit J, Mitchell PS, Xo AM, Daugherty MD, Vance RE (dekabr 2016). "Funktsional va evolyutsion tahlillar proteolitni NLRP1 inflammasomasini faollashtirishning umumiy mexanizmi sifatida aniqlaydi". PLOS patogenlari. 12 (12): e1006052. doi:10.1371 / journal.ppat.1006052. PMC  5142783. PMID  27926929. CC-BY icon.svg Ushbu manbadan nusxa ko'chirilgan, u ostida mavjud Creative Commons Attribution 4.0 xalqaro litsenziyasi.
  9. ^ a b Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L, Kuijk L, Martinon F va boshq. (2007 yil may). "Inflammasome komponentlari NALP 1 va 3 inson to'qimalarida aniq, ammo alohida ekspression profillarini ko'rsatadi, bu yallig'lanish reaktsiyasida saytga xos rolni ko'rsatadi". Gistoximiya va sitokimyo jurnali. 55 (5): 443–52. doi:10.1369 / jhc.6A7101.2006. PMID  17164409.
  10. ^ Grandemange S, Sanches E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C va boshq. (2017 yil iyul). "NLRP1 mutatsiyasiga bog'liq yangi otoinflamatuar va otoimmun sindrom: NAIAD (artrit va diskeratoz bilan NLRP1 bilan bog'liq bo'lgan autoinflammasiya"). Revmatik kasalliklar yilnomalari. 76 (7): 1191–1198. doi:10.1136 / annrheumdis-2016-210021. PMID  27965258. S2CID  206852426.
  11. ^ a b Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (mart 2001). "Sitokrom c-ga bog'liq kaspaz aktivatsiyasi va apoptozda ishtirok etgan Apaf1 apoptosomasining yangi kuchaytiruvchisi". Biologik kimyo jurnali. 276 (12): 9239–45. doi:10.1074 / jbc.M006309200. PMID  11113115.
  12. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, Vincenz C, Ward PA (mart 2001). "DEOPAP-L va -S ning molekulyar klonlashi va xarakteristikasi, apoptoz oqsillari sutemizuvchisi Ced-4 oilasining yangi a'zosining ikkita izoformasi". Biologik kimyo jurnali. 276 (12): 9230–8. doi:10.1074 / jbc.M009853200. PMID  11076957.
  13. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (mart 2013). "Sichqonlarda uchta Nlrp1 paralogining transkripsiyaviy tahlili". BMC Genomics. 14 (1): 188. doi:10.1186/1471-2164-14-188. PMC  3641005. PMID  23506131.
  14. ^ Boyden ED, Dietrich WF (2006 yil fevral). "Nalp1b sichqonchani o'ldiradigan toksiniga sichqon makrofagining ta'sirchanligini nazorat qiladi". Tabiat genetikasi. 38 (2): 240–4. doi:10.1038 / ng1724. PMID  16429160. S2CID  23316987.
  15. ^ Turk BE (2007 yil mart). "Kuydirgi toksinlari bilan mezbon signalizatsiya yo'llarini manipulyatsiya qilish". Biokimyoviy jurnal. 402 (3): 405–17. doi:10.1042 / BJ20061891. PMID  17313374.
  16. ^ Moayeri M, Leppla SH (dekabr 2009). "Kuydirgidan o'limga olib keladigan toksin va shish toksinining hujayra va tizimli ta'siri". Tibbiyotning molekulyar jihatlari. 30 (6): 439–55. doi:10.1016 / j.mam.2009.07.003. PMC  2784088. PMID  19638283.
  17. ^ Chavarriya-Smit J, Vans RE (2013). "NLRP1B ning to'g'ridan-to'g'ri proteolitik parchalanishi kuydirgi o'ldiruvchi omil bilan yallig'lanishni faollashtirish uchun zarur va etarli". PLOS patogenlari. 9 (6): e1003452. doi:10.1371 / journal.ppat.1003452. PMC  3688554. PMID  23818853.
  18. ^ Terra JK, Cote CK, Frantsiya B, Jenkins AL, Bozue JA, Welkos SL, LeVine SM, Bredli KA (yanvar 2010). "Kesish tomoni: o'lim toksiniga sezgir Nalp1b / Nlrp1b alleli vositachiligida Bacillus antracis infektsiyasiga qarshilik". Immunologiya jurnali. 184 (1): 17–20. doi:10.4049 / jimmunol.0903114. PMC  2811128. PMID  19949100.
  19. ^ Moayeri M, Crown D, Newman ZL, Okugawa S, Ekxaus M, Kataisson C, Liu S, Sastalla I, Leppla SH (dekabr 2010). "Inflatmasoma sensori Nlrp1b ga bog'liq ravishda kuydirgiga qarshilik kaspaz-1, IL-1 signalizatsiyasi va neytrofillar yollash vositasida amalga oshiriladi". PLOS patogenlari. 6 (12): e1001222. doi:10.1371 / journal.ppat.1001222. PMC  3000361. PMID  21170303.
  20. ^ de Zoete MR, Bouman LI, Keestra AM, van Putten JP (2011 yil mart). "Tollga o'xshash retseptorni mikrobial proteazlar bilan ajratish va faollashtirish". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 108 (12): 4968–73. doi:10.1073 / pnas.1018135108. PMC  3064367. PMID  21383168.
  21. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzak C, Sklenar J, Derbishir P, Chevik V, Rallapalli G, Saucet SB, Wirthmueller L, Menke FL, Sohn KH, Jones JD (may, 2015). "O'simlik immuniteti retseptorlari WRKY transkripsiyasi omillariga yo'naltirilgan patogen ta'sir qiluvchi omillarni aniqlaydi". Hujayra. 161 (5): 1089–1100. doi:10.1016 / j.cell.2015.04.024. PMID  26000484.
  22. ^ Masters SL, Gerlic M, Metcalf D, Preston S, Pellegrini M, O'Donnell JA va boshq. (2012 yil dekabr). "NLRP1 inflammasomasini faollashishi gemotopoetik progenitor hujayralarning piroptozini keltirib chiqaradi". Immunitet. 37 (6): 1009–23. doi:10.1016 / j.immuni.2012.08.027. PMC  4275304. PMID  23219391.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: Q9C000 (NACHT, LRR va PYD domenlarini o'z ichiga olgan oqsil 1) da PDBe-KB.