KDM2A - KDM2A
Lizinga xos demetilaza 2A (KDM2A) sifatida ham tanilgan F-quti va leytsinga boy takroriy oqsil 11 (FBXL11) - bu ferment odamlarda kodlanganligi KDM2A gen.[5][6][7] KDM2A superfamilaning a'zosi alfa-ketoglutaratga bog'liq gidroksilazalar tarkibida temir bo'lmagan tarkibida oqsillar mavjud.
Funktsiya
Ushbu gen. A'zosini kodlaydi F-quti oqsili taxminan 40 ta aminokislota motifi, F qutisi bilan ajralib turadigan oila. F-quti oqsillari to'rtta bo'linmadan birini tashkil qiladi ubikuitin oqsil ligazasi murakkab deb nomlangan SCFlar Funktsiyasini bajaradigan (SKP1-cullin-F-box) fosforillanish - mustaqil hamma joyda. F-quti oqsillari 3 sinfga bo'linadi: tarkibida Fbws WD-40 domenlar, o'z ichiga olgan Fbls leytsinga boy takrorlashlar yoki turli xil protein-oqsillarning o'zaro ta'sir modullarini o'z ichiga olgan yoki tanib bo'lmaydigan motiflarni o'z ichiga olgan Fbxlar. Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil Fbls sinfiga tegishli va F qutisiga qo'shimcha ravishda kamida 6 ta juda degeneratsiyalangan leytsinga boy takrorlashni o'z ichiga oladi.[7]
FBXL11 / KDM2A - bu histon H3 lizin 36 demetilaza ferment. FBXL11 / KDM2A ning fermentativ faolligi konservalangan JmjC domeniga bog'liq. N-terminali koordinatali temir va alfaketoglutarat katalizatsiyalash demetilatsiya gidroksillanishga asoslangan mexanizm orqali.[8] Yaqinda FBXL11 / KDM2A tarkibidagi ZF-CxxC DNK bilan bog'lanish domeni metillanmagan DNK bilan ta'sir o'tkazish qobiliyatiga ega ekanligi va bu domen FBXL11 / KDM2A ni genomning CpG orol mintaqalariga qaratilganligi, u erda H3 lizin 36 metilatsiyasini maxsus olib tashlaganligi isbotlangan. .[9] Ushbu mexanizm a yaratish uchun harakat qiladi kromatin CpG orollaridagi muhit, bu tartibga soluvchi elementlarni ajratib turadi va ularni yirik sutemizuvchilar genomlarining me'yoriy bo'lmagan mintaqalaridan ajratib turadi. Sichqoncha gepatotsitlarida olib borilgan tadqiqotda ushbu gen jigar glyukoneogenezini boshqarishini ko'rsatdi.[10]
Adabiyotlar
- ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000173120 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000054611 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ Nagase T, Ishikava K, Suyama M, Kikuno R, Xirosava M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (Iyul 1999). "Insonning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. XIII. In vitro katta oqsillarni kodlovchi miyadan 100 ta yangi cDNA klonlarining to'liq ketma-ketliklari". DNK rez. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
- ^ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (1999 yil dekabr). "Sutemizuvchilar F-qutisi oqsillari oilasi". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.
- ^ a b "Entrez Gen: FBXL11 F qutisi va leytsinga boy takroriy oqsil 11".
- ^ Tsukada Y, Fang J, Erdjument-Bromage H, Uorren ME, Borchers CH, Tempst P, Zhang Y (fevral 2006). "JmjC tarkibidagi oqsillar oilasi tomonidan histon demetilatsiyasi". Tabiat. 439 (7078): 811–6. doi:10.1038 / tabiat04433. PMID 16362057. S2CID 4415889.
- ^ Blackledge NP, Zhou JC, Tolstorukov MY, Farcas AM, Park PJ, Klose RJ (2010 yil aprel). "CpG orollari histon H3 lizin 36 demetilaza yollaydi". Molekulyar hujayra. 38 (2): 179–90. doi:10.1016 / j.molcel.2010.04.009. PMC 3098377. PMID 20417597.
- ^ Pan D, Mao S, Zou T, Yao AY, Cooper MP, Boyartchuk V, Van YX (2012). "Giston Demetilaza Jhdm1a jigar glyukoneogenezini tartibga soladi". PLOS Genetika. 8 (6): e1002761. doi:10.1371 / journal.pgen.1002761. PMC 3375226. PMID 22719268.
Qo'shimcha o'qish
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2003). "KIAA genlari uchun ekspresatsiyaga tayyor cDNA klonlarini qurish: 330 KIAA cDNA klonlarini qo'lda davolash". DNK rez. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
- Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). "Inson F-qutisi oqsillari oilasini aniqlash". Curr. Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.
- Ilyin GP, Rialland M, Kabutar S, Guguen-Gilyuzo S (2001). "cDNA klonlash va sutemizuvchilar F-qutisi oqsillari oilasining yangi a'zolarini ekspression tahlili". Genomika. 67 (1): 40–7. doi:10.1006 / geno.2000.6211. PMID 10945468.
- Hattori A, Okumura K, Nagase T, Kikuno R, Xirosava M, Ohara O (2001). "Odamning kattalar talog'idan uzoq cDNA klonlarining xarakteristikasi". DNK rez. 7 (6): 357–66. doi:10.1093 / dnares / 7.6.357. PMID 11214971.
- Vatanabe N, Arai H, Nishihara Y, Taniguchi M, Vatanabe N, Hunter T, Osada H (2004). "M-fazali kinazlar SCFbeta-TrCP tomonidan somatik Wee1 ning fosfoga bog'liq joyda tarqalishini keltirib chiqaradi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 101 (13): 4419–24. doi:10.1073 / pnas.0307700101. PMC 384762. PMID 15070733.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Gamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Inson signalizatsiya yo'lining funktsional proteomik xaritasi". Genom Res. 14 (7): 1324–32. doi:10.1101 / gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lion Idoralar, Diamond AI, Mann M (2005). "Nukleolyar proteom dinamikasi". Tabiat. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Tsukada Y, Fang J, Erdjument-Bromage H, Uorren ME, Borchers CH, Tempst P, Zhang Y (2006). "JmjC tarkibidagi oqsillar oilasi tomonidan histon demetilatsiyasi". Tabiat. 439 (7078): 811–6. doi:10.1038 / tabiat04433. PMID 16362057. S2CID 4415889.
- Olsen QK, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Signalizatsiya tarmoqlarida global, in vivo jonli va saytga xos fosforillanish dinamikasi". Hujayra. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
PDB galereyasi | |
|---|---|
|
 | Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 11 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish. |